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R中优雅的绘制物种冲积图

最近有朋友问R中绘制冲积图的代码,其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线;案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...) + # 根据group变量进行网格分面,设置自由的x轴和y轴刻度,自由的x轴间距 labs(x = NULL, y = NULL) + # 设置x轴标签和y轴标签为空 scale_fill_simpsons...x轴线的颜色为黑色 axis.line.y = element_line(color = "black"), # 设置y轴线的颜色为黑色 axis.text.x = element_text...= element_text(margin = margin(r = 10), size = 11, color = "black"), # 设置y轴标题的边距、大小,颜色为黑色 panel.grid.major.x...(), # 设置分面标签背景为空白 strip.text = element_text(color = "black", face = "bold"), # 设置分面标签文本的颜色为黑色,样式为粗体

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    R中优雅的绘制物种冲积图

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R中绘制冲积图的代码,其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线;案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...) + # 根据group变量进行网格分面,设置自由的x轴和y轴刻度,自由的x轴间距 labs(x = NULL, y = NULL) + # 设置x轴标签和y轴标签为空 scale_fill_simpsons...x轴线的颜色为黑色 axis.line.y = element_line(color = "black"), # 设置y轴线的颜色为黑色 axis.text.x = element_text...= element_text(margin = margin(r = 10), size = 11, color = "black"), # 设置y轴标题的边距、大小,颜色为黑色 panel.grid.major.x...(), # 设置分面标签背景为空白 strip.text = element_text(color = "black", face = "bold"), # 设置分面标签文本的颜色为黑色,样式为粗体

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    R中优雅的绘制环状sina图

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    如何在R中绘制树图(TreeMap)

    树图(TreeMap) 通过矩形面积的大小,以及填充颜色的深浅,来显示节点的统计数据,通过嵌套层次来显示分组的层级的可视化图形。...for example: 某公司产品在世界六大洲的销售情况,矩形的大小表示人口的数量,颜色的深浅表示销售额的多少。 ? 那么如何绘制树图呢?...首先绘制树图需要的包: install.packages(“treemap”) 树图函数: treemap(x,index,vSize,vColor,palette,range,border.col...,type=”value”) x 数据框 index 进行分组的列 vSize 指定面积大小的列 vColor 指定颜色深浅的列 palette 颜色的范围向量 range...("treemap", repos='http://cran.r-project.org') library(treemap) data <- read.csv('data.csv', stringsAsFactors

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    R中绘制环状聚类热图

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友需要绘制环状热图叠加多层注释,本节来通过一个例子来简单介绍一下如何实现,主要通过「ggtreeExtra」来实现,聚类分析使用「ape」包来进行更加适用于生物信息相关的数据...❞ 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇:凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们,「将自动获得2024年及以后的绘图资料和代码更新,无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+,质量方面各位无需担忧**。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容,2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggnewscale...RdBu")))+ new_scale_fill()+ geom_fruit(data=group,geom=geom_tile, mapping=aes(y=id,x=

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    R中轻松绘制聚类热图

    论文 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇:凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们,「将自动获得2024年及以后更新的绘图文档代码,无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+,质量方面各位无需担忧。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容,2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggtreeExtra...layout_fan(angle =90)+ geom_fruit(data=gene_exp,geom=geom_tile, mapping=aes(y=name,x=...Tissue,fill=value),pwidth=2, axis.params=list(axis="x",text.angle=-90,text.size=2.6,hjust

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    Mybatis中的动态sql语句 if标签 where标签 foreach标签 sql标签

    Mybatis中的动态sql语句 首先写个方法 /** * 跟进传入参数条件查询 * @param user 查询的条件:有可能有用户名,有可能有性别,也有可能有地址,还有可能都有...* @return */ List findByCondition(User user); if标签 对应resource中也要添加 <!...89 OR id=16) SELECT * FROM USERS WHERE username LIKE ‘%张%’ AND id IN (10,89,16) 这样我们在进行范围查询时,就要将一个集合中的值...标签用于遍历集合,它的属性: collection:代表要遍历的集合元素,注意编写时不要写#{} open:代表语句的开始部分 close:代表结束部分 item:代表遍历集合的每个元素...Sql 中可将重复的 sql 提取出来,使用时用 include 引用即可,最终达到 sql 重用的目的。

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    是Excel的图,不!是R的图

    R作为可视化的大势,自然也可以画出这些图,有一篇就通过ggplot2包进行了部分总结,甚是有趣,小编复刻学习了一番,现对代码做简单注释,以作分享。...饼图 饼图,将一般的柱图进行直角坐标轴到极坐标轴的转换(coord_polar()) ggplot(df,aes(x=factor(1),a,fill=factor(var)))+ geom_bar...复合饼图和复合条饼图 有嵌套类时,可以衍生一个图形展现子类内容,下图是一个demo,仅作为图案参考样式,还有许多需要改进的地方 df_tmpx=1,y=1) #准备画布所需数据...其他圆形图 用coord_polar作出的demo图 demo1x = factor(1),a,fill=factor(var)))+ geom_bar(stat=...气泡图 气泡图即点的大小表示数值大小的点图 ggplot(df1,aes(id,value,colour=item))+ geom_point(aes(size=value))+ scale_x_continuous

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    maven中的dependencyManagement标签

    使用pom.xml中的dependencyManagement元素能让所有子项目中引用一个依赖而不用显示的列出版本号。...maven会沿着父子层次向上走,直到找到一个拥有dependencyManagement元素的项目,然后它就会使用这个dependencyManagement元素中指定的版本号。...:如果有多个子项目都引用同一个依赖,则可以避免在每个使用的子项目里都声明一个版本号,这样当想升级或者切换到另一个版本时,只需要在顶层父容器里更新,而不需要一个一个子项目的修改;另外如果某个子项目需要另外的一个版本...3、总结 dependencyManagement里只是声明依赖,并不实现引入,因此子项目需要显示的声明需要用的依赖。...,那么会使用子项目中指定的jar版本。

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