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「R」数据可视化2 : 箱形图

本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法，希望能够帮助到各位读者。什么是箱形图箱形图（Box-plot）是一种用作显示一组数据分散情况的统计图，因形状如箱子而得名。...除了生信领域，该图在其他领域也经常被使用。主要用于反映原始数据分布的特征，并且可以进行多组数据分布特征的比较。...箱形图能显示出一组数据的最大值(Maximum)、最小值(Minimum)、中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile),同时还可以显示逸出值(Outlier)。 ?...箱形图怎么画 (1) 需要什么格式的数据我们需要的数据只要两列，一列为x，一列为y。本次我们使用R中提供的iris数据。 ?...比如我们想要探究不同物种的花萼长度差异。 (2) 如何使用ggplot2做箱形图利用ggplot2画图的核心命令是geom_boxplot。我们先来尝试做一个最最基础也是最丑的boxplot图。

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箱形图和小提琴图

箱形图（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图，因形状如箱子而得名。它能显示出一组数据的最大值、最小值、中位数、及上下四分位数。...箱形图绘制须使用常用的统计量，能提供有关数据位置和分散情况的关键信息，尤其在比较不同的母体数据时更可表现其差异。...箱形图的绘制主要包含六个数据节点，需要先将数据从大到小进行排列，然后分别计算出它的上边缘，上四分位数，中位数，下四分位数，下边缘，还有一个异常值。...与中位数的计算方法类似，根据未分组数据计算四分位数时，首先对数据进行排序，然后确定四分位数所在的位置，该位置上的数值就是四分位数。...小提琴图小提琴图 (Violin Plot)是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征，主要用来显示数据的分布形状。跟箱形图类似，但是在密度层面展示更好。

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python数据可视化之画箱形图

最近接到锅让画几个数据图。其实第一反应是用origin来画图，但问了一圈周围没有用Origin画过箱形图的，有些问题无法解决又百度不到。...y1.png y2.png y3.png y4.png 可以看出这是四组满足指数递增的数据。下面正式进入画图部分。...(int(x)) for x in text] #调整每个box的位置，因为一组数据中有9个box，而由于箱形图的特殊性其 y轴不是x轴的函数，而我们又希望每个box对应某个具体的x坐标。...因此利用pos来调整box的位置，可以看出pos也是指数递增的数据 WIDTH = [0.08]*9 #设置每个box的宽度 LINEWIDTH=2 #设置每个box的线宽 fig...['top'].set_linewidth(2) ax.spines['left'].set_linewidth(2) ax.spines['right'].set_linewidth(2) 此时画出的图是这样的

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python pyecharts数据可视化折线图箱形图

——《月亮与六便士》文章目录一、数据获取二、折线图三、箱形图一、数据获取数据来源：http://www.tianqihoubao.com/aqi/chengdu-201901.html...按月统计).html') 运行效果如下： [4l4j77nd9w.gif] 三、箱形图箱形图（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。...它主要用于反映原始数据分布的特征，还可以进行多组数据分布特征的比较。...箱线图的绘制方法是：先找出一组数据的上边缘、下边缘、中位数和两个四分位数；然后，连接两个四分位数画出箱体；再将上边缘和下边缘与箱体相连接，中位数在箱体中间。...[gm4ivdtllx.png] 利用pyecharts绘制箱线图需要用 prepare_data() 方法将传入的列表中的数据转换为的 min, Q1, median (or Q2), Q3, max

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ggplot2 分组箱线图图绘制方法

载入软件包这里使用R语言的data.table和ggplot2 library(ggplot2)library(data.table) 2....生成模拟数据生成示例数据 library(data.table)library(ggplot2)dat 的melt函数，速度更快。...生成分组箱线图要点 data=dat1 # 定义数据 aes(x = variable, y = value) # 定义x轴和y轴 geom_boxplot() #定义箱线图 ?...ggplot(data=dat1,aes(x=variable,y=value)) +geom_boxplot() 为不同的箱线图添加颜色 ggplot(data=dat1,aes(x=variable

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Python Matplotlib数据可视化绘制箱形图、散点图和直方图

本文用python对一批运动员数据进行操作，读取数据、数据预处理、matplotlib数据可视化，熟悉用python进行数据分析和可视化的基本方法，并绘制箱形图、散点图和直方图。...绘制箱形图箱线图，又称箱形图 (boxplot) 或盒式图，不同于一般的折线图、柱状图或饼图等传统图表，只是数据大小、占比、趋势等等的呈现，其包含一些统计学的均值、分位数、极值等等统计量，因此，该图信息量较大...，不仅能够分析不同类别数据平均水平差异（需在箱线图中加入均值点），还能揭示数据间离散程度、异常值、分布差异等等。...使用箱形图展示出不同技术等级 (Skill_Moves) 的运动员的评分 (Rating) 分布情况，即横轴为运动员的技术等级，纵轴为评分。...]: median.set(color='black', linewidth=3) plt.xlabel('技术等级') plt.ylabel('评分') plt.title('不同技术等级的运动员评分分布箱形图

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Python-科学计算-seaborn-03-箱形图

今天讲讲seaborn模块：箱形图 Part 1：示例 ?...已知df_1，有4列["p1", "p2", "p3", "p4", "from"] 根据from类别输出p1的箱形图，就是以from为分类标准，将p1列进行分类，对每类输出箱形图不考虑from列，输出..."p1", "p2", "p3", "p4"的箱形图图1 p1的箱形图 ?...图2 "p1", "p2", "p3", "p4"的箱形图 ? Part 2：代码 ?...对每组画出箱形图 data数据源，是一个DataFrame palette色板若将上句替换为sns.boxplot(data=df_1)，对应图2 对比图2和图5，同样的数据不同的可视化展示，想表达的信息也会有区别

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ggplot2分组条形图饼图箱线图

一、分组条形图 x <- read.csv("sv_distrubution.csv",header = T) x # svs % tidyr::pivot_longer(cols...三、箱线图 head(ToothGrowth) ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose) #按提供药物种类分组 ggplot(data = ToothGrowth...+ theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) + theme(legend.position = 'bottom') ggplot2 绘制箱线图加抖动的点...写在最后：有时间我们会努力更新的。...大家互动交流可以前去论坛，地址在下面，复制去浏览器即可访问，弥补下公众号没有留言功能的缺憾。 bioinfoer.com 有些板块也可以预设为大家日常趣事的分享等，欢迎大家来提建议。

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R语言中绘制箱形图的替代品：蜂群图和小提琴图

p=11073 箱形图非常有用，因为它们不仅指示中间值，而且还显示了第一四分位数和第三四分位数的测量结果变化。但是，也有一些图提供了一些附加信息。...在这里，我们将仔细研究箱形图的潜在替代方案：蜂群图和小提琴图。蜂群图原则上，蜂群图类似于一维散点图，因为它将单个测量结果显示为点。...小提琴图的想法是将箱形图和密度图结合起来。...由于该图依赖于密度估计，因此只有在有足够数量的数据可用于获得可靠估计时，该图才有意义。否则，估计的密度可能表示数据中实际上没有的趋势。...另一方面，箱形图显示，实际上只有两个测量值大于60。

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R语言基础绘图教程——第6章:箱形图和韦恩图

R基础教程可先阅读：R语言编程基础第一篇：语法基础 boxplot绘制箱形图部分数据： Value Group 2 a 4 a 3 a 2 a 4 a 7 a 7 a 2 a 5 a 4 a 5 b...ggplot绘制箱形图绘图格式： ggplot(dat, aes(Group,Value))+ geom_boxplot() 这里就不展示了，试试自己绘制一下。...韦恩图数据 ####first generate the test data #a function to generate gene names generateGeneName <- function

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什么是脏数据？怎样用箱形图分析异常值？终于有人讲明白了

箱型图分析箱型图提供了识别异常值的一个标准：异常值通常被定义为小于QL -1.5IQR或大于QU +1.5IQR的值。...箱型图依据实际数据绘制，对数据没有任何限制性要求，如服从某种特定的分布形式，它只是真实直观地表现数据分布的本来面貌；另一方面，箱型图判断异常值的标准以四分位数和四分位距为基础，四分位数具有一定的鲁棒性：...由此可见，箱型图识别异常值的结果比较客观，在识别异常值方面有一定的优越性，如图3-1所示。 ? ▲图3-1 箱型图检测异常值餐饮系统中的销量数据可能出现缺失值和异常值，例如表3-1中数据所示。 ?...运行代码清单3-2，可以得到图3-2所示的箱型图。...▲图3-2 异常值检测箱型图从图3-2可以看出，箱型图中超过上下界的7个日销售额数据可能为异常值。

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外箱标签是怎么制作的

外箱标签设计都较为复杂，无论条码类型还是数据都比较多，且在出库时每个标签上的条码、数字一般都是流水变化的。外箱标签一般包含了供应商、收货人、产品编码、生产日期、发货日期等信息。...下面我们就看看这样的外箱标签是如何制作的。　　启动条码标签软件，新建一个空白标签，设置标签的尺寸。使用矩形和直线工具先绘制一个表格。...01.jpg 　　使用文字工具在标签的相应位置输入文字，输入完成后可以在软件右侧设置文字的字体、字号和颜色等。 02.jpg 　　使用条码工具在标签相应位置画出条码。...软件中可做外箱条码的类型有多种，根据需要选择条码的类型，输入条码的起始数据。也可以在数据来源处选择“由计数器生成”。然后根据需要设置数据起始、步长和位数完成外箱条码标签的制作。...04.jpg 　　以上就是制作外箱标签的方法，其中的信息还可以通过导入数据库批量生成，我们后续会继续介绍。

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山峰图的制作

第一张图是原图，第二张图是模仿图。80%内容是PPT（Excel）自带功能制作。好了，不多说废话，今天通过这个案例主要学习的是如何运用图表中“次坐标轴”。...2.观察图表雏形，发现雏形的三角形都是互相重叠的，但我们要模仿的图表是有先后顺序的。 3.我们利用图表中的次坐标轴解决这个问题，首先打开图表工具中的更改图表类型。...（下图指示更清楚） 4.做一些微调，得到一个更接近原图的雏形实际上，主、次坐标轴的作用，就是把一个图标里的不同内容拆分为两个部分，并以前后的形式表现出来。 5.向图表内复制黏贴图片。...先画一个三角形，然后放在山峰图片的上面，先点击图片，然后在按住Ctrl的情况下点击三角形，进行相交的操作。...（可以想想为什么不直接复制黏贴图片到图表中）然后将得到的山峰三角形复制黏贴到图表中，如此类推再重复同样的操作六次。 6.最后加背景图片和一些坐标轴的修饰就完成了。（是不是结束的太唐突了）

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火箭图的制作

今天我们来做一个很美观的柱形图变形图表——火箭图，效果图如下。 ? 实现这样的图表很简单，核心技术还是前面介绍的复制黏贴大法，只要注意几个关键点就好。话不多说，直接进入教程专题。...首先我们在ppt内插入一个堆积柱状图。 ? 然后去除多余的数据，并准备火箭图标和尾焰图标，利用复制黏贴大法进行元素的替换。 ?...但是我们会发现，火箭图标有很大的变形，很不美观，引起这种现象的原因是火箭图标填充区域的数据不同，为了准确表现数据，系统自动对图标进行了拉伸。...因为火箭在这里主要为装饰作用，所以我们可以让火箭填充的数据完全相同，这样就可以解决变形的问题，而具体的展示数据，则可以用尾焰来表示。 ? 数据比较多时可以用颜色来区分。 ?

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箱线图和它配套的密度图

文字最少的一篇哈哈哈，都是代码！就创建示例数据→画图→拼图，完辽!...Group, y = Value, fill = Group)) + geom_boxplot(alpha = 0.5) + stat_compare_means(label.y = 0)+ #位置换数据要调

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R语言ggplot2分组的小提琴图加箱线图简单小例子

rep("A", 10), rep("B", 10))) set.seed()这个函数大家可能经常会看到这个函数，他的作用是保证自己模拟的数据和示例代码完全一致...作图是用groups做x轴，type填充颜色，每个group分为A，B两组作图的时候和普通的箱线图小提琴图是一样的代码 ggplot(data = df, aes(x = groups, y =...image.png 箱线图的宽度有点大，盖住了背后的小提琴图，把宽度设置的小一点，需要加width参数 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value, fill...image.png 这样就好了，上图每组的小提琴图之间的距离好像有点大，这个也可以用position这个参数调节 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value,...欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本另外还遇到一个问题是 R语言ggplot2作图如果文字标签包含罗马数字，如何输出pdf呢？

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Matplotlib数据可视化：饼图与箱线图

pie() 1.1 pie()方法参数说明 pie()是matplotlib中画饼图的方法，其主要参数如下： ?...1.7 单独设置某一扇形 pie()方法返回一个tuple，第一个元素为每个扇形对象组成的list，第二个元素为每个扇形的标签Text对象，第三个元素为每个扇形的数值标签对象，通过这三个对象，可以实现对单一扇形的设置...boxplot()方法返回值是一个dict，键值包括'whiskers'、'caps'、'boxes'、'fliers'、'means'，分别表示须线、顶端末端线段、箱体、异常数据、均值等绘图对象分别组成的列表...，通过这些对象可以横放把您的实现箱线图各个部分的自定义设置。...多图绘制') ax2.boxplot(muti_data) ax3 = fig.add_subplot(223) ax3.set_title('图3 水平箱线图') ax3.boxplot(data

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PowerBI中的箱型图(box plot)

当然，不同的箱型图，指标也不尽然全都一样，比如PowerBI中的一个可视化工具Box Whisker chart就是其中的一种，又叫做盒须图。所以就用Box Whisker chart来说明。...当然，有一些箱型图并不是按照上面的指标比如下面这张图，它其实没有上下边界，取而代之的是上下1.5个IQR的界限，而有些值超过了上下界限，就定义为异常值（圆圈的位置）。 ?...比如我们选择销售表中的各分公司、销售员和销售额可以得到如下的箱型图： ?...从中可以看出：分公司B的最大值远远超过其他分公司，说明这个月的领头羊就出现在B分公司；而几乎所有的分公司都有新人，销售额为0；均值>中位数，比较明显的有A/B/F；均值的只有G...对于B分公司来说，平均值与中位数差距很大，说明“贫富差距”很大，有几个销售员的业绩特别好，是整个集团的领头羊，而其他的销售员其实和其他分公司没什么区别。

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漏斗图的制作技巧

今天跟大家分享漏斗图的制作技巧！ ▽ 大家可能不经常听到漏斗图这个名字。其实这种图表常见于数据分析报告以及商务演示场合。...制作方法也并不复杂,还是两种方式： ►条形图（传统方式） ►漏斗图（office2016预览版）（对，你没看错，的确是office2016(预览版)，微软在2015年第三季度刚发布的，如果感兴趣可以去微软官网或者各大下载网站下载...我们想要的漏斗图目标数据条应该左右居中的，但是现在的图表目标数据条是靠左的。没关系，右键打开选择数据，将两个数据序列顺序互换。 ? ?...以上就是利用传统条形图来模拟并制作漏斗图的全过程。虽然制作效果还可以，但是毕竟走了很多冤枉路，像小魔方这种平时懒得连自己的佩服的人，肯定不想用这么麻烦的方式花这么就得时间，就为做一个漏斗图。...看，漏斗图瞬间完成，而且默认的数据条间距非常专业，甚至连数据条顺序都是做过优化，不存在条形图数据条顺序与原数据相反的问题。 ? 我们只需要修饰局部图表元素就可以了。

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多分组的PCA图和top基因热图

多分组的PCA图和top基因热图在转录组和蛋白组的差异分析中，我们常常在质控阶段需要做一下样本的PCA图和标准差top 基因的表达，来评价组内差异和组间差异。...以前主要做的二分组的比较，要想把多个分组的信息放在一张PCA图或者热图上，只需修改下Group值就行。...如存在一下蛋白组的测序数据，主要有四个组> colnames(exp) [1] "LFQ.intensity.ChM-FD1" "LFQ.intensity.ChM-FD2" "LFQ.intensity.ChM-FD3...# 2.top 1000 sd 热图---- g = names(tail(sort(apply(exp,1,sd)),200)) #day7-apply的思考题n = exp[g,]library(pheatmap...show_rownames = F, annotation_col=annotation_col, scale = "row", #按行标准化，只保留行内差别，不保留行间差别，会把数据范围缩放到大概

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