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R 交叉验证①

什么是交叉验证?在机器学习中,交叉验证是一种重新采样的方法,用于模型评估,以避免在同一数据集上测试模型。...交叉验证的概念实际上很简单:我们可以将数据随机分为训练和测试数据集,而不是使用整个数据集来训练和测试相同的数据。...交叉验证方法有几种类型LOOCV - leave -one- out交叉验证,holdout方法,k - fold交叉验证。...其中,10折交叉验证是最常用的。 英文名叫做10-fold cross-validation,用来测试算法准确性。是常用的测试方法。...10次的结果的正确率(或差错率)的平均值作为对算法精度的估计,一般还需要进行多次10折交叉验证(例如10次10折交叉验证),再求其均值,作为对算法准确性的估计。

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    R实现多分类logistic回归

    多分类logistic回归 在临床研究中,接触最多的是二分类数据,如淋巴癌是否转移,是否死亡,这些因变量最后都可以转换成二分类0与1的问题。...然后建立二元logistic回归方程,可以得到影响因素的OR值。 那么如果遇到多分类变量,如何进行logistic回归呢?...譬如临床疗效分为好,中,差,三类,或者根据指标进行分类,分为高,中,低三类,我用1、2、3代表作为因变量,进行logistic回归分析。...关于原理理论部分可参见;这里主要讲如何在R实现三分类回归,计算系数及p值与OR值 1.数据案例 这里主要用到DALEX包里面包含的HR数据,里面记录了职工在工作岗位的状态与年龄,性别,工作时长,评价及薪水有关...REGRESSION 逻辑回归(Logistic Regression)详解 iBreakDown plots for classification models MULTINOMIAL LOGISTIC

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    【算法】逐步在Python中构建Logistic回归

    笔者邀请您,先思考: 1逻辑回归算法怎么理解? 2 如何用Python平台做逻辑回归? logistic回归是一种机器学习分类算法,用于预测分类因变量的概率。...在逻辑回归中,因变量是一个二进制变量,包含编码为1(是,成功等)或0(不,失败等)的数据。 换句话说,逻辑回归模型基于X的函数预测P(Y = 1)。...Logistic回归假设 二元逻辑回归要求因变量为二元的。 对于二元回归,因变量的因子级别1应代表所需的结果。 只应包含有意义的变量。 自变量应相互独立。...在逻辑回归模型中,将所有自变量编码为虚拟变量使得容易地解释和计算odds比,并且增加系数的稳定性和显着性。...如您所见,PCA降低了Logistic回归模型的准确性。 这是因为我们使用PCA来减少维度,因此我们从数据中删除了信息。 我们将在以后的帖子中介绍PCA。

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    R语言logistic回归的细节解读

    “医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用、R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、临床研究设计、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。...logistic回归之前,我们要把数值型变量变成无序分类或有序分类变量,在R语言中可以通过factor()函数变成因子型实现。...需要注意的是自变量x1和x7,这两个应该是有序分类变量,这种自变量在进行逻辑回归时,可以进行哑变量设置,即给定一个参考,让其他所有组都和参考相比,比如这里,我们把x1变成因子型后,R语言在进行logistic...接下来进行二项逻辑回归,在R语言中,默认是以因子的第一个为参考的!自变量和因变量都是如此!和SPSS的默认方式不太一样。...结果中出现了x12/x13/x14这种,这是因为R语言在做回归时,如果设置了哑变量,默认是以第一个为参考的,其余都是和第一个进行比较,这也是R中自动进行哑变量编码的方式。

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    k折交叉验证(R语言)

    “ 机器学习中需要把数据分为训练集和测试集,因此如何划分训练集和测试集就成为影响模型效果的重要因素。本文介绍一种常用的划分最优训练集和测试集的方法——k折交叉验证。”...k折交叉验证 K折交叉验证(k-fold cross-validation)首先将所有数据分割成K个子样本,不重复的选取其中一个子样本作为测试集,其他K-1个样本用来训练。...其中,10折交叉验证是最常用的。 实例代码 在线性分类器与性能评价(R语言)中,我们将数据集随机抽取70%作为训练集,剩下30%作为测试集,通过线性回归的方法进行预测,通过ROC和AUC评价模型效果。...构建for循环,得到十次交叉验证预测的AUC值。并纪录取值最大的一组,作为最优的训练集与测试集划分。...线性分类器与性能评价(R语言)中随机选取训练集和测试集,最终测试集的AUC值仅为0.755,而本次我们通过k折交叉验证选取训练集和测试集,测试集AUC值达到0.936,可以看出模型效果提升显著。

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    在Python和R中使用交叉验证方法提高模型性能

    换句话说,为什么在别人评估我们的模型时会失去稳定性? 在本文中,我们将探讨可能的原因。我们还将研究交叉验证的概念以及执行它的一些常用方法。 目录 为什么模型会失去稳定性? 什么是交叉验证?...我已经在本节中讨论了其中一些。 验证集方法 在这种方法中,我们将数据集的50%保留用于验证,其余50%用于模型训练。...在这种情况下,应使用带有重复的简单 k倍交叉验证。 在重复的交叉验证中,交叉验证过程将重复 n 次,从而产生 原始样本的n个随机分区。将 n个 结果再次平均(或以其他方式组合)以产生单个估计。...在大多数情况下,第一步预测可能并不十分重要。在这种情况下,可以将预测原点移动来使用多步误差。例如,在回归问题中,以下代码可用于执行交叉验证。...我们还研究了不同的交叉验证方法,例如验证集方法,LOOCV,k折交叉验证,分层k折等,然后介绍了每种方法在Python中的实现以及在Iris数据集上执行的R实现。

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    R语言做Logistic回归的简单小例子

    Logistic回归的应用场景 当因变量为二值型结果变量,自变量包括连续型和类别型的数据时,Logistic回归是一个非常常用的工具。...对婚姻的自我评分 因变量y是出轨次数,我们将其转换成二值型,出轨次数大于等于1赋值为1,相反赋值为0 下面开始实际操作 这个数据集来自R语言包AER,如果要用这个数据集需要先安装这个包 install.packages...("AER") 然后使用data()函数获取这个数据集 data(Affairs,package = "AER") 然后就可以在环境的窗口里看到如下 ?...image.png 根据回归系数的P值可以看到 性别、是否有孩子、学历、职业对方程的贡献都不显著。...image.png 可以看到结果中p值等于0.2108大于0.05,表明四个变量和9个变量的模型你和程度没有差别 接下来是评价变量对结果概率的影响 构造一个测试集 testdata<-data.frame

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    R语言弹性网络Elastic Net正则化惩罚回归模型交叉验证可视化

    p=26158 弹性网络正则化同时应用 L1 范数和 L2 范数正则化来惩罚回归模型中的系数。为了在 R 中应用弹性网络正则化。...在 LASSO回归中,我们为 alpha 参数设置一个 '1' 值,并且在 岭回归中,我们将 '0' 值设置为其 alpha 参数。弹性网络在 0 到 1 的范围内搜索最佳 alpha 参数。...在这篇文章中,我们将学习如何在 R 中应用弹性网络正则化。 首先,我们将为本教程创建测试数据集。...which(bst$mse==min(bst$mse)) betlha <- bs$a\[inex\] be_mse <- bst$mse\[inex\] 接下来,我们再次使用最佳 alpha 进行交叉验证以获得...: 本文摘选《R语言弹性网络Elastic Net正则化惩罚回归模型交叉验证可视化》。

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    多项式Logistic逻辑回归进行多类别分类和交叉验证准确度箱线图可视化

    在本教程中,您将了解如何在 Python 中开发多项逻辑回归模型。 完成本教程后,您将了解: 多项逻辑回归是逻辑回归的扩展,用于多类分类。...评估多指标Logistic回归模型 在本节中,我们将使用Python机器学习库开发并评估一个多项逻辑回归模型。 首先,我们将定义一个合成的多类分类数据集,作为基础。...分层确保了每个交叉验证折在每个类别中的例子的分布与整个训练数据集大致相同。 我们将使用10折交叉验证三次重复,这是很好的默认值,并且考虑到类的平衡,使用分类精度来评估模型性能。...多项式Logistic回归的L2惩罚与准确率的箱线图 概括 在本教程中,您了解了如何在 Python 中开发多项逻辑回归模型。 你有任何问题吗? 在下面的评论中提出您的问题,我们会尽力回答。...---- 本文摘选《Python多项式Logistic逻辑回归进行多类别分类和交叉验证准确度箱线图可视化》

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    R语言画森林图展示Logistic回归分析的结果

    之前的推文参考《R语言实战》介绍了R语言做Logistic回归分析的简单小例子,R语言做Logistic回归的简单小例子今天的推文继续,介绍一些Logistic回归分析结果的展示方法。...在文献中,我们常常看到以表格的形式展示各种回归结果(如Logistic回归,多重线性,Cox回归等),比如2019年发表在 Environment International 上的论文 Exposure...image.png 就采用表格的形式展示Logistic回归分析的结果,上述表格把有统计学意义的结果进行了加粗,使得读者看起来不那么费劲。那么,有没有更加直观的方法展示回归结果呢?...近年来,越来越多文献用森林图来展示回归的结果。接下来我们一起来学习一下如何用R作森林图。...第一步是准备数据 森林图展示的数据通常是Logistic回归分析的系数和95%置信区间以及显著性检验的P值,那么如何获得这些结果呢?

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    logistic逻辑回归公式推导及R语言实现

    Logistic逻辑回归 Logistic逻辑回归模型 线性回归模型简单,对于一些线性可分的场景还是简单易用的。...Logistic逻辑回归也可以看成线性回归的变种,虽然名字带回归二字但实际上他主要用来二分类,区别于线性回归直接拟合目标值,Logistic逻辑回归拟合的是正类和负类的对数几率。...logistic逻辑回归可以拟合因变量为1的概率,最终分类的时候,我们可以一个阈值,比如0.5,大于阈值的都分为正类,向量化公式如下: ?...还可以换一种方式理解logistic逻辑回归,他是用多元线性函数去拟合因变量为正例与反例的比值的自然对数,推导如下: ? ?...总结 应该增加一部分训练数据,验证模型的正确性 应该增加正则项避免过拟合,比如L2正则 更多精彩文章 http://h2cloud.org/

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    MATLAB中 crossvalind K重交叉验证

    官方文档:https://ww2.mathworks.cn/help/bioinfo/ref/crossvalind.html k-重交叉验证(k-fold crossValidation): 在机器学习中...例子:利用十折交叉验证计算错误分类率 (Matlab内置了由Fisher在1936年发布的关于iris的数据集,鸠尾花的分类,详见UCI链接;载入该数据集,包括means和species,分别是四维的150...3)在K折十字交叉验证中,K-1份被用做训练,剩下的1份用来测试,这个过程被重复K次。...2)在十折交叉验证法中,就是重复10次,可累积得到总的错误分类率。 10折交叉验证的例子 第1步,将数据等分到10个桶中。 ? 我们会将50名篮球运动员和50名非篮球运动员分到每个桶中。...与2折或3折交叉验证相比,基于10折交叉验证得到的结果可能更接近于分类器的真实性能。之所以这样,是因为每次采用90%而不是2折交叉验证中仅仅50%的数据来训练分类器。

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