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R数据科学|第八章内容介绍

使用readr进行数据导入 本文将介绍如何使用readr包将平面文件加载到 R 中,readr 也是 tidyverse 的核心 R包之一。...: 参数 作用 file 读取的文件路径,路径名需要用反斜杠表示 col_names 如果为TRUE,输入的第一行将被用作列名,并且不会包含在数据帧中。...如果col_names是一个字符向量,这些值将被用作列的名称,并且输入的第一行将被读入输出数据帧的第一行。缺少(NA)列名将产生一个警告,并被填充为哑名X1, X2等。...默认的区域设置是以美国为中心的(如R),但您可以使用locale()创建自己的区域设置,控制默认时区、编码、十进制标记、大标记和日/月名称等内容。 na 字符串的字符向量,解释为缺少的值。...quoted_na 是否引号内缺少的值应该被视为缺少的值(默认)或字符串 comment 用于标识注释的字符串 trim_ws 在解析每个字段之前,是否应该修剪其前导和尾随空格?

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R语言函数的含义与用法,实现过程解读

逻辑值和因子在数据帧中保持不变,字符向量将被强制转化为因子,其水平是字符向量中所出现的值; 4 数据帧中作为变量的向量结构必须具有相同的长度,而矩阵结构应当具有相同的行大小。...这样我们可以很简单的在同一个目录下处理多个问题,而且对每个问题都可以使用x,y,z这样的变量名。 七  从文件中读取数据 7.1 函数read.table() 该函数可以直接将文件中完整的数据帧读入。...此时文件要符合特定的格式: 1 第一行应当提供数据帧中每个变量的名称; 2 每一行(除变量名称行)应包含一个行标号和各变量的值。...7.3 内置数据集的读取 R本身提供超过50个数据集,同时在功能包(包括标准功能包)中附带更多的数据集。与S-Plus不同,这些数据即必须通过data函数载入。...例如下面的函数cube,在R中cube(2)=8,在S中报错为sq()找不到n。

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    R语言函数的含义与用法,实现过程解读

    逻辑值和因子在数据帧中保持不变,字符向量将被强制转化为因子,其水平是字符向量中所出现的值; 4 数据帧中作为变量的向量结构必须具有相同的长度,而矩阵结构应当具有相同的行大小。...这样我们可以很简单的在同一个目录下处理多个问题,而且对每个问题都可以使用x,y,z这样的变量名。 七  从文件中读取数据 7.1 函数read.table() 该函数可以直接将文件中完整的数据帧读入。...此时文件要符合特定的格式: 1 第一行应当提供数据帧中每个变量的名称; 2 每一行(除变量名称行)应包含一个行标号和各变量的值。...7.3 内置数据集的读取 R本身提供超过50个数据集,同时在功能包(包括标准功能包)中附带更多的数据集。与S-Plus不同,这些数据即必须通过data函数载入。...例如下面的函数cube,在R中cube(2)=8,在S中报错为sq()找不到n。

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    python数据分析——数据的选择和运算

    ,方法可以通用 选取多行的语法为:变量名.loc[[行index1 行index2,……]] iloc()方法 iloc的使用与loc完全类似,只不过是针对“位置(=第几个)"进行筛选。...关键技术:使用’ id’键合并两个数据帧,并使用merge()对其执行合并操作。...代码和输出结果如下所示: (2)使用多个键合并两个数据帧: 关键技术:使用’ id’键及’subject_id’键合并两个数据帧,并使用merge()对其执行合并操作。...代码和输出结果如下所示: (3)使用“how”参数合并 关键技术:how参数指定如何确定结果表中包含哪些键。如果左表或右表中都没有出现组合键,则联接表中的值将为NA。...: 四、数据运算 pandas中具有大量的数据计算函数,比如求计数、求和、求平均值、求最大值、最小值、中位数、众数、方差、标准差等。

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第三章 数据预处理 (下)

    3.3缺失值处理 R中缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值的函数有两个,最基本的函数是is.na()它可以应用于向量、数据框等多种对象,返回逻辑值。...最后一行表示各个变量缺失的样本数合计。 程序包VIM提供了在R中探索数据缺失情况的新工具,实现缺失模式的可视化 > library(VIM) > aggr(data) ?...在R语言中通过程序包mice中的函数mice()可以实现该方法,它随机模拟多个完整数据集并存入imp,再对imp进行线性回归,最后用pool函数对回归结果进行汇总。...merge通过相同的列或行名来识别,合并两个数据框或列表,其调用格式如下: merge(x, y, by = intersect(names(x),names(y)),by.x = by, by.y =...3 11 qa 6 5 12 12 sh 3 4 2 3.4.2选取数据的子集 在R中,选取数据子集用中括号[] > data[data$salary>

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    R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

    filter() 会自动舍弃行名,如果需要行名只能将其转换成数据框的一列。...pivot_longer/pivot_wider 大部分功能是类似的,这里主要说下pivot_longer 针对下面情况的功能: 我们需要 指定切分变量名和随访号的模式,以解决一行中有多个属性的多次观测的情形...2.10 表格的拆分与合并 将同一列中的内容分为两列内容。或将两列内容合并为同一列内容。 首先还是可以创建一个数据框。...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。...nest 和 unnest 函数,可以将子数据框保存在 tibble 中,可以将保存在 tibble 中的子数据框合并为一个大数据 框。

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    安装读取的Excel的包

    这个是Rstdio的安装界面 ? 这个是下载的目录 ? 选择了一个,安装(其实还没有被安装) ? 安装过程 总览 readxl软件包使从Excel到R的数据获取变得容易。...3.2 1.3 0.2 NA> #>#…还有147行 如果您不熟悉用于数据导入的tidyverse约定,则可能需要查阅R for Data Science中的数据导入一章。...: 列名 多个标题行 特征 无需外部依赖,例如Java或Perl。...返回tibble,即带有附加tbl_df类的数据框。除其他外,这提供了更好的打印效果。 其他相关配套 以下是一些其他软件包,这些软件包具有与readxl互补的功能,并且还避免了Java依赖性。...这是一种基于libxlsxwriter将数据帧导出到xlsx的可移植且轻量级的方法。它比openxlsx简约得多,但是在简单的示例上,它的速度似乎快两倍,并且可以写入较小的文件。

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    往前一步是优秀,退后一步是懵懂

    我们的生信入门班和数据挖掘线上直播课程已经有了三年多的历史,培养了一波又一波优秀的生信人才。前面提到R语言授课时的超纲练习题,已经分享过两位优秀学员的答案。...超纲练习题不超纲 下面继续来看优秀学员Dr.luka的分享: R语言超纲练习题 (生信技能树优秀学员Dr.luka) 数据挖掘(GEO,TCGA,单细胞)2022年6月场,快速了解一些生物信息学应用图表...,因此在进行基因名转换之前,需要把探针进行过滤,留下有效的探针 table(exp$X %in% soft$ID) #如果有FALSE则说明有不对应情况 dim(exp) #过滤前探针数 exp <-...exp[exp$X %in% soft$ID,] dim(exp) #过滤后探针数 3.删除重复的基因名,整理表达矩阵 方法1.直接删除重复基因,保留下标最小的 #1.合并探针信息 colnames(...留下第一个 distinct(GeneName,.keep_all = T) %>% #GeneName转换为行名 column_to_rownames(var="GeneName") %

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    Day5:R语言课程(数据框、矩阵、列表取子集)

    学习目标 演示如何从现有的数据结构中取子集,合并及创建新数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...---- 注意:有更简单的方法可以使用逻辑表达式对数据帧进行子集化,包括filter()和subset()函数。这些函数将返回逻辑表达式为TRUE的数据帧的行,允许我们在一个步骤中对数据进行子集化。...有两个必需参数:要导出的数据结构的变量名称,以及要导出到的路径和文件名。...write.table也是常用的导出函数,允许用户指定要使用的分隔符。此函数通常用于创建制表符分隔的文件。 注意:有时在将具有行名称的数据框写入文件时,列名称将从行名称列开始对齐。...为避免这种情况,可以在导出文件时设置参数col.names = NA,以确保所有列名称都与正确的列值对齐。 将向量写入文件需要与数据框的函数不同。

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    R学习笔记(4): 使用外部数据

    R中还提供了合并数据框的函数。...(两种 情况下变量名都会被写在""中;若quote = FALSE则变量名不包含在双引号中) sep 文件中的字段分隔符 eol 指定行尾符,默认为'\n' na 表示缺失数据的字符 dec 用来表示小数点的字符...row.names 一个逻辑值,决定行名是否写入文件;或指定要作为行名写入文件的字符型 向量 col.names 一个逻辑值(决定列名是否写入文件);或指定一个要作为列名写入文件中 的字符型向量 qmethod...函数dbReadTable 和 dbWriteTable 可以在R数据框和数据库表之间传递数据,数据框的行名字映射到 MySQL 表的 rownames 字段。...但是从外部获取的数据会被R放到内存中,在处理大数据时,就会遇到问题。在处理大数据时,可以采用一下的方法: 使用数据库 每次从数据库中读取一部分数据进行处理。

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    R语言数据框深度解析:从创建到数据操作,一文掌握核心技能

    数据框由不同的行和列构成,不同的列可以是不同类型(数值型、字符型、逻辑型等)的数据,比如可以其中一列是数值型,另一列是逻辑型,另一列是字符型,等。但是同一列中必须是相同的类型。...数据访问与操作 访问数据 数据框和向量不一样,向量是一维的,数据框既有行也有列,数据框是二维的,所以在使用方括号时,我们也要指定行和列,行和列之间用,隔开,,前面表示行,后面表示列。...,小于85的变成良 df 行列转置 #行变成列,列变成行 tran_df <- t(df) tran_df 行列拼接 拼接列:把列拼起来,也就是对多个数据框水平堆叠,也就是在一个数据框的右侧添加另一个数据框...拼接行:把行拼起来,也就是对多个数据框垂直堆叠,也就是在一个数据框的下方添加另一个数据框,要求列数相同。...具有共同信息的两个数据框可以合并到一个数据框中。

    18010

    快速掌握R语言中类SQL数据库操作技巧

    在数据分析中,往往会遇到各种复杂的数据处理操作:分组、排序、过滤、转置、填充、移动、合并、分裂、去重、找重、填充等操作。这时候R语言就是一个很好的选择:R可以高效地、优雅地解决数据处理操作。...(本章节为R语言入门第二部分总结篇:数据操作) 本章内容布局思路:思来想后,想到SQL查询的查询思路可以作为本章节的布局思路 1.了解表结构/数据结构 2.对表中的一些数据做出修改、替换、甚至生成新字段...("C.1", "C.2", "C.3")) 定义矩阵行名和列名 1.3 数据框 DataFrame: data.frame() #其中" 的意思,将向量c(11:15)赋值给对象x >...数据操作中,数据(集)合并是经常被用到。...对于NA值的操作,主要都集中在了过滤操作和填充操作中,因此就不在单独介绍NA值的处理了。

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    R&Python Data Science系列:数据处理(5)--字符串函数基于R(一)

    0 前言 数据根据结构可以分为结构化数据、非结构化数据和半结构化数据,前面介绍的数据处理函数针对于结构化数据,而字符串通常包含非结构化或者半结构化数据,这一部分介绍一下R和Python中的字符串函数。...结构化数据可以使用关系数据库(RDBMS)存储,可以使用二维表来逻辑表达实现的数据(R和Python中的数据框类型数据)。...半结构化数据介于完全结构化数据和完全无结构化数据之间,具有一定的结构性。...也就是说不符合关系型数据库而无法使用二维表逻辑表达的数据,和普通文本相比,半结构化数据具有一定的结构性,OEM(Object exchange Model)是一种典型的半结构化数据模型。...组合两个或者多个字符串或者将字符向量合并为字符串,返回一个字符串 str_c(..., sep = "", collapse = NULL) 参数 sep : 字符串之间的分割方式使用sep参数控制

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    R语言之 dplyr 包

    这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。 下面以 MASS 包里的 birthwt 数据集为例,介绍 dplyr 包里常用函数的用法。...1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行 函数 filter() 可以基于观测值筛选数据框的一个子集。第一个参数是数据框名,第二个参数以及随后的参数是用来筛选数据框的表达式。...下面的命令将数据框按照变量 bwt 的值从小到大进行排序后显示: arrange(birthwt, bwt) # 默认升序 在上面的输出中,第 6 行和第 7 行的变量 bwt 的值都是 1588,在这种情况下如果还想将数据框按照第二个变量排序...相对于传统的数据框,tibble 在很多方面具有优势,感兴趣的读者可以参阅函数 tibble( ) 的帮助文档。...使用传递符 %>% 组合多个操作 我们经常需要对一个数据框做一系列的操作,后面一个操作的输入需要用前一个操作的输出结果。

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