这种数据的可视化方法非常多，今天介绍使用ggraph包可视化，功能很多，布局也很多，很多常见的网络图都是这个包画出来的。...加载R包 # libraries library(ggraph) ## Loading required package: ggplot2 library(igraph) ## ## Attaching...接下来进行一些美化操作，看看这个包的强大之处。 美化 通过组合不同的布局和线型，可以得到非常多神奇的结果。比如大家比较喜欢的圆形布局。...p1+p2+p3+p4+p5+p6+p7+p8+p9+plot_layout(ncol = 3) plot of chunk unnamed-chunk-4 如果给数据增加一些属性列，就会变成大家在论文中常见的各种图形了...，并不是线条的，所以如果你想让线条也有属性映射的话，需要在最开始构建from-to数据时添加线条属性哦~ 如果你还不会，可以参考另一篇推文：R语言生信图表学习之网络图
本文作者蒋刘一琦，自嘲是一个有艺术追求的生信狗，毕业于浙江大学生物信息学专业，目前在复旦大学就读研究生，研究方向为宏基因组。 在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。...而使用Edge Bunding图后，将同一趋势的线捆绑在一起后，就会出现较为清晰的规律。因此，这一类型的图很适合展现较为复杂的关联（不过其实Cytoscape等软件中也有类似的功能）。...当然，在微生物组领域因为存在物种分类的信息，所以可能环形的排布方式能够呈现出更加直观的规律。 ?...其实igraph包本身就是一个专门用于绘制网络图的R包（igraph也有对应的python和C包），而ggraph是一个基于ggplot2的包，它可以让网络图变得更加“优雅”（我最近学会的新形容词）。...不同width值对网络图的影响 当然其实也可以不用做成circle，比如把ggraph中的layout改为circlepack，即： #plot pggraph(mygraph, layout =
在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的
2017-11-07 07:23:04 两栏布局 在页面中经常会遇到两列的情况，比如说左侧栏固定宽度，右侧栏自适应宽度，此时可以用flex布局的方式，但是这种方式在ie8上不兼容，但是也可以用table...这里我们来说用margin的负值来实现两栏布局。...height: 400px;float: left;width: 200px;background: red;margin-left: -100%;"> 如上代码，即可实现一个两列的布局...去除列表右边距 项目中经常会使用浮动列表展示信息，为了美观通常为每个列表之间设置一定的间距（margin-right）,当父元素的宽度固定式，每一行的最右端的li元素的右边距就多余了，去除的方法通常是为最右端的...去除列表最后一个li元素的border-bottom 列表中我们经常会添加border-bottom值，最后一个li的border-bottom往往会与外边框重合，视觉上不雅观，往往要移除。
rem在响应式布局中的应用 最近做了一些响应式的页面，遇到了一些问题，想了些解决方法，在这里总结一下。目前响应式的主流实现方式是百分比布局，加上媒体查询@media screen。...rem不能用在font的简写中和伪元素（:before:after）中，这两点基本上不会影响使用。...使用rem的优点 刚开始是为了解决元素等比缩放的问题，才用上rem的，但是在试用过程中发现rem的响应式布局方案拥有以下一些优点。 1....rem会在特定场景中帮助到你，而不需要你处处使用它。 2....比百分比布局更具优势 百分比布局始终是相对父元素的，对于嵌套比较深的元素，大家是不是在计算百分比的时候异常头疼，稍不留神就弄错分母了，并且，嵌套过深也会影响精度。
OpenHarmony/HarmonyOS中Stack，Flex布局的使用 “作者：坚果 团队：坚果派 公众号：“大前端之旅” 润开鸿技术专家，华为HDE，InfoQ签约作者，OpenHarmony布道师...，擅长HarmonyOS应用开发、熟悉服务卡片开发，在“战码先锋”活动中作为大队长，累计培养三个小队长，带领100+队员完成Pr的提交合入。...用到的几个组件。 Flex 以弹性方式布局子组件的容器组件。 Flex组件在渲染时存在二次布局过程，因此在对性能有严格要求的场景下建议使用Column、Row代替。 Flex(value?...说明： 在多行布局时，通过交叉轴方向，确认新行堆叠方向。 justifyContent：所有子组件在Flex容器主轴上的对齐格式。 alignItems：所有子组件在Flex容器交叉轴上的对齐格式。...Row 沿水平方向布局容器。 Space：沿垂直方向布局的容器。 alignItems：设置子组件在垂直方向上的对齐格式。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用igraph+scatterpie来绘制网络饼图，下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用，添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(igraph) library(ggraph) library(graphlayouts) library(ggforce) library..."C"的属性，属性值为从均值为0，标准差为3的正态分布中随机生成的绝对值 V(g)$C <- abs(rnorm(20, sd = 3)) # 使用layout_with_stress函数计算节点的布局坐标...ggraph函数绘制图形，使用"manual"布局，节点的x和y坐标从属性中获取 ggraph(g, "manual", x = V(g)$x, y = V(g)$y) + # 添加边的可视化，使用...$x <- xy[, 1] V(g_clu)$y <- xy[, 2] # 使用ggraph函数绘制图形，使用"manual"布局，节点的x和y坐标从属性中获取 ggraph(g_clu, "manual
写在前面 有时候各位使用R的用户不知道会不会有这样的感觉，visual studio和Rstudio由于负载过重，在打开或者加载R script时会出现加载过慢的情况，但对于很多数据工作者来说，variable...并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例
css中grid布局的使用 说明 1、通过display属性设置属性值为grid或inline-grid或者是subgrid就可以了。...2、当元素设置了网格布局，column、float、clear、vertical-align属性无效。...实例 在CSS中，不设置 grid-template-columns，只设置 grid-template-row。 ... color: #fff; text-align: center; font-size: 20px; } 以上就是css中grid...布局的使用，希望对大家有所帮助。
它的工作原理是：在 Flexbox 布局中，margin: auto; 会根据父容器的剩余空间自动调整元素的外边距，直到子元素居中。...在传统布局中，margin: auto; 主要用于水平居中对齐，不适用于垂直居中。因为普通流布局的垂直方向是由文档流控制的，不支持类似 Flexbox 中的自动调整行为。...2.2 实现更多实际开发中的布局 示例 1：实现子元素部分集中 在实际开发中，我们常遇到这样一种需求：将元素水平分布在容器内，其中某些元素需要靠近在一起，与其他元素保持一定的自适应距离。...使用 space-around 时如果最后一行的元素数量不满，元素会在行中均匀分布，导致它们集中在中间，而不是靠左或对齐其他行。 大家在遇到这些情况时是不是就在考虑换用 grid 布局了呢？...在适当的情况下直接使用 margin 进行布局是一种更优雅、简洁的替代方案，可以在 Flexbox 布局中有效地实现居中对齐和一些复杂的布局需求。
前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...stage I，stage II，stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组，并转换成因子 方法一、使用gsub函数 前面也给大家介绍过☞R替换函数...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...gsub一样的结果 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成三个组，并转换成因子 方法一、使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A，B或者C等字母，例如Stage IIIA，Stage IIIB...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表
概率函数为f(k;r,p)=choose(k+r-1,r-1)*p^r*(1-p)^k, 当r=1时这个特例分布是几何分布 rnbinom(n,size,prob,mu) 其中n是需要产生的随机数个数，...size是概率函数中的r，即连续成功的次数，prob是单词成功的概率，mu未知.....mean+3sd)几乎是在肯定的。...Gamma分布中的参数α，称为形状参数（shape parameter），即上式中的s，β称为尺度参数（scale parameter）上式中的a E(x)=s*a, Var(x)=s*a^2....空气中含有的气体状态的水分。表示这种水分的一种办法就是相对湿度。即现在的含水量与空气的最大含水量（饱和含水量）的比值。我们听到的天气预告用语中就经常使用相对湿度这个名词。
使用STRING数据库进行蛋白互作分析是生信常规下游分析项目之一。 本文将通过R包STRINGdb来进行string蛋白互作分析，同时会利用igraph和ggraph对互作网络进行可视化。...使用igraph和ggraph可视化蛋白互作网络图 先使用igraph创建网络数据，并进行必要的处理，然后转到ggraph绘图。...布局方式有多种，除了刚才的kk方法，还有stress布局： ggraph(net,layout = "stress")+ geom_edge_fan(aes(edge_width=width),...，那么可以使用一种中心布局的方式，它是根据一个节点的连接数而排列其位置，连接数越大，节点越倾向于在中间位置排列，会更容易看得出重要节点。...另外环形布局的线使用弧形线(geom_edge_arc)会更美观： ggraph(net,layout = "linear", circular = TRUE)+ geom_edge_arc(aes
大数据文摘出品 编译：睡不着的iris、陈同学、YYY 不知道如何在地图上可视化网络图？下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。...但这与传统的网络图是不同的。在传统的网络图中，节点的分布取决于使用何种布局算法（layout algorithm），有一些算法可能会使紧密联系的那些节点聚成集群。 下面将介绍三种可视化的方法。...据我所知在ggplot2中控制线宽只能通过“size“来实现。 使用ggplot2，我们只需决定要调整哪一个几何对象的大小。...这样我们就可以对节点和边使用不同的标度了。默认情况下，ggraph将根据你指定的布局算法放置节点。...请注意，图的边与之前ggplot2的图采用了不同的绘制方式。由于ggraph采用了不同的布局算法，连接关系仍然相同，只是布局变了。
Oracle中，当需要建立一个自增字段时，需要用到sequence。...sequence也可以在mysql中使用，但是有些差别，日后再补充，先把oracle中sequence的基本使用总结一下，方便日后查阅。...='SEQ_ON_USER'; [sql] view plain copy select SEQ_ON_USER.nextval from sys.dual; 5、创建触发器使用...begin select SEQ_ON_USER.nextval into :new.id from dual; end SEQ_ON_USER_Trigger; 6、代码中使用
早在 RxJava1.x 版本就有了Observable.Transformer、Single.Transformer和Completable.Transformer，在2.x版本中变成了ObservableTransformer...其实，在大名鼎鼎的图片加载框架 Glide 以及 Picasso 中也有类似的transform概念，能够将图形进行变换。...RxLifecycle中的LifecycleTransformer trello出品的RxLifecycle能够配合Android的生命周期，防止App内存泄漏，其中就使用了LifecycleTransformer...在我的项目中也使用了知乎的RxLifecycle，根据个人的习惯和爱好，我对LifecycleTransformer稍微做了一些修改，将五个Transformer合并成了一个。....... } 如果你想在RxJava的链式调用中也使用缓存，还可以考虑使用transformer的方式，下面我写了一个简单的方法 /** * Created by Tony Shen on
这对我来说是个新闻，因为书籍经常引用 fGarch，所以这可能是那些寻求在 R 中使用 GARCH 模型的人的资源——为什么不要使用 fGarch。...在原假设下，滚珠轴承的平均直径不会改变，而在备择假设中，在制造过程中的某些未知点处，机器变得未校准并且滚珠轴承的平均直径发生变化。然后，检验在这两个假设之间做出决定。...特别是，函数 garchFit() 用于从数据中估计 GARCH 模型。但是，当我们尝试在我们的检验中使用此函数时，我们得到了明显病态的数值（我们已经完成了模拟研究以了解预期的行为）。...我在本文中强调的问题让我更加意识到选择在优化方法中的重要性。我最初的目标是编写一个函数，用于根据 GARCH 模型中的结构性变化执行统计检验。...这是一个我自认知之甚少的主题，如果 R 社区中的某个人已经观察到了这种行为并且知道如何解决它，我希望他们会在评论或电子邮件中告诉我。
yum install -y iptables && yum install -y iptables-services
当你用XML数据类型配置这些对象中的一个时，你指定类型的名字就像你在SQLServer 中指定一个类型一样。 XML的数据类型确保了你的XML数据被完好的构建保存，同时也符合ISO的标准。...那我们现在先来通过例子来看一下query()和value 两个方法是如何使用XML数据的。需要注意的是我接下来的测试环境是SQLServer2008 R2。...在Listing16中，我指定了[1]在Xquery表达式的后面，所以结果集将只返回第一个人的名字。...除了在表达式中定义你的XQuery表达式，你也能聚合的功能来进一步定义你的查询和操作数据。...总结 我们基本上了解了XML在SQLServer 中的简单应用，从定义到使用方法。也看到了query（）检索子集，也能使用value（）检索独立的元素属性的值。
：默认值false，分页插件会从查询方法的参数值中，自动根据上面 params 配置的字段中取值，查找到合适的值时就会自动分页。...方法一：使用service查询到的结果存储在request域中 private void selectAllUsers(HttpServletRequest request, HttpServletResponse...service查询到的结果存储在自定义的类中然后返回给前端 public PageResult> queryByProjectName(Integer pageNo...private int pageSize; //当前页的数量 private int size; //由于startRow 和endRow 不常用，这里说个具体的用法 //可以在页面中"显示...int navigateFirstPage; //导航条上的最后一页 private int navigateLastPage; } 第四步、关于controller中的使用 对于上边的方法一
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