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使用qsub提交作业时,如何包含本地安装的python包?

使用qsub提交作业时,可以通过设置环境变量来包含本地安装的Python包。具体步骤如下:

  1. 首先,确保本地已经安装了所需的Python包,并且包的路径已经添加到了系统的环境变量中。
  2. 在提交作业的脚本中,可以通过设置PYTHONPATH环境变量来指定本地Python包的路径。例如,假设本地安装了一个名为my_package的Python包,可以在脚本中添加以下代码:
代码语言:bash
复制
export PYTHONPATH=/path/to/my_package:$PYTHONPATH

其中,/path/to/my_packagemy_package包的路径,可以根据实际情况进行替换。

  1. 接下来,使用qsub命令提交作业。例如:
代码语言:bash
复制
qsub job_script.sh

在作业脚本中,可以使用本地安装的Python包,qsub会自动将设置的环境变量传递给作业执行环境。

需要注意的是,以上方法只适用于在作业脚本中使用本地安装的Python包。如果需要在作业提交过程中自动安装Python包,可以考虑使用虚拟环境管理工具,如virtualenvconda,并在作业脚本中进行相应的配置和安装。

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