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在使用R的分位数回归中没有标准误差输出

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数据分享|R语言零膨胀泊松回归ZERO-INFLATED POISSON(ZIP)模型分析露营钓鱼数据实例估计IRR和OR

零膨胀泊松回归 summary(m1) 输出看起来非常像 R 中两个 OLS 回归的输出。在模型调用下方,您会发现一个输出块,其中包含每个变量的泊松回归系数以及标准误差、z 分数和 p 值系数。...) ## 输出结果 res 结果是交替的参数估计和标准误差。...也就是说,第一行具有我们模型的第一个参数估计值。第二个具有第一个参数的标准误差。第三列包含自举的标准误差。 现在我们可以得到所有参数的置信区间。我们从原始比例开始,使用百分位数和偏差调整的 CI。...## 带百分位数和偏差调整的CI的基本参数估计值 ## 添加行名 row.names(pms) <- names(coef(m)) ## 输出结果 parms ## 与基于正常的近似值相比 confint...## 带百分位数和偏差调整的CI的指数化参数估计值 exps <- t(sapply(c(1, 3, 5, 7, 9), function(i) { out <- boot.ci 为了更好地理解我们的模型

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数据分享|R语言零膨胀泊松回归ZERO-INFLATED POISSON(ZIP)模型分析露营钓鱼数据实例估计IRR和OR|附代码数据

零膨胀泊松回归 summary(m1) 输出看起来非常像 R 中两个 OLS 回归的输出。在模型调用下方,您会发现一个输出块,其中包含每个变量的泊松回归系数以及标准误差、z 分数和 p 值系数。...) ## 输出结果 res 结果是交替的参数估计和标准误差。...也就是说,第一行具有我们模型的第一个参数估计值。第二个具有第一个参数的标准误差。第三列包含自举的标准误差。 现在我们可以得到所有参数的置信区间。我们从原始比例开始,使用百分位数和偏差调整的 CI。...## 带百分位数和偏差调整的CI的基本参数估计值 ## 添加行名 row.names(pms) <- names(coef(m)) ## 输出结果 parms ## 与基于正常的近似值相比 confint...## 带百分位数和偏差调整的CI的指数化参数估计值 exps <- t(sapply(c(1, 3, 5, 7, 9), function(i) {   out <- boot.ci 为了更好地理解我们的模型

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  • 逻辑回归(对数几率回归,Logistic)分析研究生录取数据实例

    rank <- factor(rank) 由于我们给我们的模型起了个名字(mylogit),R不会从我们的回归中产生任何输出。为了得到结果,我们使用summary命令。...这部分输出显示了模型中使用的各个案例的偏差残差的分布。下面我们讨论如何使用偏差统计的摘要来评估模型的拟合度。...输出的下一部分显示了系数、它们的标准误差、z统计量(有时称为Wald z统计量)以及相关的p值。gre和gpa都有统计学意义,三个等级项也是如此。...为了得到指数化的系数,你要告诉R你要进行指数化(exp),你要指数化的对象叫做coefficients,它是mylogit的一部分(coef(mylogit))。...它们都试图提供类似于OLS回归中R平方所提供的信息;然而,它们都不能完全按照OLS回归中R平方的解释来解释。 诊断法。

    1.9K30

    多元回归分析

    与一元线性回归不同的是,一元线性回归拟合的是一条线,而多元回归拟合的是一个面。使用的方法也是最小二乘法。...因为增加自变量的会降低残差SSE,进而导致R^2增加。 为什么加入新的变量会使SSE降低呢?因为每新加入一个新的变量,这个新的变量就会贡献一部分平方和,而这个平方和就是从残差里面分离出来的。...除了R^2以外,我们还可以使用标准误差来衡量回归模型的好坏。标准误差就是均方残差(MSE)的平方根,其表示根据各自变量x来预测因变量y的平均预测误差。...检验方法与一元线性回归一致,即我们假设没有线性关系,然后对变量进行F检验,具体的详细介绍,参考一元线性回归中讲解的。...以上就是关于多元回归的一个简单介绍,大家可以看到很多内容没有展开来讲,主要是因为这些东西在之前的文章都讲过了。如果没有看过的同学,可以去前面对应的文章翻翻。

    1.4K40

    工具变量法(两阶段最小二乘法2SLS)线性模型分析人均食品消费时间序列数据和回归诊断

    这是一个合理的选择,但是它有可能遗漏那些在第一阶段有高杠杆率但在第二阶段回归中没有的案例。让h(1)i代表第一阶段的hatvalues,h(2)i代表第二阶段的hatvalues。...在最常见的应用中,由Cook和Weisberg(1983)独立提出,有一个zz,即回归的拟合值yˆ,尽管使用初级回归中的回归者x作为zs也很常见。...测试是通过将标准化残差的平方e2i/σˆ2回归到zs上实现的,其中σˆ2=∑e2i/n。然后,在误差方差不变的无效假设下,该辅助回归的回归平方和除以2的渐近分布为χ2s。...最后,我们可以在2SLS中使用系数协方差矩阵的估计(或自举法:例如,见Davison和Hinkley 1997)来修正非恒定误差方差的标准误差,就像Huber(1967)和White(1980;也见Long...在我们的例子中,标准误差与传统的标准误差没有太大区别。

    3.9K30

    R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

    #估计模型并将结果存储在m中# 输出结果,固定效果之间不相关print(m, corr = FALSE)第一部分告诉我们,估计值是基于自适应高斯-赫米特的似然性近似。...来自所有节点的结果被汇总回一个单一的列表,存储在对象res中。一旦完成,我们就可以关闭本地集群,终止额外的R实例并释放了内存。 ...# 合并成功的结果 do.call(cbind, res[success])# 计算出95%CI的2.5和97.5百分位数。 ...在普通逻辑回归中,你可以保持所有预测因子不变,只改变你感兴趣的预测因子。然而,在混合效应逻辑模型中,随机效应也对结果产生影响。...# 输出没有固定效应之间相关性的mod结果print(m3a, corr=FALSE)输出告诉我们族(二元结果的二项式)和链接函数(logit)。接着是通常的拟合指数和随机效应的方差。

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    R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

    #估计模型并将结果存储在m中# 输出结果,固定效果之间不相关print(m, corr = FALSE)第一部分告诉我们,估计值是基于自适应高斯-赫米特的似然性近似。...来自所有节点的结果被汇总回一个单一的列表,存储在对象res中。一旦完成,我们就可以关闭本地集群,终止额外的R实例并释放了内存。 ...# 合并成功的结果 do.call(cbind, res\[success\])# 计算出95%CI的2.5和97.5百分位数。 ...在普通逻辑回归中,你可以保持所有预测因子不变,只改变你感兴趣的预测因子。然而,在混合效应逻辑模型中,随机效应也对结果产生影响。...# 输出没有固定效应之间相关性的mod结果print(m3a, corr=FALSE)输出告诉我们族(二元结果的二项式)和链接函数(logit)。接着是通常的拟合指数和随机效应的方差。

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    R语言用线性回归模型预测空气质量臭氧数据

    这是在所有独立值均为零的情况下模型将预测的值。 低系数  Solar.R 表示太阳辐射对预测臭氧水平没有重要作用,这不足为奇,因为在我们的探索性分析中,它与臭氧水平没有很大的相关性。...Error 是系数估计的标准误差 t value 以标准误差表示系数的值 Pr(>|t|) 是t检验的p值,表示检验统计量的重要性 标准误差 系数的标准误差定义为特征方差的标准偏差: 在R中,可以通过以下方式计算模型估计的标准误差...它定义为估计值与观察到的结果之间的相关性的平方: ## [1] 0.5924073 与[-1,1] [-1,1]中的相关性相反,R平方在[0,1] [0,1]中。...Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现 7.在R语言中实现Logistic...逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

    1.1K10

    R语言结构方程模型SEM、路径分析房价和犯罪率数据、预测智力影响因素可视化2案例|附代码数据

    有一点需要注意的是,我们在输出中没有截距。这突出了一个重要的区别,基本的SEM经常关注数据的协方差结构。我们也可以包括均值,但通常只有当它与我们的科学问题有关时才会包括。...Bonl % mutatesummary(lv2)3.2 模型拟合指数您可以在模型摘要输出中使用更详细的全局拟合指数。...这是否具有理论上的意义是另一回事(而且可能更重要)。出于演示目的,让我们接受需要自由估计这条路径。...默认情况下,这将使用 1000 个非参数引导样本重新估计参数估计的标准误差。...6.1 CFA分类数据演示这是一个快速演示——如果我们的每个智力测试项目只有三分法怎么办?hist我们用有序参数告诉R哪些项目是有序分类的。

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    结构方程模型SEM、路径分析房价和犯罪率数据、预测智力影响因素可视化2案例

    有一点需要注意的是,我们在输出中没有截距。这突出了一个重要的区别,基本的SEM经常关注数据的协方差结构。我们也可以包括均值,但通常只有当它与我们的科学问题有关时才会包括。...Bonl % mutate summary(lv2) 3.2 模型拟合指数 您可以在模型摘要输出中使用更详细的全局拟合指数。...这是否具有理论上的意义是另一回事(而且可能更重要)。出于演示目的,让我们接受需要自由估计这条路径。...默认情况下,这将使用 1000 个非参数引导样本重新估计参数估计的标准误差。...6.1 CFA分类数据演示 这是一个快速演示——如果我们的每个智力测试项目只有三分法怎么办? hist 我们用有序参数告诉R哪些项目是有序分类的。

    1.2K20

    结构方程模型 SEM 多元回归和模型诊断分析学生测试成绩数据与可视化

    p=24694 本文首先展示了如何将数据导入 R。然后,生成相关矩阵,然后进行两个预测变量回归分析。最后,展示了如何将矩阵输出为外部文件并将其用于回归。 数据输入和清理 首先,我们将加载所需的包。...调整后的 R 平方 告诉您总体水平 R 平方值的估计值。 残差标准误差 告诉您残差的平均标准偏差(原始度量)。如果平方是均方误差 (MSE),则包含在残差旁边的方差分析表中。...注意第二个图,如果残差是正态分布的,我们会有一条平坦的线而不是一条曲线。 使用多元回归来显示系数如何是残差的函数 现在,让我们看看系数是如何作为残差的函数的。我们将从之前的回归中构建 T1 的系数。...anova(modeage) summary(modage) plot(lev ~ cae, data = grb) 请注意,在SEM中,没有简单的距离或杠杆方法,但我们可以得到杠杆,因为它与DV...如果我们能找出一个异常的案例,我们在有和没有这个案例的情况下进行分析,以确定其影响。输出的变化将是对杠杆的测试。 现在我们制作测试之间关系的 3d 散点图。

    3.1K20

    R语言结构方程模型SEM、路径分析房价和犯罪率数据、预测智力影响因素可视化2案例|附代码数据

    有一点需要注意的是,我们在输出中没有截距。这突出了一个重要的区别,基本的SEM经常关注数据的协方差结构。我们也可以包括均值,但通常只有当它与我们的科学问题有关时才会包括。...Bonl % mutate summary(lv2) 3.2 模型拟合指数 您可以在模型摘要输出中使用更详细的全局拟合指数。...这是否具有理论上的意义是另一回事(而且可能更重要)。出于演示目的,让我们接受需要自由估计这条路径。...默认情况下,这将使用 1000 个非参数引导样本重新估计参数估计的标准误差。...6.1 CFA分类数据演示 这是一个快速演示——如果我们的每个智力测试项目只有三分法怎么办? hist 我们用有序参数告诉R哪些项目是有序分类的。

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    STATA教程之一:自动化输出回归表格 Estout

    Estout 介绍 我们将首先介绍如何使用$Estout$输出最基本的回归表格,接着介绍如何把描述性数字以及回归中控制的变量类型加入到表格中,最后是如何生成pdf格式的表格。...,而这个回归表格已经能够满足我们需要清晰的对比不同回归中的相同变量的系数的目的。...例如,回归系数,标准误差的小数点默认为三位,以及表格中会加入观测值数量等。当然,这个表格还不能满足我们的所有需求。当我们希望更为丰富的表格内容时该如何做呢?...例如,当需要加入因变量的均值时,我们可以使用以下命令 sum price estadd r(mean) 我们也常常需要在回归表格中标注所控制的变量的类型,这一步骤也同样的可以使用estadd来实现。...例如,当我们希望在上述部分回归中控制车辆是否是外国品牌时,我们可以在回归表格中加入一行来显示每个回归是否控制了该变量。

    12.7K41

    孟德尔随机化之两阶段估计法(一)

    在第一阶段回归中(G–X),我们使暴露在IV上回归以得出暴露在IV上的拟合值(X^| G)。在第二阶段回归中(X-Y),我们根据第一阶段回归的拟合值对结局Y进行回归。...那么,第一阶段回归模型为: 然后在第二阶段回归模型中使用拟合值 对结局进行回归: 其中εXi和εYi是独立的误差项,我们感兴趣的因果估计值为β1。...尽管在两个阶段中对因果效应的估计(顺序回归方法)给出了正确的点估计,但是在第二阶段回归中得出的标准误差是不正确的。这是因为它没有考虑第一阶段回归中的不确定性。...在等式中的误差项的方差齐性下: 2SLS估计量的渐近方差为: 其中σ2^是来自前一个等式的残差方差的估计,并且由IV组成的矩阵G和暴露X包含常数项。这里建议使用2SLS软件进行估算。...在实际中,我们经常使用稳健标准误差,因为该估计值对模型中异方差性和错误识别比较敏感。当所有关联都是线性的并且误差项呈正态分布,如果存在(k+1)个IV,那么2SLS估计量具有有限的k阶矩。

    1.5K20

    【机器学习笔记】:大话线性回归(二)

    估计标准误差 判定系数R2的意义是由x引起的影响占总影响的比例来判断拟合程度的。当然,我们也可以从误差的角度去评估,也就是用残差SSE进行判断。...通过上面步骤的假设,我们也看到了:在多元线性回归中,只要有一个自变量系数不为零(即至少一个自变量系数与因变量有线性关系),我们就说这个线性关系是显著的。如果不显著,说明所有自变量系数均为零。 2....QQ图是通过把测试样本数据的分位数与已知分布相比较,从而来检验数据的分布情况。对应于正态分布的QQ图,就是由标准正态分布的分位数为横坐标,样本值为纵坐标的散点图。...一般地数据量低于5000则可以使用Shapiro检验,大于5000的数据量可以使用K-S检验,这种方法在scipy库中可以直接调用: # shapiro检验 import scipy.stats as...以上就是残差分析的主要内容,对于线性回归诊断还有其余的线性相关性检验,多重共线性分析,强影响点分析三部分重要内容,将在下一篇进行介绍,完整代码在知识星球中。

    1.9K60

    R语言调整随机对照试验中的基线协变量

    因此,两组之间结果的差异可归因于随机化治疗而不是对照(通常是另一种治疗)的效果。 如果随机化没有受到影响,即使不调整任何基线协变量,试验的治疗效果估计也是无偏的。...这通常通过拟合结果的回归模型来完成,随机组和基线变量作为协变量。 我们可以使用R来说明这一点。我们将模拟n = 50个受试者的小型研究的数据,随机化50%治疗= 0和50%治疗= 1。...该回归模型假设Y的平均值线性地取决于X,并且该关系的斜率在两组中是相同的。无法保证这些假设在任何特定研究中都能成立。因此,如果这些假设不成立,我们可能会担心使用协变量调整分析。...协变量调整与二元结果 前面的讨论是在连续结果的背景下进行的,我们通常会使用线性回归结果模型。如果结果是不同类型怎么办?也许最常见的是二元结果。在这种情况下,事情有点复杂。...事实证明,在逻辑回归中调整基线协变量会降低治疗效果估计的精确度,但(会增加相应假设检验的能力)。

    1.7K10

    答读者问~ggplot2画图添加拟合方程的R2并且在右上角添加星号表示显著性;只有分位数和中位数数据画箱线图

    简单的小例子 library(extrafont) fonts() ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(aes(shape=D),size=10)...+ theme_bw()+ theme(legend.position = "none")+ annotate(geom = "text",x=3,y=8.5,label="小明的数据分析笔记本...image.png 添加拟合方程的R2的写法 ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(size=5)+ annotate("text",x=3,y...=7.5, label="atop(R^2==0.9^'***')", parse=T,size=10)+ theme_bw()+ theme(legend.position...image.png 公众号一位读者留言问 自己的数据是经过计算的的只有分位数和中位数的数据,应该如何画箱线图?我自己能想到的一个办法是利用annotate()函数画线段,将其组合成为一个箱子。

    1.3K20

    FRM 数量分析笔记之线性回归

    含义就是,原始数据中的波动性被解释的部分。SSR则是没有没解释的部分。那么显然,没有被解释的部分越小越好,所以有了R^2指标,这个指标在SSR越小的情况下变大。 ?        ...在线性回归中也是这样,ESS,被解释部分平方和的自由度是independent变量的个数,在单元线性回归中,就是1个自由度,剩下的n-2个自由度就是属于SSR残差平方和的。...而这一平方和除以自由度,就是SER,回归的标准误差。这又是一个衡量线性回归曲线的拟合度的指标。         完成线性回归的计算后,我们又有一个问题了,我们选择的这个X真的和Y有关吗?...这就是联合检验时候计算F-统计量的公式。         在多元性性回归中,还有一个重要的改变,就是R^2的变化。...引入的变量过多会有过拟合、运算量大、多重共线性等等的问题,所以我们在计算R^2这个指标的时候,要进行改进: ?

    1.3K50

    从零开始学统计 07 | 标准误差

    把五个样本的平均值放在一个数轴: ? 可以计算得到两个值: ? 对五个样本的平均值取平均值,计算得到的标准偏差就是标准误差。...**标准误差(Standard Error)**量化了多组测量值均值的变化程度 不难发现: 标准偏差量化了一组测量值中的变化程度 标准误差量化了多组测量值均值的变化程度 二、标准误差的表示 三个样本 ?...可以发现标准误差比标准偏差要小很多。这是因为平均值没有原始数据那么分散。 当然也可以计算标准偏差的标准偏差,这个值叫做标准偏差的标准误差。它告诉我们多个样本的标准偏差是如何分布的。...其实理论上,我们可以计算一切统计值的标准偏差,比如中位数,众数,百分数等的标准偏差,得到的值就是该统计值的标准误差。 标准误差只是来自同一群体的多个均值的标准偏差。...选取一个随机测量值 记录该值 重复以上两步,直到拿到 5 个测量值 计算均值,中位数,众数等 回到第一步,重复以上步骤,拿到多个统计量的值 利用拿到的统计量的值,如均值计算标准偏差,得到标准误差

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    性能基准测试工具 --- BenchmarkDotNet

    接下来,来看一下测试结果,输出: 讲解 可以看到控制台输出分为了几个部分。...Median(所有测试运行的中位数为300纳秒)。 Legends 简单描述了表格中的一些参数。...Mean: 所有测试运行的平均时间。 Error: 测试运行的标准误差,标准误差是测试结果的离散程度的度量,标准误差越小,表示测试结果越稳定。...中位数是测试结果的中间值,如果测试结果的个数为奇数,则中位数为中间的那个值;如果测试结果的个数为偶数,则中位数为中间两个值的平均值。...Export 上面其实还有一部分控制台内容是 「Export」 内容 ,如下图所示: 默认给你生成了三种格式的报告,CSV格式,Markdownn格式,和Html格式,生成路径是运行根目录下的BenchmarkDotNet.Artifacts

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