在SGE上使用多个通配符提交snakemake作业时出现问题

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问题描述： 当在SGE（Sun Grid Engine）上使用多个通配符提交snakemake作业时，可能会遇到一些问题。通配符是用于在snakemake中指定输入和输出文件的占位符，以便根据规则自动生成作业。然而，在SGE中，使用多个通配符可能会导致作业无法正确提交或执行。

解决方案：

1. 检查作业脚本：首先，确保你的作业脚本中正确使用了通配符，并且通配符的命名没有冲突。确保通配符在输入和输出文件路径中的位置和格式正确。
2. 调整通配符的使用方式：如果你的作业脚本中使用了多个通配符，尝试调整它们的使用方式。可以尝试将多个通配符分开使用，或者使用更具体的通配符命名规则，以避免冲突。
3. 检查SGE配置：检查SGE的配置文件，确保作业调度器正确配置，并且能够处理通配符。确保SGE的版本支持通配符的使用。
4. 联系SGE管理员：如果问题仍然存在，建议联系SGE管理员寻求帮助。他们可能能够提供更具体的解决方案或调整SGE的配置以适应你的需求。

总结： 在SGE上使用多个通配符提交snakemake作业时出现问题可能是由于通配符的使用方式不正确或SGE的配置问题所致。通过检查作业脚本、调整通配符的使用方式、检查SGE配置以及联系SGE管理员，可以解决这个问题。