之前介绍过 python venv模块和virtualenv工具的使用，今天这个Conda不仅能创建虚拟环境，还可以管理包依赖 Miniconda 是一个免费的 conda 最小安装程序。...它是 Anaconda 的一个小型引导版本，仅包含 conda、Python、它们所依赖的包以及少量其他有用的包，包括 pip、zlib 和其他一些包 下载链接 https://conda.io/en.../latest/miniconda.html 创建 $ conda create --name nemo python==3.8 激活 $ conda activate nemo 停用环境 $ conda...deactivate https://conda.io/projects/conda/en/latest/commands.html
pkgs_dirs: - /home/lvbibir/miniconda3/pkgs EOF 为了不搞坏 conda 的默认 base 环境, 我们创建一个虚拟环境, 每次默认进这个虚拟环境 cat...py37 激活虚拟环境 conda activate py37 退出虚拟环境 conda deactivate 查看虚拟环境列表, 带有 * 的行就是当前所处的虚拟环境 conda env list...删除虚拟环境, conda env remove -n py37 4.其他# conda 最为人诟病的点应该是包管理跟 pip 可能会产生一些冲突, conda 官方给出的最佳方案是 全程使用 conda...install 来安装模块, 实在不行再用 pip 使用 conda 创建完虚拟环境后, 一直用 pip 来管理模块 pip 应使用 –upgrade-strategy only-if-needed...这是运行 pip 时的默认设置, 不应更改 不要将 pip 与 –user 参数一起使用，避免所有用户安装 总结一下就是不要来回地用 pip 和 conda, 专一一点 (笑
对于数值型数据，NumPy数组在存储和处理数据时要比内置的Python数据结构高效得多。...IPython可以方便地访问系统的shell和文件系统，在许多场景中就无需在终端窗口和Python会话中来回切换。 Jupyter是一个更多语言交互计算工具，支持40多种编程语言。...推荐将文件安装到默认的主目录，例如/home/USER/miniconda（USER是用户名）。 Miniconda安装包会询问用户是否愿意修改命令行脚本，以自动激活Miniconda。...conda config --set channel_priority strict 为了使操作环境更为纯净，使用虚拟环境，虚拟环境的名字是pydata-book，命令如下： (base) $ conda...用命令conda info可以查看当前系统都有什么虚拟环境。
一言以蔽之，Conda是Python中用于管理依赖包和虚拟环境的工具，Anaconda是一个带有Conda工具的软件包（附带了Conda、python和150多个科学软件包及其相关的包），而Miniconda...也就是说，安装了Miniconda，就可以直接使用Python和Conda了。 为什么要使用Miniconda呢？不使用Miniconda难道不可以吗？...当然可以不用Miniconda，没有Miniconda也不妨碍使用Python，实际上没有Minicoda在Python中也是可以实现依赖包和虚拟环境管理的。...Python自带的包管理工具为pip，虚拟环境管理可以使用virtualenv（需要单独安装：pip install virtualenv），但是在这么一些情况下使用Miniconda能够比较方便的解决问题...场景2：系统需要存在多个环境，便于在Python2和Python3之间来回切换，使用Miniconda能很好地解决这个需求。
目前已经发展很多基于GATK4标准找变异方法的自动化工作流程，其中oVarFflow是其中之一。...对一个标准的WES双端测序的fastq文件，整个流程运行时间大概是6小时左右。...二.前期准备 安装conda cd $HOME wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh...bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ## 下载安装conda ## 设置清华镜像作为频道源，也可以使用其它镜像o conda config --add channels.../ conda info ## 查询频道是否设置好 建立conda小环境，这里直接使用yaml文件来创建哦，参考：安装conda的yaml文件赠送小米显示器 ## 新建工作目录并下载安装软件 mkdir
实际工程中，一般都使用 miniconda，按需安装软件包，本文的下面篇幅也以 miniconda 为例进行说明。...一般来说，我们保持默认即可，但需要留意下最后一步会自动在.bashrc文件添加conda的PATH路径。如果conda的环境存在与你日常使用的程序有冲突的命令，就有可能会出现问题。...当然，还有一种方式是在添加PATH路径时选择no，然后在每次需要conda的时候手动找到conda下的active命令激活下。这种方式比较灵活，如果不嫌麻烦建议使用这种方式。...，或者默认模块安装的版本比较旧，可以先尝试升级解决： conda update conda 环境管理 conda环境中的虚拟环境比起原生Python更为强大，可以指定Python的版本，并自动安装相关的...），从这里我们就可以看到两点： 利用conda就可以同时管理好conda和pip依赖 conda 的环境管理，已经成为一种标准，被mlflow这样的项目所使用。
2 conda env list或者conda info -e 查看当前存在哪些虚拟环境。 3 conda update conda 检查更新当前conda。...4 conda create -n env_name python=x.x(如2.7,3.6等) 创建python虚拟环境 5 source activate env_name(虚拟环境名称) 使用激活...8 conda update -n base -c defaults conda 更新conda到最新版本 (3).demo试练 1.创建并切换到虚拟环境simple-flask-app 使用conda...版本会进行下载和安装，时间比较久。...，将python的一个简单使用文档化。
不仅可以方便安装，更新，卸载工具包，而且安装时能自动安装相应的依赖包。在集群上利用Miniconda环境可以简易化软件的安装及编译。...本文记录 archlinux 下 miniconda3 的安装使用方法。...##创建名字为test，python版本为3.8.3的环境conda activate test ##启动test虚拟环境conda deactivate# 安装包conda install xxx...或者使用pip install xxx# 环境清单conda env list# 删除环境conda env remove -test ##删除test虚拟环境# 配置国内源conda config -...Miniconda安装与使用 Conda - archlinux wiki Conda使用指南
好比历史浪潮中工业时代过渡到互联网阶段时，从"电脑是什么"到"人人都会上网"，AI正在蜕变为每个人的必备技能。 今天我们要聊一个问题：为什么入AI前建议学学Python？...因为Python的版本比较多，并且它的库也非常广泛，同时库和库之间存在很多依赖关系，所以在库的安装和版本的管理上很麻烦，因此设计Conda作为一个管理版本和Python环境的工具，但它业可以打包和管理任何语言的软件...2.1.2 Conda、Anaconda及Miniconda及的关系 Conda：Conda是Anaconda的包管理器，主要用来安装和管理软件包。...2.3.1 Miniconda安装 # 文件名是自己下载的sh文件，-p后面填安装路径 # -b 表示将环境变量自动写入到～/.bash文件中 sh Miniconda3-py311_23.5.2-0-...说明 三、Python安装 3.1 创建PY虚拟环境 搭建之后就可以使用conda env list查看到新创建的虚拟环境 # 模版 conda create -n 虚拟环境名 python=对应的python
Anaconda 比较臃肿, 本文使用无 GUI 的 miniconda. 环境: win10 miniconda3-py11-23.5.2-0 1....: - D:\software\python\pkgs 上述配置文件中主要配置了三项: conda 的清华国内源, 虚拟环境和 pkg 的存储路径 如不配置创建虚拟环境时可能会生成到用户目录下, 导致系统盘臃肿...可以不写, 这个问题是因为我常开代理, pip 默认用 https 访问系统代理, 导致 pip 报错. 2.4 管理虚拟环境# 上述步骤做完后就可以正式使用 conda 创建虚拟环境了 用管理员打开...powershell 使用如下命令初始化 conda conda init powershell conda init cmd conda init bash 之后重新打开终端, 创建你的虚拟环境,...这是运行 pip 时的默认设置, 不应更改 不要将 pip 与 –user 参数一起使用，避免所有用户安装 总结一下就是不要来回地用 pip 和 conda. 以上.
但是Anaconda和Miniconda的用法完全一摸一样，使用上不要担心，完全就是一个多装了很多包，一个少装了很多包。...我们在这些系统安装python3.x版本时，需要经过一系列的的操作各种繁琐操作，因为系统自带的python2.x版本是不能卸载的，否则可能出现未知的错误，还需要解决各种莫名其貌的问题和各种依赖，很是心累...，如果我们使用的是conda，借助conda之手，创建各种版本的python,那就容易多了，并且使用的pip也是当前环境的pip,不会和原系统pip冲突，还有conda的安装也是很省心的，这点不用担心。...退出虚拟环境(进入环境状态下才可使用) conda deactivate 栗子 ?...安装第三方包 这里采用的方法通过pip安装 conda激活一个虚拟环境之后，使用的也是当前的python和pip,一点都不用担心和原系统的pip冲突 步骤 进入指定虚拟环境activate <env_name
相比之下，Miniconda作为Anaconda的精简版本，成为了一个更为合适的选择。Miniconda只包含了conda包管理器和最基本的库，因此它的体积相对较小，对系统资源的占用也更低。...一直enter到最后，输入yes同意协议：然后会弹出一个询问您是否希望更新您的shell配置文件（例如.bashrc或.zshrc），以便在启动时自动激活Conda环境，并在激活时更改命令提示符如果您选择...“yes”，则Conda将被初始化为在每次启动时都自动激活基础环境（默认情况下为“base”环境），并且在激活时会显示Conda环境的名称。...如果您选择“no”，则不会在启动时自动激活基础环境，您可以在需要时手动使用conda activate 激活环境。这里可以随意选择，我这里选择yes，然后应该就安装成功了！...版本，得通过编译安装才能安装GPU版本安装好后对虚拟环境使用进行conda-pack 进行conda 环境打包，conda-pack可以将conda环境打包成一个tar文件，其中包含了环境中使用的所有库和依赖项
1 简介 大家好我是费老师，conda作为Python数据科学领域的常用软件，是对Python环境及相关依赖进行管理的经典工具，通常集成在anaconda或miniconda等产品中供用户日常使用。...但长久以来，conda在很多场景下运行缓慢卡顿、库解析速度过慢等问题也一直被用户所诟病，且由于anaconda、miniconda本身属于「商业性质」的软件产品，导致很多公司在未获得商业许可的前提下，内部使用...Python环境）： 点击I Agree： 下一步： 选择或自定义安装路径： 根据推荐提示，悉数进行勾选： 等待安装完成即可： 2.2 配置环境变量 针对windows系统，由于新版本的miniforge在安装时不再提供自动创建相关环境变量的选项...和mamba），检验上述配置是否完成： 2.3 miniforge常用功能 上文提到过，miniforge中同时内置了包管理工具conda和mamba，其中mamba可「完全」作为conda功能的替代，...且运行效率优于conda，我们只需要将平时熟悉的conda命令中的conda替换为mamba即可，譬如： 「查看已有虚拟环境」 「激活指定虚拟环境」 注：如果初次执行activate命令失败，按照提示信息执行
能快速添加和移除给定的依赖，进行依赖调解。 这些功能使用 Pip 工具链其实是能很方便做到的。...目前看 Python 只能支持后者，也就是用基于 Conda 的虚拟环境。 值得一提的是，conda 虽然为Python 而生，但他其实是一个通用的虚拟环境工具。...Anaconda 相比 Miniconda 主要是多预装了很多科学计算的库，而我更喜欢按需使用不喜欢全家桶，所以我选 Miniconda。 官网下载miniconda3，并执行安装脚本。...如果不想在会话启动时就开启conda环境，就执行 conda config --set auto_activate_base false 。.../envs/frida 根据配置文件复现当前环境： $ conda env create -f environment.yaml IDE集成 使用 conda 还有个很大的好处就是和 IDE 可以非常方便的集成
1、引言 在树莓派3B中下载miniconda后（3.16的版本2018年的相当老旧；）才发现他并不能下载3.7以上的版本，3.6可以，、、使用该命令对conda升级后也不能实现； conda update...-n root -c defaults conda 查阅资料才发现 Linux操作系统为32位的 要下载armv7结尾的.sh文件，但是Miniconda对armv7的支持版本已经很古老了，在创建虚拟环境...如果您的树莓派系统和配置与此类似，那么您应该避免安装4.10及以上版本的Miniconda，以确保兼容性。...的使用（三步走：创建-激活-退出） 创建环境 conda create -n 虚拟环境的名称 python=版本 比如我： conda create -n py38 python=3.8.8 按yes...确认，三个done为安装成功 激活环境 source activate 虚拟环境的名称 比如 conda activate py38 退出环境 conda deactivate 7、卸载 在有miniconda
前面虚拟环境是安装在一个Python解释器下的，如果想使用不同版本的Python环境该怎么创建呢？这个时候miniconda就派上用场了。...Miniconda可以在创建虚拟环境时指定安装不同版本的Python解释器。...Miniconda下载地址：https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html 安装好miniconda后将scripts目录配置到环境变量中，就可以愉快的玩耍...(py3.6.5) C:\Users\16612>conda deactivate 4.查看所有的虚拟环境 C:\Users\16612>conda env list # conda environments...conda remove –n envname --all 例如： C:\Users\chao.li>conda remove -n py3.6.5 --all 相比于上一节的virtualenv，个人还是比较喜欢使用
查看条款和条件，并为每个提示选择“是”。 重新启动shell会话以使PATH的更改生效。...使用Miniconda，创建一个新的虚拟环境： wget https://downloads.lightbend.com/scala/2.12.4/scala-2.12.4.deb sudo dpkg...安装PySpark和Natural Language Toolkit（NLTK）： conda install -c conda-forge pyspark nltk 3. 启动PySpark。...Miniconda和NLTK软件包具有内置功能，可简化从命令行下载的过程。 导入NLTK并下载文本文件。除语料库外，还要下载停用词列表。...应删除停用词（例如“a”，“an”，“the”等），因为这些词在英语中经常使用，但在此上下文中没有提供任何价值。在过滤时，通过删除空字符串来清理数据。
这样，当项目完成时，可以很方便地根据当前的虚拟环境打包一个docker镜像，让你的代码可以很轻松的被任何人使用。 ?...虚拟环境一般有两种选择virtualenv和conda，两种功能差不多，但因为我用conda比较多，很少使用virtualenv，因此本文主要介绍conda的虚拟环境安装和管理。...Conda conda分为anaconda和miniconda两种，miniconda是anaconda的精简版本，我们以miniconda为例。...1.下载安装miniconda conda官网下载：https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html 清华镜像：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...笔者一般会将Pycharm配合Jupyter notebook一起使用，Pycharm用来做项目开发，Jupyter notebook用来做数据可视化和一些数据实验。
但是，运气比较好的事，python的语言特性事实上也就意味着他的运行方式就是一个虚拟机，因此，事实上我们可以将整个环境进行打包创建一个自定义的虚拟环境进行环境的隔离和自定义。...一个典型的例子如下： conda create -n py3 python=3.6* 当然，和大多数使用场景相一致，-n也可以使用全名--name进行替换。...删除虚拟环境 miniconda删除虚拟环境的命令如下： conda remove -n name 例： conda remove -n py3 3. miniconda虚拟环境的使用 miniconda...jupyter notebook 电脑就会自动启动默认浏览器然后进入到jupyter notebook页面。...参考链接 miniconda安装 Miniconda安装及使用–小白上路 jupyter中添加conda虚拟环境 Linux权限详解 Linux Bash Shell入门教程
Conda主要用于安装和管理软件包及其依赖关系，可以在不同环境中轻松切换，使得软件包的安装和管理更加方便。...Miniconda是Conda的另一个发行版，是一个轻量级的版本。它只包含conda和其他几个基础包，相对于Anaconda来说更加轻便。...常用的Conda命令包括创建虚拟环境（conda create）、列出虚拟环境（conda env list）、删除虚拟环境（conda remove）和查询conda信息（conda info）等。...shell的bash信息,当登录时以及每次打开新的shell时,该该文件被读取。.../pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yesconda 使用1.安装软件(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ conda
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