昨天我们发现需要更新BioManager至3.18的话,就需要更新600多个r包。R包安装失败怎么办?(一)msigdbr
R 语言在统计作图方面有独特优势,目前已成为许多数据科学团队最常用的语言之一。本章简要介绍 R 语言的基础知识,让读者能够开启 R 语言的学习,首先要做的是准备工作环境。
在R中,你可以使用.libPaths()函数来查看R包的安装路径。这个函数会返回一个字符串向量,其中包含了所有R包的安装路径。默认情况下,第一个路径是你的个人R库的路径,其他的路径则是系统级别的R库路径。
如果你正在使用支持 R 的图形界面软件,应该存在通过菜单栏方式安装 R 包的选项(例如,常用的 Rstudio 中,可以点击菜单栏 Tools 中的 Install Packages… 进行 R 包的安装)。这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包,如下所示:
1.The following objects are masked from package: ...
曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》,介绍了批量运行R脚本的思路,同时也提出了一些问题,今天就这个学徒作业,我们来探究一下。
生物R包网站Bioconductor-安装方式BiocManager::install("包名")
Centos 下非 Root 安装 Microsoft R Open 作者: Hyacz hyacinth.hao@foxmail.com 2017年8月30日 本教程发布时仅针对 Microsoft R Open 3.4.0 版本测试通过。 写在前面 我们新写的 GWAS 的算法包 MVP 采用了 Microsoft R Open,在我们对计算的优化中 MRO 起到了非常关键的作用。在测试的时候就遇到了在没有 root 权限要安装 MRO 的问题,经过百度、Google 都没有找到较好的方案,研究了
很久很久以前,我期望通过 插件模式 让 TBtools 成为更多老师在生信数据分析中的得力助手。 插件模式
在Linux系统中,expect 是一款非常有用的工具,它允许用户自动化与需要用户输入进行交互的程序。本文将深入探讨expect命令的基本语法、使用方法以及一些最佳实践。
31. R studio/R 工具指南(十四:在Rstudio中使用python和conda)
R提供了语言环境,它提供了R的语法规则,编译,扩展包等信息。如果只用它自带的软件包来编写和调试R脚本的话,既耗时又费力,甚至不具有开发完整项目的条件。 所以,Rstudio提供了一个人性化的可视界面来操作R语言。在软件里可以创建完整的项目,编写脚本,查看变量值,获取绘图的结果等等。 打个比方,如果R是马,那么Rstudio就是马鞍。直接骑马的话也可以,但是人们不怎么舒服,如果加上马鞍,不仅美观漂亮而且还能提高效率。
参见:https://cloud.tencent.com/developer/article/1657000 https://zhuanlan.zhihu.com/p/164507492 https://rstudio.github.io/reticulate/index.html
--增加linux7安装11g,自动替换 $(MK_EMAGENT_NMECTL) -lnnz11。
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370
我自己本人不做 Electron 的开发,但有一位合作伙伴在使用 NSIS 打包 Electron 应用的时候遇到了一些问题,主要问题有以下几个,先记录下来,然后追个击破。
解决linux服务器间的数据、文件搬运和免密登录等问题; 从多种业务环境入手,以不同方式实现服务器间的文件传输;
终于,我们还是积累了一些 TBtools R Plugin 的用户,而他们常常会遇到一个问题,那就是 TBtools 的 R 插件本身是 R 脚本,而每一个
Composer是一种流行的PHP依赖管理工具,主要用于促进项目依赖项的安装和更新。它将根据项目要求使用适当的版本检查特定项目所依赖的其他软件包并为您安装。
dpkg是一个安装、创建、移除和管理debian包的工具。更多使用界面友好的dpkg的前端”dselect”,。dpkg完全受控于命令行参数,和零个或更多参数正确的组成一个操作方式。参数告诉dpkg要做什么和多种选项控制不同的行为。dpkg不仅提供了大量的参数选项, 同时也提供了许多子命令比如: dpkg-deb dpkg-divert dpkg-query dpkg-split dpkg-statoverride start-stop-daemon
之前写了一个脚本,可以让大家1行代码提取6种类型的表达矩阵以及对应的临床信息。但是很多人完全看不见注意事项或者根本看不懂,所以我决定改动一下。
首先介绍下Sqlserver 机器学习服务: 机器学习服务介绍: https://docs.microsoft.com/zh-cn/sql/machine-learning/sql-server-m
作者:张博 链接:https://www.zhihu.com/question/38081354/answer/81829426 来源:知乎 著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
转自:http://www.cnblogs.com/zhangbaoqiang/p/4792628.html
Expect是一个用来处理交互的工具,通常用于需要手动输入数据的场景,可在脚本中使用expect来实现自动化。
Flask是用python进行web开发时,常见的python web框架。 如果服务器可以连接到外网,可以简单的用 pip install Flask 直接将Flask的依赖包及Flask直接安装好。 但公司的测试环境,一般是内网,不能随表上连到外网,这就需要采用离线软件包方式安装了。 下面是我的测试安装过程。
做接口测试的话,首先要考虑的是如何选择一个合适的工具?在忽略工具是否好用,是否能满足业务要求的前提下,需要考虑以下2点:
在前面我们介绍了R和RStudio的安装教程,也简单介绍R的GUI的使用,包括包的安装,加载等进行简单的介绍,然而并不详细,对于初学者来说,可能很难理解,原因在于我们实际分析数据或者开发的时候,一般不用GUI,而是RStudio。对RStudio怎么使用却没有介绍,今天RStudio的使用教程。
Version: 软件的实际版本号,例如:1.0.1等,后面可使用%{version}引用
expect命令通过预测远程终端将要显示的提示字符串,自动输入密码或其他用户指定的字符串,实现自动化安装。有关expect命令的使用方法请见:
本文先介绍虚拟环境的基础知识以及使用方法,然后再深入介绍虚拟环境背后的工作原理。(环境:在macOS Mojave系统上使用最新版本的Python 3.7.x)
参考 https://github.com/bilibili/ijkplayer 项目的编译过程 ;
学习R语言最快的方式就是找代码、打代码。那么我们代码往哪里打呢,安装R软件中其实有很多需要我们注意的地方,比如路径不能有中文名什么的(这里我强烈建议大家的电脑用户名最好也是英文,自己的英文名什么的)等。
Oracle 18C/19C支持Grid/Oracle安装前安装RU补丁:-applyRU
如果jenkins部署在内网,而生产环境存在DMZ区的话,此方式就不太适合了,需要考虑其它方式来部署升级。
项目是一个很简单的springboot项目(可以自己开发一个,也可以直接导入资料中提供的),结构如下:
我仔细看了一下,原来Rstudio新建的脚本,默认的是R脚本,如果想要运行Python,需要新建Python脚本。
一直在Rstudio中编写R语言程序,这里,想用VScode进行R语言的编写,毕竟除了R语言,还要编写Python,Shell,Julia等语言,Vscode是通用的平台。
然后,在写这系列文章时,发现有些操作需要用到package.json中的属性。然后,有些属性看起来人畜无害,但是用起来却需要查很多的资料。所以,就想着。写一篇或者两篇关于package.json的文章。
本人在win7-64和win10-64均完整安装使用,其他系统本人能力所限没安装成功。 lefse本地分析包。(https://download.csdn.net/download/weixin_43585681/11530367) 安装python2.7。(https://download.csdn.net/download/weixin_43585681/11530532) R语言3.6.1(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/R-3.6.1-win.exe) 这个是我总结的安装需求
有奖转发活动 回复“抽奖”参与《2015年数据分析/数据挖掘工具大调查》有奖活动。 何品言翻译,广东科技学院大学生,喜欢R语言和数据科学。王陆勤审核,从事数据挖掘工作,专注机器学习研究与应用。英文链接
参考:https://www.jianshu.com/p/797778c7703e
Composer是一种流行的PHP 依赖管理工具,主要用于促进项目依赖项的安装和更新。它将根据项目要求使用适当的版本检查特定项目所依赖的其他软件包并为您安装。
当我们配置新电脑的时候,重新安装所有的 R 包往往很麻烦,特别是 R 包数量很多的时候。
WireGuard 的安装和使用条件非常苛刻,对内核版本要求极高,不仅如此,在不同的系统中,内核,内核源码包,内核头文件必须存在且这三者版本要一致。所以一般不建议在生成环境中安装,除非你对自己的操作很有把握。Red Hat、CentOS、Fedora 等系统的内核,内核源码包,内核头文件包名分别为 kernel、kernel-devel、kernel-headers,Debian、Ubuntu 等系统的内核,内核源码包,内核头文件包名分别为 kernel、linux-headers。
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最近涉及到一些打包相关的,之前都是打包脚本打包,涉及到的相关依赖文件打包到同一目录。在执行安装脚本部署。这次涉及到服务部署,需要打成deb包,有对应的deb打包脚本,但是在实际测试中,感觉打包脚本的编写还有测试比较麻烦。就找了一下有没有对应的打包工具,就查找到了这个打包工具。checkinstall
入门教材、day1、day2、day3、day4、day5、day6、day7、day8、day9、day10、day11、day12、day13、day14、day15、day16、day17
R 的下载:https://cran.r-project.org/mirrors.html 你可以在该链接内,寻找指定的镜像。
在Oracle运维中,有一个很基础的工作就是安装数据库软件,而这个工作一般少则需要花费个把小时,多则半天。 如果我们有大批量的服务器安装任务,那么这种时候你肯定会希望从这种重复性劳动中解放出来,人工操作还是会有或多或少的差错,而且耗时。 所以我简单写了下面的脚本,可以很流畅的安装好Oracle软件,很多基础工作都统一配置好了。 比如目前我的脚本结构如下: -rw-r--r-- 1 root root 4422615040 Jun 7 14:34 11204.tar -rw-r--r-- 1 root ro
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