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BeagleBone Black 固件升级

，一怒之下就开始老老实实学习如何升级 BBB 的固件了…… 结果发现其实也并不难…… 一、前言 在 BeagleBone Black 自带的网页说明上，基本上已经把固件升级步骤说的比较详细了。...但该类别中的唯一一个系统镜像是 2014 年版本的 Debian 镜像，也就是 BBB 板的出厂时系统自带的初始镜像，比较陈旧，所以建议更换其他镜像。...在 SD 卡中烧写镜像 把下载好的镜像解压出来，然后用 Win32 DiskImager 将解压后的镜像文件烧写进 SD 卡中。烧写大致如下图所示： ? 5....此时上电之后，此时并没有把镜像烧写进 BBB 电路板中，而是读取了烧写进 SD 卡中的系统到 BBB 板中，然后再运行。...此时我们将卡槽中的 SD 卡弹出，重新上电，用 PuTTY 登录板子上的 debian 用户。 登录成功后，PuTTY 上会显示 BBB 运行的系统。

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还不会基因型数据填充？来看这一篇！

对基因型数据进行分析时，无论是GWAS还是GS，都需要对基因型数据进行填充，这里使用Beagle软件说明一下如何对基因型数据进行填充。 1....-Xmx10g，10表示10Gb内存，可以修改 -jar beagle.jar，这个beagle.jar就是我们下载的填充软件 3.2 填充命令 gt=[file]，比如gt=a.vcf，就是被填充文件...但是，填充软件beagle确实可以在windows下运行，下面演示一下。...6.2 自填充 文件： 进入cmd路径，切换到文件夹中： windows设置最大内存，报错，就去掉内存设置参数： java -jar beagle.jar window=50 overlap=20...gt=b.vcf out=re_imputed nthreads=2 结果： 6.3 填充到参考群中 切换到文件夹，进入cmd文件 运行命令： java -jar beagle.jar window

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    一篇搞定基因型数据填充！

    对基因型数据进行分析时，无论是GWAS还是GS，都需要对基因型数据进行填充，这里使用Beagle软件说明一下如何对基因型数据进行填充。 1....-Xmx10g，10表示10Gb内存，可以修改 -jar beagle.jar，这个beagle.jar就是我们下载的填充软件 3.2 填充命令 gt=[file]，比如gt=a.vcf，就是被填充文件...但是，填充软件beagle确实可以在windows下运行，下面演示一下。...6.2 自填充 文件： 进入cmd路径，切换到文件夹中： windows设置最大内存，报错，就去掉内存设置参数： java -jar beagle.jar window=50 overlap=20 gt...=b.vcf out=re_imputed nthreads=2 结果： 6.3 填充到参考群中 切换到文件夹，进入cmd文件 运行命令： java -jar beagle.jar window=50

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    SNP2HLA学习笔记

    v3.04 http://faculty.washington.edu/browning/beagle/recent.versions/beagle_3.0.4_05May09.zip beagle2linkage.jar.../SNP2HLA这个文件夹里，而且是运行的文件（plink、beagle.jar、linkage2beagle.jar和beagle2linkage.jar）。...在尸肾移植中，HLA-DR配型效果更甚于HLA-A，B配型。...HLA配型的作用可以归纳为： ①在肾移植中，供受双方共有的DR抗原越多，或已检查出的DR错配抗原数越少，移植存活率就越高； ②在移植前输血的患者中，DR配型能提高存活率； ③骨髓移植前不宜输血，以防止受体被免疫...因此由于HLA系统的高度多态性；新生儿出生时HLA抗原就忆完整表达；以及HLA的遗传规律已阐明等原因，而使其成为亲子鉴定中的一个有力工具，能肯定某些亲子关系。这在法医学中具有重在意义。

    1.5K30

    Linux 启动时间优化实战，2.41 秒启动应用！

    目标系统 硬件: Beagle Bone Black (Cortex A8) USB 摄像头 + LCD 软件： Linux 5.1 + Buildroot rootfs FFmpeg，用于采集视频并解码到...优化后的结果： 文件系统：从 16.11 MB 缩小到 3.54 MB (-78 %)。 程序的加载和运行时间：缩短 150 ms。 整体启动时间：缩短 350 ms。...在空间的优化很大，但是在启动时间上的优化很小，这是因为 Linux 运行程序时只加载程序的必要部分。...预设 loops per jiffy 在每次启动时，内核都会校准 delay loop 的值，用于 udelay() 函数。 这会测量 loops per jiffy (lpj) 的值。...点击查看大图 注意，这只是在 BeagleBone Black + Linux 5.1 上的测试结果，不同平台之间有差异。 禁用 /proc 等伪文件系统 要考虑应用的兼容性。

    4.2K50

    评估 beagle 基因型填充的准确率

    最简单的一个思路，只保留vcf文件中不包含任何缺失数据的位点。然后随机把某些样本的部分位点替换成缺失，用beagle做基因型填充，比较填充后和填充前的一致性。...temp_list))) fw.close() fw02.close() fr.close() 三个位置参数是 输入vcf 输出vcf 和随机选中位点的基因型 truth.sites文件的内容...image.png 每列的内容 位点行 样本列 基因型 基因型填充 time java -Xmx96g -jar \ ~/anaconda3/envs/syri/share/beagle-5.2_21Apr21.304...-0/beagle.jar \ gt=output.snp.vcf \ out=output.snp.impute \ nthreads=48 这个填充我之前印象里运行是非常慢的。...不知道这个运行很慢的印象是怎么来的了 提取填充过后的基因型 python getImputeSites.py output.snp.impute.vcf.gz truth.snp.sites call.snp.sites

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    物联网IEC 61499 101标准介绍

    如果您有Informatic背景，您可以将PLC看作是Raspberry Pi，Arduino，Beagle Bone Black或具有输入和输出的类似嵌入式板，但是为行业做好准备。...编程PLC时，您需要一个IDE（集成开发环境，也就是一个程序，您可以在通常的计算机上运行的PLC供应商（Windows， linux，mac），并允许您对应用程序进行编码，然后将其上传到PLC。...当事件到达时，在FB中发生的确切顺序显示在下一个图像中。事件和数据连接不兼容，这意味着您无法以任何方式将它们连接在一起。...现在，由于该标准面向分布式系统，因此应用程序不需要仅在一个设备中运行。 它可以拆分并部署在多个设备（PLC）中。 不仅如此，您可以拥有许多应用程序，分布在许多设备上。...这些算法由用户编写，例如使用结构文本（IEC 61131中定义的编程语言之一）。粉红色框是在访问状态时触发的输出事件。

    2.3K50

    Kaggle 实战：Ghouls, Goblins, and Ghosts

    $ color: Factor w/ 6 levels "black","blood",..: 4 5 1 1 5 5 6 4 3 6 ......） has_soul -灵魂的百分比 color -体表颜色，分为’white’,’black’,’clear’,’blue’,’green’,’blood’六种 type -怪物的类型，分为’Ghost...multiplot(plotlist = plots, cols = 2) 通过图像可以看到怪物中的两类Ghost和Ghoul在四个变量上区分度比较高，而Goblin则处于中间位置，同其他两类的特征都有交集...fm.base, data=train, method="class", control=tc) 模型结果中有很多信息，其中比较重要的是一个变量重要度variable.importance，给出了各个模型特征在模型训练中的重要程度...id, type = pred.base) write.csv(res, file = "D:/RData/Ghost/res_basic.csv", row.names = FALSE) 我们把结果文件

    2K00

    平头哥 TH1520 RISC-V BeagleV-Ahead使用Thead-Yocto自定义构建系统 最详细版本

    pwd=rqm4 文件比较大，文件名称为 yocto-downloads_light-beagle_thead-image-linux.tar.gz 拷贝到虚拟机 ~ 家目录后，使用如下命令进行解压缩...编译过程中 很有可能会出现各种奇怪的错误，请不要着急，一般情况下是因为 配置不够，或者网络原因导致的，如果无法找到原因 可以在 https://forums.100ask.net/c/elinuxdev...开始烧录 进入到编译好的镜像文件夹，在 xuantie-yocto/ 目录下的 thead-build/light-fm/tmp-glibc/deploy/images/light-beagle/ 目录...整个编译过程比较快，正常30分钟以内，因为只是做一些打包处理工作，但是在编译时 可能会出现一些报错等问题，需要解决。...[外链图片转存中…(img-S6wWEu5y-1690085570057)] ​ 运行起来以后，可以观察显示屏，已经在运行了我们编译好的 LVGL DEMO示例。

    2K40

    文献解读|不同基因型填充软件性能的比较

    中对前3个因素，共4X2X14=112种组合的填充结果进行评估。...可以看到，随着SNP密度的提高，填充准确率逐渐上升，二者呈现正相关关系，在大于200/MB时，斜率上升趋势变得平缓，说明至少要保证200/MB的snp密度，基因型填充的准确率才有所保障。...chr1中使用不同reference panel的结果如下所示 ? 可以看到，reference panel的选择对impute2的结果几乎没有影响，其准确率非常稳定。...对于不同的reference panel而言，panel越大，运行时间越长。其中impute2的运行时间最久，beagle4.1的运行时间最短，其次是shapeit2+impute2的组合。...对于不同软件而言，impute2的内存消耗最大，其次是shapeit2+impute2， 内存消耗最小的是beagle4.1。 study样本大小对填充准确率和运行时间的影响如下 ?

    2.2K20

    快速有效的IBD检测工具：hap-ibd

    在谱系的背景下，共享单倍型仅通过共同祖先来获得。第二类方法，也是hap-ibd使用的方法，寻找在phased或没有phased基因型数据中相同等位基因的长片段。...工具安装 工具作者提供了可以直接运行的jar版本，直接下载下来就能使用了： wget https://faculty.washington.edu/browning/hap-ibd.jar 使用命令行运行该工具...如果您的数据是没有phased的，可以使用Beagle程序对数据进行imputation。...map="PLINK map file with cM units" 具有 cM 单位的 PLINK 格式遗传图谱，遗传图谱和输入 VCF 文件中的染色体标识符必须匹配。...（1 或 2） 5.染色体 6.线段中第一个标记的基础坐标 7.线段中最后一个标记的基础坐标 8.IBD段的cM长度 运行示例 下载好两个测试文件： wget https://raw.githubusercontent.com

    2.5K20

    鸿蒙 Next 对接 AI API 实现文字对话功能指南

    项目初始化在 DevEco Studio 内创建新的鸿蒙 Next 应用项目。创建时，依据应用定位，精准选择合适的模板与配置选项。...网络权限申请在应用的\entry\src\main\module.json5配置文件中，明确声明网络访问权限，这是应用与 AI API 进行数据交互的基础。...集成 AI API 可使用 nodejs 转发在\entry\src\main\resources\base\profile\main_pages.json文件中配置页面：{ "src": ["pages...检查用户输入的文字能否准确传递给 AI API，AI 回复是否符合预期，多轮对话时上下文信息的传递是否正确，以及应用在长时间对话中的性能表现等。...在开发过程中，需充分利用鸿蒙系统资源，严格遵循开发规范，持续打磨细节，才能打造出优质的应用。

    40710

    单细胞分析 | 使用 Monocle 3 进行发育轨迹分析

    引言 在本指南[1]中，会展示如何利用Monocle 3软件和单细胞ATAC-seq数据来构建细胞发展轨迹。...acc=GSE129785 请注意，片段文件包含在GSE129785_RAW.tar压缩包内，但未提供该片段文件的索引。...根据的理解，造血干细胞是轨迹中其他细胞类型的起源，因此可以将这些干细胞设定为轨迹的起点。Monocle 3 提供了一个交互式工具，允许用户在图形界面中选择哪些细胞作为轨迹的起点。...如果在调用 order_cells() 函数时没有明确指定 root_cells 参数，该工具就会被激活。...在这里，已经预先选定了一些细胞作为起点，并将这些选择保存到了一个文件中，以确保结果的可重现性。

    1K10

    Pandas 重置索引深度总结

    今天我们来讨论 Pandas 中的 reset_index() 方法，包括为什么我们需要在 Pandas 中重置 DataFrame 的索引，以及我们应该如何应用该方法 在本文我们将使用 Kaggle...() 方法将 DataFrame 索引重置为默认数字索引，在以下情况下特别有用： 执行数据整理时——尤其是过滤数据或删除缺失值等预处理操作，会导致较小的 DataFrame 具有不再连续的数字索引 当索引应该被视为一个常见的...DataFrame 列时 当索引标签没有提供有关数据的任何有价值的信息时 如何调整 Reset_Index() 方法 前面的讨论中，我们看到了当我们不向它传递任何参数时，reset_index() 方法是如何工作的...否则，如果我们不想将旧索引保留为列，我们可以在索引重置后将其从 DataFrame 中完全删除（drop=True）： df Output: Animal ID Name DateTime MonthYear...如何将修改直接保存到原始 DataFrame 中 最后我们又完整的完成了一个在删除缺失值后重置 DataFrame 索引的实战案例 好了，这就是今天分享的全部内容

    1.8K40

    Elasticsearch Query Rule 现已普遍可用

    这在需要将品牌或赞助结果固定在搜索结果顶部的活动中非常有用，也可以帮助你在一些常见查询中“修正”顶部结果。...Query Rule首次在8.10.0版本中作为技术预览功能引入，允许索引维护者根据上下文查询条件策划特定文档，并将其固定在结果顶部。Query Rule如何工作？...你首先定义一个Query Rule集，识别在查询中发送的特定元数据时需要提升的文档。在搜索时，你将这些元数据与规则查询一起发送。如果规则查询中的元数据与任何规则匹配，这些规则将应用于你的结果集。...另一个 puppies2 规则将在首选年龄小于或等于2时返回相同的狗。adult 规则将在首选年龄在2到10之间时固定一个特定的比格犬。...我们有一个复杂的 special_needs 规则，只有在潜在的主人在家工作，有围栏的院子，没有孩子或猫在家时才会触发。

    43020

    5分钟杀入MCP生态，我是如何构建MCP Bone这个产品的

    开发者可以在MCP Bone的页面上，以简单的方式，注册自己的应用可能涉及的MCP Server，这些MCP Server会运行在云端，随后，开发者可以通过传统的Restful接口形式，从MCP Bone...当然，本文不是为了推广MCP Bone，而是向你展示一个MCP项目从设想到开发到上线的全过程。希望你也在开发MCP相关项目时，有所借鉴。...工具列表的构造 通过MCP Bone可以做到。MCP Bone做了一层适配，以适应大模型调用工具的需求。让我们思考一下，我们在调用LLM服务时，是如何传参的？...完成这个合并之后，开发者在调用API时，与之前调用大模型的completion接口一摸一样，即一个completion接口的调用，不需要考虑工具调用，（工具调用的123过程由MCP Bone在云端完成，...另一个场景则是通过MCP Bone集中管理自己常用的MCP Server，在不同的客户端（如Cursor和Cline）中，使用mcp-bone来共享相同的工具列表，这样，我们可以避免在切换工具工作时，需要重新配置

    17010
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