首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在带有ggplot2的ggarrange中使用common.legend时缺少图例项

的问题通常是由于数据不一致导致的。ggarrange函数可以将多个ggplot2图形排列在一起,并且通过设置common.legend参数来共享一个图例。当使用common.legend时,ggarrange会自动将每个图形的图例项合并为一个图例显示。然而,如果图形的数据不一致,就会出现缺少图例项的情况。

解决这个问题的方法是确保所有图形的数据和图例项一致。可以通过以下几种方式来实现:

  1. 确保每个图形中使用的数据集相同。检查代码中的数据源,确保它们都是同一个数据框或数据集。
  2. 检查每个图形中使用的图例项。确保每个图形中需要显示的图例项名称一致,并且它们都包含在数据集中。
  3. 确保每个图形中使用的图例项的颜色、形状等属性一致。检查代码中设置图例项属性的部分,确保它们都是一致的。

如果以上方法仍然无法解决问题,可能需要进一步检查代码中是否存在其他导致图例项缺失的问题。可以逐行检查代码,确保没有其他设置或操作会导致图例项被删除或隐藏。

对于ggplot2中的common.legend参数缺少图例项的具体解决方法会因具体情况而异。一般建议参考ggplot2的官方文档、在线教程或社区论坛来获取更具体的帮助和解决方案。

以下是腾讯云相关产品和产品介绍链接地址:

  1. 腾讯云服务器(云计算基础设施):https://cloud.tencent.com/product/cvm
  2. 腾讯云数据库(云数据库服务):https://cloud.tencent.com/product/cdb
  3. 腾讯云人工智能(AI服务):https://cloud.tencent.com/product/ai
  4. 腾讯云物联网(IoT服务):https://cloud.tencent.com/product/iotexplorer
  5. 腾讯云移动开发(移动开发平台):https://cloud.tencent.com/product/cmobile
  6. 腾讯云存储(云存储服务):https://cloud.tencent.com/product/cos
  7. 腾讯云区块链(区块链服务):https://cloud.tencent.com/product/baas
  8. 腾讯云元宇宙(元宇宙开发平台):https://cloud.tencent.com/product/vr
页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

ggplot2作图共享图例方法一:ggpubr包ggarrange()函数以及调整图例布局

使用ggplot2作图时候如果多个图拼接到一起,图例互相之间有一样时候,比如如下情况(我们用R语言内置鸢尾花数据集做三个散点图) ?...这里拼图使用函数是ggpubr这个包里ggarrange()函数,这个函数里有一个参数是common.legend,默认好像是FALSE,我们直接设置成TRUE就好了,代码如下 ggarrange(...image.png 还有一个legend参数用来控制图例位置 ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3, common.legend = T, legend...image.png 图例放到顶部,默认布局是3行3列,如果要改成1行6列呢?ggplot2里应该有对应参数可以修改吧?...但是目前还不知道如何使用ggplot2自带函数来操作,查资料时候发现了一个R包lemon里有一个reposition_legend()函数 参考资料链接是 https://cran.r-project.org

4.6K51

R语言统计与绘图:给组合图形添加ABCD小标签

前面我们学习了ggplot2组合图形绘制,科研论文中,组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签,如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以PS或者AI添加,也可以R中直接添加。...今天我们来学习组合图形怎么添加ABCD标签。 组合图形标签添加可以使用ggpubr包ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....()函数添加标签 ggarrange()函数使用labels参数给每张小图添加标签。...widths # 相对列宽度数值向量;如widths = c(2, 1)表示第1列宽度是第2列宽度两倍 heights # 同上 legend # 指定图例位置字符;允许值为"top", "bottom...# legend = "none"表示移除图例 common.legend # 逻辑词,是否子图使用同一图例

6.9K20
  • ggplot2学习笔记之图形排列

    主要讲解如何利用包gridExtra、cowplot以及ggpubr函数进行图形排列。...其中: label:标签 x,y:控制标签位置 size:标签字体大小 下面通过一个例子来讲解如何将多个图形放置特定位置。...ggpubr::ggarrange()可以为组合图形添加共同图例 common.legeng=TRUE:图形旁边添加图例 legend:指定legend位置,主要选项有:top、bottom、left...ggplot图形嵌入图形元素 ggplot2::annotation_custom()可以添加各种图形元素到ggplot图中 annotation_custom(grob, xmin, xmax,...多页排列 日常工作我们有时要绘制许多图,假如我们有16幅图,每页排列4张的话就需要4页才能排完,而ggpubr::ggarrange()可以通过制定行列数自动多页之间进行图形排列 multi.page

    2.4K20

    数据分析-cuttag分析流程分享2-R代码可视化流程处理

    进行R语言可视化时候,建议也是把该用包都提前安装上,这样可以省去后面报错心累。...// ###分析之前建议用biocmanager装包 省时省力 library(dplyr) library(stringr) library(ggplot2) library(viridis) library...,由于我是服务器上调用R,所以选用了ggplot2包来保存pdf图片结果,如果是windowsR下面操作,可以直接看图片进行保存。...Alignment Rate (E.coli)") plot1 = ggarrange(fig3A, fig3B, fig3C, fig3D, ncol = 2, nrow=2, common.legend...其实在后面的差异peak分析(官网推荐方法),有的是不用IgG去除一定背景,所以有的公司的人说其实是可以不用做IgG对照,但是这个感觉还是看主要研究内容是什么,来进行相关考虑

    2.5K41

    多子图如何一键绘制标签label?这些技巧推荐收藏~~

    今天小编给大家介绍一个绘图小娇巧-多图汇总图标签(如A、B (a)、(b)、(I)和(II)等),这类技巧尤其是科学文献中经常用到,虽然可以手动添加此类标签,但在绘图过程自动标记处理则可方便多。...主要内容如下: R绘图自动添加技巧 Python绘图自动添加技巧 R绘图自动添加技巧 R语言绘制图表小编主要使用ggplot2和一些第三方包,这里小编就介绍R-ggpubr和R-patchwork包绘制方法...(R-ggplot2包可通过labs(tag="**") 方法进行添加,这里不多做介绍),详细内容如下: R-ggpubr包添加 R-ggpubr包,你可以通过ggarrange()函数一个页面添加多个子图和添加对应...proplot库进行图例添加例子,更多详细内容可参考:proplot A-b-c labels 设置[3]。...总结 今天推文,小编简单介绍了如何使用R和Python绘图过程灵活添加子图Tag,这一技巧绘制多个子图则十分方便有效。

    1.5K20

    温故而知新,ggplot2 饼图几点笔记

    关于饼状图被批评为可视化效果差,不推荐 R 社区中使用文章在网络也有不少,感兴趣可以去搜一下。 不管怎么说,学习一下总不是坏事,趁着一些客户刚好对饼图有需求,重温一下。...coord_polar coord_polar() 是 ggplot2 极坐标函数,它可以弯曲横纵坐标,使用这个函数做出蜘蛛图或饼图效果。...对于并列柱状图 p,以最大 y 值作为 360 度弧度,剩下按比例类推,由于 p A、B、C 是等长,所以 p1 它们半径是 1:2:3。...虽然 dat 数据框设置是顺序一致方向相同对应,但图片分布中会改变。...画饼图过程设定填充因子方向总和图片坐标方向相反,不过因子顺序和数据 dat$Num 对应关系是正向对应或者反向对应,会影响相关区块中心位置值计算方式,从而影响 geom_text

    1.3K10

    R包:gtable包用于处理ggplot2图像

    ggplot2是基于grid绘图工具,它绘制图像其实是由多个grob(grid graph object)组成,比如一张点图,它标题是titleGrob,点图基本单元包括pointsGrob。...很多工具包都可以进行拼图或嵌图, 比如cowplot、patchwork、ggpubr、gridExtra等等,但是gtable是相对底层进行操纵ggplot2对象包。...对于ncol、nrow参数而言,它们几乎已经是拼图布局行列定义标签了,多个拼图工具中都能见到,比如ggpubrggarrange函数,当然这也不奇怪,毕竟ggarrange就是依赖cowplot...gtable进行拼图 如果要使用gtable进行拼图,只需要创建一个1行2列gtable对象,然后每个位置填入相应图像即可。 填充图形是使用gtable_add_grob实现。...panel占据新建gtable全部方格,而g2_new只右上方方格 # 于是g2_new就是g1_panel40%大小 fig_embed <- gtable(widths = unit(c(0.6

    2.3K30

    ggplot2:计数图(Counts Plot)

    , 发现里面有一张图和自己没能画出来非常像,才知道这类图叫计数图(Counts plot),但是印象里ggplot2好像没有现成函数来做这个事情,不知如何下手之际突然想到之前看过一篇文章Top 50...ggplot2 Visualizations - The Master List (With Full R Code), 应该会有对应内容,果不其然,发现了 ggplot2 geom_count...其中一种解决办法是用 jitter plot (这个jitter自己也不知道如何翻译)来代替 Scatter plot(散点图)ggplot2 对应函数为 geom_jitter(),他可以让重叠点随机分布原始位置周围...(p1,p2,ncol=2,labels=LETTERS[1:2]) 上图使用数据为R语言自带数据包 mpg 另外一种解决办法就是文章开头提到Counts Plot(计数图),散点重叠位置只画一个点...尝试着添加标签遇到了问题暂时还不知道如何解决 ? 同时还遇到了其他问题 有两个图例如果想只删掉其中一个应该如何做?

    1.5K30

    vissE--提供不同基因集富集分析方法!

    该软件包利用基因集与通路数据库和基因本体可能存在固有层次结构之间相关性来聚类结果。对于 vissE 识别的每个基因集集群,通过文本挖掘来表征生物功能和过程。...overlap是基于基因集之间基因overlap计算。或者可以使用overlap系数(用于突出层次重叠)。...对基因集名称或其简短描述进行频率分析,以评估cluster重复出现生物学themes。然后将这些结果呈现为词云。...library(ggplot2) #模拟基因集统计 set.seed(36) genes = unique(unlist(geneIds(geneset_gsc))) gene_stats = rnorm...(p1, p2, p3, ncol = 3, common.legend = TRUE, legend = 'bottom') 小编总结 vissE包利用基因集与通路数据库和基因本体可能存在固有层次结构之间相关性来聚类结果

    49330

    手把手带你复现NC图表之Figure 4

    41467_2023_35832_MOESM16_ESM.xlsx", as.data.frame=T, header=T) #文章...RColorBrewer::brewer.pal(5, "Set1") names(Mod_cols) <- levels(A.M_pT_res_stats2$Module) Figure 4D 热图显示DPT肺泡成纤维细胞进展为肌成纤维细胞时差异表达基因...用层次聚类法将这些基因分组到DPT表达谱定义模块 AM.PT_TUMOUR_Heatmap <- pheatmap(t(datExpr_CTR.TUMOUR_median)[order(gene_order...用层次聚类法将这些基因分组到DPT表达谱定义模块 TM.PT_TUMOUR_Heatmap <- pheatmap(Heatmap_df, scale =...共有模块由肺泡成纤维细胞至肌成纤维细胞和外膜成纤维细胞至肌成纤维细胞轨迹中分配到相同簇基因组成,列出了每个模块10个代表性基因 Mod.Overlap_df <- cbind(A.M_pT_res_stats2

    44610

    手把手带你复现NC图表之Figure6

    使用TCGA-LUAD数据集测试 #为了研究将肌成纤维细胞丰度作为LUAD患者分层预后生物标志物潜力,我们使用TCGA-LUAD数据集作为测试队列,以确定将样本分类为肌成纤维细胞高和低最佳阈值...TCGALUAD25样本进行二分标准化对数秩生存统计量(与总生存率相关性)变化。...队列患者生存率,按肌成纤维细胞丰度使用二分最佳临界点分层 Fig_6C <- ggarrange(Myo.ggsurvplot_list$TCGA$plot + theme(plot.title...= T, legend = "none") Fig_6D Figure 6E 散点图显示使用不同截点按肺泡成纤维细胞丰度对TCGALUAD25样本进行二分标准化对数秩生存统计量(与总生存率相关性...这种关联在肺泡成纤维细胞尤其一致,在所有分析数据集中都是显著。因此,采用与上述相同方法来测试将肺泡成纤维细胞丰度作为预后标志物可能性。

    31920

    ggplot2自定义离散型热图图例

    本节来介绍ggplot2绘制图例设置方面的问题,通过一个热图案例进行阐述。整个过程仅参考,希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2图例体系 ❝ggplot2针对图例自定义设置可通过guide与guides函数来完成,二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致,但是使用时却也有些许不同。...❞ guide函数作为scale_类函数一个内函数,通常配合比例尺函数一起使用,但是由于取其内含有众多参数,因此比例尺中使用则会显得代码比较臃肿,因此小编比较推荐单独使用guides函数来进行图例自定义...❝因此使用前需针对图例所对应几何对象来选择正确函数,同时实际绘图过程图例绘制还存在一种情况,即数据为连续型但是绘制图例将其定义为离散型。...针对这种情况上方所列两个函数就无法实现。这时就可使用「guide_colorsteps」函数来实现,该函数可将区域显示为单一恒定颜色,而不是从颜色条对应已知渐变。

    19910

    R可视化:不一样ggplot2箱线图

    欢迎大家关注全网生信学习者系列:WX公zhong号:生信学习者Xiao hong书:生信学习者知hu:生信学习者CDSN:生信学习者2介绍使用 ggplot2 包画箱线图通常使用 geom_boxplot...ggplot2 ,可以通过使用 geom_point() 来箱线图上增加点,这些点可以代表分组特定指标的出现率。...density: 密度参数,可能用于调整箱线图内密度图显示。legend.h: 图例高度。legend.x.pos 和 legend.y.pos: 图例图表位置。...legend.pixel: 图例图案像素大小。legend.w: 图例宽度。legend.label: 图例标签,用于说明不同图案代表组别或条件。...pl结果:带有显示Index不同分组出现率箱线图画图: prism主题结果:带有显示Index不同分组出现率prism风格箱线图

    14000

    R语言从入门到精通:Day17 (ggplot2绘图)

    分组指的是一个图形显示两组或多组观察结果。小面化指的是单独、并排图形上显示观察组。ggplot2定义组或面使用因子(factor)(主要涉及函数facet_grid())。...R,组通常用分类变量水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型视觉特征分组变量来完成。...基础图形可以实现图形“组合”ggplot2自然也不是难事,可以使用函数facet_wrap()和函数facet_grid()创建。...我们在前面已经见过了函数geom_smooth()例子,该函数参数含义依次为:method代表要使用平滑函数,如lm、glm等;参数formula代表函数中使用公式,和回归分析参数formula...如果我想要把图13里面右边图例换个位置,那也不是一件难事,如图14。 图14,图例修改示意图 ?

    5.1K31

    跟着Nature Communication学作图:R语言ggplot2画世界地图展示采样地点

    ,但是论文数据是公开,可以用论文中数据复现一下论文中结果,今天推文试着复现一下论文中figure1a 世界地图数据 ggplot2自带了一份地图数据,可以直接使用,这里需要注意是我们画是没有国家边界世界地图...,如果是带有国家边界地图,使用数据时候需要小心。...ggplot2画地图 library(ggplot2) world<-map_data("world") ggplot() + geom_polygon(data=world,aes(x=long...,有没有办法用代码调整每个图例位置呢?...暂时没有找到解决办法 2 图例标题如何用代码设置上下标暂时没有找到解决办法 这连个问题目前解决办法是出图后编辑图片 采样地点数据可以到论文中去下载,代码可以推文中复制

    2.7K10
    领券