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在 Linux 和 Windows 下源码安装 Perl

在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。...源码包下载 在官方网站下载新版本的源码包:http://www.perl.org/get.html,我下载的是 perl-5.26.1.tar.gz。 2....调整环境变量 在 ~/.bashrc 中把 Perl 添加到 PATH 中,然后 source ~/.bashrc 刷新。...二、Windows 7 下安装 Perl 在 Windows 下的 Perl 安装,我们推荐使用 ActivePerl,安装步骤如下。...选择 "Custom" 自定义安装: 自定义安装路径: 把 Perl 添加到系统环境变量: Perl 安装完成后,我们在 DOC 命令行输入 perl -V,可以看到详细的相关信息: 如果我们在安装过程中没有勾选把

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    R中的grep和grepl函数

    在日常数据分析的过程中,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西,或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux中模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置,grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数

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    正则表达式和grep使用

    元字符正则表达式 2.运用 2.1.例子 2.2.处理特殊字符 3. grep命令 3.1.介绍和简单使用 3.2....元字符正则表达式 元字符是一种Perl风格的正则表达式,只有一部分文本处理工具支持它,并不是所有的工具都支持下表中所列的字符,但是之前介绍的正则表达式和字符类都是被广泛支持的。...至于转义后字符的意义是否具备特殊的含义,则取决于你所使用的工具。 3. grep命令 3.1.介绍和简单使用 grep 这个命令是一个全局查找正则表达式并且打印结果行的命令。...grep 家族里还有 egrep 和 fgrep 这两个命令。 grep 命令在一个或多个文件中查找某个字符模式。如果这个模式中包含空格,就必须用引号把它括起来。...如果不用引号 (这个例子中,使用单引号或双引号都可以),TB 和 Savage 之间的空格将导致 grep 会在 Savage 和 test.txt 查找 TB。

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    使用Perl和库WWW::Curl的爬虫程序

    使用 Perl 和 WWW::Curl 库编写爬虫程序是一个常见的做法。WWW::Curl 是 Perl 对 libcurl 库的封装,提供了强大的 HTTP 请求功能,可以帮助你抓取网页内容。...以下是如何使用 Perl 和 WWW::Curl 库编写一个简单的爬虫程序的步骤:1. 安装 WWW::Curl 库首先,确保你已经安装了 WWW::Curl 库。....= $data; # 将数据追加到响应内容中 return length($data);});​# 执行请求my $retcode = $curl->perform;​# 检查请求是否成功if...运行和调试运行:保存上面的代码到 .pl 文件,然后通过 Perl 执行文件。perl your_script.pl调试:如果出现错误,可以通过打印更多的日志信息来调试。...print $curl->getinfo(CURLINFO_HTTP_CODE); # 打印 HTTP 状态码总结这个示例展示了如何使用 WWW::Curl 来构建一个简单的 Perl 爬虫。

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    如何使用`grep`命令在文本文件中查找特定的字符串?

    如何使用grep命令在文本文件中查找特定的字符串? 摘要 在这篇技术博客中,我将详细介绍如何使用grep命令在文本文件中查找特定的字符串。...引言 在日常工作中,我们经常需要在文件中查找特定的字符串,以便进行分析、调试或修改。而grep命令正是为此而生。它提供了丰富的搜索选项和灵活的使用方式,可以满足各种需求。...通过本文的介绍,您应该已经掌握了基本的grep命令用法,并了解了一些高级选项。在实际工作中,灵活运用grep命令能够帮助我们更高效地处理文本数据。...命令在文本文件中查找特定的字符串。...未来展望 在未来,我们可以进一步探讨grep命令的高级用法,如递归搜索、多文件搜索等。同时,也可以关注grep命令在大数据、日志分析等领域的应用,为我们的工作带来更多的便利和可能性。

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    表格处理awk

    一、软件介绍 awk 是一个强大的文本处理工具,它不仅是 Linux 中,也是其他环境中现有的功能最强大的数据处理引擎之一。...awk 有 3 个不同版本: awk、nawk 和 gawk,一般常用的就是 gawk,gawk 是 AWK 的 GNU 版本。我们这里演示的就是 gawk。...第一种是 awk 命令行模式,像普通 linux 命令一样使用 awk,这也是我们最常用的一种方式,在命令行中也可以使用一些 awk 编程程序语言,但是不多。...第二种是使用-f 选项调用 awk 程序。这个和 sed -f 的方法类似,awk 允许将一段 awk 程序写入一个文本文件,然后在 awk 命令行中用-f 选项调用并执行这段程序。...这部分我们不常用,因为需要 awk 编程处理文本时,我都使用 perl 语言编程了,perl 处理文本更加高效。

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    生信分析中linux的使用5-grep

    生信技能树学习笔记 Linux文本处理——grep grep:一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式匹配模式搜索文本,并把匹配的行打印出来 格式:grep [options] pattern file...常见参数: -w:word 精确查找某个关键词 pattern -c:统计匹配成功的行的数量 -v:反向选择,即输出没有没有匹配的行 -n:显示匹配成功的行所在的行号 -r:从目录中查找pattern...-e:指定多个匹配模式 -f:从指定文件中读取要匹配的 pattern -i:忽略大小写 示例 问题1:精确查找某个内容 精确后-w 问题2:当单词前后有符号如何精确匹配 带着前后一起匹配 如何打空格...-e 方法二 创建关键词文件 用grep 读取 正则表达式:是对字符串操作的一种逻辑公式,就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合,组成一个“规则字符串”,这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑

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    在PHP中,cookie和session的使用

    用途:PHP中的Cookie具有非常广泛的使用,经常用来存储用户的登录信息,购物车等,且在使用会话Session时通常使用Cookie来存储会话id来识别用户,Cookie具备有效期,当有效期结束之后,...一般情况下,大多是使用所有路径的,只有在极少数有特殊需求的时候,会设置路径,这种情况下只在指定的路径中才会传递cookie值,可以节省数据的传输,增强安全性以及提高性能。...使用session 在PHP中使用session非常简单,先执行session_start方法开启session,然后通过全局变量$_SESSION进行session的读写。...用户在登录成功以后,通常可以将用户的信息存储在session中,一般的会单独的将一些重要的字段单独存储,然后所有的用户信息独立存储。...$_SESSION['uid'] = $userinfo['uid']; $_SESSION['userinfo'] = $userinfo; 一般来说,登录信息既可以存储在sessioin中,也可以存储在

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    Perl在ASIC中的应用——高级篇(1):正则表达式

    从今天开始,我们介绍Perl在ASIC应用中的高级篇。高级篇主要介绍正则表达式、module、package、面向对象、进程等。 正则表达式最常见的有两个应用,高级查找和替换。...等,表示这些字符本身 \b 匹配单词边界 \B 非单词边界 \d 数字,就是0-9中的任一个字符 \D 非数字 \w 匹配大小写字母和下划线 \W 非大小写字母和下划线...#通过脚本确认当前目录是否是项目根目录 } Perl正则表达式是非常博大精深的,需要在工作中慢慢积累。...所以,今天的练习题多一点,主要是想多提供一些实际使用场景,并自己动手解决问题。 练习题: 1. 用正则表达式从RTL里抓取所有寄存器的路径。(用于自动产生UVM寄存器模型) 2....分享芯片数字集成电路设计中的经验和方法。Sharing makes work smoother.

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    在Git和GitHub中如何使用分支

    在之前关于 git 版本控制软件的两篇教程中,我们学习了 使用 git 的基本命令,以及 如何使用 GitHub 来建立仓库并将我们的项目代码推送到网站。...像 GitHub、GitLab 和 BitBucket 这样的平台通过在云端托管 git 仓库,使使用 git(尤其是在团队项目中)更加用户友好,开发人员可以在云端存储、共享和与他人协作编写代码。...(在本教程中,我们使用 GitHub,但其他基于 git 的版本控制平台的工作方式相同)。 什么是 Git 分支?...在我们的场景中,我们将使用 hello_octo 分支来进行和测试我们的更改,然后将这些更改推送到 GitHub 上的主分支。...到目前为止,我们一直在使用一个极其简化的示例项目,因为此时最重要的是理解和吸收 git 工作流程。在现实世界中,合并比这要复杂得多 - 例如,如果您的合并出现冲突,会发生什么?

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    在 WordPress 中如何使用 Date 和 Time

    使用 Date 和 Time 是程序员一个非常日常的工作,比如定时发布,定时抓取信息等。...PHP 提供很多 date/time 函数,但是 WordPress 有自己的一套,下面讲解下 WordPress 中使用 Date 和 Time 的经验和坑。...时区 - Timezone 使用 date/time 第一个的要注意的时时区,很多错误都是因为这个引起的,比如定时发布的文章在错误的时间发布了(比如你想是北京时间明天早上8点发布的,但是发布在格林尼治时间早上...Date 和 time 格式 WordPress 让我们在 设置 > 常规 修改默认的时间格式,所以我们尽量在代码使用这个格式,而不要使用 date() 来生成,除非你自己要生成特殊的格式。...PHP 中可以使用 Date 和 Time 做很多事情,但是一定要用 WordPress 方式使用它们。

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    【LFS】从0构建Linux系统(准备宿主系统与创建新的分区)

    创建新分区需要用到的指令有:fdisk 在分区上建立文件系统 分区只是由分区表中记录的边界确定的一段扇区。在操作系统使用分区存储文件之前,必须格式化该分区,以在分区中建立一个文件系统。...文件系统也帮助操作系统记录分区中的可用空间,在创建文件或增大已有文件的大小时保留需要的扇区,并回收利用已删除的文件的数据空间。...一些文件系统还提供数据冗余和错误恢复功能 需要用到的指令有mkfs 设置环境变量LFS 在文档中,经常使用的环境变量LFS。...你应该保证在构建LFS的全过程中,该变量都被定义且设置为你构建的LFS使用的目录。 你应该先创建这个目录,作为后续的挂载点。...在使用 LFS 时,您就像坐在驾驶座上一样,亲自掌控系统的各个部分。 本系列长期更新 期待你的关注

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