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Centos 下非 Root 安装 Microsoft R Open

写在前面 我们新写的 GWAS 的算法包 MVP 采用了 Microsoft R Open,在我们对计算的优化中 MRO 起到了非常关键的作用。...在测试的时候就遇到了在没有 root 权限要安装 MRO 的问题,经过百度、Google 都没有找到较好的方案,研究了 MRO 的安装脚本和解开 RPM 包分析了之后,最终采用手工安装的方式成功安装,遂成此文与大家分享...02A34C3D-D5D1-462B-9009-9C37DA1E48E9 MRO 是一个基于 Base R 的加强的完全开源、免费的 R 发行版,与原有的 Base R 完全适配,可以使用所有的 R 包和脚本...重要(随便翻译一下↑) Microsoft R Open 将会被默认安装在 lib64/R/bin/R。(会覆盖之前安装的 Base R 的软链接。)...检验安装 在终端输入: R 如果回显中除了 Base R 正常启动时的回显还包括类似的这一段: ?

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    高效R开发(二):Microsoft R

    在其他项目的测试中,MRO相比CRAN R都有着2x~50x的提高。可能有小伙伴会问,那CRAN R在多线程形况下性能有多少提高呢?...一个很常见的例子是:在SAS中,无论你的程序陷入了怎样的死循环,按一个terminate键立马就能退出,而且程序从来不崩溃;但是在R中,一旦陷入死循环或者假死状态,想要退出只能重启R进程,而且working...其实MRO的安装非常简单: 1)首先,进入MRO下载页面: https://mran.revolutionanalytics.com/download/ 2)在下载页面中,我们能够看到针对多个系统的MRO...这时启动MRO,会在启动界面中发现MRO已经自动侦测到你的多核CPU并且自动设置线程数: ? 由于大猫用的是Surface Pro 4,所以在这里MRO显示自动开启了双线程。...本 期总结 本期大猫带领大家领略了MRO在矩阵运算上相对于CRAN R的巨大提高,同时还介绍了MRO的安装方法。但是,除了多线程运算,MRO还有其他杀手锏!

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    linuxunix实用基本命令小全

    -l按长格式列出文件名,包括文件类型标识,权限,链接数,文件主名, 文件组名,字节数,日期。 -r列出包括子目录下所有文件 -g在长格式中给出用户组的标识。...在显示一页文件时,最后一行将显示等待用 户输入指令。可输入的指令有如下选项。 选项:h 显示pg命令中可使用的帮助(help)命令。 q 退出pg命令。...p 显示pg命令行中说明的前一个文件。 % 显示正文当前页的前面一页。 /pattern 在文件中向前搜索指定的字符模式。 ?pattern 在文件中向后搜索指定的字符模式。...注释:输出三列,第一列表示在file1中出现的行,第二列表示在file2中出现 的行,第三列表示在file1和file2中共同出现的行。...:f90 [option] filename 功能:编译或链接指定的Fortran90文件 选项:同FORTRAN77编译选项 注释:FORTRAN90编译器参考手册可用命令man f90查看

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    每个Python程序员都应该知道的10个缩写

    根据Wikipedia的介绍,在Python软件包索引(PyPI)中索引了235,000多个软件包。我们可以使用pip工具从PyPI安装任何软件包。...该安装过程非常轻松,只需在命令或终端中使用一行代码即可。以下代码段总结了一些常用用法。...因为子类和超类都共享一些实现方法可能不同的通用方法,所以Python解释器需要一种机制来确定在特定调用中应使用哪种方法或属性,而这正是MRO的职责。下面的代码段显示了一个示意性示例。...bin called in X bin called W go called Y 对于W类的实例(第22行),当我们调用bingo()方法时,该方法将在其自己的类中解析,因为它是在类中定义的(第18-20...以下代码段显示了使用EAFP与LBYL的可能方案。使用EAFP编码样式,我们只需在try…except语句中包装我们的代码和可能的异常,而使用LBYL编码样式,我们必须使在之前验证适用条件。

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    使用line_profiler对python代码性能进行评估优化

    简单介绍一下每一列的含义:代码在代码文件中对应的行号、被调用的次数、该行的总共执行时间、单次执行所消耗的时间、执行时间在该函数下的占比,最后一列是具体的代码内容。...在演示line_profiler的性能测试之前,让我们先看看如何将一个fortran的f90文件转换成python可调用的动态链接库文件。...numpy,math,cmath四个开源库的正弦函数实现以及自己实现的一个fortran的正弦函数,通过上面介绍的f2py构造的动态链接库跟python实现无缝对接。...另外,在测试的过程中我们还可以发现,不同形式的正弦三角函数实现,性能是存在差异的,只是在日常使用频率较低的情况下是不感知的。...版权声明 本文首发链接为:https://www.cnblogs.com/dechinphy/p/line-profiler.html 作者ID:DechinPhy 更多原著文章请参考:https:

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    【精心解读】关于Jupyter Notebook的28个技巧

    在“帮助”菜单中,您可以找到包含NumPy,Pandas,SciPy和Matplotlib等通用库的在线文档的便捷链接。...%%time会给你关于单元中的代码的单一运行的信息。...在终端上运行下面的代码: conda install -c r r-essentials 较不容易的选项:手动安装R内核 如果你不使用Anaconda,这个过程会更复杂一些。...installation 21、在同一个 notebook中运行R和Python 最好的解决方案是安装rpy2(需要一个R的工作版本),可以很容易地用pip完成:(https://bitbucket.org...原则上,你可以在动态库中编译函数并编写Python包装器... 但是,这个无聊的部分应该你做吗? 你可以用cython或者fortran编写函数,直接从python代码中使用。 首先你需要安装: !

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    在Win10中使用Linux版本的R和Python

    顺带一提,列表中的“Hyper-V”是 Win10 自带的虚拟机,微软的 Azure 就是基于自家 Hyper-V 技术。 ?...在 Linux 命令行中输入 jupyter lab,然后在 Windows 中使用浏览器打开 locolhost:8888(默认端口为8888)。如果你的 Linux 命令行出现类似信息: ?...你已经成功在 Linux 子系统中创建了一个 Jupyter 服务器并且在 Windows 中直接访问了! 安装 R (Linux) 大猫强烈推荐使用微软的 Microsoft R Open。...MRO不仅和原生R百分之百兼容,更增加了英特尔多线程库,大幅提升了计算能力。我们打开这个(mran.microsoft.com/download)网址,找到 MRO 的下载链接: ?...在 Jupyter 中配置 IRKernel 在 R 的命令行中,运行以下命令: IRkernel::installspec(name = 'ir35', displayname = 'MRO-3.5.1

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    Jupyter Notebook的27个窍门,技巧和快捷键

    几个我的最爱: Esc + F 在代码中查找、替换,忽略输出。 Esc + O 在cell和输出结果间切换。...把变量名称或没有定义输出结果的语句放在cell的最后一行,无需print语句,Jupyter也会显示变量值。当使用Pandas DataFrames时这一点尤其有用,因为输出结果为整齐的表格。...鲜为人知的是,你可以通过修改内核选项ast_note_interactivity,使得Jupyter对独占一行的所有变量或者语句都自动显示,这样你就可以马上看到多个语句的运行结果了。...下面以运行R内核为例说明: 简单的方法:通过Anaconda安装R内核 conda install -c r r-essentials 稍微麻烦的方法:手动安装R内核 如果你不是用Anaconda,...installation ◆ ◆ ◆ 20.在同一个notebook里运行R和Python 要这么做,最好的方法事安装rpy2(需要一个可以工作的R),用pip操作很简单: pip install

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    详解模板注入漏洞(上)

    其中,对于每个模板引擎,我们都会提供一个练习,其中含有已“暴露”模板引擎的Web应用程序。 所需软件 在软件方面,唯一的要求是安装相应的HTTP拦截代理。...$ docker-compose up 配置DNS(可选) 为了使相关的链接可以正常使用,您可以在本地主机文件(/etc/hosts或C:\Windows/system32\drivers\etc\hosts...)中添加如下所示的一行内容: 127.0.0.1template-injection.gosec.co 相关视频 您可以通过视频观看完整的研讨会。...它将提供一个非常简单的表单,其中只有一个字段。 JDK 16 即将发布,新特性速览! 在这个表单中,您可以提交一个简单的表达式来确认模板是否用于显示值。下面的表达式将进行减法运算。...在Python 3.8中,它的索引可能是245。当然,这个索引值会根据加载的模块的不同而有所变化。 {{[].__class__.__mro__[1].

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    PGI OpenACC 2018版:原来你是这样的编译器

    添加或增强的其他OpenACC特性包括缓存指令改进和Fortran模块中命名常量数组的支持。...当同一个应用程序在没有gpu的系统上运行时,OpenACC区域将在系统的所有CPU内核中并行执行。...LLVM / x86 - 64代码生成器 2018年发行版包括一个用于x86-64的LLVM代码生成器,完全集成了PGI Fortran、C和c++编译器,包括对OpenACC和CUDA Fortran...作为PGI Linux安装包的一部分,LLVM组件与默认的PGI编译器一起安装,并使用一个简单的命令行选项进行调用。 ?...增强分析的特性 新的CPU Detail View可以显示CPU上每个线程所花费的一个断点时间。 Three call tree选项允许您基于caller、callee或者每文件和行号来分析。

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    linux vim怎么退出编辑模式_shell退出vi编辑器

    文件内行间快速跳转 命令功能 :set nu 在编辑器中显示行号 :set nonu 取消编辑器中的行号显示 1G跳转到文件的首行 G跳转到文件的末尾行 #G跳转到文件中的第#行 进入输入模式 命令功能...word 从下而上在文件中查找字符串“word” n定位下一个匹配的被查找字符串 N定位上一个匹配的被查找字符串 字符串替换操作 命令功能 :s/old/new 将当前行中查找到的第一个字符“old”...s/old/new/g 在整个文件范围内替换所有的字符串“old”为“new” :s/old/new/c 在替换命令末尾加入c命令,将对每个替换动作提示用户进行确认 vi编辑器的在线帮助 使用vi在线帮助需安装的软件包...vim-common-6.3.035-3.i386.rpm vim-enhanced-6.3.035-3.i386.rpm 软件包在RHEL5的第2张安装光盘 使用vi在线帮助的两种方法 在vi编辑器中按...“F1”键 输入help末行命令 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。

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    英特尔最新版 CC++ 编译器采用 LLVM 架构,性能提升明显

    你会注意到的第一件事是新编译器改了名字(icx)。这可以让你同时安装经典版本和新版本,并在它们之间自由切换。许多用户已经决定在未来产品中只使用基于 LLVM 的英特尔 C/C++ 编译器。...基于 LLVM 的 Fortran 编译器测试版提供了对 Fortran 语言的广泛支持,但有些功能仍在开发中。...你可以查看具体特性的开发状态,看它是否已准备就绪:在我们的 Fortran 和 OpenMP 特性状态表中可以找到基于 LLVM 的 Fortan 编译器中各个特性的发布状态。...在这些基准测试结果中,英特尔编译器选项都已关闭,但成绩显示基于 LLVM 的英特尔编译器与经典版本还有一些差距。...在这些基准测试结果中,英特尔编译器选项都已关闭,但成绩显示基于 LLVM 的英特尔编译器与经典版本还有一些差距。

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    MathWorks MATLAB R2022b

    它将数值分析、矩阵计算、科学数据可视化以及非线性动态系统的建模和仿真等诸多强大功能集成在一个易于使用的视窗环境中,为科学研究、工程设计以及必须进行有效数值计算的众多科学领域提供了一种全面的解决方案,并在很大程度上摆脱了传统非交互式程序设计语言...它在数学类科技应用软件中在数值计算方面首屈一指。行矩阵运算、绘制函数和数据、实现算法、创建用户界面、连接其他编程语言的程序等。...在新的版本中也加入了对C,FORTRAN,C++,JAVA的支持。...3.第三步 在软件安装完成后,文件管理器中打开软件的安装目录,将之前License.7z压缩包 解压出的Patch目录下的libmwlmgrimpl.dll程序,复制到安装目录lmgrimpl该文件夹下覆盖替换原文件...默认安装目录为C:\ProgramFiles\MATLAB\R2022b\bin\win64\matlab_startup_plugins\lmgrimpl 到此为止就完成了该软件的安装,有任何问题请联系站长

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    RPM 卸载参数

    更新RPM数据库 卸载后,RPM删除该软件包在数据库中的所有信息。 8....例如: 包裹文件file-3.26-6.i386.rpm安装后,其软件包标识为file-3.26-6。可以用此标识卸载,查询,校验该软件包。在命令行上输入软件包标识时,可以写全,也可以采用简写的方式。...(行号后以D:开始的行输出的为调试信息) 第1行: 打开/var/lib/rpm目录下的RPM数据库; 第2行: 取已安装文件系统列表; 第3行: 执行卸载前触发脚本程序;...第4行: 这一行是卸载前触发脚本程序的执行结果; 第5行: RPM提示将要删除文件,其中test=1表明为卸载测试,并非真正删除; 第6-9行: 显示各文件的执行操作–删除...; 第10行: 执行卸载后触发脚本程序; 第11行: 本行是卸载后触发脚本程序的执行结果; 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。

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    mac的homebrew会把gcc安装在哪里

    ("Matrix", version = "1.6-1.1") 并不是说要大家都安装这个低版本哦,因为每个人的电脑里面的r和其它r包版本都不一样,都是互相依赖的,所以每个人需要的版本都不一样,这一点非常的热心...Homebrew 会将软件包安装在独立的目录中,并使用符号链接来链接到 /usr/local 目录,以避免冲突和混乱。 建议查阅官方文档以获取最新信息:Homebrew 官方网站。...在 macOS 中,这两个编译器通常一起安装,并且在命令行中都可以使用。 gfortran: gfortran 是 GNU Fortran Compiler 的缩写。...用于编译和链接 Fortran 语言的源代码。 在终端中可以使用 gfortran 命令调用。...在 macOS 中,由于默认情况下系统使用 LLVM 的 Clang 作为 C/C++ 编译器,gcc 实际上是一个指向 Clang 的符号链接。

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    78行Python代码帮你复现微信撤回消息!

    本文基于python的微信开源库itchat,教你如何收集私聊撤回的信息。 [ 导读 ]Python曾经对我说:"时日不多,赶紧用Python"。...于是看到了一个基于python的微信开源库:itchat,玩了一天,做了一个程序,把私聊撤回的信息可以收集起来并发送到个人微信的文件传输助手,包括: who :谁发送的 when :什么时候发送的消息...note的msg_id不一致 巧合解决方案 face_bug = None # 将接收到的消息存放在字典中,当接收到新消息时对字典中超时的消息进行清理 | 不接受不具有撤回功能的信息 # [TEXT...简单是用itchat代码即可构建一个基于微信的即时通讯,更不错的体现在于方便扩展个人微信的在其他平台的更多通讯功能。 2....安装 pip3 install itchat 3. itchat - Helloworld 仅仅三行代码发送一条信息给文件传输助手。

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    【思考】2019年MRO工业品的发展困境和战略部署

    八月底,工业用品电商服务平台震坤行更是完成总额1.29亿美元的C轮融资,这也是中国MRO领域最大一笔单轮融资,中国市场也才刚刚被打开,MRO工业品前景一片光明。...管理成本和仓储成本过高:有数据显示,金额占企业总采购10%的MRO物料,一般需要花费采购部门大约80%的精力。...传统采购方式中,由于MRO产品种类众多,采购分散,产品质量参差不齐,供应商统一化管理非常费时费力。...与企业的一些战略性、关键性物料采购与供应商结成战略合作伙伴不同,MRO具有低风险、低成本、用量大的特点,基于这些特点,其采购目标是精简流程,提高效率,可以利用B2B电子商务平台实现。...要做好MRO电商平台并非是一朝一夕的,MRO作为一个大赛道,在美国和其他工业发达国家都得到了很好的验证。

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    撤回的微信消息真的看不到?78行Python代码帮你看穿一切!

    于是看到了一个基于python的微信开源库:itchat,玩了一天,做了一个程序,把私聊撤回的信息可以收集起来并发送到个人微信的文件传输助手,包括: (1) who :谁发送的 (2) when :什么时候发送的消息...note的msg_id不一致 巧合解决方案 face_bug = None # 将接收到的消息存放在字典中,当接收到新消息时对字典中超时的消息进行清理 | 不接受不具有撤回功能的信息 # [TEXT,...简单是用itchat代码即可构建一个基于微信的即时通讯,更不错的体现在于方便扩展个人微信的在其他平台的更多通讯功能。 2....安装 pip3 install itchat 3. itchat - Helloworld 仅仅三行代码发送一条信息给文件传输助手。.../zh/latest/ *声明:推送内容及图片来源于网络,部分内容会有所改动,版权归原作者所有,如来源信息有误或侵犯权益,请联系我们删除或授权事宜。

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    【报错解决办法】ModuleNotFoundError: No module named ‘numba‘

    numba 是一款可以将 python 函数编译为机器代码的JIT编译器,经过 numba 编译的python 代码(仅限数组运算),其运行速度可以接近 C 或 FORTRAN 语言。...numba可以基于llvm动态生成优化代码,提高python的执行效率,只需要给python代码加上修饰器就好了。...如果遇到ImportError: No module named numba这样的问题,安装numba即可,而安装numba依赖于llvmlite,因此解决方案如下: pip install numba...#会自动安装numba及依赖 #如果没自动安装依赖llvmlite pip install llvmlite 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。...本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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