当我们看到很多优美的绘图时，你是否会有据为己有的冲动？我反正是有的。那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。...彩虹图（在连续的x值上表示y的范围，例如Tufte著名的拿破仑远征图） geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...，来自colorbrewer.org网站展示的颜色标度 scale_continuous 连续标度 scale_data 日期 scale_datetime 日期和时间 scale_discrete 离散值...scale_gradient 两种颜色构建的渐变色 scale_gradient2 3中颜色构建的渐变色 scale_gradientn n种颜色构建的渐变色 scale_grey 灰度颜色 scale_hue...中重要的图层控制对象，因为它负责图形渲染的类型。
A ~ x表示A在纵轴上展示，x在横轴上展示。 条件变量为连续型变量时，要先将其转换成离散型变量。...一种方法是使用cut()函数，另外可以使用lattice包中的函数将连续型变量转化为瓦块（shingle）数据结构，这样，连续型变量可以被分割为一系列（可能）重叠的数值范围。...1.2 lattice绘图系统相关参数对照表 参数名 参数解释 spect 数值，设定每个面板中图形的宽高比 col/pch/lty/lwd 向量，分别设定图形中的颜色、符号、线条类型和线宽 Groups...(v=mean(x),h=mean(y), lty=2) # 加线，v是水平线，h是竖直线，线类型为2, panel.lmline(x,y,col="red") # 加线性回归线，...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数，因此需要将图形存储到对象中，然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法，将第一幅图放置到第二幅图的上面
如果时间紧张，需要在一两天之内为论文做一张图，那么推荐用lattice，如果时间充裕，推荐学习ggplot2。...标度（Scale）：标度是一种函数，它控制了数学空间到图形元素空间的映射。一组连续数据可以映射到X轴坐标，也可以映射到一组连续的渐变色彩。...位面就是控制分组绘图的方法和排列形式。...首先加载ggplot2包，然后用ggplot定义第一层即数据来源。其中aes参数非常关键，它将displ映射到X轴，将hwy映射到Y轴，将cyl变为分类数据后映射为不同的颜色。...上图是对几种不同汽缸的数据分别平滑，如果需要对整体数据进行平滑，可将colour参数设置在散点图层内而非第一层，这样第三层的平滑图形就不会受到colour参数的影响。
abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p <-...~variable) p 2.5 density()与density2d() 很多时候当我们获取的数据集样本数量足够时，通常我们可以绘制密度估计图来大致描述数据集数据的分布，ggplot2中当然提供了这类方法...() 为我们的填充设置透明度，并将边框也赋以对应的颜色： p ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class), colour=factor(class...~cut) p 2.8 curve()与segment() 有时候我们需要在已绘制的图形中添加线段、曲线、小箭头之类的注解，这时候就可以用到ggplot2中的geom_curve()与geom_segment
R-grafify的颜色展示 颜值党最关注的肯定是颜色了。 grafify的颜色对色盲友好，可以使用以下这些色盘。...自带的函数们），「最常用三个参数」是ColPal（使用哪一个色盘）, ColSeq（为FALSE时非连续挑选颜色，默认为TRUE），ColRev（是否倒置颜色顺序） 由于是「和ggplot2联动」，所以也可以贴心的在...常用的参数也会调整为：Colseq（挑选非连续远距离颜色），reverse=TRUE（颜色倒序） 举几个栗子 1.颜色倒序 ggplot(data = InsectSprays, #data...3.连续的向量也能取色 ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = disp))+ geom_point(aes(fill = gear), #按照gear的数值映射颜色...作图时依然需要长数据，此外还需要groups参数一列标注数据之间的对应关系。
生信技能树学习之画图 一、ggplot2与ggpubr作图时的代码之间的差异 ## ggplot2 library(ggplot2) ###用某一个包之前，最好先library()加载一下...手动设置：把图形设置为一个或n个颜色，与数据内容无关。 Q1 ：能不能自行指定映射的具体颜色？ 想要自行指定映射的颜色，就必须要有映射。...dat$Group = sample(letters[1:5],150,replace = T) ###在a/b/c/d/e,5个字母中随机重复选取150个值，进行作图 ggplot(data...stat_compare_means(label.y = 9) p是做出来的基础的图片，p+stat_compare_means() 在原图的基础上叠加 增加组间比较P值函数：stat_compare_means...，所以需要翻转 小技巧： 这里的横纵坐标不用一个字母一个字母敲上去，两种方法： 1.运行代码colnames(iris)，然后在控制台复制； 2.x=iris $ tab键就能自动补齐，iris $
默认值为“loess”，即 LOESS 局部加权回归 如果想换一种拟合曲线的方法，可以改变参数 method 的值。...标度函数是图形细节的调节函数，好比电视机的遥控器，可以调节电视机的音量、画面、色彩等属性。ggplot2 中有种类繁多的以 scale 开头的标度函数，可用于控制图形的颜色、点的大小和形状等。...接下来我们将探索用 ggplot2 包绘制常用统计图形的方法。 2.分布的特征 在探索数据的过程中，最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量，可以绘制直方图或密度曲线图。...30，在作图时可以尝试设置不同参数值以得到比较满意的结果。...3.3 热图 热图（heatmap）是将一个矩阵中的元素数值用不同颜色表达，并对矩阵的行或列进行层次聚类的一种颜色图。通过热图，我们不仅可以直接观察矩阵中的数值分布状况，还可以知道聚类的结果。
)) 图片 3.2属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等） 3.2.1手动设置，需要设置为有意义的值 图片 color 颜色，可以用RGB编码值的字符串 size 大小，只能用数字 shape...，manual应该就有几个颜色取值 图片 图片 ## Q2 区分color和fill两个属性 ##color是颜色，fill是填充颜色 ### Q2-1 空心形状和实心形状都用color设置颜色（形状中...，填充颜色为黑色 图片 ggplot(data = iris)+ geom_boxplot(mapping = aes(x = Species,...-5（A-E）中可重复的取150个值 图片 3.2.4 几何对象 指一个以geom开头的函数画出来的所有东西称为一个几何对象，也称为了一个图层 几何对象可以叠加 #4.几何对象 #局部设置和全局设置...(mapping = aes(x = cut)) ## 图片的横坐标为钻石切割质量，纵坐标为每个取值的格式。
需要设置为有意义的值 图片 > ggplot(data = iris) + + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, +...·手动设置：把图形设置为1个或者n个颜色，于数据内容无关 #映射 aes() >ggplot(data = iris)+ + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...，aes是不带引号的，存在于数据中的列名 ····映射 #手动设置 > ggplot(data = iris) + + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...，是具体的颜色···手动设置 Q2 区分color和fill两个属性 Q2-1 空心形状和实心形状都用color设置颜色 > ggplot(data = iris)+ + geom_point(mapping...2.尝试修改点的颜色为暗绿色(darkgreen)、灰色、红色 ggplot(data = test)+geom_point(mapping = aes(x=a,
在相关矩阵中需要考虑的第一个设置是选择要使用的观测值。...这些设置控制在存在缺失值时如何计算协方差。它们之间的区别在cor函数的文档中有解释。 ggcorr需要的第二个设置是要计算的相关系数的类型。...使用nbreaks参数时，颜色标度中显示的位数通过digits参数控制。 digits参数默认为两位数，但如上例所示，如果中断不需要更高的精度，则默认为一位数。...注意：尝试在颜色标度上使用ColorBrewer调色板时，调色板中的颜色比调色板中的颜色多，将向用户返回警告（实际上是两个相同的警告）。...控制内部值 由于ggcorr生成ggplot2对象，因此理解对象是如何构造的以便从中获取更具体的图可能很有用。
上图只是在aes()中添加了一个参数color = class，ggplot2就会给class中的每个唯一值赋予一种颜色，并添加相应的图例。...变量中的值并不一定要是一系列数值(连续变量)，如这里就是汽车的各种类型(离散变量)。...size参数 美学映射包含多个种类，如果想将变量中的值映射为点的大小，可以用以下代码： ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ...这是因为aes()本身也是一个函数，它在geom_point()函数中可以将各个变量映射到图形中，而外面那个fill参数是控制整个图中的点的颜色的。...可以看到颜色和尺寸都可以较好的反映出连续变量的信息，但是用shape时，会出现报错： ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ
图形属性映射1.3.1 基本定义将数据集中的变量（列）映射为图形的属性（图中对象的可视化属性：数据点的大小、形状和颜色）将图中点的颜色映射为变量class，来显示每辆汽车的类型：ggplot(data...（1）此时颜色不会传达关于变量的信息，仅仅改变图的外观（2）手动设置图形属性时，是将其作为几何对象函数的一个参数，位置在aes()函数的外面（3）图形属性要是有意义的值，例如颜色名称是一个字符串color...mpg中的哪些变量是分类变量？哪些变量是连续变量？当调用mpg时，如何才能看到这些信息？glimpse(mpg)显示为chr的是分类变量，为int的是连续变量。...color：连续变量使用的是同一种颜色，从浅到深以连续变量cyl为例ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy,...（6）在使用函数facet_grid()时，一般应该将具有更多唯一值的变量放在列上。为什么这么做呢？
频率直方图 boxplot() 箱线图 barplot() 柱状图 dotplot() 点图 映射 lines() 添加线...作图 ggplot2是与base r语言不同的作图语法，最少元素包括：指定数据、美学映射、几何对象 ggplot2 基本元素 数据：作图的原始数据 ggplot(data = ) 几何对象...：数据作图的图形方式 geom_() 美学映射：图形的位置、颜色、大小、形状等 aes() 刻度：数据与美学映射的关系 scale() 统计转换：数据的统计作图 stat() 坐标系统：数据的坐标转换...y = Petal.Length), color = "red", #点的颜色 size = 2, #点的大小...透明度 alpha 填充颜色 fill 点的形状与编号： 21-25分为边框与填充的颜色，参数color仅能控制边框的颜色，需设置参数fill的颜色 color() 可使用十六进制颜色代码 # 刻度函数可指定各自的颜色
目前，市场上以USB2.0为接口的产品居多，但很多硬件新手在USB应用中遇到很多困扰，往往PCB装配完之后USB接口出现各种问题。...在元件布局时，尽量使差分线路最短，以缩短差分线走线距离（√为合理的方式，×为不合理方式）。 2....优先绘制差分线，一对差分线上尽量不要超过两对过孔（过孔会增加线路的寄生电感，从而影响线路的信号完整性），且需对称放置（√为合理的方式，×为不合理方式）。 3....下图为四层板的参考叠层，其中中间两层为参考层，参考层通常为GND或Power，并且差分线所对应的参考层必须完整，不能被分割，否则会导致差分线阻抗不连续。...以上所描述的布线规则是基于USB2.0设备，在USB布线过程中把握差分线路最短、紧耦合、等长、阻抗一致且注意好USB电源线的载流能力，掌握好以上原则USB设备运行基本没问题。
, y = Petal.Length))2.属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等） 2.1 映射：按照数据框的某一列来定义图的某个属性ggplot...，也可以为十六进制色彩代码图片 2.2 手动设置，需要设置为有意义的值--与数据内容无关ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length...，可叠加4.2 全局设置: mapping =在ggplot中对所有图层有效ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Sepal.Length,...y = Petal.Length))+ geom_smooth()+ geom_point() #最优写法5.统计变化--柱状图#y轴值为默认统计的ggplot(data = diamonds) +...geom_bar(mapping = aes(x = cut)) #geom_bar与stat_count相对应，属于ggplot中不同的体系，不用细究ggplot(data = diamonds
y = Petal.Length))2.属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状，线型等）2.1 手动设置，需要设置为有意义的值颜色：library(ggplot2)ggplot(data = iris)...aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length), color = "blue")#输入参数时，...点的形状图片ggplot常用的五个参数：color, size, shape, alpha, fill；shape有25中形状2.2 映射：按照数据框的某一列来定义图的某个属性ggplot(data...color = Species))+ geom_boxplot()图片#变成实心的颜色：将color改成fillggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species...fill = Species))+ geom_boxplot(width=1)+ geom_jitter(size=0.6)图片6.2堆叠直方图
此外, 图形中还可能包含数据的统计变换(statistical transformation, 缩写为stats), 最后绘制在某个特定的坐标系(coordinate system, 缩写为coord...，要求的属性会有些不同，这些属性也可以在几何对象映射时提供，以下语法与上面的aes中是一样的。...1.2 颜色标尺“第三个”单词选择方法 根据第三个单词的不同，更换的颜色分为以下几种 1）离散型：在颜色变量是离散变量的时候使用，比如分类时每一类对应一种颜色 manual 直接指定分组使用的颜色 hue...通过改变色相（hue）饱和度（chroma）亮度（luminosity）来调整颜色 brewer 使用ColorBrewer的颜色 grey 使用不同程度的灰色 2）连续型：颜色变量是连续变量的时候使用...如果数据类型不符合映射要求就得做类型转换，在组合图形时还得注意图层的先后顺序。
其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观，逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...() # 设置连续性x轴的最小值和最大值 ylim() # 同上 ylim(0, max(PlantGrowth$weight)) # y轴最大值为weight变量的最大值 ylim()是scale_y_continuous...facet_wrap( ~ class) # class为变量 facet_wrap()默认使用相等数量的行和列，比如说分面为4时，行与列为2x2；分面为5时，为3x3。...ggplot(birthwt, aes(x=bwt)) + geom_histogram(fill="red", colour="black") 一般而言，colour参数控制的是线条、多边形轮廓的颜色...6.2 将变量映射到颜色上 对于几何对象，将colour或fill参数的值设置为数据中某一列的列名即可。
#1.基础包 plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) #iris为数据框，以iris第一列为横坐标，第三列为纵坐标，第五列有多少个不同的取值则有多少种颜色 text...(6.5,4, labels = 'hello')#在(6.5,4)坐标处添加“hello” dev.off() #关闭画板 #2.ggplot2 中坚力量，语法有个性 library(ggplot2..., color = Species))#以iris数据框作点图，x=和y=分别表示行名和列名,Sepal.Length为数据框中的列名 属性 参数...)) 3.x和y为aes的参数，color为geom_point的参数 ggplot(data=iris)+ geom_point(mapping=aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Length...),color="red") 4.scale_color_manual手动设置显示的颜色，此函数必须与color=Species一起使用，更多颜色查询十六进制颜色代码 ggplot(data=iris)
在散点图中，随机抖动点以减少过度绘制 尺度：每个几何属性都有一个函数，称为尺度；比例控制从数据到几何属性的映射，以确保数据值对该几何属性有效。此外，在统计变换之前执行缩放。...例如，对于位置，用线性比例变换连续值，并将分类值映射到整数；对于颜色，将连续变量映射到HCL颜色空间中的平滑路径，将离散变量映射到具有相等亮度和色度的均匀间隔的色调，例如，对于位置，连续值被映射到整数；...尺度函数既可用于连续变量，也可用于分类变量。例如，在连续情况下，用刻度填充直方图或密度图；在离散情况下，比例用于填充直方图或条形图，或者在映射颜色、大小或形状时用于散点图。...更改颜色的另一个重要应用是将不同颜色映射到源数据集中的类别变量的不同级别。例如，在微生物群落研究中，我们经常使用不同的颜色来呈现不同的实验组或条件。...实际上，在ggplot2中，除了颜色之外，我们还可以使用大小、形状、笔划（边界的厚度）和填充（填充颜色）来区分适当绘图中的分组。
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