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我有一个用于训练DL TensorFlow模型的Snakemake工作流。在高层次上，有一些运行时间较长的作业(模型训练)可以并行运行。我想在云上运行这些，因为我可以，所以dask-cloudprovider似乎是一个很有前途的选择。要做到这一点，我是否必须使用Dask函数(可能是dask delayed)重写我的工作流？或者有什么方法可以让Snakemake使用Dask？
浏览 18提问于2020-05-06得票数 3
可以使用来自同一个工作目录的两个不同的信任来运行snakemake管道吗？
这里的配置文件将有一个“项目名称”参数，该参数将定义管道的输入和输出路径。由于snakemake锁定了工作目录，所以我想知道在同一个工作目录中使用不同配置文件运行相同的管道是否会导致一些冲突。如果是，对这种情况是否有可行的替代战略？
浏览 1提问于2018-04-23得票数 1
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自定义Dask调度程序与客户端
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我希望在自定义调度程序上运行Dask任务，类似于Ray上的Dask工作方式。目前，我正在使用Dask的配置来指定调度程序：这种方法适用于简单的Dask dataframe操作，如下面这样的操作客户端的东西，例如XGBoost培训，都不使用自定义调度程序。在XGBoost中使用客户机的需求迫使我以某种方式将Dask客户端指向my_custom
浏览 3提问于2021-07-01得票数 0
我正在使用modin读取sql表，但是我收到了以下警告 import pyodbc from sqlalchemy importHosting the HTTP server on port 57475 instead 我是新用户modin，不知道发生了什么，Jupyter Lab慢了5分钟，然后加载了数据帧，有什么建议/建议吗？
浏览 53提问于2021-04-12得票数 0
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.S1) --> S2 (speed=5) --> S3 (height=12) --> S4这将使用朴素方法的计算从20个步骤减少到13个步骤，包含3个转储和4个负载。倾销后Run1提交run4，倾销S2后提交run2和run3，倾销S2后run4提交run5。使用此解决方案，在向Slurm提交作业时声明依赖关系是否有意义？从用户的角度来看，所有作业都提交并链接到依赖项(例
浏览 3提问于2019-11-02得票数 1
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pip支持在从互联网安装Python包的同时安装额外组件，例如，pip install "dask[all] @ git+https://github.com/dask/dask"
但是，它支持从本地Python包安装时安装额外的组件吗？例如，如果我将dask Python包下载到本地，如何使用特定的额外组件安装它？
浏览 3提问于2021-03-09得票数 0
Snakemake需要一个有效的-N调用
我发现影响职务名称的only方式是使用-职务名称。我通常的电话是：1)如果我使用no att
浏览 2提问于2017-05-25得票数 0
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我在达克上读到：
分布式系统是否只对客户端/服务器通信使用旋风，并有单独的进程/线程来运行dask任务？实际上，dask-worker有--nprocs和--nthreads参数，
浏览 3提问于2016-10-04得票数 4
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这里没有经验，自认为是“编码器”，所以请理解:]假设我想使用fastqc工具分析一组4个.fastq文件。实例(很容易同时运行我所
浏览 0提问于2018-06-25得票数 1
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对于每幅图像，我将使用dask并行阵列运行滤波(高斯和拉普拉斯)，以加快处理速度()。我将通过apply_parallel()函数在scikit-映像中使用dask数组。我将使用20 cpus在小型服务器上运行处理。--我想得到一个建议，建议使用哪种并行策略更有意义：2)用h5内核并行处理x文件，并使用剩余的20-x进行dask</
浏览 6提问于2016-02-10得票数 2
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我正在尝试使用python函数处理一些文件，并希望使用dask在PBS集群上并行化任务。在集群上，我只能启动一个作业，但可以访问10个节点，每个节点有24个核心。所以我的dask PBSCluster看起来是这样的：from dask_jobqueue import PBSCluster
浏览 0提问于2019-05-26得票数 1
现在，我使用snakemake集群来执行我自己的k8s。当提交任务时，命令如下所示：简短的lsub脚本逻辑：
从snakemakesubmita k8s作业中读取参数的是通过: cat <<EOF \ kubectl创建-f - xxxxxxxx EOF (来自snakemake的原始子步骤shell包括在xxxxxxxx中的命令部分)。由于k8s环
浏览 7提问于2022-04-11得票数 0
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我希望我的应用程序能够使用来自我的客户Azure AD的外部用户池，而不是当他们已经在Azure AD中创建我的应用程序中的每个用户的时候。最初，我认为只使用OIDC来实现这一点，因为我可以在第一次登录时在我的应用程序中创建用户。但是OIDC不允许我在Azure AD中删除应用程序中的用户时注销和禁用它们。为了解决这个问题，我认为我可以将OIDC和SCIM结合起来：
Azure AD通过端点将用户提供给我的应用程序。把SCIM和OIDC一起使用有意义吗
浏览 1提问于2021-01-27得票数 2
我有一个对象列表，存储在arrayController中，并使用#each宏呈现在视图上 {{view App.ItemView}}
{{/
浏览 0提问于2012-06-26得票数 1
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我们有很多数据，决定使用mongodb，它工作得很好。
我们开始在我们的实时应用中使用redis来跟踪活跃用户。我们还开始用redis做一些pub/sub频道的事情。我们的下一步行动可能是使用mongodb来处理休眠数据，使用redis来处理活动数据。例如，我们所有的用户都存储在mongodb中，但当他们登录时，我们会将该数据的副本移动到redis，以便快速访问。我们还将他们的游戏活动等内容存储在redis中，并相应地使用这些数据。当用户注销时，我们将在mongo中保存所需的任何内容，直到再次需
浏览 1提问于2011-07-26得票数 5
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多处理与Dask
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Dask :，我正在使用Dask并行化读取和计算。cluster = PBSCluster(cores=1,processes=1,memory='70GB',queue='extra',pro
浏览 5提问于2021-03-17得票数 1
1回答
这是我正在使用的代码：import dask_mlfrom dask_ml.model_selection import train_test_splitimport xgboost
import dask_xgboost我分析了可用的仪表板，我注意到我的代码一直在增
浏览 2提问于2021-05-01得票数 0
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