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在群集服务器上的slurm中提交R作业,并将对象保存在slurm工作目录以外的其他目录中

在群集服务器上使用slurm提交R作业,并将对象保存在slurm工作目录以外的其他目录中,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 首先,确保你已经安装了slurm并且配置了群集服务器。slurm是一个开源的作业调度系统,用于管理和调度群集上的作业。
  2. 创建一个R脚本,用于执行你的任务。在脚本中,你可以指定R代码来完成你的任务。例如,你可以使用以下命令创建一个名为"myjob.R"的R脚本:
代码语言:txt
复制
# myjob.R
# 这里是你的R代码
  1. 在你的R脚本中,指定你想要保存对象的目录。你可以使用R的setwd()函数来设置工作目录,例如:
代码语言:txt
复制
# myjob.R
setwd("/path/to/your/directory")
# 这里是你的R代码
  1. 在群集服务器上使用slurm提交你的R作业。你可以使用sbatch命令来提交作业,并指定你的R脚本作为参数。例如,使用以下命令提交作业:
代码语言:txt
复制
sbatch myjob.R
  1. slurm将会在群集服务器上调度你的作业,并将其分配给可用的计算节点。你的R脚本将在计算节点上执行。
  2. 当你的作业完成后,你的对象将会保存在你在R脚本中指定的目录中。

需要注意的是,以上步骤假设你已经正确配置了slurm和群集服务器,并且你的R脚本中的代码是正确的。如果你遇到任何问题,可以参考slurm的文档或寻求相关支持。

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