在ImageJ中编写宏以打开、更改颜色、调整亮度和重新保存显微镜图像
的步骤如下：
- 打开ImageJ软件，点击菜单栏中的“Plugins”选项，选择“Macros”下的“Record…”，开始录制宏。
- 在弹出的“Macros Recorder”窗口中，点击菜单栏中的“File”选项，选择“Open…”，选择要打开的显微镜图像文件。
- 点击菜单栏中的“Image”选项，选择“Color”下的“RGB Split”来将图像转换为RGB颜色模式。
- 点击菜单栏中的“Image”选项，选择“Adjust”下的“Brightness/Contrast…”，调整图像的亮度和对比度。
- 点击菜单栏中的“File”选项，选择“Save As…”，选择保存图像的格式和路径，并点击“Save”按钮进行保存。
- 停止录制宏，点击“Macros Recorder”窗口中的“Create”按钮，将宏保存为一个独立的文件。
在这个过程中，ImageJ是一款开源的图像处理软件，它提供了丰富的图像处理功能和插件扩展机制。通过编写宏，可以将一系列的图像处理操作自动化，提高工作效率。
ImageJ的优势包括易于使用、免费开源、跨平台等。它广泛应用于生物医学领域的显微镜图像处理、分析和测量等任务。
腾讯云提供了一系列与图像处理相关的产品和服务，如云服务器、云存储、人工智能等。具体推荐的产品和产品介绍链接地址可以根据实际需求进行选择和查阅。
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我正在尝试在图像J中编写一段代码，它将：
打开文件夹内包含"488“的单独窗口中的所有图像使用查找表将图像转换为绿色和RGB颜色从ImageJ，命令是:运行(”绿色“)；和运行(”RGB颜色“)；调整亮度和对比度与定义的最小和最大值(每个图像相同的值)。我知道它的代码是：
//run(“亮度/对比度...”)；setMinAndMax(最小值，最大值)；run(“应用查找表”)；
将每个图像保存在相同的原始文件夹中，在Tiff中，使用相同的名称，但以"processed“结束。
我没有使用Java的经验，对编码也很不在行。我试图使用我在stackoverflow和ImageJ网
浏览 142提问于2021-06-01得票数 0
很抱歉把这个标记为ImageJ --这是MicroManager的一个问题，它是一个显微镜插件，我认为这是最好的选择。
最近，我用MicroManager (最近的版本，但我记不起确切的数字)为一个重要的实验拍摄了图像。我所在的机构的IT服务最近出现了一些网络问题，我保存的软件偏好也被删除了。当我意识到我将图像保存为单独的图像文件(三个灰度文件加上元数据文本文件)而不是OME iamge堆栈时，我已经完成了一半的实验。
我所有用于图像处理的ImageJ宏都依赖于多通道图像堆栈，因此这是一个小问题。在MicroManager (或ImageJ)中，有什么简单的方法可以在图像已经拍摄完之后将这些单
浏览 6提问于2015-09-01得票数 0
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3回答
我正在查看ImageJ中的一组图像(一堆.tif图像，约130个帧)，我对数据集有一个问题。这是一系列的显微镜图像，每一帧都是一个平面，大约在上面/下3-4微米。当我深入到数据集中时，光散射会使背景变得更亮，所以样本的主要特征更加模糊。
然而，ImageJ的亮度和对比度特性使用了代表整个图像堆栈的直方图。当我在堆栈的深处点击“自动”和“重置”图像时，产生的对比是完美的:所有的功能都会很好地发光。然而，在堆栈开始时，大多数特性已经饱和。
我试着从堆栈中的各个点手工提取几幅图像，并分别对每个点执行“自动>重置”亮度和对比度，然后再将它们转换为堆栈，并且看起来非常可靠。如何以编程方式(例如，使
浏览 4提问于2010-12-17得票数 6
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我用共聚焦显微镜拍摄了细胞的图像。当文件较大时，图像堆栈在以后的阶段开始向下移动。移位后的图像只是重复先前的图像。当我用兼容的软件(Zen)打开图像堆栈时，它是正常的，但我需要imageJ来做一些编辑。原始文件为.lsm格式，大小约为6 6GB。这是我的视频的链接，显示了当我在imageJ中打开文件时移动的堆栈。任何帮助都是最好的。
浏览 2提问于2016-10-11得票数 0
2回答
我正在处理显微镜图像(在Matlab中)的tiff格式，通常是uint8或uint16。基本上，我读取它们，将它们放在一个单元格数组中进行处理，然后以tiff格式导出它们，要么作为图像序列，要么作为堆栈(分别使用imwrite和imwrite的'overwrite‘或'append’写符属性)。到目前为止，一切都很顺利。
我遇到的问题如下：
当我用ImageJ打开图像时，它们不是在真彩色"RGB“颜色模式下，而是在复合模式下。例如，ImageJ将数据读取为8位(它是这样的)，但不会将图像作为真实颜色打开(对不起，我不知道正确的术语)。因此，我必须手动将三个通道组合在一起
浏览 2提问于2014-08-05得票数 3
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我有一个tiff堆栈(b/w)，当我在imageJ中打开堆栈中的单个图像时，对比度是完美的，但是，当我打开整个堆栈(运动物体的图像序列)时，对比度对于末尾幻灯片来说很糟糕(当然，荧光已经褪色)。在Matlab或imageJ中，有没有一种方法可以确保对比度不是由整个堆栈决定的，而是由堆栈中的单个图像决定的(这样亮度的变化就不再存在)。
让我知道怎样才能解释得更好。这是一个非常简单的问题，但我不知道不看就能理解它有多容易。
谢谢
浏览 6提问于2013-09-12得票数 0
1回答
用ImageJ测量强度
、、、
我们必须用imagej测量图像某些区域的荧光强度。我们想出了下面的步骤来测量强度。虽然这似乎是正确的，但我的问题是
把图像变成8位
阈值图像(图像>调整>阈值)以勾勒出所有区域并单击“应用”
打开分析>分析粒子。确保单击“添加到经理”
分析>分析粒子>显示>裸露的轮廓。这将打开一个新的图像。
打开彩色显微镜图像。然后，图片>覆盖>来自ROI管理器。
图像>覆盖>到ROI管理器。
在ROI经理中:按“测量”。(将弹出具有单个数据点的结果窗口)
右键单击“结果”窗口，然后单击“汇总”。
记录平均强度数据
浏览 13提问于2013-01-02得票数 1
我将显微镜实验中的.tif文件加载到ImageJ中，它告诉我显微镜视场的尺寸(424.27x424.27微米)。要在ImageJ中访问该数据，我将转到图像选项卡，然后“显示信息”，然后滚动到底部以找到以下数据：
如何在python中访问这些数据？我的目标是用python显示显微镜数据，我已经做过了，但是我想让这个数字的x和y轴达到424.27微米。
谢谢!
浏览 8提问于2022-04-09得票数 0
我正在尝试使用ImageJ的一个变体，斐济来分析一些显微镜图像。当我尝试“打开下一个”以访问网络图像时，什么也没有发生。
在ImageJ的标准版本中，此功能可以工作，如果失败则会引发错误。
似乎缺少一些底层代码。我一直找不到有同样问题的帖子。会不会是我遗漏了一些模块才能正常工作？会不会和Java有关？
任何帮助都将不胜感激，谢谢。
浏览 0提问于2014-07-27得票数 1
1回答
我是imageJ新手，我正在尝试分析几个图像:我有一个代码，可以分析目录中一组图像的颜色阈值，并分别存储它们：
input = "/m_3/ImageJ/test_folder/";
output = "/m_3/ImageJ/finished2/";
function action(input, output, filename) {
open(input + filename);
run("Set Scale...", "distance=872 known=9 pixel=1 unit=cm");
run("
浏览 5提问于2015-05-15得票数 0
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1回答
我正在使用imageJ对活细胞进行自动显微镜检查。
显微镜把舞台中心放在一个想要的细胞上，取一个Z堆栈，然后把这个堆栈传递给imageJ。
然后，我想使用分析粒子来输出每个Z片中细胞的面积。(这个效果很好)
为此，我使用了一个宏，它执行以下操作：
选择A区域。所选区域堆栈是复制的，堆栈是粒子，堆栈为堆栈(排除边界上的对象)运行，最大区域结果为<code>H 111</code>，相应的z片打印在文件中以供进一步工作。<code>H 212</code><code>G 213</code>
除了重复的步骤对于管道来说太慢之外
浏览 1提问于2020-09-16得票数 0
1回答
新来的斐济和ImageJ这里，所以我道歉，如果这个问题听起来愚蠢的退伍军人。我偶然发现了一个非常酷的工具集，可以在这里对激光扫描显微镜图像进行模糊处理：，但我新下载的斐济版本中缺少它。我想我在这里找到了代码：，但我不知道如何手动安装它。我是否需要将它保存为.jar (代码看起来像java)或.ijm文件？或者，有没有办法从斐济应用程序中搜索它？
我的斐济版本: ImageJ 1.52p Java 1.8.0_172 (64位)
浏览 3提问于2021-05-17得票数 0
4回答
我正在使用Python设计一个软件，图像处理是其中的一个步骤。我正在使用ImageJ来实现这一点。
由于在ImageJ中有一个可以在ImageJ软件中打开的Jython解释器，因此必须有一种方法将ImageJ连接到Python并调用Python中的所有函数。
我想知道如何才能在Python语言中完成所有处理，而不是在ImageJ中打开解释器？
浏览 2提问于2015-04-20得票数 6
3回答
我在python中使用tifffile来保存3通道tiff堆栈，然后我想将其读入ImageJ或斐济。这些tiff堆栈在ImageJ中以复合形式打开，每个通道都分配一个(可能默认的)颜色映射/LUT。然而，分配给我的颜色并不是对我的图像有意义的颜色。我的问题是，当使用tifffile**.**保存图像时，我无法确定如何为每个通道指定颜色映射
例如，我希望有以下彩色地图分配：
第0章:灰色
第1章:绿色
第2章:红色
下面是我用来保存文件的代码：
# save hyperstack
with tifffile.TiffWriter(filename, bigtiff=False
浏览 0提问于2018-05-09得票数 5
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2回答
转换16位图像的选项
、、、
当我打开tiff格式的16位图像时，它显示为黑色图像。16位tiff图像仅在程序ImageJ中打开；但是，它不会在预览中打开。我想知道我的选择是什么，以一种更容易的方式查看格式，而不降低分辨率比打开ImageJ查看它。我是否应该将其转换为8位格式，但当格式从16位减少到8位时，我不会丢失数据吗？此外，我正在考虑将tiff图像转换为jpeg，但这会导致分辨率降低吗？
浏览 7提问于2012-12-18得票数 0
我正在分析一幅图像，主要问题是确定对象的亮度以及它与背景之间的对比度。然而，由于物体具有像细胞一样的结构，其中有许多内部空间和背景，背景颜色的像素使我用来确定亮度的选择方式太多，破坏了结果。我想要过滤所有背景颜色的像素，因为我使用的图片分析工具(imageJ)不允许这样做，过滤表格中对应的像素似乎是一个合理的过程。
使用c#，我如何完成此任务？或者，欢迎任何现有的解决方案。
浏览 0提问于2011-12-12得票数 0
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我有一个8位的图像，其中包含4个模式(标签为1，2，3和4).我想在"ImageJ 3D查看器“中显示此图像，并为每一种模式分配颜色。"ImageJ 3D查看器“接受"RGB颜色”图像，因此我首先将图像(以分析格式)加载到ImageJ，然后使用“编辑LUT”为每个数字( 1、2、3、4)分配颜色。然后图像正好显示了我想要的颜色。当我通过改变图像类型将图像从8位转换为"RGB颜色“时，颜色完全改变了.
在将8位图像传输到RGB后，我如何保留所选择的颜色？还是有一种更简单的方法来为8位图像分配颜色，并将其显示在3D查看器上？
非常感谢你的关注。
浏览 1提问于2015-05-31得票数 0
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我正在尝试创建一个.bat文件来读取.bsv文件并将它们转换为彩色pngs。第一部分是使用imagej打开.bsv，然后使用我添加的“全部保存”插件。我试着做一个宏，但它只会给我带来错误。在命令提示符下，我将如何使用图像j：
文件->导入->原始->myfile.bsv并选择8位，宽度: 4000，高度: 2672，偏移到第一个图像: 0，图像数量: 40，图像之间的间隔: 0，小字节顺序。
然后
插件->保存所有
感谢您提供的任何帮助！
浏览 4提问于2013-08-09得票数 3
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我正在做一个基于内容的图像检索的研究。我希望开发基于web的图像检索系统。目前，我正在评估CBIR中不同的图像检索方法。我想使用imagej来开发这个web应用程序，但是我对imagej并不熟悉，也不知道该如何做。
作为一个初学者，我想阅读一个图像，并提取该图像的颜色特征。首先，我将使用颜色瞬间作为图像特征。
我想使用imagej并将这个过程编码到一个java应用程序中，并自动完成特征提取过程。
我不知道从哪里开始。如果您可以提供简单的代码示例，那么如何开始这个过程，我可以在此过程中学习。
浏览 2提问于2013-12-27得票数 0
我最近才开始使用ImageJ (或者斐济)来测量显微镜照片中硅藻壳的大小。用一张千分尺的参考照片来设定全球尺度，然后简单地使用线工具来测量我的硅藻，这是非常直接的。唯一的问题是，每次我启动程序时，我都必须重新设定刻度，我更希望避免额外的麻烦，但也希望每次我的校准方式都有一些不同。我找到了启动宏生成器，如果我能让它将刻度设置为每微米164.4像素，我将是一只快乐的河马。不幸的是，当涉及到计算机语言时，我是相当文盲的。有人能帮帮我吗。
浏览 5提问于2015-04-17得票数 1
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我正在处理一个父文件夹的几个子目录中的大量图像文件。
我正在尝试运行一个ImageJ宏来对图像进行批量处理(具体来说，我试图将显微镜上拍摄的一系列图像拼接成单个图像)。不幸的是，我不认为我不能作为一个ImageJ宏运行，因为这些图像是以不同的网格大小拍摄的，比如有些是2x3，有些是3x3，有些是3x2，等等。
我已经编写了一个R脚本，它能够评估图像文件夹并确定网格大小，现在我正在尝试将这些信息提供给我的ImageJ宏，以便对文件夹进行批处理。
我遇到的问题似乎应该很容易解决，但我还没有搞清楚:在R中，我有一个data.frame，需要逐行传递给系统命令，并将列连成由*'s分隔的单个字符
浏览 5提问于2022-03-08得票数 0
我使用ImageJ来创建时空电影，使用ImageJ在一系列tiff图像上的研究功能。我对我的图像的所有线条(或仅在图像的某一区域)进行重新设计，并对整个电影(图像序列)执行此操作。因此，我有一个电影，其中每一个图像是一个时空图像的一条线的原始图像。
我的问题是，我的图像非常大，我有2021张照片在我的电影。因此，即使我在我的Macbook Pro上将14 in的内存用于ImageJ (16 in的内存总数)，但它需要大量的计算时间，而且最终ImageJ似乎没有内存。
可以在不打开(或至少显示)所有图像的情况下启动这样的计算吗？
谢谢你的帮助,
最好的
阿德里安
浏览 4提问于2014-11-11得票数 0
1回答
图像中的目标检测(HOG)
、、、、
我想检测显微镜图像细胞内的物体。我有很多带注释的图片(应用程序)。有一个物体的50.000张图像和没有一个物体的500.000张图片)。
到目前为止，我尝试使用HOG提取特征，并使用logistic回归和LinearSVC进行分类。我已经尝试了几个参数的HOG或颜色空间(RGB，HSV，实验室)，但我没有看到太大的差别，预测率约为70 %。
我有几个问题。我应该用多少个图像来训练描述符？我应该用多少张图像来测试这个预测？
我尝试了1000张图像进行训练，其中55 %为阳性，5000张为阳性，72 %为阳性。然而，它也在很大程度上取决于测试集，有时测试集可以达到80%-90%的阳性检测图像。
下
浏览 0提问于2015-04-21得票数 7
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是否可能有一个宏自动设置图像的比例多次，然后使用它来计算arae和其他测量参数？
例如，我有一千多张下面的图片，通常有三个相同的有机体的视图。我想使用刻度栏下的每一幅图像(100微米常数)，以确定长度，宽度和面积的每一幅图像。缩放条总是位于每个图像的下方，对于所有其他图像来说，这是相当恒定的。如有任何帮助或指导，将不胜感激。
请耐心点，我对imagej宏脚本很陌生.
浏览 1提问于2017-11-24得票数 2
2回答
我经常使用ImageJ来查看由多个图像组成的图像堆栈，这些图像位于一个文件夹中。我只需将各自的文件夹拖放到ImageJ图形用户界面中，它就会创建一个可滚动的可视化，这非常方便。不过，这可能更方便，因为每次我这样做时，都会出现一个对话框，询问是否要将文件夹中的所有图像作为堆栈打开。是否可以将其默认为“是”？我需要修改源代码并自己编译吗..？如果是这样的话，我从哪里开始找呢？
浏览 11提问于2017-07-11得票数 0
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1回答
我在ImageJ中写了一个宏，在BMP图像文件列表上运行批处理“度量值”。我使用headless.jar在远程linux机器上以无头模式运行代码。
每当ImageJ在读取/加载列表中的图像时遇到错误或异常，它将退出该进程。因此，我必须不断地监视进程，并手动强制ImageJ跳过文件。
是否有一种方法可以强迫ImageJ继续该进程，即使它遇到了错误/异常？并报告文件名，可能在日志或其他文件中？
浏览 6提问于2012-10-12得票数 0
我需要运行Macro，但我不想显示图像。如果我不调用imp.show()，ImageJ将打印到控制台，没有打开的图像。那么如何才能在不显示图像的情况下运行Macro呢？提前谢谢。
public class MyPlugin implements PlugIn {
public static void MyPlugin(String path) {
System.setProperty("plugins.dir", "libraries/plugins");
System.setProperty("macros.dir",
浏览 2提问于2013-05-07得票数 3
我尝试将Java插件编写到ImageJ，它应该：
加载图像(24位)。
做一些预处理操作。
通过多种方法对图像进行阈值化。。
做些其他的手术。
我有门限手术的问题。我代码的一部分如下所示：
Opener opener = new Opener();
ImagePlus imp = opener.openImage(source);
// Preprocessing
IJ.run("Threshold..." , method);
// Other operations e.g. "open", "outline" etc.
浏览 3提问于2015-06-22得票数 2
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我最近刚刚开始使用ImageJ (因此没有太多的宏编程经验)来分析我的显微镜照片。为了生成经过光谱溢出校正的FRET逐像素图像，我使用了插件：。这个插件需要3个图像的堆栈才能工作: FRET，plug，Acceptor。到目前为止，我必须自己打开每一张图片，这对于大的时间堆栈(> 1000张图片)来说真的很不方便。我正在寻找一种方法来循环插件或创建某种类型的宏来做到这一点。
对我的数据结构的简短描述: workfolder\filename_t001c1 (在时间点001的频道1图像供给者)，filename_t001c2 (在时间点001的频道2图像-帧)，...t001c3 (可以忽
浏览 8提问于2013-05-28得票数 1
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我在使用ImageJ宏时遇到麻烦。函数selectImage(id)和selectWindow(名称)导致ImageJ完全崩溃，甚至使我不得不完全重置Unity (我在Ubuntu12.04上)，因为所有的GUI输入都是冻结的。
发生这种情况的宏相当长。当我在简单和简单的宏中使用上述函数时，什么都不会发生。我首先打开图像，然后执行数千次操作，然后请求窗口开关。就在那时整件事都结冰了。
是否有人对这些问题有足够的了解，从而提出可能的问题？
浏览 2提问于2013-09-26得票数 0
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我尝试了以下代码，我从目录中读取图像，并使用ImageJ自动阈值插件来分割我的图像。任何人都可以使用imagej程序轻松地做到这一点，如下所示：
1- Open an image.
2- Then Go to : image->Adjust->Auto Threshold.
3- From methods drop list: Select the mean method.
4- Pick the white object on the black background.
我的问题是我不能从Matlab中正确地调用这个插件。我的Matlab代码如下：
javaaddpath &#
浏览 0提问于2016-02-28得票数 0
4回答
USB显微镜的自动聚焦算法
、、、、
我正在设计一个低成本USB显微镜的自动对焦系统。我一直在开发硬件方面的精密PAP马达，能够调整焦点旋钮在，现在我在困难的部分。
我一直在考虑如何实现这个软件。硬件有两个USB接口，一个用于显微镜摄像机，另一个用于电机。我最初的想法是用C#编写一个应用程序，该应用程序能够从显微镜中获取图像，并将马达前后移动，到目前为止还不错:)
现在我需要一些关于自动对焦的帮助，如何实现它？有什么好的算法吗？或者是帮助我完成任务的图像处理库？
我一直在谷歌但没有成功..。我将感激任何帮助/想法/推荐！
非常感谢:)
编辑：谢谢各位的回答，我会尝试所有选项，然后带着结果(或者更多的问题)回到这里。
浏览 9提问于2010-11-19得票数 16
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我试图在Image中编写一个代码，它将：
在以“- GFP.vsi”结尾的文件夹中打开所有图像，使用查找表将图像从ImageJ转换为绿色和RGB颜色，命令是:run(“green”)和RGB(“RGB颜色”)；将每个图像保存在相同的原始文件夹中，该文件夹具有相同的名称，如果图像覆盖原始文件，则可以作为.tif保存，但如果图像具有新的名称，则也可以。从ImageJ保存为.tif文件: saveAs("Tiff"，"Filepath");
我没有使用Java的经验，也没有编写代码的经验。我试着用我在堆栈溢出和ImageJ网站上找到的代码把一些东西拼凑在一起，但是一直
浏览 7提问于2020-06-24得票数 0
1回答
我尝试在我的grails项目(1.1.1，在Mac上)中使用一些图像处理插件或java库: imageTools插件、imageJ、awt库等等。每次我打开/从路径获取图像开始处理时，imageTools jar都会在finder中打开并吃掉大量的内存。
行为正确吗？
更新-样本代码：
def openFilePath = "/path/to/the/file/testfile.jpg"
def imageTool = new ImageTool()
imageTool.load(openFilePath)
ImageTool插件，但是imageJ和其他java映像库也会
浏览 4提问于2009-10-27得票数 2
我是第一次接触imagej/斐济，我在.tif扩展中有一堆图像。
1.Load the Stack file ie., .tif file into ImageJ -- File -> Open -> Browse the Stack file(.tif)
2.Convert the Stack file of 16-bit image into 8-bit image-- Image -> Type -> select 8-bit
3.Apply Threshold on the 8-bit image-- Image -> Adjust ->
浏览 1提问于2014-04-17得票数 0
在ImageJ中，我需要保存与图像相关联的所有感兴趣区域度量(在感兴趣区域管理器中)。并有可能打开最近仍可编辑(移动线，移动点，在结果中保存测量)，因此也有ImageJ文件，其中可以保存我们正在做的工作，并最近打开重新编辑？
浏览 6提问于2012-03-14得票数 1
因此，我的目标是在去除背景后，使用综合像素密度来量化ImageJ中的点斑点。我的问题是:我需要的图像格式，将是足够小，在ImageJ中打开没有质量损失，也是16位。我需要做一个非均匀的背景校正，并希望使用这个插件来完成，并且需要16位：
我扫描了tiff格式的图像，但是图像超过170MB，由于内存的原因无法在ImageJ中打开(即使在命令行运行ImageJ来释放更多内存时也是如此)。我知道由于质量损失，jpeg是不明智的。谁有任何想法，我应该以什么格式的扫描后保存的图像，以获得它的16位格式和适当的大小，以便在ImageJ中工作？图像是一张有6个部分的白纸，每个部分包含一个带有斑点的小薄膜。每
浏览 3提问于2015-03-28得票数 1
我试着用ImageJ和它的一个插件3DViewer创建一个3D视频。
我的照片来自一个8位的分析文件。在ImageJ中打开它之后，我使用LUT为4个条目中的每一个指定一个颜色。有没有办法改变每种颜色的模糊性？例如，红色需要透明，其中蓝色和绿色应该是坚实的。
非常感谢你抽出时间。
浏览 1提问于2015-06-01得票数 0
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有没有办法更改ImageJ/斐济中的默认色彩映射表？也许它太明显了，但我没有在选项中发现它。或者，有没有一种方法可以在打开图像后自动运行脚本，例如: run("Fire")？
干杯
约翰尼斯
浏览 10提问于2020-03-04得票数 0
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我想用附在显微镜上的BW相机测量显微镜图像的光强。我的目的是比较特定的图像之间的亮度。我对测量绝对光强和单位既不感兴趣。
我认为，函数应该使用曝光和一些亮度相关的度量(例如阈值直方图宽度或像素值平均值)。
我的第一次尝试:1/曝光*亮度工作范围较小的曝光范围。
曝光是一个真实的0.001.0.6，亮是一个自然数.255。是否有计算这两个数字的摄像机接收到的光强的公式？
非常感谢您的建议！
P.S.：目前我使用模糊逻辑来估计强度.它可以工作，但校准不灵活。
编辑：我从相机制造商那里得到了更多的信息。当像素值在50-200范围内时，光的作用是线性的。
浏览 3提问于2014-01-23得票数 3
1回答
我使用的是ImageJ v1.49e (它附带java 1.6.0_24 (64位))
我编写了一个宏，它从输入目录读取图像，进行一些处理，并根据条件将图像移动到输出目录。在批处理模式下运行，因为我希望处理大约100,000个图像。
因此，我从ImageJ运行这个宏，通过JConsole监视内存使用情况，我只看到内存使用量不断上升，再也不会下降。ImageJ已经分配了6GB，但很快就达到了这个极限。即使我从JConsole或宏调用GC，它也什么也不做。
我检查，以确保我运行在批处理模式和关闭任何窗口，我正在打开，仍然没有走。网络上也找不到这一切发生的原因。
我没有正确地释放我的资源吗？我遗漏了
浏览 1提问于2014-08-08得票数 0
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我有一个只有一个颜色通道的TIF。它显示的是绿色或红色的东西。但在大多数图像工具中，它只显示为灰度。
我想把它转换回彩色图像。这将显示不同的绿色或红色值，而不是灰度。
如果我运行以下命令，ImageJ将显示以下内容：
run("Channels Tool...");
run("Red");
但是如果我保存图像，新的颜色不会被保存。
浏览 4提问于2014-11-26得票数 0
如何在imageJ，中使用exec()？我是否可以使用exec()函数启动外部python程序，其内容如下：
exec("python"，d:\py\program1.py")；
能否将图像数组从python返回给exec？
浏览 0提问于2014-05-02得票数 0
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我正在为大学启动一个使用ImageJ和Manager的项目。我想要能够访问每个像素的图像从快照的相机饲料。我的目标是能够将自定义构建的函数应用于图像快照中的每个像素。是否可以使用ImageJ进行此操作。
浏览 2提问于2016-11-16得票数 0
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我有一个来自共焦显微镜的TIFF图像文件，我可以用ImageJ打开，但我想进入Python。
TIFF的格式如下:Z维中有30个堆栈。每个Z层有来自不同荧光标记的三个通道。每个通道的深度为8位。图像尺寸为1024x1024。
原则上，我可以使用skimage (我计划使用tifffile插件来进一步分析数据)读取文件。然而，我得到的并不完全是我所期望的。
merged = io.imread("merge.tif", plugin="tifffile")
merged.shape
# (30, 3, 3, 1024, 1024)
# (zslice, RGB?,
浏览 3提问于2015-10-01得票数 2
2回答
我在使用LibTIFF库保存图像时遇到了问题。
在我的代码中，我有一个表示图像像素值的浮点数组。当我将这些值保存到一个原始文件中时，它看起来没有问题。但是，当我尝试使用LibTIFF库将其保存为TIFF文件时，当我在ImageJ中打开它时，图像看起来非常好，但是当我在Photoshop或Windows中打开它时，它看起来很奇怪(如下所示)，并且Gimp显示了一个完全透明的图像(就像图像中根本没有数据一样)。
我使用ImageJ打开原始文件，图像类型被设置为32位-实数，小端字节顺序被勾选。
下面是我用来保存TIFF图像的代码：
TIFF *tif= TIFFOpen(name, &#
浏览 1提问于2014-07-06得票数 1
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我将使用一组任意的图像。其中一些可能需要一些颜色校正。
我在Photoshop中打开了一张需要校正的图像，注意到直方图中的黄色有点高。我应用了自动上色，这改善了图像。
这是如何工作的呢？如何实现它？我是否要在直方图中寻找峰值，并根据其他峰值对它们进行平均？
语言/语法不应该太重要。
浏览 4提问于2010-07-16得票数 3
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我需要比较一下颜色。我想将颜色设置为变量，然后将其与使用getPixel获得的值进行比较。
但是，以下内容不起作用。似乎ImageJ不知道BaseColor值是一种颜色。
basecolor = 0xFFFFFF;
rightpixel = getPixel(x, y);
if (rightpixel == basecolor) count++;
浏览 3提问于2016-11-28得票数 0
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我想自动计数单元格，我通常用ImageJ来实现这一点。
我可以使用子进程打开imagej。
subprocess.Popen(r"path\ImageJ\ImageJ.exe")
我想把图片上传到python的imagej中
然后使用以下代码从python运行imagej宏(编辑图像文件和设置阈值)：
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\macros\autocount.ijm")
如何通过python在ImageJ中打开图像？完整代码：
#import libraries
import subproce
浏览 5提问于2021-11-30得票数 0
我想在ImageJ中打开灰度图像或图像堆栈，并将它们从8位JPEG转换为32位浮点TIFF图像。我已经使用以下命令完成了此操作：
file->open->(selected image)->image->type->32-bit->file->Save as->TIFF
所以我的问题是，这是否是将8位JPEG保存为32位浮点TIFF的正确方法，因为数字灰度值保持不变，介于0和255之间，而我希望它们更改为介于0和2^32之间的数字。
谢谢你的帮助。
浏览 0提问于2014-06-12得票数 1
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