在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...然而，提供一个 plot()用于一个对象的可视化总结帮助用户理解该对象是有帮助的。为了满足你的所有用户，我们建议写一个函数将这个对象转换为一个数据框（如果更加复杂，可以是包含数据框的列表）。
library(tidyverse) library(patchwork) dt <- diamonds[1:1000, ] 众所周知，在ggplot2中，对于分类型变量，我们可以通过将其转换为factor...类型，并通过设置其levels控制其在坐标轴的顺序。...中，数值从小到大是从下向上排序的，在我的levels中，"Premium"排在前面（序号最小），所以它排在最下面。...但如果我们想要让需要最小的排在最上面（从小到大对应从上往下），我们可以把levels的顺序反过来。...中序号从小到大对应变量从上到下排列，但是同时产生了一个新的问题：在legend中变量的排列也反了过来。
image.png 对照论文然后看数据和代码，能够更好的理解论文的设计和分析思路，非常好的学习素材。论文的主要研究内容还没有看太懂，好像是研究了越南和坦桑尼亚的一些厕所的微生物多样性。...数据集的部分截图，总共是81行，52列，行是物种，列是地点，数值代表物种丰度 ?...row.names=1指定第一列作为数据集的行名 check.names 参数我平时很少用，，查了一下帮助文档，作用是检查每列的名字是否符合规范 ?...(Samples),transform,rescale=sqrt(Value)) ggplot2画图 library(ggplot2) p ggplot(df, aes(Species, Samples...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本
论文 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk0989 image.png 最近朋友圈好多人都在转这个论文，我也找来看了看，论文研究的内容看的还是一知半解...论文用到的数据代码都是公开的，我们可以学习一下其中的代码 代码链接 https://github.com/James-S-Santangelo/glue_pc 今天的图文重复论文中的Figure 2B...to PC2 这里为什么只展示对PC2的贡献暂时还不明白。...library(ggplot2) ng1 <- theme(aspect.ratio=0.7,panel.background = element_blank(), panel.grid.major...enviroPCA_variableContrib ggplot() + geom_hline(yintercept = 0, linetype = "dotted") + geom_vline
今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfc.1 head(dfc.1) 作图的代码 ggplot...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
前言 先前提到了60-R可视化-8-用ggsignif做统计分析绘图 (qq.com)这个包。 当时挖了一个坑： 那么问题来了，我的字体该加到哪里呢？...基本的ggplot 就够了 比如你可以将内容以captain 的形式加在图片的侧方。 ggstatsplot 就是个很好的例子： subtitle, captain 都是很不错的选择。...参考下面就行了：57-R可视化-6-ggplot2基石三部曲最终之进阶为菜鸟 (qq.com) 我非要加在图片里 p ggplot(iris) + geom_point(aes(Sepal.Length...：画好了柱状图，希望在柱状图上标记出相应的数字。...当然先给你们展示一下效果啦： 在画图前，先提一个技巧。
涉及到的知识点如下: 1.iris鸢尾花数据集的简单介绍 2.assign ()和get () 联合使用，存储及调用横/纵坐标的名称 3.for 循环中调用ggplot，实现批量绘图 一. iris...其次，我们定义一下iris数据集中的4个数值型变量的英文缩写以及单位 （不一定符合实际） 变量 缩写 单位 Sepal.Length SL mm Sepal.Width SW mm Petal.Length...ggplot，实现批量绘图: 重申一下，本篇教程解决的问题是 - 以iris数据集中的前3个变量为自变量，第4个变量Petal.Width为因变量，用ggplot批量绘制散点图，并用简单线性回归拟合。...先加载程序需要的安装包 library(ggplot2) for 循环中调用ggplot，实现批量绘图 windowsFonts(roman=windowsFont("Times New Roman")...",sep=""),plot=p,width =17,height=10) #以自变量的名称为文件名 } 用Photoshop排了一下版（也可以直接用R排版，但是稍微有些许麻烦），得到散点图集如下: Fig
R.30: Take smart pointers as parameters only to explicitly express lifetime semantics R.30: 只有在包含明确的生命周期语义时使用智能指针作参数...如果一个函数只是需要一个部件本身，接受一个智能指针作参数是错误的。它应该可以接受所有部件对象，而不只是一个生命周期被按照特定方法管理的对象。不需要管理生命周期的函数应该使用原始的指针和引用。...（简单）如果一个函数使用了可拷贝的（重载了操作符->和操作符*的）智能指针类型的参数但是只是调用了运算符*、->或者get(),发出警告并建议使用T*或者T&。...标记定义了（重载了操作符->和操作符*的）可拷贝/可移动智能指针类型的参数，但在函数体中却从未使用拷贝和移动功能，指针从未被修改也没有交给一个会那么做的函数的情况。那意味着所有权语义根本没有被使用。...原文链接 https://github.com/isocpp/CppCoreGuidelines/blob/master/CppCoreGuidelines.md#r30-take-smart-pointers-as-parameters-only-to-explicitly-express-lifetime-semantics
facet_wrap（）的第一个参数应该是一个公式，你用〜后跟一个变量名创建（这里“formula”是R中数据结构的名称，而不是“equation”的同义词）。...要在两个变量的组合上构建绘图，请将facet_grid（）添加到绘图调用中facet_grid（）的第一个参数也是一个公式。 这次公式应该包含两个用〜分隔的变量名。 ?...而不是变量名，例如facet_grid（.〜cyl）。 Genometric Objects 两个图包含相同的x变量，相同的y变量，并且都描述相同的数据。 但情节并不完全相同。...每个图使用不同的可视对象来表示数据。 在ggplot2语法中，我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...这里，4代表四轮驱动，f代表前轮驱动，r代表后轮驱动。 如果这听起来很奇怪，我们可以通过在原始数据上叠加线条然后根据drv着色所有内容来使其更清晰。 请注意，此图包含同一图表中的两个geom！
点击下方公众号，回复资料分享，收获惊喜 简介 最近在看一些关于贝叶斯深度学习在可靠性方向应用的文章，看到下面这篇文章，发表在可靠性方向顶刊的 ITR 中。...ITR 期刊，可靠性领域顶刊 本文主要介绍：使用贝叶斯深度学习来预测产品剩余使用寿命，但是传统的深度学习方法只能得到未来时间点的估计值，并不能包含不确定性因素，而使用贝叶斯深度学习，最后可以得到未来时间点预测值的分布...这里我们假设每个时间点的密度函数服从正态分布，均值分别为 1：5，标准差都为 1。颜色是自己比较喜欢的几种配色，参考小明的推文：R语言ggplot2画图一套好看的配色以及调整字体的简单小例子。...真实值也可以在循环中加入，这里就不再进行啦。 如果你想换一种箱子风格可以调整 bty 参数，例如：bty = "g" , bty = "f"等。...参考资料 [1] 3D Plots with ggplot2 and Plotly: https://www.r-bloggers.com/2014/11/3d-plots-with-ggplot2-and-plotly
在之前的教程中，我们在学习各类数据分析方法的过程中学习创建了各种各样的普通图形和特殊图形，它们大部分都是利用R的基础绘图系统创建的。...除了基础图形，grid、lattice和ggplot2软件包也提供了图形系统，它们克服了R基础图形系统的低效性，大大扩展了R的绘图能力。...它通过全面一致的语法帮助我们将多变量的数据集进行可视化，并且很容易生成R自带图形难以生成的图形。...第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的身高和语音变量等。 第二个是mtcars数据集，它包含32辆汽车的详细信息。...在R中，组通常用分类变量的水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。
简介 ggplot2是目前主流的绘图R包，有着丰富的扩展包。今天来推荐一个极其强大的配色R包——paletteer包。...探索paletteer包 在使用paletteer包绘制图形前先看看paletteer包的调色板情况。 2.1 离散型调色板 palettes_d_name是一个包含了R包和离散型调色板的数据集。...可以看到数据集共有1788行，包含4个变量，分别表示R包、调色板、调色板中的颜色数量、调色板类型等。 2.2 连续型调色板 palettes_c_name是一个包含了R包和连续型调色板的数据集。...可以看到数据集共有315行，包含3个变量，分别表示R包、调色板、调色板类型等。 3. paletteer包的用法 3.1 主要函数 paletteer包使用起来很简单，包中有4个主要的函数。...ggsci包是一个很优秀的调色板，我们可以在paletteer包中使用ggsci包的调色板。
双变量数据可视化可能对于我们比较简单， 但是如果变量是三个或者更多，怎么在一幅图一起显示呢？今天我们就来讨论这个问题，解决方案有两种。 1.数据介绍 使用R包自带的mpg数据集，前几行展示如下。...3.1.facet_wrap() 当想通过单个变量进行分面，则可以使用函数`facet_wrap()`其第一个参数是一个公式，创建公式的方式是在~符号后面加一个变量名，并且该变量应该是离散的。...3.2.facet_grid() 如果想通过两个变量对图进行分面，则使用`facet_grid()`。这个函数第一个参数也是公式，但该公式包含由~隔开的两个变量。...它是指用于分面的包含每个变量元素所有数据的数据组。很好用的参数！ 具体例子如下： 用drv与cyl变量进行分面，x轴方向是cyl，y轴方向是drv的值。注意的是俩都是分类型变量。...~cyl) 4.4.要在每个面板中重复相同的数据，只需构造一个不包含faceting变量的数据框架。
前言在 Python 中，数据容器是组织和管理数据的重要工具，集合作为其中一种基本的数据结构，具有独特的特性和广泛的应用。本章详细介绍了集合的定义、常用操作以及遍历方法。...定义字面量：{元素1，元素2，元素3，元素4，...}定义变量：变量名称 = {元素1，元素2，元素3，元素4，…}定义空元组：变量名称 =set()②特点：可容纳多个数据可容纳不同类型的数据（混装）可修改...：对比集合1和集合2，在集合1内删除和集合2相同的元素，集合1被修改，集合2不变。...', 'best'，请按如下要求操作：1.定义一个空集合2.通过for循环遍历列表3.在for循环中将列表的元素添加至集合4.最终得到元素去重后的集合对象，并打印输出my_list = ['新闻', '...in my_list: # 在for循坏中将列表元素添加至集合 my_set.add(element)print(f"列表的内容为{my_list}")print(f"通过for循坏得到的集合为
这里使用R中的ggplot()和geom_point()函数。...柱状图和条形图 使用场景：柱状图一般用于表现分类的变量或者是连续的分类变量的组合。 在超市数据的例子中，如果我们需要知道在每一年新开的超市的门店数量，那么柱状图就是一个很好的图形分析的方式。...下面是一个简单的画堆叠条形图的例子，使用的是R中的ggplot()函数。...箱线图 使用场景：箱线图一般用于相对复杂的场景，通常是组合分类的连续变量。这种图表应用于对数据延伸的可视化分析和检测离值群。主要包含数据的5个重要节点，最小值，25%，50%，75%和最大值。...R程序的简单介绍，相信你可以使用R中的ggplot库进行自己的数据可视化分析了。
第一次提问：在r编程语言里面绘制一个箱线图 在R语言中，你可以使用ggplot2包来绘制箱线图，或者使用基础图形系统中的boxplot()函数。...", x = "Category", y = "Values") 使用基础R函数boxplot()绘制箱线图 如果你不想使用ggplot2，可以使用R的基础图形函数boxplot()： # 使用相同的模拟数据...第二次提问；还有ggpubr包，ggstat等吗 在R语言中，除了ggplot2包之外，还有几个扩展包可以用于绘制包含统计信息的图形，包括箱线图。...() # 添加p值和显著性标记 ggstatsplot包： ggstatsplot是另一个ggplot2的扩展包，它允许用户创建包含统计细节的图形。...例如，如果你在创建一个自定义函数来绘制图形，并且函数内部使用了select()，你需要确保传递给select()的变量名在数据框中不是重复的。
今天跟大家分享ggplot图表系统中形状。 在ggplot函数系统中，形状是一类重要的映射属性，如同颜色一样，它可以被赋予给变量，当然也可以直接指定实际的形状类别。...ggplot函数的图层理念中，修改局部图层的元素，需要在局部图层内进行设定，这里需要在geom_point（）函数内部进行形状设定。 R绘图系统中存储着的形状符号多达25种： ?...颜色变量是所有属性中为数不多的既可以使用离散型变量、又可以使用连续性变量进行映射的属性 二、关于制定属性映射时shape、size、colour（fill）的位置问题。...如果属性是指定给数据集中的变量（无论是连续性还是离散型）的话，那么一定要包含在美学属性之内（aes()）：因为只有包含在aes（）中，软件才能通过在数据集中调用对应变量进行映射。...（比如本例中同时作用于折线图和散点图的数据集、x轴y轴变量以及分组变量等） 以上是个人学习ggplot函数过程中所获得的一些体会和心得，希望能够帮助大家在学习R语言可视化过程中少走一些弯路，限于个人能力和水平
R有几种不同的系统用来产生图形，但ggplot2是最优雅而多变的那一种。ggplot2实现了图形语法，一种描述和构建图形的逻辑系统。通过ggplo2，我们能够快速学习，多处应用。...其所属的分组不由它们在矩阵中的位置决定，而是在一个单独的列中指定。 术语 数据是我们想要可视化的对象。它包含了若干变量，变量存储于数据框的每一列。...在上述例子中，geom_point()函数在图形中画点，创建了一个散点图。labs()函数是可选的，可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数，并且大多数包含可选的参数。...分组 在R中，组通常用分类变量的水平（因子）来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...不过指导它们的存在是有用的。 修改ggplot2图形的外观 R的基础绘图中,使用par()函数或特定的画图函数的图形参数来自定义基本函数。
分面在美学映射那一节中，当我们需要把大于两个变量映射到图形中时，x轴和y轴就已经不够用了，需要通过形状和颜色等可区分的形式来代表新增的变量，但是一味的在一张图中增加多种映射会导致图上的信息密度过高，可读性差...单变量分面对于单个变量的分面，可以用函数facet_wrap()，它的第一个参数是一个表达式，用~ variable来表示，就是在~后加上变量名，注意这里的变量需要是离散的：library(ggplot2...其实并不直观，因为针对连续变量，一般是想看到它连续变化时的影响，如下图，就可以直观看出不同型号的汽车的每加仑高速里程并不是一直和发动机排量成正比的：ggplot(data = mpg[1:15, ])...图片有3张空图，那再看不分面的：ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = drv, y = cyl))图片可以看到三种传动类型(drv)都没有包含...~ drv)图片参考资料：https://r4ds.had.co.nz/index.html
，从而结束循 环，否则循环将一直执行下去，形成死循环。...③具体执行的语句 ④循环后，循环变量的变化情况 输出10次HelloWorld do...while 循环的特点：无条件执行一次循环体，即使我们将循环条件直接写成 false ，也依然会循...1.5 循环语句的区别 for 和 while 的小区别： 控制条件语句所控制的那个变量，在 for 循环结束后，就不能再被访问到了，而 while 循环结束还可 以继续使用，如果你想继续使用...原因是 for 循环结束，该变量就从 内存中消失，能够提高内存的使用效率。 在已知循环次数的时候使用推荐使用 for ，循环次数未知的时推荐使用 while 。...扩展知识点 2.1 死循环 死循环： 也就是循环中的条件永远为 true ，死循环的是永不结束的循环。例如： while(true){} 。
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