本文介绍基于R语言中的raster包，批量读取多张栅格图像，对多个栅格图像计算平均值、标准差，并将所得新的栅格结果图像保存的方法。 ...在文章R语言raster包读取栅格遥感影像中，我们介绍了基于R语言raster包，对单张或多张栅格图像加以平均值、标准差计算的方法；但这一篇文章中的标准差计算方法仅仅可以对一张栅格图像的全部像元加以计算...首先，我们按照文章R语言raster包读取栅格遥感影像中提到的方法，配置、加载raster包，并通过stack()函数读取同一文件夹下的全部栅格图像，具体代码如下所示。...当然，前述提到的文章R语言raster包读取栅格遥感影像中的方法也是可以对多个栅格图像计算平均值的。...tif_sd <- calc(tif_file_all, fun = sd) plot(tif_sd) 此外，上述代码在calc()函数运行时，若某一空间位置上的像元在多张栅格遥感影像中，存在至少一个无效值
本文介绍基于R语言中的raster包，遍历文件夹，读取文件夹下的大量栅格遥感影像，并逐一对每一景栅格图像加以拼接、融合，使得全部栅格遥感影像拼接为完整的一景图像的方法。 ...)代码，导入本文所需的R语言raster包；关于这一包的配置，大家可以参考R语言raster包读取栅格遥感影像。...其中，在本文中我们需要指定mosaic()函数的fun参数与na.rm参数，二者分别是指拼接时重叠区域像元值的计算方法，以及计算重叠区域像元值时，是否考虑NoData值的影响；我们将这2个参数分别设定为...max与TRUE，二者分别是指重叠区域的像元以2景遥感影像中的最大值像元为准，以及在计算时不考虑NoData值的影响。 ...其实，这里的merge()函数与前述的mosaic()函数功能大致一样，但merge()函数在处理重叠区域时，默认选择位于顶层的遥感影像的像元数值，就没有mosaic()函数中的这么多计算方法选择了。
R矢量地图栅格化（将shapefile转换成raster） 背景 在处理地图数据时候，经常会碰到shp与raster两种格式。通常r中应用较多的为raster栅格数据。shp文件太大，读取也不方便。...及在转换过程中碰到的一些问题。...案例 利用raster包自带的数据进行演示。读取的是SpatialPolygonsDataFrame，关于如何读取shp文件，可以用rgdal与sf的命令。...主要参数cbind（0,a,b）意思是将0-a的数值全部变成b。 具体参见： ?...参考 栅格化shp数据 Rasterize polygons with R 替换raster中NA数据 根据shp裁剪raster地图 [sf裁剪 https://rpubs.com/cyclemumner
本实验拟分析艾比湖地区2010年至2020年间的NDVI数据，数据从MODIS遥感影像中提取的NDVI值，在GEE遥感云平台上将影像数据下载下来。...folder='image',scale=1000,region=region) for y in range(2010,2021): get_mean_ndvi(y) 影像会下载到Google云盘中，...通过手动下载到本地，其根目录结构如下： 图1 根目录结构 下载该10年间的数据后，打开RStdio并导入将趋势检验中将使用的R包。...(pattern = '*tif$') firs <- raster(fl[1]) for (i in 1:10) { r <- raster(fl[i]) firs <- stack...(firs, r) } fun <- function(y){ if(length(na.omit(y)) <10) return(c(NA, NA, NA)) #删除数据不连续含有NA的像元
背景 今天给大家介绍下，R处理NASA下载的降雨量数据 在进行环境数据分析时候，经常需要用到降雨量的信息，而NASA提供了每年，每个月甚至每天的降雨量数据。...TRAMM与GRM下载的HDF5格式在R中，会出现坐标与我们常用坐标系不一致的情况， 主要投影坐标系不同。 所以这篇文章，这要介绍raster如何转换成常规的4236坐标系。...hdf_raster=raster(hdf_tif_name) 上述主要是将HDF5文件转换成Raster文件，找到储存在HDF5文件中的precipitation位置。...我们将hdf_raster旋转一下，这样子可以看到差不多正常了。 但是cont还是在左下角，坐标对应不上。...缺点，在制图过程中，也需要很长时间才能出图。
本文介绍基于R语言中的raster包，遍历读取多个文件夹下的多张栅格遥感影像，分别批量对每一个文件夹中的多个栅格图像计算平均值，并将所得各个结果栅格分别加以保存的方法。 ...library(raster) result_path <- r"(E:\02_Project\01_Chlorophyll\Select\Result)" tif_folder <- list.files...tif_file_all <- stack(tif_file_name) NAvalue(tif_file_all) <- -10000 tif_mean <- calc(tif_file_all, fun..., "\n") } 首先，需要通过library(raster)代码，导入本文所需的R语言raster包；关于这一包的配置，大家可以参考R语言raster包读取栅格遥感影像。...接下来，我们需要指定结果存放的路径，并将其放入变量result_path中。
现在是雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组显示SARS-CoV-2感染期间巨噬细胞的顺序变化专辑第3讲：细分巨噬细胞的单细胞亚群 下面是前年实习生（日行一膳）的分享 1643459432584 本次复现的是于2021年7月27日发表在Nature...bronchoalveolar lavage fluid reveals sequential change of macrophages during SARS-CoV-2 infection in ferrets“中的...Figure3 Fig. 3 Sub-clustering analysis of macrophages. 1643472361945 ## 安装所需要的R包 chooseCRANmirror(graphics...install.packages("BiocManager") BiocManager::install("piano") install.packages("msigdbr") ## 载入R包...IL1B+ISG15−(weaklyactivated M1) #CSF3R+IL1B+ISG15+(highly activated M1) #proliferating macrophages
为了记录更多细节，在这里划出一块宝地，聊聊单细胞数据分析包Seurat，就在前几天它升级到了4.0版本。...于是，我在Seurat的github上watch了所有的问题，所以我的个人邮箱是这样的： ? 所以看看大家都踩了Seurat的哪些坑，Seurat社区成员又是如何回复的，不能不说是一件有意思的事儿。...Deploying Shiny apps using Seurat library to shinyapps.io #2716 这是一类问题属于对Seurat的扩展，这里是想把Seurat扩展到Shiny程序中，...这要求再开发者不单要对Seurat的函数和数据对象及其依赖的R包和环境有所了解，还要求他要懂得Shiny的语法和结构。其实这个问题下的讨论多是想要弥补Seurat与Shiny的界限。...对了，在github上面提问了没？
aggregate()函数，它比较难使用一点但内置于R中。...- 这意思是，因子组合可能存在，但原始数据框里又没有实际出现。...处理缺失值 如果数据中存在NA值，你需要添加na.rm=TRUE选项。通常你可以在summaryBy()函数中设置，但length()函数识别不了这个选项。...- 这意思是，因子组合可能存在，但原始数据框里又没有实际出现。...所以不需要按照其他包。
本文已收录到 GitHub · AndroidFamily[1] 中。 前言 大家好，我是小彭。 过去两年，我们在掘金平台上发表过一些文章，小彭也收到了大家的意见和鼓励。...另外，❓是什么呢？...那么，所有 XML 布局文件都生成 Java 类，会不会导致包体积瞬间增大？不会的， 未使用的类会在混淆时被压缩。 ---- 2....如果不使用 post 的方式，那么业务方要是在 onDestroyView 中访问了 binding，则会二次执行 getValue() 这是不必要的。...在老版本 Java 中，传递代码块需要使用匿名内部类实现，而使用 lambda 表达式甚至连函数声明都不需要，可以直接传递代码块作为函数值； 问题 6、Fragment::requireView 是什么
R studio/R 工具指南（十四：在Rstudio中使用python和conda） (qq.com) 前言 最近忽然发现linux 上装R 包让人叫苦不迭，各种蜜汁依赖或路径原因的报错，比如单单一个...通过conda安装 我创建一个conda 环境，用这个环境来安装R 和我需要的R 包不就好了吗？...Rserver的诡计 比如免费版的Rserver，只能使用管理员配置的R。这也就意味着，你没法自由地驰骋在你的R环境里，包括安装R 包等等。...所以，这里一个解决方案就是通过vscode 连接服务器使用R，只不过稍微折腾一些。 你terminal 里用的是什么，它就用的是什么。服务器配置 vs code，得提上日程了。...参考资料 [1] installation error on linux: Makevars:18: *** missing separator.
#include #include "gdal_priv.h" #include "cpl_conv.h" using namespace std; void create_missing_raster...(string path); int main() { string file_path = R"(E:\02_Project\TIFF\TEST)"; create_missing_raster...(file_path); return 0; } void create_missing_raster(string path) { vector all_file_path...New file is :" << one_file_path << endl; } } GDALDestroyDriverManager(); } 上述代码主要都是在create_missing_raster...首先，我们需要基于文件夹中遥感影像文件的文件名称特征，遍历生成文件名列表。在这里，我们使用两个嵌套的for循环，生成所有可能的栅格图像文件名，并将这些文件名保存在all_file_path向量中。
转载自：Rxjava2入门教程五：Flowable背压支持——对Flowable最全面而详细的讲解 背压介绍 当上下游在不同的线程中，通过Observable发射，处理，响应数据流时，如果上游发射数据的速度快于下游接收处理数据的速度...所以，如果能够确定： 上下游运行在同一个线程中， 上下游工作在不同的线程中，但是下游处理数据的速度不慢于上游发射数据的速度， 上下游工作在不同的线程中，但是数据流中只有一条数据 则不会产生背压问题，就没有必要使用...BackpressureStrategy类型的参数，该参数负责当BackPress产生的时候，对应的Emitter的处理策略是什么样的 onSubscribe中接收的不是Dispose，而是Subscription...$t") }) BackpressureStrategy背压策略 BackPress策略有这几种： MISSING ERROR BUFFER DROP LATEST 当上游发送数据的速度快于下游接收数据的速度...在FlowableCreate类中看到，在设置完BackpressureStrategy之后，对应的Strategy会根据映射生成不同Emitter： MISSING ----> MissingEmitter
oncoplot （瀑布图）经常出现在肿瘤研究中的Fig1 ，可以展示多种变异类型的全景图。...一 载入R包，数据 #加载R包 library(tidyverse) library(openxlsx) library(reshape2) library(ComplexHeatmap) #读取数据...注意看一下提示信息，“Aggregation function missing: defaulting to length” ，提到因为Aggregation function missing，默认是length...2.2 擅长使用R帮助 使用 ?...◆ ◆ ◆ ◆ ◆ 精心整理（含图PLUS版）|R语言生信分析，可视化（R统计，ggplot2绘图，生信图形可视化汇总）
那么数据是什么时候被复制了呢？...parents(baseenv()) ## base ## R_EmptyEnv ## Error in parent.env(env): 空环境没有父母环境 环境链是内置环境和扩展包环境的组合，使用...median()函数，该函数处于stats包环境中，然后再基础环境中找到了c()函数，另外+也是一个函数，它也在基础包环境中。...如果需要调用两个包得同名函数，则会优先选取后加载得包中定义得函数，即后添加的包函数会屏蔽掉之前加载包的同名函数，因为后加载的包环境更接近全局环境。...这意思是在函数执行时，任何未在执行环境中定义的变量都会到封闭环境中寻找，这正是词法作用域的机理。
1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...“dplyr”包中的distinct() 函数更强大： distinct(df,V1,V2) 根据V1和V2两个条件来进行去重 unique()是对整个数据框进行去重，而distinct()可以针对某些列进行去重...trim函数的语法：trim(x) 注意： 1、trim函数来自raster包，使用前，先使用library(raster)引入该包； 2、如果还没有安装该包，则需先使用install.packages...("raster")安装； #空格数据清洗 data <- read.csv('1.csv'); install.packages('raster', repos='http://cran.r-project.org...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
本文介绍基于R语言中的raster包，读取单张或批量读取多张栅格图像，并对栅格图像数据加以基本处理的方法。...1 包的安装与导入 首先，我们需要配置好对应的R语言包；前面也提到，我们这里选择基于raster包来实现栅格图像数据的读取与处理工作。...首先，如果有需要的话，我们可以先到raster包在R语言的官方网站（https://cran.r-project.org/web/packages/raster/index.html）中，查阅raster...接下来，我们开始安装raster包；这里我是在RStudio中进行代码的撰写的。 首先，我们输入如下的代码，从而开始raster包的下载与自动配置。...此时，在RStudio右下方的“Packages”中，可以看到raster包以及其所依赖的sp包都处于选中的状态，表明二者都已经配置成功，且完成导入。
它的作用又是什么呢？ 如果你只是注意到了，但从来没有进行深入探究，相信这篇文章能够帮你找到答案。...inline主要是对闭包block做优化，为了对比它做的优化，我对应定义一个没有inline的方法 public fun T.ret(block: (T) -> R): R { return...简单的理解就是未使用inline修饰的方式，会对带有函数式参数的方法，创建对于函数的实例，再将这个实例传递到方法参数中。该参数方法最终在原方法的内部被显示调用。...(block: (T) -> R): R { val a = 0 if (a is T) { // error: Cannot check for instance of erased...crossinline 还有一种情况，如果使用了inline修饰的函数，被使用到了嵌套的内联函数中，直接使用是会报错的，需要为函数参数添加crossinline修饰符 inline fun
describe()函数可返回变量和观测的数量、缺失值和唯一值的数目、平均值、 分位数，以及五个最大的值和五个最小的值 通过Hmisc包中的describe()函数计算描述性统计量: >describe...使用by()分组计算描述性统计量： doBy包和psych包也提供了分组计算描述性统计量的函数，doBy包中summaryBy()函数的使用格式为： summaryBy(formula,data=dataframe...,FUN=function)其中的formula接受以下的格式： var1+var2+…+varN~grounpvar1+goupvar2+…+groupvarN 在~左侧的变量是需要分析的数值型变量，...使用doBy包中的summaryBy()分组计算概述统计量 >library("doBy", lib.loc="d:/ProgramFiles/R/R-3.1.3/library") >summaryBy...describe.by()函数可计算和describe相同的描述性统计量，只是按照一个 或多个分组变量分层，使用psych包中的describe.by()分组计算概述统计量.
、bind(0) 端口号分配的奇偶性分析 如何修复 TCP 自连接的代码 背景说明，这个 PR 是什么 复现的代码如下，getAvailablePort() 用于寻找一个可用的偶数的端口号，测试例子中返回的是...TCP 自连接 TCP 的自连接是一个比较有意思的现象，甚至很多人认为是 Linux 内核的 bug。我们先来看看 TCP 的自连接是什么。...自连接原因分析 自连接成功的抓包结果如下图所示。 对于自连接而言，上图中 wireshark 中的每个包的发送接收双方都是自己，所以可以理解为总共是六个包，包的交互过程如下图所示。...早期的 Linux 内核版本上，connect 非偶数端口也是可以复现的，在新的 4.2 内核版本中引入了一个特性（部分 Linux 发行版本有没有 backport 这个 feature） https..."); } printf("bind local port: %d\n", ntohs(local_addr.sin_port)); close(sockfd); 在新版的内核中输出结果如下，可以看到
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