在Snakemake中,可以使用可选的通配符或文件名的一部分。可选的通配符可以用方括号([])括起来,表示该部分可以存在也可以不存在。这样可以在规则中处理一些可选的输入或输出文件。
例如,假设有一个规则需要处理两个不同版本的输入文件,可以使用可选的通配符来表示这两个版本。规则的输入可以定义为input = "data/[version1, version2].txt"
,这样Snakemake会尝试匹配两个不同的文件路径,分别是"data/version1.txt"和"data/version2.txt"。
在规则中使用可选的通配符时,可以根据具体情况编写相应的规则逻辑。例如,可以使用条件语句来判断某个可选的输入文件是否存在,然后根据不同的情况执行相应的操作。
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