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    使用布隆过滤器求两个大文件交集

    但每个文件达到320GB,远超过4G内存限制,无法操作。一种改进是分批载入A和B的一部分数据,每次在内存中求交集,最后合并结果。这种方法可以控制每次内存使用,但需要对两个文件多轮遍历。...// 判断每个url是否在过滤器A中 print(url); // 如果存在,则输出 } } }}这个示例先初始化了两个布隆过滤器,然后分别加载两个文件的url,最后判断文件...总结本文以求两个大文件交集为例,展示了如何利用布隆过滤器这个高效的数据结构解决大数据场景下的复杂问题。主要优点是:1. 只需要两轮遍历,降低了IO和计算复杂度;2....具体实现上,使用m比特长度的位向量v初始化为0。还需要k个随机映射函数h1~hk,作用是将元素映射到0~m-1的整数索引上。...算法实现基于布隆过滤器,可以设计一个求两个文件交集的算法:根据文件A的数据规模和可接受的误判率,初始化布隆过滤器A;遍历文件A,将每个url输入到过滤器A中;同样初始化过滤器B,遍历文件B将元素输入过滤器

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    Python3实现两个Excel文件内容

    最近在工作中,需要人工比对大量的excel格式报表,刚好刚学了Pyhon入门基础知识,想着写个东西练练手,不但能提高代码编写能力,还能减轻工作量,提高工作效率。说干就干,简单的理了逻辑。...首先,将目标表和源表的内容分别写入到字典中,Excel表中不确定有没有字段是唯一值,所以选择了行号作为key值,一行的内容放到list中,然后从源表中取一行去目标表中遍历。...想好之后开始敲代码了,在代码编写过程中遇到很多的问题,都是遇到一个查一个。基本的比对功能实现后,就想着在加个日志记录下比对结果。写下此文记录下,just do it....下面是全部代码 #-*- coding: utf-8 -*- #比对两个Excel文件内容的差异 #---------------------假设条件---------------- #1、源表和目标表格式一致...target_xls={} #比对的xls文件 wb_ori=xlrd.open_workbook(ori_path) #打开原始文件 wb_tar=xlrd.open_workbook

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    使用 Python 实现文件递归遍历的

    今天有个脚本需要遍历获取某指定文件夹下面的所有文件,我记得很早前也实现过文件遍历和目录遍历的功能,于是找来看一看,嘿,不看不知道,看了吓一跳,原来之前我竟然用了这么搓的实现。...,一次用来过滤文件夹,如果只是从功能实现上看,一点问题没有,但是这…太不优雅了吧。...,只调用了一次 listdir,把文件和文件夹用 if~else~ 进行了分支处理,当然,自我调用的循环还是存在。...有木有更好的方式呢?网上一搜一大把,原来有一个现成的 os.walk() 函数可以用来处理文件(夹)的遍历,这样优化下就更简单了。...,方案二是最优雅简洁的了,但是再翻看 os.walk() 实现的源码就会发现,其实它内部还是调用的 listdir 完成具体的功能实现,只是它对输出结果做了下额外的处理而已。

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    Python3+叠加两个音频文件,实现混

    将两个单声道的音频文件叠加成一个新的音频文件。 实现:a + b = c(新) 同理,如果用 c - b 可以得到文件a 同理,也可以将多个单声道音频文件叠加到一起。...注意: 两个文件要是相同声道的文件,这里的代码只适用1声道的。 两个音频文件的rate也要是相同的。 当两个音频文件的长度不同,需要将较短的音频文件补上静音数据,这里都是将静音添加到了音频文件后。...import pyaudio file1 = os.path.join(os.path.abspath(os.path.dirname(os.path.dirname(__file__))), '音频文件.../demo1.wav') file2 = os.path.join(os.path.abspath(os.path.dirname(os.path.dirname(__file__))), '音频文件/...new_wave_data.tostring() p = pyaudio.PyAudio() CHANNELS = 1 FORMAT = pyaudio.paInt16 RATE = 44100 # 实现录音

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    使用Python实现文件压缩和解压

    大家可能都熟悉.zip格式的文件。它可以把多个文件,压缩成一个文件。这在网络上传输时很有用,而且节省硬盘空间。 接下来,我们使用Python实现压缩和解压。...请注意,zipfile 是 Python 模块的名称,ZipFile()是函数的名称。...= zip_file.getinfo('zfile/a.txt').compress_size ZipFile 对象有一个 namelist()方法,返回 ZIP 文件中包含的所有文件和文件夹 的字符串的列表...如果向 ZipFile 对象的 write()方法传入一个路径,Python 就会压缩该路径所指 的文件,将它加到 ZIP 文件中。write()方法的第一个参数是一个字符串,代表要添 加的文件名。...第二个参数是“压缩类型”参数,它告诉计算机使用怎样的算法来压 缩文件。

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    比较两个vcf文件的多种实现方法

    有粉丝邮件求助,给了我两个vcf文件,旧的vcf文件走的是标准的bwa+gatk流程,参考基因组是hg19,新的文件参考基因组是hg38,也是gatk标准流程。...想有比较它们,首先得保证两个vcf文件的参考基因组一致,因为版本不一致,所以需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换,然后里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令比较它们...image-20200711195600818 最后看专业的软件进行两个vcf文件比较 这里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令,代码如下: java -Xmx1g -jar...有意思的是ALT_1/ALT_1 22538 两个流程不可能完全一致,近4万个位点在两个vcf文件里面都有,超过80%的一致性了。挺好的。...这两个vcf文件可以是不同人的,也可以是同一个人的不同批次测序或者不同数据分析流程拿到的vcf文件。

    2.9K20
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