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浙江大学提出最新全自动高通量系统

超快光催化合成与表征 图 1 作者设计并构建了一种新型微流体光催化微反应器,采用液芯波导(LCW)技术将高强度激光光源引入光催化反应通道,以显著提高光催化反应速度(图1A)。...AI辅助的超高通量光催化合成与筛选 稳态与非稳态实验模式 图 3 在高通量筛选不同反应条件的实验中,当前一个反应条件的合成与表征完成后,需要将新反应溶液引入反应器和检测流动池通道。...在上述稳态模式下的光催化筛选实验中,激光持续照射微反应器通道,系统大部分时间(每次实验循环的32秒中有27秒)用于切换不同实验条件并等待稳态检测信号(例如图3A2)。...如果采用传统间歇式光催化合成的手动模式完成相同工作量,需2000个有机合成器工作1天,或1个合成器工作2000天(假设每人每天完成5个条件筛选实验)。...较高的流速意味着更高的通量,但反应溶液在光催化微反应器中的停留时间(即光照时间)较短,导致较低的反应收率。

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JACS|一种支持机器学习的开源化学反应数据库

随着时间的推移,从单个容器中取出多个样品或等分试样的动力学分析实验,由一个反应和几个不同的结果描述,每个结果都有自己的分析和产品信息;如果每个时间点使用不同的反应器,则这些反应被描述为不同的反应。...具有不完整中间分离的反应序列(例如,一锅反应或伸缩反应序列)通过将一个步骤的乘积视为后续步骤的"粗"输入来链接。...如果数据集与期刊或专利文章无关,则审稿人只能检查内部一致性和完整性,并且必须信任提交者提供正确的结构和技术细节。随着ORD提交率的增长,我们预计招募更多的志愿者评审员,并根据需要调整评审流程。...如果发现数据质量问题或差异,我们将要求原始提交者帮助修改或审核任何建议的更改。 架构的进化 ORD架构是一个"活文档",它将改变并适应其用户和社区的需求。...在其他情况下,几乎从未使用的结构化字段可能会被弃用并删除。我们将使用版本控制和迁移过程来确保在不中断固定到早期版本的数据和代码的现有工作流的情况下,部署向后不兼容的更改(如果有)。

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    基于AI的连续流反馈系统加速化学反应开发

    在这个系统策略中,自动反馈与液滴微流体中的高通量反应筛选相结合,液滴在一个全自动的微流控系统中进行反应,并通过LC/MS进行在线分析。...然而,如果反馈系统被设计为确定内在反应速率,例如在快速传热和传质以及微尺度流动系统中发现的低分散的条件下,黑盒优化的结果仍然有很大的实用价值。...将反应动力学和反应热叠加在先进流动反应器中,可以实现500倍的放大倍数。...相比之下,包含三烷基膦配体L5、L7和二烷基联芳基膦配体L1、L2和L3的预催化剂,由于其良好的电子供体性质,即使在氯底物存在的情况下,也能继续促进氧化加成。 图9:(a)预催化剂选择频率。...鉴于系统能够在没有先验信息的情况下区分催化剂,作者预计这种方法和化学信息学工具将最终成功实现对离散变量的共享属性的自动解释,在未来为更智能的筛选和机制开发提供指导。

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    治疗性抗体开发中的深度学习

    但是在一般蛋白质行为建模方面的成功和早期的抗体模型表明了这种可能性,特别是由于抗体有一个共同的折叠。...分子建模方法的准确性对变量预测施加了随机噪声和系统偏差,而分析者则对所选择的特征施加了他们的偏差。...在工艺行为预测中,有两个有希望的方面是使用毫升规模的生物反应器来收集生产力数据和小规模的纯化实验。Gagliardi等人展示了一个使用这种小规模生物反应器系统进行生产力预测的例子。...通过定制一个高通量细胞培养系统,以模拟灌注的形式运行,Gagliardi等人在10-15毫升规模的生物反应器中操作了24-48个生物反应器,这些生物反应器可以预测10L灌注培养中的克隆性能和介质效应。...深度学习中的每一个中间成功都是有用的,但道路是漫长的。如果业界继续专注于引导这些努力,提高抗体生物治疗的质量和成本,深度学习就会产生影响。

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    很多工作10年都讲不清楚,Redis为什么这么快,5k字长文给你讲透!

    ,则它将自动切换到client->reply链接列表,理论上可以容纳无限数量的数据(受机器物理内存限制)最后,将client添加到LIFO队列clients_pending_write。...,如果写缓冲区中仍然有剩余数据,则注册sendReplyToClient命令到连接的回复处理器,等待客户端写入后继续在事件循环中写回剩余的响应数据。...但如果要删除具有数百万个对象的非常大的键值对,则此命令可能会阻塞至少几秒钟,由于事件循环是单线程的,它会阻塞随后的其他事件,从而降低吞吐量。...但这个解决方案存在一个致命的缺陷:如果其他客户端继续写入正在逐步删除的键,而且删除速度跟不上写入的数据,那么内存将无休止地被消耗,这个问题通过一个巧妙的解决方案得以解决,但这个实现使Redis更加复杂。...如果客户端写缓冲区中还有数据,它将注册sendReplyToClient以等待连接的写准备就绪事件,并等待客户端写入,然后继续在事件循环中写回剩余的响应数据。

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    盘点 | 从单目标优化到多目标优化,3D 打印材料开发进入 100X 倍速阶段

    开发成功的机器学习模型,需要特定材料的归纳偏置 (inductive biase),这要求输入必须是具备一定格式或规律的,比如我们可以用 2D 图结构来表示分子,用序列表示蛋白质,这在材料领域是无法实现的...结合贝叶斯优化和高通量自主实验,科研人员开发了一个贝叶斯实验自动研究员( Bayesian experimental autonomous researcher,简称 BEAR ),除快速实验外,BEAR...(microfluidic reactor),用于筛选锆茂(zirconocene,一种化合物)催化剂,并结合拉丁超立方算法,提高催化剂的开发效率。...锆茂金属催化剂自动热成像微反应器系统工艺流程图 在实验过程中,科研人员提出了一个用机器学习辅助自动显微化学反应器 (machine-learning-assisted auto mated microchemical...这种方法有望轻松地推广到其他材料设计系统并实现材料的自动发现。

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    LLM与多智能体驱动的化学合成开发平台:从文献搜索到产品纯化的全自动化

    底物范围与条件筛选 实验设计智能体和硬件执行智能体自动化了高通量筛选(HTS)实验,帮助研究人员快速确定最佳反应条件。...通过自动化平台,研究人员能够在短时间内完成大量实验,并利用光谱分析智能体自动分析实验结果。...反应放大与产品纯化 实验设计智能体帮助研究人员制定了反应放大策略,并指导了产品纯化过程。分离指导智能体通过迭代实验确定了最佳洗脱剂组成,成功分离出高纯度的目标产物。...光氧化还原C-C交叉偶联反应的条件优化 通过LLM-RDF,研究人员自动化了光氧化还原反应的条件优化过程,成功找到了最佳反应条件,显著提高了产物收率。...异相光电化学反应器的放大设计 LLM-RDF帮助研究人员设计了多电极阵列策略,优化了光电化学反应器的电流分布,解决了大规模合成中的电流不均匀问题。

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    Nat Biotechnol | 杨弋团队报道RNA光遗传学工具,可时空精确操纵活细胞RNA代谢与功能

    针对这一亟需解决的技术挑战,2022年1月3日,华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室、光遗传学与合成生物学交叉学科研究中心杨弋教授团队在Nature Biotechnology杂志上在线发表了题为Optogenetic...该研究基于合成生物学及光遗传学原理并结合全新的高通量筛选策略成功构建了系列光控RNA效应因子,实现了动物细胞内RNA生成、剪接、运输、翻译、降解等代谢活动的时空精密控制。...其中,利用合成生物学方法来进行光可控功能蛋白质分子的设计与筛选,并获得简单易用的光遗传学技术,是光遗传学前沿领域最重要的热点之一。...图:RNA光遗传学控制概念图 为了实现RNA结合蛋白的光遗传学控制,研究团队首先基于合成生物学理性设计并结合全新的高通量筛选策略,构建了国际上首个人工合成的光控RNA结合蛋白LicV。...原文链接: https://doi.org/10.1038/s41587-021-01112-1 责编 | 兮 排版:BioArt

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    单细胞测序的微流控技术应用

    微流体技术在分析样品方面具有多项优势: 首先,微流控芯片的结构和功能设计灵活,可以满足单细胞分析的需求 其次,典型的微流体通道具有几十到几百微米的尺寸,可以处理从皮升到纳升的溶液体积,从而减少样品损失和高灵敏度,并使高通量单细胞分析成为可能...该方法成功地保持了细胞形态和结构,并保留了空间位置信息 FACS 系统通过在各种类型的流式细胞仪中用荧光标签标记细胞的特定表面分子,细胞流快速通过激光束以提供光激发,然后下游的光检测器用于捕获具有特定信号的细胞...基于液滴的微流体封装单个细胞并提供理想的微反应器,每个液滴在功能上相当于微孔板中的一个孔,但反应体积小一百万倍。每秒可以产生数千个单独的隔室,表面活性剂用于降低表面张力并防止液滴融合。...此外,由于微反应器的数量不受芯片物理尺寸的限制,液滴本质上是可扩展的。 液滴是通过使用两种不混溶的流体,载体流体( carrier fluid)和分散流体(dispersed fluid)产生的。...Drop-seq 倾向于使用条形码珠( barcoded beads),而 inDrop 则使用条形码水凝胶微球(barcoded hydrogel microspheres)。

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    【Netty】主从反应器 ( Reactor ) 多线程模型

    , 如果监听到客户端的数据发送事件 , 将对应的业务逻辑转发给 处理器 ( Handler 进行处理 ) ; 3 ....从反应器监听客户端数据上传并进行相应处理 : ① 监听客户端数据上传事件 : 从反应器 ( SubReactor ) 调用 select 方法 , 监听其管理的客户端连接 , 如果客户端有数据上传 ,...会触发事件 , 从反应器就会调用该客户端连接对应的 处理者 ( Handler ) 处理事件 ; ② 读取数据并分发事件 : 处理者 ( Handler ) 处理事件 , 首先调用 read 读取客户端上传的数据...NioEventLoop 作用 : 在每个 NioEventLoop 中 , 都有一个 Selector , 该 Selector 作用是循环监听 IO 事件 , 如果监听到 IO 事件 , 就处理该...IO 事件 , 然后更新处理任务队列 , 然后继续监听 ; 3 .

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    mLife|华东师范大学张鲁嘉团队:高效的酶智能设计平台NAC4ED

    如果即将形成新化学键的个原子之间的接触距离小于它们的范德华半径之和,并且键角与过渡态相近,则该构象被认为是活性的,这些构象被称为NAC。...成功定义活性构象模型后,通过分子动力学模拟比较了野生型(WT)和LW202 Michaelis复合物中的活性构象群体。...如果对接结果符合NAC的标准,则该过程进入MD模拟。(D) MD模拟模块。通过模拟,分析突变体随时间变化的活性构象比,并计算其催化效率。...高效筛查突变 在NAC4ED平台的支持下,研究人员继续以EHs为研究目标进行研究,但本研究旨在对未知突变进行高通量筛选,并通过实验验证,获得新的高适应性突变体,评估NAC4ED平台的高通量筛选能力和所选突变体的适应性...利用NAC4ED平台建立了TrEH的自动近攻击活性酶构象模型,生成突变并分析突变后活性构象群体的变化,以反映各突变体与底物的结合状态。TrEH的高通量筛选工作流程包括几个步骤。

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    Linux内核与DPDK-HTTP 性能对决(Linux Kernel vs DPDK: HTTP Performance Showdown)

    我将以我之前的性能调优帖子中的许多想法和技术为基础,因此在继续之前至少阅读概述部分可能是值得的。...您可以单击一个细分以深入了解更详细的视图,或者您可以搜索(Ctrl + F 或单击右上角的链接)函数名称。...请注意,每个完整的火焰图都捕获了四个几乎相同的堆栈,代表 4 个反应器(reactor)线程(每个 vCPU 一个),但在整个帖子中,我们将主要关注分析单个反应器/vCPU 的数据。...该函数等待反应器的 _task_quota_timer 到期,然后通过调用 request_preemption() 中断主线程。...如果要修改设备设置,则必须在启动前或通过应用程序进行。 如果要捕获指标,则必须配置应用程序才能执行此操作; 即时进行故障排除要困难得多。

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    在机器人骨架上培养活细胞:将人类细胞放入「生物反应器」,再给点营养液

    但是,来自牛津大学和机器人公司 Devanthro 的研究人员认为,如果想要培育出能够像肌腱或肌肉一样运动和弯曲的组织,最好是尽可能准确地重现它们的自然生长环境。...为了研究类人生物反应器的可行性,牛津大学设计了一个柔性的生物反应器腔室,它可以连接到改良肌肉骨骼(MSK)的类人机器人肩关节。...这与图 4j 中所示的细胞增值数据一致,并通过样品冷冻切片的组织学染色得到进一步证实。 研究者在静态对照中观察到了最快的细胞增殖,在 LFR 下观察到的增殖速度稍慢,在 HFR 下观察到的细胞群减少。...类人生物反应器策略的潜在应用和影响 研究者展示了使用 MSK 类人机器人通过在柔性生物反应器腔室中培养细胞来支持肌腱组织工程的可行性,其中生物反应器可以在类人机械臂上进行机械刺激。...参考链接: https://www.theverge.com/2022/5/26/23142769/tissue-engineering-growing-cells-mobile-robot-skeleton

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    BIO与反应器模式

    比如说,当我们最开始使用Java编写网络请求,都是建立一个ServerSocket,它负责绑定IP地址,启动监听端口;然后,Socket负责发起连接操作,连接成功建立后,双方通过输入输出流进行同步阻塞式通信...;如果没有成功建立,要么等待,要么被拒绝。...该模型最大的问题就是缺乏弹性伸缩能力,当客户端并发访问量增加后,服务端的线程个数和客户端并发访问数呈1:1的正比关系,Java中的线程也是比较宝贵的系统资源,线程数量快速膨胀后,系统的性能将急剧下降,随着访问量的继续增大...,系统最终就死掉了 反应器(reactor)模式 使用单线程模拟多线程,提高资源利用率和程序的效率,增加系统吞吐量 一个老板经营一个饭店,传统模式:来一个客人安排一个服务员招呼,客人很满意;(相当于一个连接一个线程...反应器(reactor)模式诞生了饭店的生意红红火火,几个服务员就足以支撑大量的客流量,老板用有限的资源赚了更多的MONEY

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    哈佛大学让青蛙断腿再生:有骨头有血管,对刺激物还会产生强烈踢腿反应

    但现在,来自美国塔夫茨大学和哈佛大学的科学家们,成功让原本也不能自然再生的青蛙长出了后肢。 这个新后肢,不仅包括皮肤和骨骼,血管和神经组织也一个都不少。...在这项实验中,研究人员首先在青蛙断肢处装上一个硅胶制的生物反应器。...反应器内含有丝基水凝胶(silk-based hydrogel),里面提供了五种混合药物,分别可以预防炎症、抑制生成可能导致瘢痕的胶原蛋白,以及促进神经纤维、血管和肌肉这三种组织的生长 (BDNF、1,4...除此之外,还有两个对照组,一组只在24小时内给青蛙们装上只含有丝基水凝胶、不含任何药物的反应器(BD组),另一组则什么都不装,直接进入生长室(ND组)。...论文地址: https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abj2164 参考链接: https://www.eurekalert.org/news-releases

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    原子弹的入门到精通

    最后,把有螺纹的盖子套在管子上头,等到它能旋得松紧自如时,再将它拿下来,在它上面钻一个洞,使能容得下引爆的装置杆;装置杆则留下6~8寸长露出洞口,杆上并恰留钻一个钉孔。...然后,将TNT或炸药涂在一个碟子上(最好是咖啡壶中过滤器的底座),再塞进去,并插进一两个雷管。这放在引爆装置杆的四周,再由一两条引线连出来到外面,然后把它旋紧,原子弹就大功告成了。...反应器的铀大约含3%的铀235(自然界铀则只含0.5%的铀235),做原子弹的铀则需要97%的铀235,否则根本不BOOM。...如果你觉得此路不通,还有其它的办法。你可以在树林里建个滋生反应器(BreederReactor),用铀来作钸,再用化学上的技术分离即可。...因此,若能有愚公移山之志,或可成功,祝你好运!

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    牛津大学团队采用先进机器人技术,推动「人造肌腱」实际应用

    论文地址: https://spj.sciencemag.org/journals/cbsystems/2022/9842169/ 文初,研发团队回顾了当前的肌腱组织工程发展,并指出传统的生物反应器存在输出单一...图.肌腱组织工程发展趋势 先进机器人技术在肌腱组织工程里的应用 在20世纪80年代医学领域成功引入机器人技术之后,大量有关研究使医疗机器人发展迅速,但刚性医疗机器人仍存在柔性度不足等难以突破的局限性问题...如果将软体机器人与传统刚性机器人共同协作可为医学治疗提供更多解决方案,提高医疗效率。 具体而言,在肌腱组织工程当中,人体的肌腱存在被拉伸、压缩、扭转和剪切的应力。...因此,研究团队利用类人骨骼机器人被提出作为新型生物反应器,从而可以很好模拟人体肌肉的多种激励,以更好协助研究人员设计人造肌腱。 图. ...诸如肌腱组织工程的复杂应用环境里,可以通过采用先进机器人技术来设计相关应用并使其成功落地。

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    下载NCBI SRA数据的最佳方法

    高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。当我们需要用到这些数据的时候,就需要合适的方法来下载。...curl 命令直接下载 NCBI官方的 SRA Toolkit 进行下载 很多教程建议使用 aspera 来实现高速下载,但是很多时候折腾配置了很久,结果下载并不稳定或者由于端口或者网络代理等原因没有能成功下载...用它们来下载小数据是十分合适的,但是对于动辄以GB 甚至TB来计数的高通量数据,wget的优势就并不明显了。如果程序中断,或者网络原因下载中断,你又得重新下载。...使用如下命令批量下载 (放入后台不中断下载:nohup cmd &): nohup prefetch -O ....如果你有其他的更好的下载方法,欢迎留言或者私信后台交流~ 参考: https://github.com/ncbi/sra-tools https://github.com/ncbi/sra-tools

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    深入浅出AQS之独占锁模式

    获取锁的过程: 当线程调用acquire()申请获取锁资源,如果成功,则进入临界区。 当获取锁失败时,则进入一个FIFO等待队列,然后被挂起等待唤醒。...当队列中的等待线程被唤醒以后就重新尝试获取锁资源,如果成功则进入临界区,否则继续挂起等待。 释放锁过程: 当线程调用release()进行锁资源释放时,如果没有其他线程在等待锁资源,则释放完成。...,即如果是正常唤醒则返回false,如果是由于中断醒来,就返回true return Thread.interrupted(); } 看acquireQueued方法中的源码,如果是因为中断醒来...不管是正常被唤醒还是由与中断醒来,都会去尝试获取锁资源。如果成功则返回中断标记,否则继续挂起等待。...,继续挂起,由于这次的中断已经被清除了,下次如果是被正常唤醒,那么acquireQueued方法就会返回false,表示没有中断。

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    Scrapy源码解读

    reactor反应器知道网络、文件系统和计时器事件。它等待并解复用这些事件,并将它们调度到等待的事件处理程序。 A transport传输表示通过网络通信的两个终结点之间的连接。...生成器总是在每个 yield 语句后暂停直到被显示的重启.因而我们可以延迟它的重启直到 deferred 被激发, 届时我们会使用send 方法发送值(如果 deferred 成功)或者抛出异常(如果...Engine发送请求给Downloader(下载器,负责在网络上下载数据,输入待下载的 URL,输出下载结果),如果有配置Downloader middlewares,则接着调用中间件 Downloader..._needs_backout()来控制爬取速度,如果没有获得新的地址或者资源已用满,就等待 如果是起始的链接,使用scheduler.enqueue_request将request放入队列 _next_request_from_scheduler...如果有新的链接,就发送请求,通过dwld.addBoth(_on_complete)完成回调。

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