原来ggplot只有两种scale的类型,即continuous和discrete,在新版本中加了一种新的类型,可以将连续型的数据根据bin变成离散型的。如下所示:
ggplot2是目前主流的绘图R包,有着丰富的扩展包。今天来推荐一个极其强大的配色R包——paletteer包。据R包作者介绍,这个包收集了52个R包的2100种调色板,R用户可以通过paletteer[1]包来直接调用其他R包的调色板。下面来学习下怎么使用这个R包[2]。
本期推文我们开始介绍基础柱形图(条形图)的绘制推文,其目的就是让大家希望大家可以一步步打好基础,为以后绘制更加复杂、更加精美的可视化设计作品做准备。本期主要涉及的知识点如下:
在收集我们R语言数据可视化课程的学员问题时,发现咨询的比较多的就是如何使用R语言便捷的处理地理数据?最好能像tidyverse一样具有多个便捷的处理函数。
一篇旧文,解决一个困扰已经的小技术问题,权当是学习ggplot2以来的整理回顾与查漏补缺。 ---- 今天这一篇是昨天推送的基础上进行了进一步的深化,主要讲如何在离散颜色填充的地图上进行气泡图图层叠加。 为了使得案例前后一致,仍然使用昨天的数据集。 加载包: library("ggplot2") library("plyr") library("maptools") library("sp") library("ggthemes") 导入中国省界地图: china_map<-readShapePoly("
今天跟大家分享如何在地图上进行散点图、气泡图绘制。 昨天跟大家介绍了ggplot函数进行地图绘制的原理,通过轮廓点和分组来定义每一个地区(国家边界),通过多边形填充来完成区域填色。 ggplot的图层叠加原理晕允许我们在坐标系统的叠加多个图层; 所以在地图上叠加散点、甚至气泡可以很容易的实现: 包的导入: library(maptools) library(ggplot2) library(plyr) 导入地理信息数据: china_map <- readShapePoly("c:/rstudy/bou2_
ggplot2是由Hadley Wickham创建的一个十分强大的可视化R包。按照ggplot2的绘图理念,Plot(图)= data(数据集)+ Aesthetics(美学映射)+ Geometry(几何对象)。本文将从ggplot2的八大基本要素逐步介绍这个强大的R可视化包。
color, size, linetype: 同上 fill: 填充 alpha: 透明度
今天这一篇是昨天推送的基础上进行了进一步的深化,主要讲如何在离散颜色填充的地图上进行气泡图图层叠加。 为了使得案例前后一致,仍然使用昨天的数据集。 加载包: library(ggplot2) library(plyr) library(maptools) library(sp) 导入中国省界地图: china_map<-readShapePoly("c:/rstudy/bou2_4p.shp") data1<- china_map@data data2<- data.frame(id=row.n
今天给大家介绍一个快速绘制火山图(volcano map) 拓展工具包-ggVolcano,绘图结果为ggplot2对象,也就可以灵活进行相关主题的设置。详细介绍如下:
数了一下刚好有一周多没有写新文章了,主要是临近毕业琐事比较多,再也没有像之前那样,拥有大把时间可以用来挥霍和消遣,静下心来写代码了。 毕竟要写一篇技术含量很高而又能让大家感兴趣的文章出来,足够的时间保障和没有任何干扰的的心情,一个都不能少。 真的不知道还能坚持写几篇,或者说接下来的时间还能容许我抽出多少来打理这些,希望以前写过的那些对于大家还有价值。 今天给大家介绍一个ggplot2连续颜色映射函数中一组非常好用的预设函数,它可以很容易的帮我们实现特定离散颜色间的均匀连续化。 说的不那么专业一点儿,就是如
柱形图 简介 英文:histogram或者column diagram 排列在工作表的列或行中的数据可以绘制到柱形图中。在柱形图中,通常沿水平轴组织类别,而沿垂直轴组织数值。 柱形图具有下列图表子类型
填充颜色、设置坐标轴及坐标轴标签。这里重点是颜色填充函数:Axes.fill_between()
继续“一图胜千言”系列,箱线图通过绘制观测数据的五数总括,即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值,描述了变量值的分布情况。箱线图能够显示出离群点(outlier),通过箱线图能够很容易识别出数据中的异常值。
今天介绍关于直方图的美化技巧! 数据集仍然使用上一节使用到的有关钻石的数据信息。 data(diamonds) set.seed(42) small <- diamonds[sample(nrow(
今天向大家介绍一个绘制序列标识图的方法,这样更直观的展示测序数据的情况,让我们的数据更容易分析,gglogo是基于ggplot2绘制的。
ggridges包提供了geom_density_ridges_gradient()函数,用于画核密度估计峰峦图
R有几种不同的系统用来产生图形,但ggplot2是最优雅而多变的那一种。ggplot2实现了图形语法,一种描述和构建图形的逻辑系统。通过ggplo2,我们能够快速学习,多处应用。
函数scale_x_discrete可用于将项目的顺序更改为“2”,“0.5”,“1”:
今天跟大家分享关于密度曲线图及其美化技巧! 密度曲线图可能平时大家用的不多,不过其实没什么神秘,它的功能于直方图一样,都是用于表达连续型数值变量的分布形态。 案例还是使用之前的关于钻石的那个数据集。
我们想在画布上画个基本的简单形状的时候,使用 Canvas 不会觉得有什么繁琐。但当画布上需要任何形式的互动,绘制复杂的图形和在特定情况需要改变图片的时候,使用原生 canvas API 将会变得很困难。 而 Fabric 旨在解决这个问题。
之前的ggplot2入门实践篇已经更新告一段落,也已经做了归总分类分享给大家。 最近翻看突然发现少了一个知识点,就是分面中没有讲填充多边形分面的应用,虽然其理念跟其他的常用图表类型一致。 但是鉴于多边形填充本身就比较复杂,再加上分面肯定能把大部分小伙伴儿绕晕,这里还是亲自实践一篇案例详细讲解一下实际用法。 如果你还不懂如何使用ggplot2制作数据地图的话,你可以参考以下序列文件: 地图部分(ggplot2) 你想要的地图素材资源,我都帮你整理好了~ 一篇文章教你搞定JSON素材,从此告别SHP时代~ 大道
箱式图适用于连续变量的可视化展示,显示变量的四分位数,中位数、异常值等 同时箱式图可以预览两组之间的差异,为后续统计分析做准备
KM法即乘积极限法(product-limit method),是现在生存分析最常用的方法,是由Kaplan和Meier于1958年提出,因此称Kaplan-Meier法,通常简称KM法。KM法是这样估计生存曲线:首先计算出活过一定时期的病人再活过下一时期的概率(即生存概率),然后将逐个生存概率相乘,即为相应时段的生存率。
今天是一个案例应用,采用东北三省地图进行离散颜色映射,让大家感受下R语言在地理信息空间可视化方面的强大功能,同时也会对之前强调过的地图配色技巧进行应用。 加载工具包: library(ggplot2) ###绘图函数 library(plyr) ###数据合并工具 library(maptools) ###地图素材导入 library(sp) library(Cairo) #图片高清导出 library(RColorBrewer) ###有一些高质量
今天跟大家分享如何以百分比形式填充离散分段数据地图。 案例用环渤海三省二市的地理数据。 library(ggplot2) library(maptools) library(plyr) 数据导入、转换、抽取 CHN_adm2 <- readShapePoly("c:/rstudy/CHN_adm/CHN_adm2.shp") CHN_adm2_1 <- fortify(CHN_adm2) data1 <- CHN_adm2@data data2 <- data.frame(id=
第一步:准备数据,使用的数据包括三列,len长度,supp是分类变量,dose是0.5mg,1mg和2mg三个变量。
小提琴图用于可视化数据的分布及其概率密度。它是箱式图和密度图的组合,密度图通过旋转放置在箱式图侧边,以显示数据的分布形状。小提琴图比箱形图显示更多的信息。主要是数据的分布,可以看出是双峰的还是多峰的
等高线图(contour map) 是可视化二维空间标量场的基本方法[1],可以将三维数据使用二维的方法可视化,同时用颜色视觉特征表示第三维数据,如地图上的等高线、天气预报中的等压线和等温线等。假设
小编已经搭建了一套稳定的真核转录组分析流程,可以完成「从原始数据分析到最终出结果分析文档」基本包含目前RNA_seq文章的所有分析内容。「有数据分析需求的朋友可联系小编进行咨询」
R具有强大的统计计算功能和便捷的数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统:基础图形(base)、网格图形(grid)、lattice图形和ggplot2。其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观,逐渐成为R中数据可视化的主流选择。
本文主要使用函数coord_polar()用于生成饼图,它只是极坐标中的堆积条形图。
本次演示我们以R自带的数据集diamonds为例进行绘图,由于数据量比较大我们使用tidyverse随机抽取1000条数据进行演示。
本文主要讨论ggplot2是如何通过颜色信号来对多边形进行填充的底层理念,这也是想要进阶R语言数据可视化过程中必须搞明白的关键环节。 ggplot2所有图层对象中,geom_ploygon()几何图层对象最为复杂,也最为特殊: 复杂在哪儿呢? 这种几何对象所定义的多边形(特别是在地理信息数据里面),领土边界是基于行政区划、行政区划再细分为单个多边形(也就是group),单个多边形又是一组经纬度坐标点构成(按照order排序)。 所以说geom_ploygon()所要显式声明的参数至少需要四个: data(地
Transfoms 是很常用的图片变换方式,可以通过compose将各个变换串联起来 1. class torchvision.transforms.Compose (transforms) 这个类将多个变换方式结合在一起 参数:各个变换的实例对象 举例:
桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。
使用guides()参数来设置或移除特定的美学映射(fill, color, size, shape等).
ggplot2是R语言最流行的第三方扩展包,是RStudio首席科学家Hadley Wickham读博期间的作品。根据其绘图理念,图形由以下几个模块组成:
第一感觉应该是是R语言的ggplot2包做出来的,这么好的学习素材不重复一下岂不是可惜了,遂以关键词“Joel Embiids Points Per 100 Possessions When Guarded By”搜索找到了原文https://www.reddit.com/r/nba/comments/bjuiy4/oc_joel_embiids_points_per_100_possessions/
前面几章的内容为你提供了构建基本的 Web 应用所需的所有元素。 在本章中,我们将实现一个。
本文介绍了如何利用R语言中的maps包和mapdata包绘制地图,并通过热力地图展示数据分布情况。首先,通过map()函数创建地图对象,并获取每个区域的名字以及顺序。然后,在每个区域的名字和顺序后面,加上需要展示的数据以及经纬度。接着,根据数据的大小设置每个区域的颜色深浅,以区分不同的区域。最后,给地图加上地名标记,并添加热力地图元素。
但是学生的表现实在是太超出我意料了,能超脱于现有的工具,达到随心所欲的定制化,值得分享!
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image.png 之前有读者在公众号留言问开头的图应该如何画?我第一眼看到这个图简单的理解为了堆积柱形图,加折线图。所以基本的想法就是构造两份数据来画这个图,第一份用来画堆积柱形图,第二份用来画折线图。但是准备画图的时候才意识到这个堆积柱形图是一个分组的堆积柱形图,我之前画的都是单独的,没有画过分组的。一时还想不起来该如何画这个分组的堆积柱形图了。 今天找资料的时候找到一个链接 Beginners Guide to Creating Grouped and Stacked Bar Charts in R
考虑到公众号后台数不胜数的提问其实并不是生物学知识或者数据处理知识的困惑,仅仅是绘图小技巧以及数据转换的困难。所以我们一再强调系统性掌握编程知识的重要性,在这个打基础方面我让实习生“身先士卒”,起码每个人在每个编程语言上面都需要看至少五本书而且每本书都需要看五遍以上,并且详细的记录笔记。
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