img 其中test_1是一个包，在util.py里面想导入同一个包里面的read.py中的read函数，那么代码可以写为： from .read import read def util():...此时read.py文件中的内容如下： def read(): print('阅读文件') 通过包外面的main.py运行代码，运行效果如下图所示： ?...img 现在，我们增加一个数据文件，data.txt，它的内容如下图所示： ? img 并且想通过read.py去读取这个数据文件并打印出来。...这是因为并不是所有数据文件都是字符串，如果某些数据文件是二进制文件或者图片，那么以字符串方式打开就会导致报错。...此时如果要在teat_1包的read.py中读取data2.txt中的内容，那么只需要修改pkgutil.get_data的第一个参数为test_2和数据文件的名字即可，运行效果如下图所示： ?
随着下一代测序（NGS）技术的发展，肿瘤基因组学在癌症治疗中扮演了越来越重要的角色。然而，尽管目前积累了大量的突变数据，但只有少数突变与经过验证的治疗方法相关联。...因此，该研究利用大规模的临床基因组学数据，系统地分析了肿瘤突变与特定治疗（包括免疫治疗、化疗和靶向治疗）之间的关系，旨在为精准医学提供更深入的见解。...数据包括患者的肿瘤突变信息、治疗方案、生存结果、人口统计学信息等。基因组数据通过Foundation Medicine的下一代测序（NGS）技术获得，覆盖了300多个癌症相关基因。...NF1突变的aNSCLC患者在免疫治疗中表现出更好的生存率，但在ALK抑制剂或EGFR抑制剂治疗中生存率较差。 通路-治疗相互作用：研究还探讨了特定基因通路中的突变如何影响治疗效果。...尽管该模型仍需进一步验证，但其在临床实践中的应用潜力巨大。
在单细胞转录组数据分析中常见的有基因调控网络，生物代谢与信号转导网络，蛋白质互作网络，细胞相互作用网络，此类网络可以采用R中igraph包、Python 中的Networkx构建并实现出图。...单细胞转录组应用network 在单细胞转录组数据分析中我们知道主要有两条分析路径，可以说均可以利用network来反映信息，其实已在用了： ?...基因层面 基于表达量数据主要是共表达网络，这方面我们知道WGCNA几乎做到了极致，如我们在文章单细胞转录组WGCNA到底应该怎么做？...目前在单细胞转录组数据分析中，network不仅作为一种可视化展示多元关系，也作为一种数学模型来指导细胞分群。...图是一种数据结构，我们相信数据可以启发新知，network在以后的多元数据分析中也会得到广泛的应用。
GCN现有变体汇总（应用篇） Mix Hop（高阶多跳的图特征）融合 文献： ICML_2019 MixHop: Higher-Order Graph Convolutional Architectures
excelperfect Q：数据放置在列A中，我要得到这些数据中任意3个数据的所有可能组合。如下图1所示，列A中存放了5个数据，要得到这5个数据中任意3个数据的所有可能组合，如列B中所示。...Dim n AsLong Dim vElements As Variant Dim lRow As Long Dim vResult As Variant '要组合的数据在当前工作表的列...A Set rng =Range("A1", Range("A1").End(xlDown)) '设置每个组合需要的数据个数 n = 3 '在数组中存储要组合的数据...Then lRow = lRow + 1 Range("B" & lRow) = Join(vResult, ", ") '每组组合放置在多列中...如果将代码中注释掉的代码恢复，也就是将组合结果放置在多列中，运行后的结果如下图2所示。 ? 图2
R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图（Gantt chart）-项目管理/学习计划 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 ：测序结果的数据质控及图标展示...R-forestplot包| HR结果绘制森林图 ? maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化 ? maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图） ?...R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表 ? ggballoonplot|气球图-多分类数据可视化 ? ggrisk|高效绘制风险因子联动图 ?...ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 ? R|clusterProfiler-富集分析 ? ggplot2| 绘制KEGG气泡图 ? ggplot2|绘制GO富集柱形图 ?...R|UpSet-集合可视化 ? ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并 ? ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达图 ? R|plotly ?
数据 为了说明这是如何工作的，让我们假设我们有一个简单的数据集，它有一个datetime列和几个其他分类列。您感兴趣的是某一列(“类型”)在一段时间内(“日期”)的汇总计数。...运行中的go.Scatter（）图，但未达到预期。点的连接顺序错误。下面图形是按日期对值进行排序后的相同数据。...在本节中，让我们切换到一个样本数据集，该数据集有几百条记录和两个类别(a、b)，它们跨越了几年时间。...因为我们在for循环中传递了分组的dataframe，所以我们可以迭代地访问组名和数据帧的元素。在这段代码的最终版本中，请注意散点对象中的line和name参数，以指定虚线。...总结 在本文中介绍了使用Plotly将对象绘制成带有趋势线的时间序列来绘制数据。 解决方案通常需要按所需的时间段对数据进行分组，然后再按子类别对数据进行分组。
在Plotly中可以利用px.scatter_3d 和go.Surface绘制3D图。...残差图 就像预测误差图一样，使用plotly很容易在几行代码中可视化预测残差。...每一组不同的验证数据都会得出一个准确度，求得五组准确度的平均值，就是某个参数情况下的准确度。 Plotly可以使用Scikit-learn的LassoCV绘制交叉验证结果中各种 惩罚值的结果。...每个大块代表不同数据分割下，不同网格参数的R方和。而其中每个小块代表相同数据分割下，网格参数：'criterion'与'max_depth'在不同取值组合下的R方和。...第二个图汇总了所有分割的结果，每个盒子代表一个单一的模型。三组盒子代表三个不同的树深度'max_depth'，每组中不同颜色的盒子代表不同的评价标准'criterion'。
（通常用于时间标签的比较） 在plotly中没有直接进行百分比柱形图绘制的方法，因此我们可以先使用pandas算出数据的百分比，然后再将百分比数据用于绘图。..., size=[40, 60, 80, 100], )) ]) fig.show() 06 构成类图 饼图 饼图通常用于展示一组数据中各项的大小和总和的比例...，在瀑布图中，底部贴着坐标轴的条图表示阶段性统计值（汇总值），其余的表示增长或者减少（相对值）。...绘制直方图时，最简单的我们只需要一个维度的数值型数据即可，复杂的我们可以同时使用多组数据绘制组合直方图。 切记不要把直方图和柱状图混为一谈，在使用的场景上二者是有一定差异的。...，在箱线图中有上下两个边界，所有超出边界的数据点都被认为是异常值。
当我们的数据涉及日期和时间时，分析随时间变化变得非常重要。Pandas提供了一种方便的方法，可以按不同的基于时间的间隔(如分钟、小时、天、周、月、季度或年)对时间序列数据进行分组。...比如进行数据分析时，我们需要将日数据转换为月数据，年数据等。在Pandas中，有几种基于日期对数据进行分组的方法。...Pandas 中的 Grouper 函数提供了一种按不同时间间隔（例如分钟、小时、天、周、月、季度或年）对时间序列数据进行分组的便捷方法。...通过与Pandas 中的 groupby 方法 一起使用，可以根据不同的时间间隔对时间序列数据进行分组和汇总。Grouper函数接受以下参数:key: 时间序列数据的列名。...在Pandas中，使用dt访问器从DataFrame中的date和time对象中提取属性，然后使用groupby方法将数据分组为间隔。
一、简介 在实际工作中，遇到数据中带有缺失值是非常常见的现象，简单粗暴的做法如直接删除包含缺失值的记录、删除缺失值比例过大的变量、用0填充缺失值等，但这些做法会很大程度上影响原始数据的分布或者浪费来之不易的数据信息...，因此怎样妥当地处理缺失值是一个持续活跃的领域，贡献出众多巧妙的方法，在不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点，在R中用于处理缺失值的包有很多，本文将对最为广泛被使用的mice和VIM包中常用的功能进行介绍...中的matshow，VIM包中的matrixplot将数据框或矩阵中数据的缺失及数值分布以色彩的形式展现出来，下面是利用matrixplot对R中自带的airquality数据集进行可视化的效果： rm...如上图所示，通过marginplot传入二维数据框，这里选择airquality中包含缺失值的前两列变量，其中左侧对应变量Solar.R的红色箱线图代表与Ozone缺失值对应的Solar.R未缺失数据的分布情况...: 当只希望从合成出的m个数据框中取得某个单独的数据框时，可以设置action参数，如action=3便代表取得m个数据框中的第3个 mild: 逻辑型变量，当为TRUE时，会输出包含全部m个合成数据框的列表
但是，数据可视化类型图繁多，在实际工作中，要选择最适合当前业务或数据的类型通常很棘手。...克利夫兰点图 这是一个类似散点图的图表，在一个维度中垂直显示数据。...带标记的雷达图 在这些中，蜘蛛图上的每个数据点都被标记。 填充雷达图 在填充的雷达图中，线条和蜘蛛网中心之间的空间是彩色的。 象形图 它使用图标来提供一小组离散数据的更具吸引力的整体视图。...plotly code 在 plotly 中，标记符号可以与 graph_objs Scatter 一起使用。...它将系列中的每个数据点与表示缺失数据点的粗略近似值的拟合曲线连接起来。 plotly code 在 plotly 中，它是通过将 line_shape 指定为 spline 来实现的。
当我们探索如何将这两种语言在人工智能数据分析中交互和融合时，便开启了一段充满无限可能的创新之旅。在实际的人工智能数据分析项目中，为什么要考虑 C 语言与 R 语言的交互融合呢？...例如，在一个生物信息学的基因数据分析项目中，C 语言负责从基因测序设备读取原始的基因序列数据，并将其映射到共享内存区域，R 语言则可以直接对共享内存中的数据进行基因序列的比对、变异分析等统计操作，大大加快了数据分析的速度...在人工智能数据分析的模型训练和优化过程中，C 语言与 R 语言的交互也有着独特的应用场景。...C 语言与 R 语言在人工智能数据分析中的交互和融合为我们提供了一种强大而灵活的数据分析解决方案。...无论是在科研领域的大数据研究，还是在工业界的智能决策支持系统中，这种跨语言的协同工作模式都将为我们开启新的数据分析之门，助力我们在人工智能的浪潮中更好地挖掘数据的宝藏，推动相关领域的不断发展和进步。
在「瀑布图有什么用？怎么画？」这篇文章中，我介绍了一种用 Python 画瀑布图的方法。...在《麦肯锡方法》这本书中，有关于瀑布图的详细介绍，作者认为瀑布图是一种阐述如何从数字 A 得到数字 B 的极佳方法，它可以描述静态数据（资产负债表、利润表），或者动态数据（时间序列数据、现金流）。...书中有一个瀑布图的示例，我认为这张图有 3 个特点： （1）标题突出了图表中的重要信息； （2）关键位置用箭头突出标注出来； （3）使用不同的柱子，来表示汇总数据和相对数据。 ?...我参考上面的瀑布图，用 Python 中的 plotly 库，画出下面这张瀑布图，主要有 2 点变化： （1）颜色区分：使用绿色代表增加，红色代表减少，蓝色代表汇总； （2）位置调整：把标题中的一句话，...开始画图 其次，我们开始利用 Python 中的 plotly 库进行画图。
无论你是去对多个数据源进行汇总，还是简单的数据收集，开始你都需要对重复数据的删除做一个有意义的分析。 如你所想，有取之不尽的方法可以用来合并数据和用之不竭的规则来定义你数据的等价意义。...StarCluster允许所有人在面向分布式和并行计算的应用和系统的云服务器中轻松的创建一个集群计算环境。这允许你在无限制的数据上做交互程序。...Plotly Plotly是一个面向R，Python，MATLAB，JavaScript和Excel的交互式图形库。Plotly也是一个用于分析和分享数据和图像的平台。...Plotly的R，Python和MATLAB的API可以让你做交互、更新仪表面板和图像。...例如，下面的图是使用ggplot2制作的，然后嵌入到这个博客中。将鼠标悬停后看看数据变化，然后单击拖动放大。 ? 创建交互式地图。Plotly的图形库建立在D3.js之上。
由于数据的对数规范版本几乎是正常的单峰数据，因此可以将权重用于推断统计中的后续分析。 女性参加者比男性参加者更多，其幅度大大超过美国的总人口。这可能表明抽样方法在性别抽样方面并非完全随机。...但是，数据样本足够大，可以继续评估健康风险因素。 年龄范围似乎在两端都偏向极端。 在比较年龄和体重时，性别的体重分布似乎确实存在明显差异。男性似乎比女性重。...（变量：性别，X_ageg5yr，weight2，diabete3） 当观察样本中的女性和男性参与者时，报告的糖尿病比率非常相似。...报告患有糖尿病的患者似乎在每个年龄段都较重。报告患有糖尿病的年轻患者似乎比老年患者具有更大的体重范围。虽然尚不清楚年龄与糖尿病和体重之间的关系，但应进一步探讨这种关系。...第4部分：结论 从数据的初步探索中可以明显看出，某些功能具有比其他功能更强的相关性。体重与性别有关。性别似乎与体重无关。但是，糖尿病似乎与年龄有关，而与体重密切相关。
瀑布图 瀑布图显示加上或减去值时的累计汇总，在理解一系列正值和负值对初始值（例如，净收入）的影响时，这种图表非常有用。 列采用彩色编码，可以快速将正数与负数区分开来。...在plotly.express中暂时没有瀑布图，我们需要用到plotly.graph_objects。...股价图 以特定顺序排列在工作表的列或行中的数据可以绘制为股价图。 顾名思义，股价图可以显示股价的波动。...在plotly.express中暂时没有股价图，我们需要用到plotly.graph_objects。...import plotly.express as px df = pd.read_excel(r'F:\PythonCool\可视化\上海二手房经纬度.xlsx') df.head() ?
打开带有Visual Studio Code的终端 我们将在终端中打开VS Code。首先，创建一个工作文件夹。然后，在终端命令中转到创建的工作文件夹，并输入以下命令，然后按回车键。...确认的方法是，在打开的VS Code终端中输入以下命令，然后按下Enter键。星号(*)标记显示为活动状态。...Streamlit支持主流的数据分析库和可视化库，因此可以在创建的Web应用程序中轻松实现它们。...RESAS是一个将地区经济相关的各种数据以地图和图表的形式非常清晰地汇总的系统。.../jp_city_latlon/ 关于Plotly 将使用一个名为Plotly的开源交互式数据可视化工具，其中的一个高级API群体被称为Plotly Express。
3.3 堆积百分比柱状图3.4 分组柱状图四、讨论一、前言柱状图又称条形图，在统计分析中的使用频率最高，也是众多小白入门R最早绘制的可视化图形。...安装R包：barplotggplot2plotly二、初阶图形2.1 基本条形图values 按组排序...R包，可以绘制点图、线图、条形图、气泡图、桑基图、甘特图、树状图等。...关注公众号「生信初学者」回复【barplot】领取示例数据和代码
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