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「R」ggplot2在R包开发中的使用

没有特别系统的学习 tidy evaluation 这方面的高级操作,最近有空准备补一补,学习下这方面的知识。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法,但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...如果没有,则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中,而该字节码可能与安装的ggplot2不一致!

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R EnhancedVolcano 绘制火山图

火山图是用于差异表达分析结果可视化的一种有效方法。...今天,我们来介绍一个用于增强火山图绘制的强大 R 包:EnhancedVolcano ,该包拥有强大的绘图功能,用户可以简单的通过设置颜色、形状、大小和阴影等参数定义不同的绘图属性,此外通过可以通过添加连线的方式有效避免数据点之间的重叠现象...使用 EnhancedVocalno 包绘制的火山图基本可以直接用于文献发表,可以说非常简单又实用的一款神器了。 1. 下载与安装 R 版本:3.6.1。...简单使用 2.1 输入数据格式 首先,我们先来介绍一下 EnhancedVolcan o 输入数据格式。...EnhancedVolcano 包可以使用多种差异算法(例如 DESeq2 等)的结果作为输入,数据中需包含 log2FC 、Pvalue 或(和) qvalue 结果,示例数据如下: ?

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    在Android开发中如何使用OpenSL ES库播放解码后的pcm音频文件?

    支持pcm数据的采集和播放 支持播放的音频数据来源广泛,res、assets、sdcard、在线网络音频以及代码中定义的音频二进制数据   和Android提供的AudioRecord和AudioTrack...如果希望减少拷贝,开发更加高效的Android音频应用,则建议使用Android NDK提供的OpenSL ES API接口,它支持在native层直接处理音频数据。...二.使用OpenSL ES播放pcm音频数据的步骤   开发步骤如下: 创建引擎对象和接口 创建混音器对象和接口 创建播放器对象和接口 创建缓冲队列接口并给缓冲队列注册回调函数 设置播放状态,手动调用回调函数...pcm_path){ const char *pcmPath=env->GetStringUTFChars(pcm_path, nullptr); pcmFile=fopen(pcmPath,"r"...absolutePath+File.separator+"input.pcm" playPcmBySL(pcmPath)   需要注意的是,pcm文件可以通过使用ffmpeg解码mp3文件得到,但是在解码的时候需要注意的是

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    在Win10中使用Linux版本的R和Python

    中使用并行计算包 Parallel 更快,因为 R 可以直接调用 Linux 内核中的 fork 功能复制 N 个“一摸一样”的线程,但是在 Window 中,fork 并不被支持,想要创建多线程,就必须先创建一个主线程...原来就捉襟见肘的内存和硬盘,开了虚拟机后可能就没多少留给 R 了(别忘了 R 和 Python 需要把所有数据都加载到内存中!)...背后的原因在于,虚拟机对于宿主系统来说是个外来者,因此虚拟机中的系统想要访问 Internet 或者宿主系统中的文件,就必须使用某种技巧“在宿主系统的防火墙中打一个洞”。...你已经成功在 Linux 子系统中创建了一个 Jupyter 服务器并且在 Windows 中直接访问了! 安装 R (Linux) 大猫强烈推荐使用微软的 Microsoft R Open。...安装 devtools 继续上一步,在 Linux 命令行中打开 R 后,运行我们熟悉的 install.packages('devtools')来安装包。 ? 2.

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    R EnhancedVolcano 绘制火山图

    火山图是用于差异表达分析结果可视化的一种有效方法。...今天,我们来介绍一个用于增强火山图绘制的强大 R 包:EnhancedVolcano ,该包拥有强大的绘图功能,用户可以简单的通过设置颜色、形状、大小和阴影等参数定义不同的绘图属性,此外通过可以通过添加连线的方式有效避免数据点之间的重叠现象...使用 EnhancedVocalno 包绘制的火山图基本可以直接用于文献发表,可以说非常简单又实用的一款神器了。 1. 下载与安装 R 版本:3.6.1。...简单使用 2.1 输入数据格式 首先,我们先来介绍一下 EnhancedVolcan o 输入数据格式。...EnhancedVolcano 包可以使用多种差异算法(例如 DESeq2 等)的结果作为输入,数据中需包含 log2FC 、Pvalue 或(和) qvalue 结果,示例数据如下: 2.2 基础绘图

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    增强火山图,要不要试一下?

    但在操作过程中发现,其shape功能并没有在help文档中找到,经过搜索在github上看到了以下的答复 。。。(说明整个文档功能并没有完全开发,需进行选择) ?...加载R包 library(EnhancedVolcano) 3 开始 作者使用该流程: RNA-seq workflow: gene-level exploratory analysis and differential...# 对dex列进行relevel,再把revel后的结果赋值到airway$dex。...用户可以选择性地提供他/她希望在图中标记的转录本名称的矢量(as selectLab)。 在这个例子中,还修改了点和标签大小,帮助改善清晰度,保障更多的转录本进入差异分析中。...4.6 绘制调整后的p值 作者通过 bquote 函数修改轴标题 EnhancedVolcano(res2, lab = rownames(res2), x = 'log2FoldChange

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    R语言实现meta分析过程中的可视化展示

    今天我们给大家介绍一个在R语言中进行meta分析的工具metafor包。我们通过这个包把相应的meta分析的常规的一些图为大家介绍下。 1....森林图,主要是对研究的一致性进行评估的可视化展示形式,以竖线为界,总结结果在线左认为是研究的因素降低,或者对研究的因素不利。此处我们使用此包自带的卡介苗抵抗肺结核(TB)的研究数据进行森林他绘制。...其中主要的参数有meature,一般我们都选用‘RR’,‘OR‘(具体解释可以自行百度或者参见我们前面的教程); ? method,具体的方法如下: ?...散点图,主要是绘制预测结果,观察是否在置信区间内部。由于其运算的简单,我们就不把程序一一展开了。...Plot ofInfluence Diagnostics 主要是评估模型的中研究质量,从而发现对分析主要的影响的研究以及偏差很大的研究。

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    【react-dnd使用总结一】拖放完成后获取放置元素在drop容器中的相对位置

    工具函数-根据元素的起始位置和最终位置,计算相对于某元素的位置 export interface IPosition { left: number; top: number; } /** *...根据元素的其实位置和最终位置,计算相对于某元素的位置 * @param initialPosition 拖动元素相对于屏幕左上角的起始位置(偏移量) * @param finalPosition 拖放完成后当前节点相对于屏幕左上角的位置...finalX) - dropTargetPosition.left; return { left: newXposition, top: newYposition, }; }; 在drop...回调函数中 drop(target: any, monitor: DropTargetMonitor) { console.log(target, monitor); const position...) monitor.getSourceClientOffset(), // 拖放完成后当前节点相对于屏幕左上角的位置 document.querySelector('#container

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    如何在MATLAB中实现各种特殊上标?

    最近遇到同学提出的字母上标问题,要求在字母正上方标注横线或者尖角,在数学中这是常见的标识方法,但在MATLAB中有其特殊的表示方法。...本人在学习中也搜索相关的表达方式,发现大多数表述不完整,或者实现方式不对,因此抽时间整理并编写代码,将大多数上下标的实现方式以代码的形式展示出来,供大家学习交流。...1、上下标示例展示: 本文只针对特殊上标情况,上下角标可由符号“^”或者“_”实现,故不在本文讨论范围之内,特殊上标的示例如下图所示。 ? 图示中所有上标标识均可由代码实现。...其中绿色部分是常见错误的表示,因为绿色的标识只在第一个字符的正上方标注,而正确的标识要求标注符号均体现在字符的正上方。红色部分为正确示范,供读者学习参考。 2、应用举例及代码实现 ?...}{0.5}$','interpreter','latex','FontSize', 24,'Color','r'); 最后强调一个通用性较强的代码,在LATEX下只需修改\stackrel{F}{\

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    Fabric.js 上标和下标的使用偏方🔥

    对于数学化学这方面的项目,“上标” 和 “下标” 功能是很常用的,比如 次方 、化学元素 等表达方式,都需要用到上标或者下标。...在 Fabric.js 中,文本元素有 Text 、IText 和 Textbox 。本文主要讲解 IText 的上标和下标如何实现。在 Text 和 Textbox 中的实现方式也是一样的。...行号和字符下标都是从0开始,和 js 的数组一样。 IText 换行是使用 \n 来操作。 本例只有1行,所以行号为0。 2 所在的位置下标是 1。...fontSize: 24 } } } }) 复制代码 在本例中,下标我并不打算向下偏移,因为这样看起来不是那么好看,所以我只是设置了 fontSize 为24,将字号改小一点了。...除了上述方式,其实还有另一种方式设置上标和下标的,但那种方式的应用场景稍微有点不同,下一篇再说说那种方法。 源码仓库 ⭐Fabric IText 上标和下标

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    ASCIIMathML技术简介~

    安装mathplayer后,鼠标指向(只是指向,不要单击哦)公式时,可以阅读到输入公式时的源代码(阅读到的代码省略了标记符号)。...1、上、下标的输入   (1)上标符号为“^”、下标符号为“_”,例如:`2^n`;`U_2`。  ...(2)可同时输入上下标(注意要先下标再上标),例如::`{::}_(\ 92)^238U` 备注:上、下标符号对于字母一次只能作用一个字符,而对于数字却一次作用一个字符串(含数字的正负号),或者换句话说...想作用多个字符时可以使用{}将多个字符括起来。 2、分式的输入   (1)简单一点的分式用斜杠表示分数线。...至于定积分的上、下标,和上面的介绍的方法完全一致。  接下来我们学习特殊符号的输入  举几个例子,大家先熟悉以下模式,注意观察一下一些公式的代码。

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    Matplotlib 中文用户指南 4.6 编写数学表达式

    任何文本元素都可以使用数学文本。 你应该使用原始字符串(在引号前面加一个'r'),并用美元符号($)包围数学文本,如 TeX。 常规文本和数学文本可以在同一个字符串内交错。...这是常规 TeX 的一个小改变,其中非数学文本中的美元符号必须被转义(' 注意 虽然一对美元符号($)内的语法是 TeX 风格的,但是外面的文本不是。...下标和上标 为了制作下标和上标,使用_或者^符号: r'$\alpha_i > \beta_i$' 一些符号会自动将它们的下标或上标放在操作符的底部或顶部,例如,为了编写 0 到无穷的 的和,你可以...注意在上面的例子中,A和sin之间的间距被挤压。...注意下面的\imath用来避免i上额外的点: r"$\hat i\ \ \hat \imath$" 符号 你也可以使用更大量的 TeX 符号,比如\infty,\leftarrow,\sum,\int

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    【Latext】上标下标 ( 右侧上标下标 | 任意字符的正上标记 | 任意字符的正下标记 | 常用数学符号的上标和下标 | 加和 | 乘积 | 交集 | 并集 | 上积 | 极限 | 上弧 )

    文章目录 一、右侧上标下标 二、任意字符的正上标记 三、任意字符的正下标记 四、常用数学符号的上标和下标 ( 加和 | 乘积 | 交集 | 并集 | 上积 | 极限 ) 五、上弧 一、右侧上标下标 --...-- 普通上标使用 ^ 表示 , 普通下标使用 _ 表示 , 如 : A^2 展示效果 : A..., 上标下标在右侧 , 如 : 在行内模式中 , \sum_{n = 1}^{+\infty} 展示效果为 ∑...\sum_{n = 1}^{+\infty} , 展示效果为 : \sum_{n = 1}^{+\infty} 如果需要在行内模式中 , 将上标下标都放在正上方 , 或正下方 , 使用 \limits...\overarc , 但是在 CSDN 的 Markdown 中无法使用 , 这里只能使用正上标记 \overset{} 实现 ; \overset{\frown}A 展示内容为 :

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    scRNA分析|一(尽)文(力)解决你的单细胞火山图问题

    当有了聚类结果(cluster)或注释结果(celltype)后就可以 找不同cluster/celltype间,不同样本间 或者 不同分组间的差异,为后面的 机制探索 或者 样本间/组间异质性研究 提供一些帮助...但是在对差异结果进行可视化的时候,你是否经常会遇到以下情况, 1)单细胞数据的火山图 中间经常会缺一块 ?Y轴最高处会堆积很多点? 2)除bulk常见的火山图外,文献中是否还有什么其他的展示形式?...cluster/celltype间的pct差值,纵坐标使用log2FC ,P值可以使用颜色来表示。...Fig2-D所示 ,提出了同时展示所有cluster差异基因的方式 这里介绍一种简单实现的方式,推荐老俊俊封装的scRNAtoolVis-R包,可以一行代码简单出图 jjVolcano 一行代码绘制单细胞火山图...◆ ◆ ◆ ◆ ◆ 精心整理(含图PLUS版)|R语言生信分析,可视化(R统计,ggplot2绘图,生信图形可视化汇总)

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    上标下标字母和数字,以及如何使用

    除了常用的26个字母和10个数字字符之外,在 unicode 中还有一些上标数字,下标数字,以及上标字母,这些特殊的字符如果用的好的话,可以给我们生活增色不少,今天就将如何使用这些字符。...上标数字及符合 ⁰ ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ ⁷ ⁸ ⁹ ⁺ ⁻ ⁼ ⁽ ⁾ 这个最常用就就是数学中使用了,比如: x²-y² x⁵⁽ⁿ⁻⁶⁾ 另外就是做成上标电话放在自己微信昵称或者群昵称中,让朋友或者同个群里的用户能够立刻联系你...下标数字及符合 ₀ ₁ ₂ ₃ ₄ ₅ ₆ ₇ ₈ ₉ ₊ ₋ ₌ ₍ ₎ 这个应用比较多的可能是化学分子式中,当然也用到上标数字: H₂O CO₂ C₂H₄ O₂ H₂SO₄ CCl₄ O²⁻ H⁺...Fe²⁺ Al³⁺ Cl⁻ 当然也可以做成下标电话号码放在昵称中,我做的工具:下标电话号码生成器。...完整的下标字符 ₐ ₔ ₑ ₕ ᵢ ⱼ ₖ ₗ ₘ ₙ ₒ ₚ ᵣ ₛ ₜ ᵤ ᵥ ₓ ᙮ ᵤ ᵩ ᵦ ₗ ˪ ៳ ៷ ₒ ᵨ ₛ ៴ ᵤ ᵪ ᵧ 结合上标字符,可以做成一些有趣的组合: Lₒᵥₑ Yₒᵤ

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    缺失的第一个正数(LeetCode 41)

    打完标记后,遍历数组,如果下标 i 没有被打上标记,那么 i+1 就是数组中缺失的第一个正整数。 如果数组所有下标均被打上标记,那么 n+1 就是数组中缺失的第一个正整数。...如何给数组下标打上标记呢? 由于我们只在意 [1,n] 中的数,因此我们可以先对数组进行遍历,把不在 [1,n] 范围内的数修改成任意一个大于 n 的数(例如 n+1)。...在遍历完成之后,如果数组中的每一个数都是负数,那么答案是 n+1,否则答案是第一个正数的下标加 1。 时间复杂度: 三次遍历数组,第一次遍历将数组中所有非正数变成 n+1。...,将给定的数组「恢复」成下面的形式: 如果数组中包含 x∈[1,n],那么恢复后,数组的第 x−1 个元素为 x。...在完成交换后,新的 nums[i] 可能还在 [1,n] 的范围内,我们需要继续进行交换操作,直到 x∉[1,n]。 注意到上面的方法可能会陷入死循环。

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    SAS-Macro 中的那些语句(四)

    这还是继续前面的基础说,今天来说一说宏中数值运算、几个常见函数等... 宏数值运算 大家都知道SAS数据集中的变量是分数值型、字符型的。那么SAS的宏变量是否分数值型变量和字符型变量呢?...*&mvar2.); %eval进行运算的宏变量有小数点是会有Error的...那么来看看日志。 ? %sysfunc 前几天小编推送了一大堆SAS里面的基础函数,那么那些函数在宏是否可以用呢?...%str()/%nrstr()/%bquote/%nrbquote...这些都是干嘛的呢,%str()与%nrstr()可以在小编的历史推送中的例子时长出现,这个俩个是作用在编译期间,可以屏蔽一些特殊符号...;进行编译的时候,发现&mac存在,便开始进行执行,在执行过程中,先将&mac解析成%bquote(&sss) 此时,由于%bquote()作用在执行期间,且不对&符号进行屏蔽,发现&sss不存在便报出了一次警告...,由于%bquote()的存在,造成了未知因素的干扰, 并未将&sss作为字符串,进行了执行,在执行时又发现了&sss不存在... */ %put NOTE:&mac2.; /* 1次警告原因:在 %

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