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1
回答
错误帕伽索斯包: TypeError: highly_variable_features()得到了一个意外的关键字参数'consider_batch‘
、
我正在使用Pagesus软件包
分析
我的
单细胞
RNA测序
数据
。我遇到了以下错误,使用飞马软件包进行
单细胞
分析
。
浏览 7
提问于2022-04-17
得票数 -2
1
回答
Seurat
数据
可视化
嗨,我正在使用公共
数据
pbmc来练习
单细胞
分析
,我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始,遇到困难,有人能给一个指针吗?非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final,features = features,ncol = 2) FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3
提问于2022-08-11
得票数 0
1
回答
所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞)?
全血管的
单细胞
测序进行
数据
分析
时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞等等),为什么?
浏览 284
提问于2022-01-09
0
回答
RNA velocity图的箭头长短有什么含义吗?
单细胞
测序
分析
方法Velocity的箭头长短有什么含义吗?
浏览 183
提问于2022-01-19
1
回答
如何从GEO
数据
库中提取
单细胞
RNA测序
数据
?
、
、
、
我正在尝试查看已发布的
数据
集,以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI
数据
库中
分析
R上的
单细胞
RNA测序
数据
的材料。这是我试图访问的
数据
谢谢!
浏览 12
提问于2020-04-14
得票数 0
1
回答
更改R中pheatmap中树状图的线宽
我使用存储在
单细胞
实验
分析
中的
单细胞
RNA-seq
数据
,使用R中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类,以显示
数据
的异质性。
浏览 5
提问于2018-05-22
得票数 2
1
回答
( R) Seurat:样品分组
、
我用Seurat软件包
分析
了六个
单细胞
RNA-seq
数据
集。这6个
数据
集是通过每一个不同的10倍运行获得的,然后结合批处理效应-通过Seurat函数"FindIntegrationAnchors“进行校正。同时,在6个
数据
集中,
数据
1、2、3和4属于“未处理”组,而
数据
5和6属于“处理”组。我合并了所有的6个
数据
集与批处理校正,但我也需要比较的特点“未处理”与“处理”。如何将
数据
1,2,3和4分组为“未处理组”,
数据
浏览 15
提问于2020-07-16
得票数 0
回答已采纳
1
回答
单细胞
:如何把想要的cluster提取出来,再进行
分析
?
您好,可以请教您一个小小的问题嘛,我最近也在做
单细胞
,用Seurat把cluster分完了,可是我想要把cluster8和16单独拿出来,在进行
分析
,这个代码要怎么写呢,万分感谢
浏览 570
提问于2021-05-10
1
回答
如何在指定的网格中绘制多个UMAP?
、
我正在使用新的Seurat 3软件包来
分析
单细胞
测序
数据
。我已经合并了18个Seurat对象,并将单独的标识符保存在meta.data中。
浏览 3
提问于2018-12-11
得票数 2
1
回答
如何更改Seurat Dimplot的默认配色方案?
、
尊敬的世界各国专家: 您好,我正在使用Seurat
分析
集成的
单细胞
RNA-seq
数据
。我确认了Dimplot的默认配色方案,如下所述。 show_col(hue_pal()(16)) ? 它成功地更改了Dimplot中的颜色,但此更改后的调色板不适用于下游
分析
(例如DoHeatmap中的簇标签栏)。,'12'='#A4DFF2','15'='#4B4BF7','13'='#AC8F14',
浏览 3233
提问于2020-09-13
得票数 0
1
回答
用定义的细胞群绘制X轴上基因的小提琴图
、
、
这与
单细胞
RNA测序
数据
分析
有关. 是否有可能创造一个小提琴图,在X轴上有基因,Y轴上有归一化表达,而不是X轴上的簇或细胞类型,Y轴上有基因,而选择
分析
的细胞是用户定义的?
浏览 11
提问于2022-10-01
得票数 0
回答已采纳
3
回答
安装Seurat -R
单细胞
基因组工具包
、
、
我是R的新手,并试图安装Seurat来
分析
我的基因组
单细胞
数据
。但是,我想使用Seurat (),但是在安装软件包时遇到了困难。
浏览 3
提问于2015-08-03
得票数 1
1
回答
如何解决状态为非数字的addPerCellQC错误?
、
我的工作是R
分析
单细胞
RNA序列
数据
。我目前正在尝试将QC
数据
添加到我的SingleCellExperiment (sce)对象中;mito_genes、ribo_genes和ERCC_genes包含由执行的这些特定基因的行位置将QC
数据
添加
浏览 25
提问于2021-02-21
得票数 0
1
回答
如何从单元格中提取所需的文本
、
、
、
、
如下面所示,我在
单细胞
中有这些
数据
,所以我只想要车号。 📷
浏览 0
提问于2021-02-24
得票数 0
2
回答
如何在slotname @data中从seuratobject中筛选基因?
、
、
、
我正在使用一个名为"Seurat“的R包进行
单细胞
RNA-Seq
分析
,我试图从插槽名'data‘中删除seuratobject (s4类)中的几个基因。这个对象中还有几个插槽,它们存储与插槽‘
数据
’相关联的信息。插槽‘
数据
’在行中有基因名,在列中有单元ID,其基因的表达值对应于矩阵中的每个单元。我希望根据唯一的基因名称删除整行,但在对象中保留结果。
浏览 4
提问于2018-01-10
得票数 1
回答已采纳
1
回答
需要在apache poi中的
单细胞
中创建指数
数据
(数字)而不使用paragraph.break
、
我正在构造一个8列的行,需要在apache中以
单细胞
形式创建指数
数据
(Number),而不需要使用paragraph.break。
浏览 3
提问于2019-11-04
得票数 0
回答已采纳
1
回答
文本选择不适用于单个单元格-NG2表
、
、
、
这是angular2的
数据
表,由Valor软件编写。 我试图通过鼠标单击和拖动(!重要-
单细胞
内)选择
单细胞
中的文本。
浏览 3
提问于2017-04-14
得票数 0
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1
回答
单细胞
分析
中的叠加条形图
、
、
ggplot() + geom_bar(aes(y = percentage, x = TBD, fill = TBD), data = charts.data, stat="identity") 我想为我的
单细胞
分析
创建一个条形图
浏览 3
提问于2020-01-11
得票数 0
1
回答
单细胞
内的Cognos
分析
多重测度
、
、
、
是否有可能在一个交叉表单元中放置多个度量?例如,在一个单元格中放置一个2x2表,并在表的每个单元格中删除一个度量值?我尝试过这样做,而值只是跨行重复。
浏览 2
提问于2020-06-05
得票数 0
回答已采纳
6
回答
JavaFX TableView如何获取小区
数据
?
、
、
tableView.getSelectionModel().getSelectedItem() 我是说把S20BJ9DZ300266作为字符串?
浏览 16
提问于2015-03-17
得票数 12
回答已采纳
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