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1
回答
在
SITK
中
注册
两个
图像
的
最佳
方法
是什么
?
、
、
我非常熟悉如何在
SITK
中将一个
图像
配准到另一个
图像
,这非常简单。然而,我
的
问题是,我可以相互
注册
图像
吗?例如,有没有一种
方法
可以将运动
图像
转换为固定
图像
的
50%,然后将固定
图像
转换为移动
图像
的
50%?所以他们都是共同
注册
的
吗?这个是可能
的
吗?本质上,我想这样做
的
原因是,我希望两者都被转换,以
浏览 19
提问于2021-10-21
得票数 0
1
回答
转换第三个
图像
w.r.t。登记
的
结果
、
Execute
方法
在
SimpleElastix中
注册
返回已
注册
(转换)版本
的
移动
图像
,但不允许类似地转换另一个
图像
。我有两张CT
图像
,想要基于骨骼进行
注册
,因此我使用逻辑乙状结肠
在
大约600到1500 Hounsfield单元之间对输入
图像
进行软阈值处理,这样对比度就集中
在
骨头上。
注册
,使用SimpleElastix fixed =
sitk
.G
浏览 0
提问于2018-04-04
得票数 4
1
回答
SimpleITK不使用任何数据类型,无论是3D还是2D
、
、
、
、
我使用SimpleITK
在
分层
的
tiff
图像
中加载,这是一个包含30个平面/片
的
体积
图像
。
在
大量使用skimage和imageio之后,我发现SimpleITK是处理体积
图像
的
最佳
方法
,但问题是,这些函数似乎都不适合我
的
图像
。img =
sitk
.ReadImage(path) 在读取
图像
后,我可以轻松地将其转换为numpy,甚至可以使
浏览 2
提问于2018-11-13
得票数 1
3
回答
形状检测
、
、
图像
减法。如果
图像
有不同
的
噪声,他们认为这
两个
图像
是完全不同
的
。有什么办法解决这个问题吗?
浏览 5
提问于2020-01-22
得票数 1
1
回答
如何为glob.glob添加path+file
、
、
import osimport globimport numpy as np path= 'C:/DataLuna16pred/*/' ds =
sitk
.ReadImage
浏览 9
提问于2018-01-10
得票数 0
1
回答
用SimpleElastix手动
注册
、
、
、
我使用SimpleElastix ()对这两幅2D
图像
进行配准(仿射)(见附件) (ResultImageFormat "nii")(CompressResultImage "false") 我
的
目标是利用这个矩阵变换来
注册
浮动
图像
,并得到一个与SimpleElastix获得
的
图像
相似的
注册</em
浏览 2
提问于2020-11-02
得票数 0
回答已采纳
1
回答
SimpleITK:应用逆变换
、
、
、
、
我最近开始使用SimpleITK进行
图像
配准。对于我目前
的
项目,我需要
注册
X射线
图像
和CT
图像
,然后应用逆矩阵
在
ROI掩膜上跟踪X射线
图像
。我得到了这条线
的
逆矩阵:如何将转换应用于ROI掩码?
浏览 1
提问于2018-08-29
得票数 2
回答已采纳
2
回答
不支持8位无符号整数
的
向量。
、
、
、
我试图使用简单
的
-itk托管dll
在
.bmp映像上应用.bmp。new ImageFileWriter();write.Execute(image2,"Output.bmp", true); 我如何将这个不受支持
的
东西转换成简单支持
的</e
浏览 5
提问于2015-05-08
得票数 5
2
回答
在
SimpleITK
中
对3D
图像
进行切片操作,并创建新
的
3D
图像
、
、
、
我有一个从NIfTI文件读取到SimpleITK (使用python)
的
3D
图像
,取每个轴向切片,对其做一些操作,并将新
的
2D切片重新插入到具有(希望)适当尺寸
的
3D体积
中
。例如,output.CopyInformation(original) raise IndexError(&qu
浏览 1
提问于2015-05-14
得票数 3
1
回答
如何在Python
中
翻转MRI
图像
、
、
、
我试图翻转图片1
中
显示
的
图像
,以匹配
图像
2
的
方向,但我不确定如何。这就是如何以形象为导向:有什么想法吗?
浏览 24
提问于2022-09-21
得票数 2
回答已采纳
1
回答
如何将具有相同间距和原点
的
数组保存为SimpleITK
图像
?
、
我想在将数组
的
值修改为SimpleITK
图像
后,将加载到数组
中
的
图像
写入数组。如何设置间距和原点?res_file_dir是nii.gz文件
的
路径 segmentation_result=
sitk
.ReadImage(res_file_dir,
sitk
.sitkUInt8) #segmentation_result.GetSpacing() (0.3645833432674408, 0.3645833432674408, 0.69999998807
浏览 15
提问于2020-05-23
得票数 0
1
回答
注册
一对二进制掩码
、
、
我试着
注册
一对二进制面具,而不是一对
图像
。为了进一步解释,我试图建立一个模型,自动从头部头盖骨剥离大脑。为了提高模型
的
准确性,我已经用ITK标记了大脑区域.我只想知道我能不能做二元掩码之间
的
配准,而不是
图像
。是否有这方面的工具?
浏览 11
提问于2022-06-17
得票数 -1
回答已采纳
1
回答
如何在Python中使用SimpleElastix进行3d
图像
配准?
、
、
我正在试着
注册
两个
3d卷。尝试此操作可以找到。代码首先生成
两个
不同
的
体积,每个体积都恰好包含一个半径为4
的
球体。然后我尝试使用默认
的
平移参数map对齐它们。然而,正如在最后一行
中
可以看到
的
(如果在本地运行,也可以从曲线图中看到),结果体积根本不与固定体积对齐。当尝试相同
的
过程时,此时
在
2d
中
,结果
图像
看起来确实与固定
图像
正确对齐,如所示。我浏览了SimpleEla
浏览 14
提问于2018-05-16
得票数 2
2
回答
SimpleItk裁剪
图像
、
、
、
我想在Python3
中
使用simpleItk裁剪3D
图像
首先,加载
图像
并获取numpy数组 image_ct =
sitk
.ReadImage(path_ct,
sitk
.sitkInt16)array_gt = array_gt[center[0]-50:center[0]+51, center[1]-50:center[1
浏览 143
提问于2020-04-21
得票数 1
1
回答
如何在python中使用SimpleITK.WarpImageFilter函数
我找不到任何关于这个函数
的
python文档。warp.SetInterpolator(
sitk
.sitkLinear)它给了我确切
的
reference_img,但不是转换后
的
图像
。
浏览 1
提问于2017-11-19
得票数 0
1
回答
固定掩码必须是像素型sitkUInt8‘simpleitk“
、
我对SimpleITK
的
图像
注册
相当陌生,我已经从源代码
中
在
Python3上安装了SimpleITK包。这是我
的
代码:MOVING_IMAGE_NAME = '/data(FIXED_IMAGE_NAME,
sitk
.sitkInt16) movingImag
浏览 2
提问于2020-12-23
得票数 1
1
回答
如何将不返回任何特定值
的
函数组合到类
中
、
、
以下
两个
函数读取并保存目录
中
的
图像
: def resample(image, reference_image, def_value=0.0): def __init__(self, dcmPath, nrdPath): self.dcmPath = dcmPath(d
浏览 14
提问于2021-07-11
得票数 0
4
回答
图像
配准
、
、
关于如何做一个简单
的
图像
配准(我有来自同一主题
的
IMAGE1和IMAGE2照片,但相机稍微移动,想要匹配IMAGE2和IMAGE1)有什么想法吗?我检查了很多软件,但它们都集中
在
医学
图像
上,所以我不能输入简单
的
JPEG (其中一个甚至允许PGM,但不起作用)。 谢谢
浏览 3
提问于2009-10-26
得票数 2
1
回答
python
sitk
.ReadImage可以读取列表/系列
图像
吗?
、
、
我不明白
sitk
.ReadImage是否可以读取
图像
列表?我没有找到一个示例来说明如何将
图像
列表输入到该函数
中
。但在函数文档
中
,它写道:
sitk
.ReadImage([
浏览 47
提问于2017-07-14
得票数 0
2
回答
将.nrrd分割转换为具有参考体积
的
Nifti体积
、
、
、
、
我有匹配分段
的
200+ CT卷文件。卷采用.nrrd格式,分段采用seg.nrrd格式。我需要这
两个
作为.nii.gz格式,我想脚本从一种格式转换为另一种格式。但现在
的
问题是,分段不再向卷
注册
。
图像
尺寸和
图像
来源不再相同,因此,我无法处理转换后
的
图像
。当我使用3D切片器执行以下手动步骤时,也会发生同样
的
情况: 1.将.seg.nrrd文件加载到切片器
中
作为分段2.将分段另存为.nrrd文件而不是seg.nrrd 3.
浏览 169
提问于2021-03-30
得票数 0
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