1月30日，《新英格兰医学杂志》（NEJM）发表的的一篇文章——Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia（新型冠状病毒感染肺炎在中国武汉的初期传播动力学），根据最早425例确诊病例数据，针对新型冠状病毒（2019-nCoV）提出了迄今为止最详细的流行病学研究。
2020年，一场新冠疫情使多个国家公共卫生系统不堪重负，暴露出应急处置能力的薄弱等问题，改革和加强公共卫生事件应急处置已成为全球关注焦点。今年2月，习总书记来到北京市朝阳区CDC进行调研指导时指出：“这场疫情对全国各级疾控中心的应急处置能力是一次大考。这次抗击疫情斗争既展示了良好精神状态和显著制度优势，也暴露出许多不足。要把全国疾控体系建设作为一项根本性建设来抓，加强各级防控人才、科研力量、立法等建设，推进疾控体系现代化”。
今天（1月28日）是国际数据隐私日（International Data Privacy Day），旨在提升对隐私和数据保护的意识，推进保护隐私和数据的行动。
中青在线北京12月28日电（中国青年报·中青在线见习记者王林） 中国平安与重庆疾控中心27日联合宣布，其共同研发的“人工智能＋大数据”疾病预测与筛查模型可提前一周预测传染病发生情况，指导民众预防疾病，帮助政府部门在相关疾病的防控工作中提升效率，降低疾病预防和控制成本。 重庆的监测数据显示，应用“AI＋大数据”的流感、手足口病预测模型，可以提前一周预测传染病发生情况，准确率均达到86％以上，高发季预测准确率可达到90％以上；慢阻肺智能筛查模型的准确率达到92％，应用此模型可大幅减少筛查成本，提高筛查效率。 目
2020年春节，新型冠状肺炎牵动着大家的心。作为一名互联人，我们能在这场战役中做些什么？这篇文章，作者从专业的角度，告诉我们，很多事情我们都可以做。
通过构建统计学模型、数学模型，或者利用机器学习、深度学习方法拟合疫情发展趋势，利用历史数据对未来的确诊病例等疫情形势进行预测，比如说，逻辑斯蒂生长曲线拟合数据，预测未来几天可能的发展趋势；或者利用时间序列模型构建预测模型；也可用LSTM构建预测模型，一种特殊的RNN网络。以上方法，除生长曲线外，其他模型，需要大量数据做训练，就目前情况看，数据量并不大，即使构建出模型，参考价值并不大，并没有与业务做融合，只是以数据理解数据。
公司于周天推出了自我筛选功能——允许用户询问，“Siri，我是否患有新冠肺炎？”如果用户有一些症状，例如发烧，干咳，气短等，或者说如果他们接触过新冠病人，siri便会引导用户完成由美国疾病防控中心和美国公共健康服务准备的调查问卷。
蚊媒病毒传染病的传播流行是人类健康和生命的严重威胁之一。以登革热和寨卡热这两种最具代表性的蚊媒病毒传染病为例，登革热在全球100多个国家感染流行，每年引发多达3.9亿人感染、50-100万人入院治疗；寨卡热于2015年至2017年在太平洋岛屿和南美洲突然暴发大规模疫情，不到一年时间内出现了超过22.3万例寨卡确诊病例，数千例新生儿小头畸形病例，国际卫生组织将寨卡疫情宣布为国际关注的公共卫生紧急事件。迄今为止，多数蚊媒病毒尚无有效的药物和疫苗，灭蚊措施也无法控制蚊媒病毒的传播流行。人们迫切需要成本低廉且环境友好的防控策略来阻断蚊媒病毒的广泛传播。
导语：怎么能在有限的时间内，根据不完整的信息，做出最优的决定，成为了决策者的一大挑战。
BenevolentAI借助生物医学知识图谱确定了一种可能的药物“ Baricitinib”，可以抑制COVID-19感染并减少炎症损伤，目前已用于感染患者的临床试验。
截至今日9点，全国新型冠状病毒肺炎确诊病例数已达17238，疑似病例数21558。
4月初，美国50个州，其中44个州爆发危机，26个州处于高度紧张状态。美国纽约州为此颁布紧急禁令，禁止部分人群进入公共场所。
数据科学在流行病疫情控制上的应用，当然不止是统计每天的疫情数据，它是理解流行病的传染特性，传染规律和控制策略的有效性的重要手段。
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今天为大家介绍的是来自Cesar de la Fuente-Nunez和James J. Collins的一篇综述论文。尽管分子生物学、遗传学、计算和药物化学取得了进展，传染病仍然对公共卫生构成了可怕的威胁。应对病原体爆发、大流行和抗微生物药物耐药性所带来的挑战需要跨学科的协同努力。与系统和合成生物学相结合，人工智能（AI）正在推动快速进展，在扩大抗感染药物发现、增强我们对感染生物学的理解和加速诊断方法的发展方面发挥着重要作用。在本综述中，作者讨论了检测、治疗和理解传染病的方法，强调了每种情况下AI的进展支持。作者提出了AI的未来应用以及如何利用它来帮助控制传染病爆发和大流行。
问题解决(problem solving)是由一定的情景引起的，按照一定的目标，应用各种认知活动、技能等，经过一系列的思维操作，使问题得以解决的过程。在《漫谈软件系统测试——通信节点识别》一文中，我们通过识别通信节点发现问题，在《漫谈软件系统测试——缺陷分析》一文中，我们类比软件系统开发过程和考试过程分析问题，本文想分享的是整个软件系统测试过程中看到的一些解决问题的思路。
原作：Jeremy Hsu Root 编译自 IEEE Spectrum 量子位 出品 | 公众号 QbitAI 还记得比尔及梅林达·盖茨基金会和高智公司共同出资成立的Global Good基金会吧。
中共中央、国务院1月8日在人民大会堂举行2017年度国家科学技术奖励大会。82岁的南京理工大学教授王泽山，89岁的国家“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项技术总师侯云德，共同获得2017年度国家最高科学技术奖。 国家最高科学技术奖自2000年正式设立至今，已有29位科学家获奖。每位获奖者奖金500万元人民币。 82岁的中国工程院院士、南京理工大学教授王泽山步履矫健、精神矍铄，1月8日在北京人民大会堂举起2017年度国家最高科学技术奖证书。王泽山院士是中国火炸药学科带头人，是发射装药理论体系的
什么是传染病动力学？numpy和matplotlib用python实现传染病模型SI模型SIS模型SIR模型SEIR模型
截至2月27日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例39919例（其中重症病例7952例），累计治愈出院病例36117例，累计死亡病例2788例，累计报告确诊病例78824例，现有疑似病例2308例。累计追踪到密切接触者656054人，尚在医学观察的密切接触者65225人。
2024年2月20日，专门开发AI-Immunology™动力疫苗的临床阶段TechBio公司Evaxion Biotech A/S（NASDAQ:EVAX）宣布，其与MSD（美国新泽西州拉威市默克公司的商标名）的疫苗合作的初始阶段成功完成。疫苗开发项目结合了两家公司的独特能力和专有技术。
大数据 (big data) 是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和分析的数据集。 大数据具有“4V”特征：①数据容量 (Volume) 大，常常在 PB(1 PB=250 B)级以上；②数据种类 (Variety) 多，常常具有不同的数据类型（结构化、半结构化和非结构化）和数据来源；③产生和更新速度 (Velocity) 快（如实时数据流），时效性要求高；④科学价值 (Value) 大，尽管利用密度低，却常常蕴藏着新知识或具有重要预测价值。
生物学家Jason Ladner和Jason Sahl于2023年8月1日发表在《PLOS Biology》（IF2022=9.8）的一篇文章中主张，持续发展基因组测序是能从大流行病中快速获得信息的最重要方法之一。基因组测序对全球应对COVID-19产生了巨大影响，随着更多研究人员的使用，测序技术得到了改进。研究人员提出，为更好地应对下一次大流行病，我们需要在现有知识的基础上进一步发展，同时也要认识到我们在防控传染病的能力方面仍然存在的差距。
如果论资排辈，微生物一定是地球上最古老的物种，而让人感到害怕的病毒，则是微生物的一种，几乎与地球同时诞生，存在时间已长达四十亿年。
在传染病学领域，建模评估和预测病毒的传播路径、速率等对于疫情的控制非常重要。在经典的传染病学模型中，R0 值常被用来描述疫情的传染速率，可以反映传染病爆发的潜力和严重程度。
「在家待着就能为国家做贡献」其实不只是一句玩笑话。在疫情肆虐的这几天里，国内外的流行病学家、统计学家似乎都没闲着。他们基于疫情爆发初期的一些数据建立了传播动力学模型，给出了关于疫情传播速率的见解和峰值预测，可能为有关部门的防疫决策提供重要参考。
2019年末，在中国武汉爆发的冠状病毒疫情冲击了整个金融市场和实体经济。这座总人口超过千万，春运期间流动人口超过500万的巨型城市的灾难在世界各地引发了一连串蝴蝶效应，也在全球普通民众中引发恐慌。
要知道，现实情况往往比训练AI的数据集复杂N倍，而研究人员打造的模型，往往只是研究传播对象的前几个步骤，然后将这个速率引入复杂的数学模型之中，来预测传播的广度和速度。
将传染病范围内的人群分为以下类别： (Susceptible) 类：指未得病，但与感染者接触后容易收到感染的人。 (Exposed) 类：指接触过感染者，但暂时没有传播的能力的人。 (Infectious) 类：指染上传染病，具有传播能力的人。（可以传播给 类人员，将其变成 类或 类成员） (Recovered / Removed) 类：指病愈而具有免疫力的人或被隔离的移出者。（如果免疫期有限， 类人员可以重新变为 类）
2021年11月，来自哈佛医学院波士顿儿童医院的Sheng He和麻省综合医院的Yanfang Feng等人，在药学顶尖杂志Adv Drug Deliver Rev（药物递送领域，2020年影响因子15.47）发表综述，整理和分析了AI在传染病药物递送方面的现状、挑战、解决方案和未来前景。
感染性传染地图利用激活次阈值分配向量在高维欧氏空间节点的网络。作为传染病地图图像的点云既反映了网络的底层结构，也反映了传染病在网络上的传播行为。直观地说，如果传染病沿着该结构传播，那么这样的点云展示了网络底层结构的特征，这一观察表明，传染图是一种可行的多形学习技术。我们在许多不同的真实世界和合成数据集上测试传染映射作为一种流形学习工具，并将其性能与最著名的流形学习算法之一Isomap进行比较。我们发现，在一定条件下，在有噪声的数据中，传染病映射能够可靠地检测底层流形结构，而Isomap由于噪声引起的误差而失效。这巩固了传染病映射作为一种多方面学习的技术。
金磊 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 家人们，口罩现在被“玩”出新高度了。 同济大学最新的一项发明，直接把口罩升级成了一种“探测仪”： 研制出一种生物电子口罩，可以检测周围是否有病毒！ 更具体点来说，这种口罩可以在10分钟内检测出多种常见的呼吸道病毒，包括流感、冠状病毒等（例如新冠病毒、H5N1、H1N1）。 若是病毒被检测出来了，口罩就会通过手机这样的移动设备向你发出预警。 这项研究已于近日发表在Matter杂志，并且根据研究人员的说法： 这种电子生物口罩可以作为预警诊断工具，预防呼吸
新冠肺炎的大流行警示我们，传染病对人类构成巨大威胁，也凸显了建立传染病监测预警系统的紧迫性。这需要对传染病在人群中的分布进行长期持续的时空分析，以便及早发现异常情况，阻止疫情的大规模扩散甚至爆发。
金磊 明敏 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 那个让多国告急的不明原因儿童急性肝炎，背后的“元凶”终于露出了马脚。 国际顶刊《柳叶刀·胃肠病和肝病学》最新发文称： 或与新冠病毒导致的超抗原 （super antigen，SAg）相关。 而此前令科学家困惑的是，这种急性肝炎，与目前已知的甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒均不符。 但随着这项最新研究的发布，新的治疗方案或许有了眉目。正如作者所述： 如果发现超抗原介导的免疫激活的证据，应考虑对患有严重急性肝炎的儿童进行免疫调节治疗。 为什么会与新冠病毒
2022年2月16日，南京农业大学粟硕教授团队与中山大学医学院施莽教授团队等单位共同合作在Cell杂志上发表题为 “Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”的研究论文。
本来说好的2021会有一个好开局，似乎又出了点问题。 年关将近，现在疫情反扑，部分小区甚至全部隔离，为了安全着想，近期返乡还要求提供7日内核酸监测。作为普通人，我们除了戴好口罩，不乱跑，还能干点啥？ 要知道这个，我们需要理解疫情是如何传播，防控是怎么进行的。 病毒通过黏膜感染，飞沫传播，由于病毒可以在体外存活一段时间，因此甚至可以间接传播。 传染病的预防措施包括消灭传染源，切断传播途径和保护易感人群。由于新冠肺炎的潜伏期不短，感染特征也不算明显，因此实际情况会复杂些，因此我们需要核酸检测、隔离、健康码。
2019年底，一场没有硝烟的战役不期而至。突然爆发的疫情对全国乃至全球都造成了巨大的影响。针对全国发生的新型冠状病毒肺炎疫情,习大大多次作出重要指示，强调要把人民群众生命安全和身体健康放在第一位，制定周密的方案，组织各方面的力量来开展防控，采取切实有效的措施，坚决抑制疫情的蔓延。
一旦将目光投掷到疫情同样在扩散的意大利、美国、日本等欧美发达国家，会发现这些印象中的大型都市、科技强国，似乎都没准备拿起AI这把强有力的防控武器。
众志成城，中国加油！ 冠状病毒 冠状病毒-1* 冠状病毒是一类引起人类呼吸道感染的重要病原体，其中的SARS和MERS病毒的感染能导致严重肺炎，危及生命。在真核细胞中，蛋白质的泛素化修饰广泛存在，参与调节多种生理功能，包括抗病毒感染。最近在HIV中的研究发现，宿主E3泛素连接酶MARCH8通过抑制包膜蛋白掺入病毒颗粒中，从而降低HIV感染。MARCH1与MARCH8具有较高的同源性。目前它们在冠状病毒感染中的作用仍然是个空白。在前期研究中，我们发现过表达MARCH1和8蛋白能够有效地抑制SARS和MERS病
小站VIP群里有中标标书的摘要，不过大家使用的并不全面站长挑选几个研究热点的摘要，本期的主题是【冠状病毒】 冠状病毒 冠状病毒-1* 冠状病毒是一类引起人类呼吸道感染的重要病原体，其中的SARS和MERS病毒的感染能导致严重肺炎，危及生命。在真核细胞中，蛋白质的泛素化修饰广泛存在，参与调节多种生理功能，包括抗病毒感染。最近在HIV中的研究发现，宿主E3泛素连接酶MARCH8通过抑制包膜蛋白掺入病毒颗粒中，从而降低HIV感染。MARCH1与MARCH8具有较高的同源性。目前它们在冠状病毒感染中的作用仍然是个空
内容导读：近日，中国疾病预防控制中心（CDC）发布了新的疫情统计报告，分析了截止 2 月 11 日超过 7 万名病例的数据。研究人员从流行病学特征入手，对这份数据进行了详细的描述和分析。
核酸是核苷酸聚合成的生物大分子化合物(可分为脱氧核糖核酸 DNA 和核糖核酸 RNA)，是生命的最基本物质之一。以 DNA 或者 RNA 为载体或靶向目标的药物称为核酸药物。
1月29日，中国疾控中心（CDC）在《新英格兰医学杂志》发了一篇名为《新型冠状病毒感染的肺炎在中国武汉的初期传播动力学》的论文。
《瘟疫公司》的开发者曾被邀请去美国疾控中心进行讲座。它让全球玩家对病毒的感染和传播机制有了基本的知识储备、感性认识和危机意识，是款很棒的科普性游戏。在疫情爆发后，已在国内外官方平台下架。
另一种变异毒株拉姆达（Lambda）被正式列为「需要关注的变异毒株」（Currently designated Variants of Interest）。
美国CDC出版的杂志《Emerg Infect Dis. (新发传染病)》最新一期封面刊登了一幅绘画作品：《two lucky cats to support leadership》。为我们描述了猫在人类传染病历史中的作用。
这不，又到了nature的年度总结环节，这次提名的奖项是「2022最佳科学图表」。
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