在GWAS中,查找lead SNP是一种常见的分析方法,用于确定与特定性状或疾病相关的单核苷酸多态性(SNP)。Lead SNP通常是与该性状或疾病最强相关的SNP。
在查找lead SNP时,可以按照邻近度分组的行的最小值来进行。这意味着将SNP按照其在基因组上的位置进行分组,并找到每个分组中具有最小p值(或其他相关统计指标)的SNP作为lead SNP。
这种方法的优势在于可以减少多重比较的问题,并提高对真实相关SNP的检测能力。通过按照邻近度分组,可以更好地控制假阳性率,并提高对功能相关SNP的发现能力。
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