04 ccNetViz 一个轻量级的JavaScript库，用于使用WebGL进行大型网络图可视化。它是在Helikar实验室开发的GPLv3许可下可用的开源库。...24 Graphvy 使用Kivy进行的基本图形(数据)浏览和可视化，并根据MIT许可发布。 25 H3Viewer 一个JavaScript库，提供3D双曲空间中节点链接图的布局和导航。...28 JavaScript Diagram 一个商业JavaScript库，用于可视化，创建和编辑交互式图。它支持通过代码或可视界面创建流程图，组织结构图，思维导图和BPMN图表。...该库可以处理大量动态数据并与之交互。 60 visNetwork VisNetwork是专有R软件包，使用vis.js库进行网络可视化。...61 VivaGraphJS JavaScript的图形绘制库，旨在支持不同的呈现引擎和布局算法。 62 yFiles 商业编程库，用于可视化任何类型的图，图或网络。
甚至，网络可视化操作还能与时序数据结合，例如 Maximilian Noichl 绘制的这张古代哲学家的动态关系网络图。 ? 网络可视化的工具，是非常多的。 然而，一旦涉及了交互式，选项就大幅减少了。...环境 我们使用的，是 R 的集成开发环境（integrated development environment, IDE） RStudio 。 ? 你可以在本机安装 R 以及 RStudio 。...请你根据我的介绍，逐步点击代码模块旁边的运行按钮，查看运行的结果。 ? 代码 首先，我们需要读入本教程中最重要的软件包，也就是 R 环境下的网络交互可视化工具—— visNetwork。 ?...visNetwork 基于 Javascript 可视化工具库 vis.js 开发，为 R 用户提供了简单易用的界面，而且功能也很强大。 ? 我们使用 library 命令来读入它。...从中选择自己感兴趣的部分深入研读。 另外，这个工具，也绝不仅仅可以帮助你绘制社会网络图。只要是适合用网络图展现的内容，它都可以发挥作用。 希望你充分发挥自己举一反三的能力，把这项新技能用好。
请记住，思维导图只是工具，思考才是使用它的最终目的。...2、jsMind jsMind，极速灵感，是一个国产的基于互联网的、协作的、高效的、免费的思维导图制作与分享工具。纯 javascript ，基于 html5 的 canvas 实现。...它提供思维导图的显示、编辑等功能，支持 freemind 数据格式，有丰富的开发接口可供使用。 jsMind 以 BSD 协议开源，目前仍在不断迭代中。...[image] 3、My Mind My Mind 和百度脑图类似，同样是一款开源的网页版思维导图编辑器，简单易用，支持 JSON、FreeMind、MindMup、Mind Map Architect...TiddlyMap 是一款基于 JavaScript 的 Web 应用，使用 Vis.js 库可视化，图形与内容同步，以 BSD 协议开源。 [image] 最后的最后，说一下 XMind。
导语 GUIDE ╲ 通常是使用Cytoscape、igraph包等来可视化网络，虽然能够创建美观的网络图，但它们只是静态的。...对于创建交互式网络可视化，可以使用R中的特定包—visNetwork，有许多参数来创建个性化网络。...举例介绍功能 01 基础网络图visNetwork nodes <- data.frame(id = 1:6) edges 的所有可用布局并计算坐标。...优于常规的网络可视化方法是交互式的动态呈现，生动有趣。简单的几行代码就可以满足你对网络图更“苛刻”的要求，一起来探索他的更多功能吧！
p=5658 使用R检测相关主题的社区 ? 创建主题网络 对于Project Mosaic，我正在通过分析抽象文本和共同作者社交网络来研究UNCC在社会科学和计算机和信息学方面的出版物。...我遇到的一个问题是：如何衡量主题之间的关系（相关性）？特别是，我想创建一个连接类似主题的网络可视化，并帮助用户更轻松地浏览大量主题（在本例中为100个主题）。...允许R中的交互式网络图的包。...首先，让我们调用库并运行visIgraph一个交互式网络，但是使用igraph图形设置在igraph结构（图形）上运行。...您可以使用鼠标滚轮进行缩放。
ggvis：交互式图表多功能系统 htmlwidgets：一个专为R语言打造的可视化JS库 leaflet：绘制交互式地图 dygraphs：绘制交互式时间序列图 plotly：交互式绘图包，...rCharts：提供了对多个javascript数据可视化（highcharts/nvd3/polychart）的R封装。...pROC：用于可视化，平滑和对比ROC曲线 沟通交流 以下R包用于实现数据科学结果的自动化报告，以便于你跟人们进行沟通交流。...drat：一个用于创建和使用备选R包库的工具 testthat：单元测试，让R包稳定、健壮，减少升级的痛苦。 roxygen2：通过注释的方式，生成文档，远离Latex的烦恼。...：提供了一个执行非负矩阵分解的算法和框架 crayon：用于在输出终端添加颜色 RJSONIO：rjson是一个R语言与json进行转的包，是一个非常简单的包，支持用 C类库转型和R语言本身转型两种方式
ggvis：交互式图表多功能系统 htmlwidgets：一个专为R语言打造的可视化JS库 leaflet：绘制交互式地图 dygraphs：绘制交互式时间序列图 plotly：交互式绘图包，中文介绍详见这里...rCharts：提供了对多个javascript数据可视化库（highcharts/nvd3/polychart）的R封装。...pROC：用于可视化，平滑和对比ROC曲线 沟通交流 以下R包用于实现数据科学结果的自动化报告，以便于你跟人们进行沟通交流。...drat：一个用于创建和使用备选R包库的工具 testthat：单元测试，让R包稳定、健壮，减少升级的痛苦。 roxygen2：通过注释的方式，生成文档，远离Latex的烦恼。...crayon：用于在输出终端添加颜色 RJSONIO：rjson是一个R语言与json进行转的包，是一个非常简单的包，支持用 C类库转型和R语言本身转型两种方式。
机器学习：一种使计算机系统从数据中学习并改进的算法。 深度学习：一种特殊的机器学习技术，使用类似人脑的神经网络结构处理数据。 自然语言处理：使计算机能够理解和生成人类语言的技术。...数据库：选择合适的数据库系统（如MySQL、MongoDB等）存储用户数据和思维导图信息。 AI服务：集成AI算法或使用外部API，提供思维导图的自动生成和优化功能。...可视化展示：优化思维导图的视觉效果，提供多种布局和样式选项。 分享和协作：允许用户分享思维导图，并支持多人在线协作编辑。 多语言支持：提供多语言界面，满足不同用户的需求。...机器学习算法：用于模式识别和预测，比如决策树、支持向量机等，来辅助决策思维导图的布局。 深度学习：特别是卷积神经网络（CNN）或循环神经网络（RNN），在图像和序列数据处理上的应用。...确定关系：分析关键词之间的语义关系，确定节点间的连接。 布局优化：使用机器学习算法优化思维导图的布局，提高可读性。 视觉设计：为节点选择合适的视觉元素，并生成最终的思维导图。
GitHub:https://github.com/jgraph/mxgraph 网站描述:一个完整的客户端JavaScript图表库 mxGraph是一个强大的JavaScript流程图前端库， 绘图组件适用于需要在网页中设计.../编辑 Workflow/BPM 流 程图、图表、网络图和普通图形的 Web 应用程序。...国内外著名的ProcessOne和draw.io都是使用该库创建的强大的在线流程图绘制网站。...mxGraph的使用场景 mxGraph的使用场景有4个：图形可视化、图形交互、图形布局、图形分析。...图形可视化 图形可视化是mxGraph的主打功能，这个很好理解，就是把一些抽象的概念用图形来表示，比如常见的流程图、思维导图、实体关系图等。
组件包装） 杂项 Chroma.js – 用于处理色彩的小型库文件 Piecon – 图标上的饼状图绘制工具 Recline.js – 使用纯 JavaScript 和 HTML 的用于构建数据应用的简单而又强大的库...其能够对 ASCII、 SVG 和 图像进行渲染 svgo – 针对 SVG 的 Go 语言库 iOS工具 JBChartView – 同时支持线性和条形图的图表库 PNChart – 使用了 Piner...ggplot2 的输出中添加了交互性）, 统计图和简单网络图 rbokeh – 针对 Bokeh 的R语言接口 rgl – 使用了 OpenGL 的3D 可视化 shiny – 用于创建交互式应用和可视化的框架...visNetwork – 交互式网络可视化 Ruby工具 Chartkick – 使用 Ruby 的单线创建图表的工具 其他工具 不与特定平台或语言绑定的工具 Charted – 一个能够从任何数据文件中创建自动化...CSV 和 Excel 文件创建的网络可视化工具 Spark – 命令解释程序（shell）走势图.
写在前面 上期介绍了network包和igprah包进行网络可视化的方法。undefined本期介绍tidygraph包和ggraph包，颜值极高！ 号外！号外！文末动态、交互网络绘制教程!...修改网络文件 有时候我们会想修改已经建好的网络文件， 可以使用activate函数单独进行nodes文件或edges文件的修改。 这里我们将edges文件中的weight以降序进行排列。...undefined 这里我们可以使用visNetwork 和 networkD3实现动态、交互网络的绘制。...首先加载相关包 library(visNetwork) library(networkD3) --- 7.1 方法一 visNetwork包进行网络可视化 7.1.1初步绘制 ︿(￣︶￣)︿ visNetwork...edges <- mutate(edges, width = weight/5 + 1) --- 使用igraph包的layout_with_fr进行排列 (～￣▽￣)～ visNetwork(nodes
D3是一个根据数据操纵文档的JavaScript库[2]，其全称Data-Driven Documents强调了这一点。...本书思维导图简要版 D3技术基础 D3操作的是Web上的文档，可以便捷快速地向全世界发布可视化作品，对操作系统和设备的依赖很低。...数据绑定 通过d3.csv("food.csv", function(data) {dataset=data;})可以读取本地的csv文件数据进行使用，这是写JavaScript代码很常用的写法。...关于D3，可以继续深入学习内容参考如下： •交互：通过绑定事件监听器和定义行为实现图形和键鼠的交互；•过渡动画：同样通过事件监听和缓动实现过渡效果和数据更新；•各种布局：通过饼图布局实现柱状图变旭日图、...后续会基于这本书用6篇文章详细介绍和实践D3可视化，希望能写得容易实践且有深度。希望与你一同进步。 ? 《数据可视化实战》这本书的读书笔记思维导图如上。
写在前面 scDiffCom包是一个用于单细胞数据中细胞间通讯分析的R工具包。 该工具包结合了最新的生物学知识库和单细胞表达数据，通过识别配体-受体相互作用来揭示细胞间的信号传递关系。...scdiffcom_object, categories = "all", simplified = TRUE) # Categories available names(ORA_results) 火山图可视化...theme_minimal()+ theme(legend.position = 'right', legend.key.size = unit(0.4, "cm") ) 网络可视化...-受体相互作用的自定义数据库 scDiffcom还可以使用自己的LRI数据库和关联的注释。...这里我们以删减版mouse数据库为例。 其实这里可以是任何数据库，只要它是data.table的列与默认值相同就行。
写在前面 上期介绍了network包和igprah包进行网络可视化的方法。 本期介绍tidygraph包和ggraph包，颜值极高！ 号外！号外 ！文末动态、交互网络绘制教程!...修改网络文件 有时候我们会想修改已经建好的网络文件， 可以使用activate函数单独进行nodes文件或edges文件的修改。 这里我们将edges文件中的weight以降序进行排列。...动态交互网络 有时候我们会想做个交互网络，像Cytoscape软件一样实现单个节点的拖拽、排列等。 这里我们可以使用visNetwork 和 networkD3实现动态、交互网络的绘制。...首先加载相关包 library(visNetwork) library(networkD3) ---- 7.1 方法一 visNetwork包进行网络可视化 7.1.1初步绘制 ︿(￣︶￣)︿ visNetwork...edges <- mutate(edges, width = weight/5 + 1) ---- 使用igraph包的layout_with_fr进行排列 (～￣▽￣)～ visNetwork(nodes
不理解原理并不影响大家使用，知道这个概念，知道如何根据AUC值去判断结果就好。...其实这个包的核心在于motifRankings变量，数据库文件来自于前面的教程，见：基因集的转录因子富集分析，也是很容易制作的，选取人类的不到2000个TF的全部chip-seq数据的peaks文件的bed...高级分析之网络图 这里面的R代码技巧还是蛮值得细细品读的： anotatedTfs <- lapply(split(motifEnrichmentTable_wGenes$TF_highConf,...visOptions(highlightNearest = TRUE, nodesIdSelection = TRUE) 一个简陋的网络图就出来了...PPI调控网络图确实有点老套了 我有预感，这个转录因子调控网络图应该是在未来5年内会逐步替代PPI调控网络图，直到转录因子调控网络图也变得俗气为止。
Graphviz （英文：Graph Visualization Software的缩写）是一个由AT&T实验室启动的开源工具包，用于绘制DOT语言脚本描述的图形。它也提供了供其它软件使用的库。...Dia 是开放源代码的流程图软件，是GNU计划的一部分，程序创立者是Alexander Larsson。Dia使用单一文件界面模式，类似于GIMP与Inkscape。...Dia将多种需求以模块化来设计，如流程图、网络图、电路图等。各模块之间的符号仍是可以通用的，并没有限制。 ? 顺便安利一下，我最喜欢的操作系统OpenSuSE——简洁、尾长、绿色。 ?...脑图： XMind 我想这个一般人都是知道的。 XMind思维导图软件被著名互联网媒体Lifehacker评选为“最佳头脑风暴和思维导图工具”及“最受欢迎的思维导图软件”。...各种图：D3.js D3.js（D3或Data-Driven Documents）是一个用动态图形显示数据的JavaScript库，一个数据可视化的工具。 与上面的工具相比，这个工具可能没有那么方便。
内容提要，学习本文，你会学到： markmap这个库实现的核心技术原理 一种抽象思想，结构化数据转化为另外一种呈现的方式 Markmap 是一个非常有用的工具，它可以将 Markdown 文本转换成交互式的思维导图...，我在工作中经常会用到这个工具，比如： 在会议中使用 Markdown 记录要点，然后转换成思维导图，以便更直观地查看讨论的结构和关键点。...在这个过程中，通常会将 Markdown 中的标题转换成思维导图的主节点和子节点。 SVG 渲染：使用 D3.js 或类似的库来将树形结构渲染成 SVG 图形。...D3.js 提供了强大的数据可视化工具，可以用来创建和操作 SVG 元素，从而生成动态的、可交互的思维导图。...交互性：Markmap 允许用户与生成的思维导图进行交互，比如展开或折叠节点，这通常是通过监听 DOM 事件并相应地更新 SVG 元素来实现的。
5.Pandas思维导图 五.Matplotlib 1.基础用法 2.绘图简单示例 3.Matplotlib思维导图 六.Scikit-Learn 1.基础介绍 2.Sklearn思维导图 七.本章小结...NetworkX库支持图的快速创建，可以生成经典图、随机图和综合网络，其节点和边都能存储数据、权重，是一个非常实用的、支持图算法的复杂网络库。...它使用数据流图进行数值分析，TensorFlow使用有向图表示一个计算任务，图的节点表示对数据的处理，图的边Flow描述数据的流向，tensor（意为张量）表示数据，它的多层节点系统可以在大型数据集上快速训练人工神经网络...---- 3.NumPy思维导图 熟悉作者的读者都知道，2021年初我和CSDN许老师完成了一份《Python成长路线图》，这里也给出NumPy的思维导图。...2D图表和一些基本的3D图表，类似于MATLAB和R语言。
Vision On 一款集流程图、思维导图、白板于一体的轻量级在线图形工具在工作和学习过程中，通过可视化的图形，有助于清晰高效地表达我们的灵感、想法、思想。 工欲善其事，必先利其器。...依赖于左侧工具栏的多种元素，VisionOn 成为一个集流程图、思维导图、白板等功能于一体的制图工具和创意思考工具。VisionOn 有哪些特点？轻量在线，支持跨平台使用不需要专门安装客户端。...内置了丰富的模版库模版库。...目前，Vision On 根据使用场景，提供了包括可视化工具、软件设计、Cloud、网络产品设计、商务、管理工具、平面海报、工程设计、平面布局、家庭亲子、Scientific 在内的多种模版。...；VisionOn 使用范例流程图ai_图形连接_拷贝复制操作-底纹.gif软件-软件架构缩放操作-底纹.gif思维导图深度学习-思维导图-底纹.gif概念图韦恩图看板表格白板文档
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