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【2023最新版】Windows11:WSL(Ubuntu22.04)安装Anaconda(换源、各种报错及解决方案)+连接Pycharm进行远程开发

enter确认安装 开始安装,不出意外的话就要出意外了,报错来了 WARNING: md5sum mismatch of tar archive expected: b35af0fae8e8667609722e2c0d196f1d...啊,chatgpt说…… 根据您提供的报错信息,出现了两个问题:MD5校验和不匹配以及解压缩过程中出现了意外的数据结尾。...检查文件系统空间:确保在解压缩过程中有足够的磁盘空间。检查您的文件系统是否有足够的可用空间来解压缩Anaconda3。...base 退出环境 conda deactivate conda使用文档 管理 conda — conda 23.5.3.dev85 文档 https://docs.conda.io/projects...Linux 选择conda环境——base(或其它环境) 创建 测试代码 五、远程开发——使用 SSH 在另一台主机上WSL 实例 如图所示: 点击安装选项可修改安装位置 点击下载IDE并连接 安装

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    熟练使用Bioconda

    https://anaconda.org/bioconda/repo 为什么要选择使用 bioconda,因为其很好的解决了生物软件安装过程中的各种问题,主要包括以下几点: 1、...+重写了 conda 的部分功能,运行效率显著提高,可以进行并行的下载,使用 rpm 包管理工具中的 libsolv,可以更快的解决环境依赖问题。...更新基础 conda mamba update -n base -c defaults conda 更新全部包 mamba update -y --all 七、常见问题 conda 在使用过程中会遇到很多问题...7.2 搜索速度慢 conda 搜索或者安装初期一直在转圈,一直处于 solving environment 中。...原因: 这是因为 bioconda 中包含的软件越来越多,而且软件的不同版本都保留了下来,软件的索引文件越来越大,安装一个新软件时搜索满足环境中所有软件依赖的软件的搜索空间也会越来越大,导致

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    生信马拉松 Day14 conda!

    ,因为我们用的大多数软件主要在bioconda里,所以把相应频道列在最前面,conda就会最先找如何查看配置镜像结果:配置镜像完成后会在~/.condarc 文件中写入cat ~/.bashrc# 查看镜像配置的结果可以考虑手动删除...defaults,因为是官方频道,有时连接比较慢sed -i‘/defaults/d' ~/.condarc创建独立小环境,建议不要往base环境安装任何软件包,如果不小心装进base里了,那只要conda...-y的作用是代替我写yes去安装conda只要能正常使用就没有必要升级,但3.8以后conda有较大的更新,更早的版本conda建议升级创建小环境成功之后会出现3个done,代表成功了哪些软件可以用conda...clean -a 清空环境中所有的缓存tarball 压缩包,index,package(没有安装的包)3.把~/.condarc中的https中的s去掉变成http,去掉安全相关的交互信息4.换个时间再试试一直在...solving environment1.网络差,换个时间试试2.conda clean -a 清空环境中的缓存3.实在不行就重新创建环境安装频道404添加的频道不存在,从.condarc文件中删除错误频道后重新添加

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    《利用Python进行数据分析·第3版》学习笔记1·准备环境

    第三版多了41页内容,pandas升级为1.4.0、Python升级为3.10。第三版最大的变化是紧贴pandas升级,主要是新增了方法和特性的内容。...曾经不止一次听别人抱怨,pandas的知识点分散、零碎、不便于记忆。在细节上,作者这次在新版中摒弃了许多容易造成记忆混乱的用法。...将conda-forge配置为默认的包安装方式: (base) $ conda config --add channels conda-forge (base) $ conda config --set...channel_priority strict 为了使操作环境更为纯净,使用虚拟环境,虚拟环境的名字是pydata-book,命令如下: (base) $ conda create -y -n pydata-book...安装完毕后,使用conda activate激活环境: (base) $ conda activate pydata-book (pydata-book) $ 看到$前出现了(pydata-book),

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    conda创建虚拟环境后文件夹中只有conda-meta文件夹,无法将环境添加到IDE中

    1.问题描述:anaconda的envs的其中一个环境目录下,没有python.exe文件,只有conda-meta和scripts 平时创建虚拟环境都是: conda create -n test...#test为创建的虚拟环境名称 因为之前也创建过好几次了,在命令行中也没有报任何错误,于是准备将刚配置的test虚拟环境添加到pycharm解释器中,但是发现在test环境中根本找不到除conda-meta...解决方案: anaconda虚拟环境 使用的还是base环境的python/pip 当时新建xxxx虚拟环境时 并没有指定python版本 直接conda create -n xxxxx然后激活后看到python...是此anaconda默认版本的python 以为就没问题了 原来不指定python版本的话这个env文件夹下就没有bin文件夹 无法正常激活、使用 使用的还是base环境(尽管前面标出了一个(xxxxx...)) 删除有问题的虚拟环境:(base环境中执行) conda remove -n xxxx --all 重新新建虚拟环境,新建时指定python版本 conda create -n test python

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    安装conda和jupyter notebook

    下面是conda的一些基本命令: 升级 conda update conda conda update anaconda conda update anaconda-navigator /...conda环境使用基本命令: conda update -n base conda //update最新版本的conda conda create -n xxxx python=3.5...但是因为在它上面只能运行py语言,所以必须装c,c++内核,但是在linux环境下装其内核很难办,于是 有了一开始的conda,接下来需要notebook 的运行环境, yum install -y...#指定一个访问端口,默认8888,注意和映射的docker端口对应 绑定地址一定要弄,可以让所以的浏览器都可以访问,这里有个巨坑,之前一直报错(错误已经忘了,因为后面还有两个印象更深的错误,需要将*改为...0.0.0.0 忘了说了,之前我们输入自己的密码后,需要记住自己的密码外,还需要复制linux系统给你弹出的一串密码,在配置文件中需要用到 如果是宝塔面板(默认8888)端口,这时我我们需要配置为8889

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    新版Mamba体验超快的软件安装

    在一文掌握Conda软件安装:虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移中详细介绍的conda的基本使用和遇到问题的解决方式,也提到了mamba作为一个替代工具,可以很好的加速conda的solving...但有时也会遇到一个很尴尬的问题想用mamba就得先装mamba, 之前通过conda install mamba -n base -c conda-forge有时也会卡在solving environemnt...想用mamba解决solving environemnt,就得先解决安装mamba的solving environemnt。 现在新版的mamba支持开箱即用了,下载、初始化就可以使用。...error/Segment fault/段错误 怎么办 2.4.11 Conda为什么越来越慢?...2.4.14 如何提速Conda solving environment 2.4.15 从了通道外还能怎么下载提速 2.4.16 使用conda-pack直接从已经安装好的地方拷贝一份 (同一操作系统)

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    Anconda安装

    我本来也不想写这个文章的,只不过是这次换了新系统很多配置都没有用了。。。一败涂地哇。我现在什么也干不了,人生大好时间配了环境。。。 不比比了,开搞! ?...默认情况下,活动环境---您当前使用的环境---显示在命令提示符开头的括号()或括号[]中:(myenv) $   如果您没有看到这个,请运行:conda info --envs   在显示的环境列表中...2、激活环境   conda activate myenv 普通打开的cmd不成功,我也折腾了好久,上面的错误还是有的。 ?...里面有着一个基本的python解释器, lLib里面也有base环境下的各种包文件....导入导出环境 如果想要导出当前环境的包信息可以用 conda env export > environment.yaml 将包信息存入yaml文件中.

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    可重复的生信分析系列二:Conda的介绍

    Conda可以快速安装,运行和更新软件包及其依赖的环境与工具。Conda可以轻松地在本地计算机上的环境中创建,保存,加载和切换。它是为Python程序创建的,但可以适用于任何语言的软件。...因为它可以创建不同的虚拟环境,使得不兼容的工具在相对独立的环境中运行,两者之间不冲突和打架。 关于几个conda 什么是Anaconda? Anaconda是Conda的发行的一个安装包。...的环境管理 相信大部分的小伙伴对上面提到的分析都应该了如指掌了,但是conda在可重复的生信分析中,究竟能起到一个什么的作用,下面请听我细说: 什么是Conda的环境?...我强烈不建议在同一环境中安装所有软件包/工具。这个是很多新手玩家会犯的错误。很多刚刚入门生信的初学者,都会一个劲的在base的环境里,安装各种各样他们所需的工具。...conda deactivate: conda deactivate # 回到之前的base了 # (base) root@d470a3e9da91:/tmp# 通过命令来手动指定需要安装的软件包

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    Anaconda完全入门指南 原

    python环境有了大概的了解, 其实最关键的, 一个python环境中需要有一个解释器, 和一个包集合....为了避免可能发生的错误, 我们在命令行输入conda upgrade --all 先把所有工具包进行升级 管理虚拟环境 接下来我们就可以用anaconda来创建我们一个个独立的python环境了.接下来的例子都是在命令行操作的...试试, 这样会进入base环境的python解释器, 如果你把原来环境中的python环境去除掉会更能体会到, 这个时候在命令行中使用的已经不是你原来的python而是base环境下的python.而命令行前面也会多一个...conda env list 去查看所有的环境 现在的learn环境除了python自带的一些官方包之外是没有其他包的, 一个比较干净的环境我们可以试试 先输入python打开python解释器然后输入...image.png 结语 现在你是不是发现用上anaconda就可以十分优雅简单的解决上面所提及的单个python环境所带来的弊端了呢, 而且也明白了其实这一切的实现并没有那么神奇.

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    Conda简单教程

    在命令行中执行命令:python,如果在进入的Python交互式环境中显示有Anaconda信息,则表明已经安装完毕,如下所示: Python 3.8.8 (default, Apr 13 2021,...示例:创建一个名称为myenv的环境,同时在该环境中安装一个numpy包 conda create -n myenv numpy 当然,也可以只创建环境而不用安装包:conda create -n myenv...如果在项目开发和部署过程中遇到如下场景,都可以考虑使用Conda(以依赖numpy模块为例说明): 1.在同一台机器上需要同时安装两个版本的numpy,可以通过Conda为每个版本的numpy创建一个虚拟环境...2.在同一台机器上有多个项目运行,但是可能有一些项目需要用Python3运行,同时另外一些项目需要用Python2运行,同时安装这两个版本的Python可能会导致很多混乱和错误。...因此,最好是有单独的虚拟环境来管理和使用,这也可以通过Conda来解决。 总结为一句话:在需要对Python环境或模块版本进行隔离的时候都可以使用Conda。

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    手把手教你如何在Ubuntu下安装Miniconda

    解释一下为什么用conda来创建python环境 现在基于linux的发行版本有很多,有centos,ubuntu,redHat等,一般情况下,基于linux的衍生系统,至少都安装了Python2版本,...但是现在Python已经是3.x版本大行其道了。...安装位置就在用户目录下,所以不能执行 rm -rf * 命令了,要不然还得重新安装 ? 前面一直有个(base) ???...可能细心的会发现,在执行完source .bashrc 之后,前面就会有一个(base),新建session还有一个(base)。 ? 这其实就已经代表激活了base(最基础)环境。...在Linux系统上,介绍了Minoconda的安装方法及其常用的语法命令,通过具体的例子展示,图文并茂,帮助大家理解和学习。 如果你觉得文章还可以,记得点赞留言支持我们哈,感谢你的阅读。

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    为你的Jupyter Notebooks注入一剂强心针

    一旦您按照下面的说明操作,您的Jupyter Notebooks将具有以下出色的功能(如果您愿意,还会有更多可能): 无需重新启动Jupyter Notebooks即可在飞行中的多个Conda环境之间切换...# Kill and exit the Notebook server # Make sure you are in the base conda environment conda activate...这将确保我们可以通过在内核菜单中简单地选择环境来切换环境。切换内核时不需要重启笔记本。 假设您在Anaconda中创建了两个自定义环境my_NLP和gym。...现在打开你的Jupyter Notebooks,进入Kernel菜单中的Change Kernel选项,然后……Boom! 您应该能够看到所有列在那里的内核,现在只需单击它们就可以激活它们。...代码段扩展与工作中的目录生成扩展一起使用。 ? 便条簿扩展 请告诉我您对Jupyter Notebooks的这些增强功能有何看法。如果您在安装扩展时遇到任何错误,请随时发表评论。

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    RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具

    /anaconda/cloud/bioconda/ 用vim进行查看 vim ~/.condarc 二 学习conda基本操作的管理环境 -搜索bwa进行安装(注意是在conda环境下(base))...bwa命令就可以了,同理可以进行samtools的软链接 ln -s ~/miniconda3/bin/samtools ~/.local/bin 三 管理环境变量 安装python2环境 启动minicon3...macs2,但是一旦退出环境就不能用了 source deactivate#退出python2 source deactivate#退出base 现在macs2无法使用,解决方式和上面的bwa一样 第一.../envs/python2/ 总结 conda安装小技巧 -1 根据软件所用的编程语言确定安装策略 -2 安装conda不要添加到环境变量中,用source activate启动 -3...我不小心按了y,在python3安装完成了,然后用conda install htseq卸载) conda install htseq -y 启动htseq-count htseq-count 继续搜索

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