开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

在带有ggplot2的ggarrange中使用common.legend时缺少图例项

的问题通常是由于数据不一致导致的。ggarrange函数可以将多个ggplot2图形排列在一起，并且通过设置common.legend参数来共享一个图例。当使用common.legend时，ggarrange会自动将每个图形的图例项合并为一个图例显示。然而，如果图形的数据不一致，就会出现缺少图例项的情况。

解决这个问题的方法是确保所有图形的数据和图例项一致。可以通过以下几种方式来实现：

确保每个图形中使用的数据集相同。检查代码中的数据源，确保它们都是同一个数据框或数据集。
检查每个图形中使用的图例项。确保每个图形中需要显示的图例项名称一致，并且它们都包含在数据集中。
确保每个图形中使用的图例项的颜色、形状等属性一致。检查代码中设置图例项属性的部分，确保它们都是一致的。

如果以上方法仍然无法解决问题，可能需要进一步检查代码中是否存在其他导致图例项缺失的问题。可以逐行检查代码，确保没有其他设置或操作会导致图例项被删除或隐藏。

对于ggplot2中的common.legend参数缺少图例项的具体解决方法会因具体情况而异。一般建议参考ggplot2的官方文档、在线教程或社区论坛来获取更具体的帮助和解决方案。

以下是腾讯云相关产品和产品介绍链接地址：

腾讯云服务器（云计算基础设施）：https://cloud.tencent.com/product/cvm
腾讯云数据库（云数据库服务）：https://cloud.tencent.com/product/cdb
腾讯云人工智能（AI服务）：https://cloud.tencent.com/product/ai
腾讯云物联网（IoT服务）：https://cloud.tencent.com/product/iotexplorer
腾讯云移动开发（移动开发平台）：https://cloud.tencent.com/product/cmobile
腾讯云存储（云存储服务）：https://cloud.tencent.com/product/cos
腾讯云区块链（区块链服务）：https://cloud.tencent.com/product/baas
腾讯云元宇宙（元宇宙开发平台）：https://cloud.tencent.com/product/vr

相关搜索:当我使用ggplot2绘制连续颜色时，如何修复图例中缺少的色标？在ggplot2中对图例的项进行排序并手动上色在ggplot2中使用geom_pointrange显示图例时出现的问题在使用项目时缺少DLL自己的依赖项在ggplot2中，当使用两种图形类型时，如何缩放图例？在ggplot2中合并图例的标题中使用上标为什么在使用gridExtra时我的ggplot2图例大小不正确？[r]R:在不使用ggplot2的情况下向R中的线条图添加图例，或者使用它但使用我自己的图例？在SAS中缺少值时继续使用先前的值如何使用ggplot2将图例和带有数据值的表格添加到不同线条的图表中在使用ng重复时覆盖json中的项。如何在R中的ggplot2中使用qpolot在图例标题中上标a-(减号在R中使用rasterLayer ()绘制plot时(使用breaks参数)图例中的空白如何使用带有geom = "line“的stat_summary在ggplot2中绘制NA间隙？如何修复在属性更改时使用useEffect挂钩更新状态时出现的缺少依赖项警告在R中的plotly中的子图之间共享轴和图例( ggplot2中的分面和使用ggplotly不起作用)在ggplot2中使用ylim时的破坏置信区间区域在绘图构造结束时，使用"+“和"-”重命名ggplot2中的列在使用带有testng的selenium中的函数时，如何保持代码干爽？在Swift 3中使用带有竖线分隔符的regex来过滤匹配项

相关搜索:

页面内容是否对你有帮助？

有帮助

没帮助

相关·内容

ggplot2作图共享图例方法一：ggpubr包的ggarrange()函数以及调整图例的布局

当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起，图例互相之间有一样的时候，比如如下的情况（我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图） ?...这里拼图使用的函数是ggpubr这个包里的ggarrange()函数，这个函数里有一个参数是common.legend，默认好像是FALSE，我们直接设置成TRUE就好了，代码如下 ggarrange(...image.png 还有一个legend参数用来控制图例的位置 ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3, common.legend = T, legend...image.png 图例放到顶部，默认的布局是3行3列，如果要改成1行6列呢？ggplot2里应该有对应的参数可以修改吧？...但是目前还不知道如何使用ggplot2自带的函数来操作，查资料的时候发现了一个R包lemon里有一个reposition_legend()函数参考资料的链接是 https://cran.r-project.org

4.7K5 1

R语言统计与绘图：给组合图形添加ABCD小标签

前面我们学习了ggplot2中组合图形的绘制，在科研论文中，组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签，如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以在PS或者AI中添加，也可以在R中直接添加。...今天我们来学习组合图形中怎么添加ABCD标签。组合图形的标签添加可以使用ggpubr包的ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....()函数添加标签在ggarrange()函数中，使用labels参数给每张小图添加标签。...widths # 相对列宽度的数值向量；如widths = c(2, 1)表示第1列宽度是第2列宽度的两倍 heights # 同上 legend # 指定图例位置的字符；允许值为"top", "bottom...# legend = "none"表示移除图例 common.legend # 逻辑词，是否子图使用同一图例。

7.2K2 0

ggplot2学习笔记之图形排列

主要讲解如何利用包gridExtra、cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列。...其中： label:标签 x,y:控制标签位置 size:标签字体大小下面通过一个例子来讲解如何将多个图形放置在特定的位置。...ggpubr::ggarrange()可以为组合图形添加共同图例 common.legeng=TRUE:在图形旁边添加图例 legend：指定legend的位置，主要选项有：top、bottom、left...ggplot图形中嵌入图形元素 ggplot2::annotation_custom()可以添加各种图形元素到ggplot图中 annotation_custom(grob, xmin, xmax,...多页排列日常工作中我们有时要绘制许多图，假如我们有16幅图，每页排列4张的话就需要4页才能排完，而ggpubr::ggarrange()可以通过制定行列数自动在多页之间进行图形排列 multi.page

2.4K2 0

ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并

图形组合使用ggpubr包的函数ggarrange（）中在一页上进行组合展示 1）ToothGrowth数据集的箱线图，点图组合展示 ggarrange(Box_plot, Dot_plot,labels...#图的边缘放置共同的唯一图例：common.legend = TRUE参数 ggarrange(bxp, dp, labels = c("A", "B"), common.legend...2）mtcars 数据集的条形图，散点图组合展示 figure <- ggarrange(Scatter_plots, Bar_plot + font("x.text", size = 10),ncol...3）ggarrange（）函数更改绘图的列/行跨度 #散点图在第一行跨两列，箱形图和点图并于第二行 ggarrange(Scatter_plots,...", widths = c(2, 1), heights = c(1, 2), common.legend = TRUE) ?

2.4K2 0

数据分析-cuttag分析流程分享2-R代码可视化流程处理

在进行R语言的可视化的时候，建议也是把该用的包都提前安装上，这样可以省去后面报错的心累。...// ###在分析之前建议用biocmanager装包省时省力 library(dplyr) library(stringr) library(ggplot2) library(viridis) library...，由于我是在服务器上调用的R，所以选用了ggplot2的包来保存pdf图片的结果，如果是在windows的R下面操作，可以直接看图片进行保存。...Alignment Rate (E.coli)") plot1 = ggarrange(fig3A, fig3B, fig3C, fig3D, ncol = 2, nrow=2, common.legend...其实在后面的差异peak分析（官网推荐的方法）时，有的是不用IgG去除一定背景的，所以有的公司的人说其实是可以不用做IgG对照的，但是这个感觉还是看主要的研究内容是什么，来进行相关的考虑的。

2.7K4 1

多子图如何一键绘制标签label?这些技巧推荐收藏~~

今天小编给大家介绍一个绘图小娇巧-多图汇总时图标签(如A、B (a)、(b)、(I)和(II)等)，这类技巧尤其是在科学文献中经常用到，虽然可以手动添加此类标签，但在绘图过程中自动标记处理则可方便的多。...主要内容如下： R绘图自动添加技巧 Python绘图自动添加技巧 R绘图自动添加技巧在R语言绘制图表小编主要使用ggplot2和一些第三方包，这里小编就介绍R-ggpubr和R-patchwork包绘制方法...(R-ggplot2包可通过labs(tag="**") 方法进行添加，这里不多做介绍)，详细内容如下： R-ggpubr包添加在R-ggpubr包中，你可以通过ggarrange()函数在一个页面中添加多个子图和添加对应的...proplot库进行图例添加的例子，更多详细内容可参考：proplot A-b-c labels 设置[3]。...总结今天的推文，小编简单介绍了如何使用R和Python在绘图过程中灵活添加子图Tag,这一技巧在绘制多个子图时则十分方便有效。

1.6K2 0

温故而知新，ggplot2 饼图的几点笔记

关于饼状图被批评为可视化效果差，不推荐在 R 社区中使用的文章在网络也有不少，感兴趣的可以去搜一下。不管怎么说，学习一下总不是坏事，趁着一些客户刚好对饼图有需求，重温一下。...coord_polar coord_polar() 是 ggplot2 中的极坐标函数，它可以弯曲横纵坐标，使用这个函数做出蜘蛛图或饼图的效果。...对于并列柱状图 p，以最大的 y 值作为 360 度的弧度，剩下的按比例类推，由于 p 中 A、B、C 是等长的，所以在 p1 中它们的半径是 1:2:3。...虽然在 dat 数据框中设置是顺序一致方向相同的对应，但图片分布中会改变。...在画饼图的过程中设定填充的因子方向总和图片坐标中的方向相反，不过因子的顺序和数据 dat$Num 的对应关系是正向对应或者反向对应，会影响相关区块的中心位置值计算的方式，从而影响 geom_text

1.3K1 0

R包：gtable包用于处理ggplot2图像

ggplot2是基于grid的绘图工具，它绘制的图像其实是由多个grob（grid graph object）组成的，比如一张点图，它的标题是titleGrob，点图的基本单元包括pointsGrob。...很多工具包都可以进行拼图或嵌图，比如cowplot、patchwork、ggpubr、gridExtra等等，但是gtable是相对底层的进行操纵ggplot2对象的包。...对于ncol、nrow参数而言，它们几乎已经是拼图布局的行列定义的标签了，在多个拼图工具中都能见到，比如ggpubr的ggarrange函数，当然这也不奇怪，毕竟ggarrange就是依赖的cowplot...gtable进行拼图如果要使用gtable进行拼图，只需要创建一个1行2列的gtable对象，然后每个位置填入相应的图像即可。填充图形是使用的gtable_add_grob实现的。...panel占据新建的gtable全部方格，而g2_new只在右上方方格 # 于是g2_new就是g1_panel的40%大小 fig_embed <- gtable(widths = unit(c(0.6

2.3K3 0

ggplot2:计数图（Counts Plot）

, 发现里面有一张图和自己没能画出来的非常像，才知道这类图叫计数图（Counts plot）,但是印象里ggplot2好像没有现成的函数来做这个事情，在不知如何下手之际突然想到之前看过一篇文章Top 50...ggplot2 Visualizations - The Master List (With Full R Code), 应该会有对应的内容，果不其然，发现了 ggplot2 包中的 geom_count...其中一种解决办法是用 jitter plot (这个jitter自己也不知道如何翻译)来代替 Scatter plot（散点图）ggplot2 对应的函数为 geom_jitter(),他可以让重叠的点随机分布在原始位置的周围...(p1,p2,ncol=2,labels=LETTERS[1:2]) 上图使用的数据为R语言自带的数据包 mpg 另外一种解决办法就是文章开头提到的Counts Plot(计数图)，散点重叠的位置只画一个点...尝试着添加标签时遇到了问题暂时还不知道如何解决 ? 同时还遇到了其他问题有两个图例如果想只删掉其中一个应该如何做？

1.5K3 0

vissE--提供不同的基因集富集分析方法！

该软件包利用基因集与通路数据库和基因本体中可能存在的固有层次结构之间的相关性来聚类结果。对于 vissE 识别的每个基因集集群，通过文本挖掘来表征生物功能和过程。...overlap是基于基因集之间的基因overlap计算的。或者可以使用overlap系数（用于突出层次重叠）。...对基因集名称或其简短描述进行频率分析，以评估cluster中重复出现的生物学themes。然后将这些结果呈现为词云。...library(ggplot2) #模拟基因集统计 set.seed(36) genes = unique(unlist(geneIds(geneset_gsc))) gene_stats = rnorm...(p1, p2, p3, ncol = 3, common.legend = TRUE, legend = 'bottom') 小编总结 vissE包利用基因集与通路数据库和基因本体中可能存在的固有层次结构之间的相关性来聚类结果

5113 0

R海拾遗-图片拼接

概述对于ggplot，不支持将多个图片拼接的操作，因此绝大多数的人使用ps或者ppt进行拼接图片，包括我，现在可以使用软件包来完成安装包：patchwork patchwork的作用是将不同的ggplot...组合到同一个图形中。...## 拼接图片后，作为一个新的绘图单元，可以添加ggplot2的元素 p1 + p2 + labs(subtitle = 'This will appear in the last plot') ?...## 使用/布局 p1 / p2 ? ## 更复杂的布局 p1 | (p2 / p3) ?...## 4.额外的包ggpubr 同时在浏览patchwork包中，其实很多包能够完成这些操作，比较简单的是ggpubr library(ggpubr) # 基础拼接 ggarrange(p1,p2,p3

9351 0

手把手带你复现NC图表之Figure 4

41467_2023_35832_MOESM16_ESM.xlsx", as.data.frame=T, header=T) #在文章中的...RColorBrewer::brewer.pal(5, "Set1") names(Mod_cols) <- levels(A.M_pT_res_stats2$Module) Figure 4D 热图显示DPT中肺泡成纤维细胞进展为肌成纤维细胞时差异表达的基因...用层次聚类法将这些基因分组到DPT表达谱定义的模块中 AM.PT_TUMOUR_Heatmap <- pheatmap(t(datExpr_CTR.TUMOUR_median)[order(gene_order...用层次聚类法将这些基因分组到DPT表达谱定义的模块中 TM.PT_TUMOUR_Heatmap <- pheatmap(Heatmap_df, scale =...共有模块由在肺泡成纤维细胞至肌成纤维细胞和外膜成纤维细胞至肌成纤维细胞轨迹中分配到相同簇的基因组成，列出了每个模块的10个代表性基因 Mod.Overlap_df <- cbind(A.M_pT_res_stats2

4601 0

手把手带你复现NC图表之Figure6

，使用TCGA-LUAD数据集测试 #为了研究将肌成纤维细胞丰度作为LUAD患者分层的预后生物标志物的潜力，我们使用TCGA-LUAD数据集作为测试队列，以确定将样本分类为肌成纤维细胞高和低的最佳阈值...TCGA中LUAD25样本进行二分的标准化对数秩生存统计量（与总生存率的相关性）的变化。...队列患者生存率，按肌成纤维细胞丰度使用二分最佳临界点分层 Fig_6C <- ggarrange(Myo.ggsurvplot_list$TCGA$plot + theme(plot.title...= T, legend = "none") Fig_6D Figure 6E 散点图显示使用不同截点按肺泡成纤维细胞丰度对TCGA中LUAD25样本进行二分的标准化对数秩生存统计量（与总生存率的相关性...这种关联在肺泡成纤维细胞中尤其一致，在所有分析的数据集中都是显著的。因此，采用与上述相同的方法来测试将肺泡成纤维细胞丰度作为预后标志物的可能性。

3362 0

如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

以下代码显示了在标准图表制作工作流程中应如何使用bbc_style（）。这是一个非常简单的折线图的示例，使用了来自gapminder包的数据。...添加到guide中来更改图例符号的默认外观，例如下面将增加图例符号的大小： + guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 4)))) 在图例标签之间添加空格...在轴标签中添加千位分隔符可以指定轴文本具有千位分隔符，并带有scale_y_continuous的参数。...您可以在调用labs（）时将其更改为所需的任何内容。...使用\ n在标签中的必要位置添加换行，并使用lineheight设置行高。

13.1K1 0

ggplot2自定义离散型热图图例

本节来介绍ggplot2绘制中图例设置方面的问题，通过一个热图的案例进行阐述。整个过程仅参考，希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2中的图例体系 ❝在ggplot2中针对图例的自定义设置可通过guide与guides函数来完成，二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致，但是使用时却也有些许不同。...❞ guide函数作为scale_类函数中的一个内函数，通常配合比例尺函数一起使用，但是由于取其内含有众多的参数，因此在比例尺中使用则会显得代码比较臃肿，因此小编比较推荐单独使用guides函数来进行图例自定义...❝因此在使用前需针对图例所对应的几何对象来选择正确的函数，同时在实际绘图过程中图例绘制还存在一种情况，即数据为连续型但是在绘制图例将其定义为离散型。...针对这种情况上方所列的两个函数就无法实现。这时就可使用「guide_colorsteps」函数来实现，该函数可将区域显示为单一恒定颜色，而不是从颜色条对应项中已知的渐变。

2181 0

R可视化：不一样的ggplot2箱线图

欢迎大家关注全网生信学习者系列：WX公zhong号：生信学习者Xiao hong书：生信学习者知hu：生信学习者CDSN：生信学习者2介绍使用 ggplot2 包画箱线图通常使用 geom_boxplot...在ggplot2 中，可以通过使用 geom_point() 来在箱线图上增加点，这些点可以代表分组中特定指标的出现率。...density: 密度参数，可能用于调整箱线图内密度图的显示。legend.h: 图例的高度。legend.x.pos 和 legend.y.pos: 图例在图表中的位置。...legend.pixel: 图例中图案的像素大小。legend.w: 图例的宽度。legend.label: 图例的标签，用于说明不同图案代表的组别或条件。...pl结果：带有显示Index在不同分组出现率的箱线图画图: prism主题结果：带有显示Index在不同分组出现率的prism风格的箱线图

2590 0

R语言从入门到精通：Day17 (ggplot2绘图)

分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。ggplot2包在定义组或面时使用因子(factor)（主要涉及函数facet_grid()）。...在R中，组通常用分类变量的水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。...在基础图形中可以实现的图形“组合”在ggplot2中自然也不是难事，可以使用函数facet_wrap()和函数facet_grid()创建。...我们在前面已经见过了函数geom_smooth()的例子，该函数中的参数含义依次为：method代表要使用的平滑函数，如lm、glm等；参数formula代表在函数中使用的公式，和回归分析中的参数formula...如果我想要把图13里面在右边的图例换个位置，那也不是一件难事，如图14。图14，图例修改示意图 ?

5.2K3 1

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2画世界地图展示采样地点

，但是论文的数据是公开的，可以用论文中的数据复现一下论文中的结果，今天的推文试着复现一下论文中的figure1a 世界地图的数据 ggplot2自带了一份地图数据，可以直接使用，这里需要注意的是我们画的是没有国家边界的世界地图...，如果是带有国家边界的地图，使用数据的时候需要小心。...ggplot2画地图 library(ggplot2) world<-map_data("world") ggplot() + geom_polygon(data=world,aes(x=long...，有没有办法用代码调整每个图例的位置呢？...暂时没有找到解决办法 2 图例的标题如何用代码设置上下标暂时没有找到解决办法这连个问题目前的解决办法是出图后编辑图片采样地点数据可以到论文中去下载，代码可以在推文中复制

2.9K1 0

Top50ggplot2Visualizations_第2幅：面积图

第一部分公众号里有朋友提问——在散点图添加拟合曲线的图中如何添加一条虚线对角线？ ?...image.png 就是由图A变成图B；应该有很多方法可以实现，这里我使用geom_segment()函数 geom_segment()函数需要四个参数：起点位置坐标和终点位置坐标，默认是实线；通过linetype...上面图片的实现代码 head(cars) library(ggplot2) p1<-ggplot(cars,aes(x=speed,y=dist))+ geom_point()+ geom_smooth...=F)+ theme_bw()+ geom_segment(aes(x=0,xend=25,y=0,yend=120), linetype=2) ggpubr::ggarrange..."B")) 第二部分原文地址 http://r-statistics.co/Top50-Ggplot2-Visualizations-MasterList-R-Code.html 今天重复这个教程中的第二幅图

8201 0

R语言之可视化⑤R图形系统目录

R base graphs R带有简单的函数来创建许多类型的图形。例如： ? 在大多数情况下，您可以使用以下参数来自定义绘图： pch：改变点形状。允许值包括1到25之间的数字。...安装软件包后，使用R命令install.packages（“lattice”）。格子包中的主要功能： ? 创建y乘以x的基本散点图。语法：y~x。...按组更改颜色并使用auto.key = TRUE显示图例： library("lattice") xyplot( Sepal.Length ~ Petal.Length, group = Species...ggplot2中的gg表示图形语法，这是一个图形概念，通过使用“语法”来描述图。...ggplot2包中的主要功能是ggplot（），它可用于使用数据和x / y变量初始化绘图系统。

1.8K5 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭