在R中，将字符向量传递给dplyr::bid_rows - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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Day6——R包

思维导图安装和加载R包以dplyr函数为例options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) options(...test, Petal.Length, Petal.Width)vars 字符向量中的列...，select中不能直接使用字符向量筛选，需要使用one_of函数R语言中使用vars参数指定数据框中需要分析的字段索引范围在R语言中，我们经常需要对数据框进行分析和处理。...在进行数据分析时，有时我们只对数据框中的特定字段感兴趣，而不需要使用所有的字段。这时，我们可以使用vars参数来指定需要分析的字段索引范围，从而提取出感兴趣的字段进行后续操作。...vars参数是dply包中select函数的一个参数，它允许我们通过指定字段的索引范围来选择需要的字段。索引范围可以是一个连续的整数向量，也可以是一个布尔向量。

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一文看懂用R语言读取Excel、PDF和JSON文件（附代码）

dplyr则是用来将数据库中的数据保存到本地。...当使用pdf_text提取文档内容时，全部内容都被提取为一个字符串向量，每页的内容都被单独放置于一个字符串中。帮助文档的PDF格式一共包含5页，所以这里会得到一个长度为5的字符串向量。...：自动将嵌套的数据集转换成非嵌套的平面数据集 …：设置显示方法首先以JSON常见的数组形式创建一个字符串向量，保存为example。...中括号代表数组的起始，双引号中代表值，值与值之间以逗号进行分隔，然后再用单引号将这一数组格式保存到字符串向量中。...因为example中的数组是按照JSON格式输入的，所以直接使用fromJSON函数即可。在默认的参数设置下，可以得到一个包含4个值的R对象—字符串向量。

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R语言 | R基础知识

1安装包问题：如何安装R包？方法：使用install.packages()函数来安装包，括号中写上要安装的包的包名。...install.packages(c("ggplot2","dplyr")) 2加载包问题：如何加载一个已经安装了的包？方法：使用library()函数，括号中写上要加载的包名。...datafile.csv", sep = "") 如果是以制表分隔符，sep参数应设置为\t data <- read.csv("datafile.csv", sep ="\t") ③数据类型转换默认情况下，数据中字符串会被视为因子...我们也可以通过将某些列的类型设置为"blank"来丢弃它们。...dplyr包中的filter()函数， #仅仅保留Expt为1的那些行，之后该结果传递给summary()函数计算统计结果 morley %>% filter(Expt ==1) %>% summary

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高效R编程

##1）内在排序因子可用于图形排序，通常read.csv()中自动转换为因子，我们一般options(stringsAsFactors = F)，但是作者出于可移植性考虑不建议将这个放到.Rprofile...因子还比字符串稍微节约点空间。 Apply函数家族可以看作是循环的替代，第一次听说eapply()独立环境，这个我们应该用不到。将一个函数应用到每行或每列。参数可以放在后面传递给函数。...lapply()与vapply()一致，dplyr::select()与dplyr::filter()也是.purr中是map_dbl()代替Map()，flatten_df()代替unlist()。...0.1406 0.78 10 test(1000) 0.00053 0.00062 0.24 0.001 0.0014 2.40 10 函数闭包函数闭包可以提供更高级别的缓存，R中...windows需要使用Rtools: 或者修改R.environ文件中的R_COMPILE_PKGS设为正整数并指定从source安装 install.packages("ggplot2", type=

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

R 当中是split( ),*apply( ),aggregate( )…,以及plyr包 1、split函数 split( )的基本用法是：group <- split(X,f) 其中X 是待分组的向量...在base包里和split功能接近的函数有cut(对属性数据分划)，strsplit(对字符串分划)以及subset（对向量，矩阵或数据框按给定条件取子集）等。...")],function(x) sum(x)) 4、subset()函数利用subset()函数进行访问和选取数据框的数据更为灵活，subset函数将满足条件的向量、矩阵和数据框按子集的方式返回。...进一步地，data.table在某些情况下执行效率更高。（参考来源：R高效数据处理包dplyr和data.table，你选哪个？） ?...data.table比较简洁一步搞定，dplyr花了两步，不过也dplyr也可以通过%>%来实现一步搞定。%>%的功能是用于实现将一个函数的输出传递给下一个函数的第一个参数。

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R语言入门（一）之数据处理

air.hole <- c(10,12.5,12.5,12.5，……) #产生向量，将(10,12.5,12.5,12.5，……)中的值赋予到air.hole length(air.hole) ?...；rep() 重复一个对象 #rep(x,times):x是要重复的对象（例如向量c(1,2,3)）,times为对象中每个元素重复的次数（如times=c(9,7,3)就是将x向量的1重复9次，2重复..."R11.txt", sep = "\t", header = T) #读取R11.txt文件，header = T表示将数据的第一行作为标题 ?...dplyr::rename(a2.2, Flower = Species) #将a2.2数据中的Species标题改成Flower后显示 ?...", stringsAsFactors = F) #指的是读入的数据中的字符串数据是否要变成属性数据，stringsAsFactors=FALSE就是不变成属性数据，按字符串读入。

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R语言数据集合并、数据增减、不等长合并

数据选取与简单操作： which 返回一个向量中指定元素的索引 which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素...3、paste函数生成一长串字符向量。 paste(c("X","Y"),1:10,sep="") #"X”,"Y"是长度为2的字符向量,1:10 长度为10的向量。...命令是让这两个向量粘合在一起生成新的字符串向量，粘合后的新字符之间没有间隔。...相比来说，其他一些方法要好一些，有dplyr，sqldf中的union 5、sqldf包利用SQL语句来写，进行数据合并，适合数据库熟悉的人，可参考： R语言︱数据库SQL-R连接与SQL语句执行...（RODBC、sqldf包）二、数据增减 x=x[,-1] #这个就代表，删除了x数据集中第一列数据或用dplyr包中的mutate函数 a=mutate(Hdma_dat,dou=2*survived

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R语言中这些你想知道含义又不知道怎么查的特殊符号

::和:::: 通常是如dplyr::filter(包名字::函数名)的方式显示制定调用某个包的某个函数。别人运行的好好的R代码，到我这怎么就冲突了？...=: 单个等号，一般是赋值和传参 ==: 判断是否相等 !=: 判断是否不等 !...` : 反引号` ` 在R中用于不规则变量名。 `?|: 可以查看|`函数的帮助，这也是不规则变量名的一个体现。...: 通常配合sym用于需要传入变量的函数中。具体见下面例子。...yvariable_en)) %>%: 管道符，上一个函数的输出传递给下一个函数作为输入。来源于magrittr包，同类型的还有%T>%,%$% 和 %%，具体查阅相应帮助文档。

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运行耗时比较长的代码就需要后台运行了

在Linux或者Unix系统中，你可以使用nohup命令和&符号来在后台运行R脚本。这样即使你关闭了终端，你的R脚本也会继续运行。...假设我们有一个简单的R脚本，名为myscript.R，它的任务是读取一个CSV文件，计算一些统计数据，然后将结果保存到另一个CSV文件。...这个函数返回一个字符向量，其中包含了传递给脚本的所有参数。例如，假设你有一个名为myscript.R的脚本，你想让它接受两个参数：输入文件的名称和输出文件的名称。...& 在这个命令中，input.csv是传递给myscript.R的第一个参数，output.csv是第二个参数。...这些参数在脚本中通过args[1]和args[2]来访问。

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R语言基础提升与总结

从今天起试一试先听课之后再跟着课件整理笔记的方法~1 玩转字符串——stringr1.1 str_length 字符串的长度区分字符型向量/字符串/字符y = c("jimmy 150","nicker...140","tony 152")y：字符型向量"jimmy 150"：字符串，一个引号内的所有东西引号内的单个字母/数字/符号称为字符x %传递，简洁明了把前一步的运算结果传递给下一步的函数...=0) { print('0')} else if (i0,"+",ifelse(i向量中的每一个元素进行循环对...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 $表示以……结尾dir(pattern = ".R") file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt

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直接写和放在函数中不同的R语言用法

索引数据框中的某一列 df$A可以索引数据框df中列名为A的列的所有值。那么假如列名是一个R对象怎么做？...sym把一个R字符串对象转换为一个symbol。 (bang-bang操作符)!!则把symbol再转回R字符串对象，等同于直接写这个对象。...兜兜转转，2步转换把想传的值传进去了。 # 注意sym和!!...，则可以转换向量、列表对象。...library(dplyr) df %>% select(A,B) ## A B ## 1 1 2 ## 2 2 4 ## 3 3 6 ## 4 4 8 ## 5 5 10 # 等同于

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

全文并非是对数据整理的实操整理,主要整理在数据整理/清洗中常用的R包介绍 library(tidyr) library(dplyr) library(stringr) library(tibble) 1...(x," ")) x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #向量长度仅为1，因此用[[1]] x2为字符型向量 ################################...#提取x中第5和第9位的字符串 str_sub(x,5,9) 1.4 字符检测 str_detect(x2,"h") # 第一个参数为向量名，第二个是检测的关键词 str_starts(x2,"T")...#判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") #每个元素里面只替换第一次出现的目标字符...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在 file.remove

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《高效R语言编程》6--高效数据木匠

这是本书最重要的一章，将涉及以下内容：使用tidyr整理数据使用dplyr处理数据使用数据库使用data.table处理数据软件配置 library("tibble") library("tidyr...通常的数据清理是将非标准文本字符串转换成lubridate简介所描述的数据格式。vignette("lubridate") ? 整洁是个广泛的概念，也包括重构数据，以便有利于数据分析和建模。...使用变量名非标准化求值更高效，见R语言 dplyr传递参数_自由平等~忠诚奉献-CSDN博客[2]。只是函数名多了个下划线那么简单吗？...unlist()函数的作用，就是将list结构的数据，变成非list的数据，即将list数据变成字符串向量或者数字向量的形式。...这里建议不要把数据库密码和API密钥等放在命令中，而要放大.Renviron文件中。dbConnect()函数连接数据库，dbSendQuery()查询，dbFetch()加载到R中。

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R语言的综合应用-1

require(stringr))install.packages('stringr')library(stringr)一、字符串#1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #这是向量的长度...例如 y=c("nihaoa 11","niyehaoa 22","zhangsongwen 33")向量：y字符串：一个引号内的所有东西 “nihaoa 11” 字符：引号内的单个字母/数字...#这是一个字符串x#2.字符串拆分str_split(x," ") #以空格为分割符号将字符串拆分开，这个函数输出的结果是一个列表x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #y...xstr_remove(x," ")str_remove_all(x," ")二、数据框#1.arrange，数据框按照某一列排序library(dplyr)arrange(test, Sepal.Length...在R语言的世界里，没有赋值就是没有发生过。#补充select()、filter() 筛选列、行类似于之前的$,[]#管道符号（%>%），表示把前一步的运算结果传递给后一步的函数，不需要多次赋值。

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DAY6-学习R包

安装和加载R包镜像设置使用R配置文件使用file.edit()编辑文件——输入file.edit('~/.Rprofile') options("repos" =c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)install.packages("dplyr") 加载 library和require 使用一个R包需先安装再加载...library(dplyr）dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值...test中名为Sepal.Length的一列按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)选择字符向量中的列，select中不能直接使用字符向量筛选，需要使用one_of...% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))count统计某列的unique值count(test,Species)dplyr处理关系数据（将2

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R数据框如何取交集

你可以在查询miRNA靶基因的时候限定使用哪些预测软件（如下图红圈所示），这样得到的结果就是多个预测软件预测结果的交集。...那么我们怎么利用R代码来对miRNA预测结果取交集呢？我们知道一般在R里，对向量取交集，直接用intersect函数就可以了。...下面给大家介绍三种对R数据框取交集的方法方法一、我们将各列的信息合并成一个字符串，然后取交集 #将各列的信息用_连接起来 combine1=apply(df1,1,function(x) paste...(x,collapse = "_")) combine2=apply(df2,1,function(x) paste(x,collapse = "_")) #查看合并后的字符串向量1和字符串向量2的交集...包里的intersect函数 #加载dplyr包 library(dplyr) #直接利用dplyr包里面的intersect函数对数据框取交集 result2=intersect(df1,df2) #

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5R语言综合运用

(x)#字符串长度 ## [1] 42 length(x)#注释str_length(x) 是 stringr 包中的函数，用于计算一个字符串中的字符数（包括空格和标点符号）。...R语言中，select函数用于选择数据框中的列，可以使用列名或者向量来指定要选择的列。...这两个函数都用于将字符串转换为小写字母，但是它们有以下区别：库依赖：str_to_lower()需要先安装和加载stringr包，而tolower()是R的内置函数，不需要任何额外的库。...输入类型：str_to_lower()仅适用于字符向量或字符串标量，而tolower()可以应用于所有字符数据类型，例如字符向量、字符串标量、因子等。...%>% names() #注释在R语言中，head()和tail()函数用于查看数据框或向量的前几行或后几行。

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R语言基础5（绘图基础）

2、搜索画图代码 3、仿制示例数据 4、套代码，调整细节玩转字符串 str_length() length()#向量里面元素的个数 str_split() str_sub(x,5,9)#提取5-9的元素...可用于向量取子集； str_replace(x,"o","a")#将x中的o替换为a，只替换出现的第一个o； str_replace(x,"o|s","a")#将x中的o或者s替换为a，只替换出现的第一个...o； str_replace_all(x,"o","a")#将x中的o替换为a，替换所有的o； str_remove(x," ")##将x中的第一个空格删除； str_remove_all(x," ")...3.管道符号传递，简洁明了 iris %>% select(-5) %>% as.matrix() %>% head(50) %>% pheatmap::pheatmap() ##将管道符前面所有的结果传递给后面的函数...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在 file.remove

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R tips：使用!!来增加dplyr的可操作性

R中代码的运行过程在介绍!!运算符之前，有必要先了解一下R中的代码是如何运行的。在R console中输入一个代码，R就会返回代码的结果。...这个瞬间的过程其实需要两个步骤和三个阶段：代码 --解析-> 语句 --执行-> 结果输入的是文本代码（code），R会首先解析成语句（R称之为expression），expression在R中是一个树状结构...一个代码在R console中是直接运行到结束的，如果想要获得其中间态：语句，可以使用expr函数来捕获它。...辅助dplyr完成编程工作上面的例子中，之所以group_var不起作用，是因为dplyr直接将group_var当做变量名，然后去mtcars中寻找名字叫做group_var的列，这肯定是会报错的。...PS：对于ggplot2而言也是一样的，它的aes也是不能直接使用变量传入列名，如果想要使用赋值了字符串的变量来传值的话，可以如上述操作。但是也有更简单的的办法，它是？

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Learn R 专题1-3

,包含空格和符号 length(x) #返回的是向量中元素的个数，即x中只有一个元素 [1] 1 y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152") #y是字符型向量...，由三个字符串组成的向量 #“jimmy 150”：字符串，一个引号中所有的东西 #引号内的单个字母/数字/符号：字符 2.字符串拆分代码2 str_split() >str_split...加载test1.Rdata，将dat数据框按照logFC从小到大排序 load('test1.Rdata') library(dplyr) x=arrange(dat,logFC);head(x) 2....1000个的基因名称提取出来对列表/向量中的每个元素（向量）实施相同的操作 > test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test $x [1] 36 35...name也在test2中包含的人取出来 %in% name blood_type 1 jimmy A 2 nicker B 3 Damon

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