ROC曲线是通过绘制真阳性率(TPR)与假阳性率(FPR)在不同阈值设置下的曲线。在机器学习中，真阳性率也被称为灵敏度、回忆率或检出率。假阳性率也称为误报率，可以计算为(1 -特异度)。...④AUC值越大的分类器，正确率越高。 R包介绍 01 R包pROC pROC是一个用于显示、平滑和比较ROC曲线的工具。...#print.auc，AUC的数值是否应该打印在图上 ) ③添加ROC曲线 roc5 roc(aSAH$outcome, aSAH$wfns,...） #power，测试的期望power(第二类错误的1 -probability) 02 R包plotROC 大多数ROC曲线绘图模糊了cutoff 值，限制了多条曲线的解释和比较。...提供可以生成用于web使用的交互式ROC曲线图，以及打印版本的功能。plotROC是基于ggplot2绘图的。
R语言临床预测模型系列文章，目前已更新20+篇内容，持续更新中，欢迎订阅： 临床预测模型之二分类资料ROC曲线绘制 临床预测模型之生存资料的ROC曲线绘制 R语言画多时间点ROC和多指标ROC曲线...生存资料ROC曲线的最佳截点和平滑曲线 .........今天说一说ROC(AUC)的比较。 二分类资料的ROC比较 可以通过pROC包实现的，使用其中roc.test()函数可实现两个ROC 的Delong检验。...这个函数里面有个method参数：delong/bootstrap/venkatraman，默认是delong，delong和bootstrap用于比较AUC，如果只是ROC曲线的比较，需要用venkatraman...还是用之前推文中用过的例子，获取数据请翻看之前的推文~ rm(list = ls()) library(timeROC) library(survival) load(file = "../000files
因此，在评估模型性能时，通常需要结合其他指标，如精确率、召回率、F1分数等，来进行全面的评估。 ---- 起码从R的角度来说，箱线图直接到ROC曲线，顺便计算得到AUC值是很容易的。...曲线 roc_result roc(labels, predictions) # 打印AUC print(paste("AUC:", auc(roc_result))) # 绘制ROC曲线 plot...然后，它计算了一个ROC曲线，并打印了AUC值，最后绘制了ROC曲线。这只是一个基本的示例，实际的分析可能需要更复杂的统计测试和更复杂的图形。...曲线 roc_result pROC::roc(data$group, data$expression) # 打印AUC print(paste("AUC:", auc(roc_result)))...# 绘制ROC曲线 p2=pROC::ggroc(roc_result)+ggtitle(auc(roc_result))+theme_bw() library(patchwork) p1+p2 如下所示
本文作者在简书了也更新了许多高质量的文章，因为明天只能有一个原创作者，所以本文加入我的名下，但是请感兴趣的相关领域朋友直接关注真实作者并且交流即可。...在【rROC】ROC的计算与绘制这篇文章中我讲了ROC曲线的本质以及如何计算和绘制ROC曲线。...pROC pROC是一个相对plotROC更强大的R包，不同于plotROC基于ggplot2的创建，pROC自身构建了比较完整的ROC分析和绘图体系。...包最重要几个函数的使用，第一个是plot.roc()，它可以绘制ROC曲线，并返回一个ROC对象，里面包含该曲线的众多有用信息，并为后续的分析做基础，lines.roc()为当前ROC曲线上增添新的ROC...不仅如此，roc.test()函数提供了对曲线进行检验，检验的方法分为3种，可以自己选择，有兴趣的朋友不妨再深入看看。
导读：ROC三剑客这三篇文章由一年前的两篇文章和今天写的一篇文章组成，内容涵盖了 ROC 原理解析和计算、两个R包 plotROC 和 pROC 的使用教程。...希望感兴趣的读者修此剑术，保家卫国~~你的剑，就是我的剑！ 在《使用R语言手撕ROC曲线》这篇文章中我讲了ROC曲线的本质以及如何计算和绘制ROC曲线。...有读者谈到如何修改，之前之所以没写多条曲线添加AUC，是因为涉及一些文本图像的微调，实际使用时需要自定义一下 如果想要添加6条曲线，在加上ALL，就是7条，请补充函数中的if代码块 if(length...pROC pROC是一个相对plotROC更强大的R包，不同于plotROC基于ggplot2的创建，pROC自身构建了比较完整的ROC分析和绘图体系。...包最重要几个函数的使用，第一个是plot.roc()，它可以绘制ROC曲线，并返回一个ROC对象，里面包含该曲线的众多有用信息，并为后续的分析做基础，lines.roc()为当前ROC曲线上增添新的ROC
1、roc曲线的意义 ROC曲线就是用来判断诊断的正确性，最理想的就是曲线下的面积为1，比较理想的状态就是曲线下的面积在0.8-0.9之间，0.5的话对实验结果没有什么影响。...#建立曲线 data(aSAH) rocobj1roc(aSAH$outcome,aSAH$s100b) rocobj2roc(aSAH$outcome,aSAH$wfns) rocobj3roc(aSAH$outcome,aSAH$ndka) #计算full AUC auc(rocobj1) auc(rocobj2) auc(rocobj3) #绘制曲线 plot(rocobj1)...","red"),max.auc.polygon=TRUE,auc.polygon.col="skyblue",print.thres=TRUE,reuse.auc=FALSE) #比较两个曲线，pROC...") library("pROC")##roc data(aSAH) roc1roc(myData$label,myData$score) roc2roc(myData2$label,myData2
AUC：曲线下面积（Area Under the Curve, AUC）是一个单一的数字，用于描述ROC曲线下的面积。...这很重要，因为ROC曲线是基于类别的正负性来绘制的。在逻辑回归中，通常将较高级别的类别设置为“成功”或“事件”。...统计测试：pROC::roc函数还包括对AUC是否统计显著不同于0.5（即随机猜测）的测试，这可以通过pROC::summary.roc函数获得。...通过这些步骤，pROC::roc函数提供了一种评估和比较不同预测指标或模型在区分两个或多个分组方面性能的方法。...将inputdata中相应的列名替换为"Idx"和"Cmp"，以便与pROC::roc函数的要求一致。15-21. 使用pROC::roc函数计算ROC曲线。
ROC曲线是临床中常用的统计分析之一，R中可以绘制ROC曲线的包也有很多，pROC包就是其中的佼佼者。 pROC包可以计算AUC和95%置信区间，可以可视化、平滑和比较ROC曲线。...pROC包中的常用缩写： 缩写 解释 ROC曲线 受试者操作特征曲线 AUC ROC曲线下面积 pAUC 部分ROC曲线下面积 CI 置信区间 SP 特异度specificity SE 灵敏度sensitivity...建立拟合曲线 在pROC包中，使用roc()函数来建立ROC对象。默认情况下roc()函数会输出AUC的值。...可视化ROC曲线的CI plot.ci()函数能够在ROC曲线上增加置信区间，置信区间可以表示为条形或置信带形状。...no.roc # 逻辑词，如果为FALSE，则将ROC曲线重新添加到该形状上； # 如果为TRUE，则只绘制形状；在type=bars则忽略 ROC曲线外观参数的修改参考《R语言统计与绘图：pROC包绘制
ROC曲线是评价模型的重要工具，曲线下面积AUC可能是大家最常见的模型评价指标之一。...如果你还不太了解关于ROC曲线中的各种指标，请看下面这张图，有你需要的一切（建议保存）： 混淆矩阵 混淆矩阵计算 R语言中有非常多的方法可以实现ROC曲线，但是基本上都是至少需要2列数据，一列是真实结果...，另一列是预测值，有了这两列数据，就可以轻松使用各种方法画出ROC曲线并计算AUC。...这篇文章带大家介绍最常见的并且好用的二分类变量的ROC曲线画法。 方法1 方法2 方法3 方法1 使用pROC包，不过使用这个包需要注意，一定要指定direction，否则可能会得出错误的结果。...这个R包计算AUC是基于中位数的，哪一组的中位数大就计算哪一组的AUC，在计算时千万要注意！ 使用pROC包的aSAH数据，其中outcome列是结果变量，1代表Good，2代表Poor。
之前的推文中介绍了ROC曲线的本质以及两面性： ROC阳性结果还是阴性结果？...并详细介绍了如何手动计算真阳性率/假阳性率，以及怎样计算多个，并把点连接成线，变成ROC曲线：ROC曲线纯手工绘制 这些现在都有成熟的R包可以帮我们搞定，不需要我们手动计算。...不过这些包在计算AUC时，默认是计算阳性结果的AUC，这在实际情况中有时会遇到问题，大家在使用时最好手动指定，到底是计算谁的AUC，关于ROC的两面性，可以参考上面的推文。...")@y.values[[1]] ## [1] 0.075 但是大多数时候我们需要的都是阳性结果（比如这里我们想计算癌症的AUC，而不是非癌症）的AUC，所以我建议大家在使用R包计算AUC或者画ROC...曲线R包都有这样的潜规则，大家在使用的时候一定要注意~ 示例数据还提供了用数值表示的结果变量class，感兴趣的可以试试看，是不是和我说的一样！
和其它地区的销售额无关，和用户的评分相关性较低。 得到相关系数图如下，其中除对角线以外，颜色越靠近深蓝色，表示相关性越强。其中用户使用量和用户得分与日本销售额相关性较低。...在Tableau和R中分析，哪些属性值可以不分析（删除） 无关变量: 游戏名称 /用户得分,这两个变量属性属于无关变量，可进行删除。 2....) #画ROC曲线和计算AUC所用到的pROC包 pred.aic <- glm.aic$fitted.values #AIC模型预测值（出险概率） roc.aic roc(a$LossClass...,pred.aic) #AIC模型ROC曲线取值 plot(roc.aic,print.auc=T,print.auc.x=0.9,print.auc.y=0.8,print.thres=T,print.auc.cex...=2.5,print.thres.cex=1.5,col="pink",main="AIC模型的ROC曲线")# 选择AIC模型，在ROC曲线上标注AUC值和最佳阈值 ##混淆矩阵 thres <- 0.318
ROC曲线（受试者工作特征， Receiver Operating Characteristic) 可以简单、直观得观察分析方法的临床准确性，并可用肉眼作出判断。...ROC以真阳性率（灵敏度FPR）为纵坐标，假阳性率（1-特异度TPR）为横坐标绘制的曲线，可准确反映某分析方法特异性和敏感性的关系，是试验准确性的综合代表。...ROC曲线不固定分类界值，允许中间状态存在，利于使用者结合专业知识，权衡漏诊与误诊的影响，选择一更佳截断点作为诊断参考值。...提供不同试验之间在共同标尺下的直观的比较，ROC曲线越凸越近左上角表明其诊断价值越大，利于不同指标间的比较。曲线下面积可评价诊断准确性。...ROC曲线下的面积（area under ROC curve）值在1.0和0.5之间。 在AUC>0.5的情况下，AUC越接近于1，说明诊断效果越好。
这个R包计算AUC是基于中位数的，哪一组的中位数大就计算哪一组的AUC，在计算时千万要注意！ 使用pROC包的aSAH数据，其中outcome列是结果变量，1代表Good，2代表Poor。...计算AUC及可信区间： res pROC::roc(aSAH$outcome,aSAH$s100b,ci=T,auc=T) ## Setting levels: control = Good, case...cutoff cutoff包中的roc函数也可以用于确定二分类数据ROC曲线的最佳截点，这个R包还可以用于连续性变量最佳截点的计算，之前专门介绍过： library(cutoff) ## ## Attaching...和pROC的结果有一点点差别，问题不大。 optimalcutpoints OptimalCutpoints包也是用于二分类数据ROC曲线的最佳截点，不能用于生存数据。...ROC曲线。
—————————————————————————— 笔者觉得在性能评价上有两个分支： TPR-TNR，后续接AUC值/ROC曲线； 召回率-正确率，接F1值曲线，再接mAP曲线（召回-准确曲线） 本节部分参考...ROC曲线可以帮助我们清楚的了解到这个分类器的性能表现，还能方便比较不同分类器的性能。在绘制ROC曲线的时候，习惯上是使用1-TNR作为横坐标，TPR作为纵坐标。...TNR的延伸——AUC值 为了更好的衡量ROC所表达结果的好坏，Area Under Curve（AUC）被提了出来，简单来说就是曲线右下角部分占正方形格子的面积比例。.../lang/chinese/1205 该博客示范了三种画出ROC曲线的方法，第一种主动自己运算、第二种ROCR包、第三种pROC包。...曲线的包，例如常见的ROCR包，它不仅可以用来画图，还能计算ROC曲线下面积AUC，以评价分类器的综合性能，该数值取0-1之间，越大越好。
二、ROC与AUC ROC(接收者操作曲线)绘制的是真正率(tp rate)随假正率(fp rate)的变化情况。tp rate代表被正确分类的正样本比例。fp rate是FP相对于实际负样本的比例。...ROC曲线越接近于左上角，分类器效果越好。AUC为曲线下方的面积，面积越大，证明效果越好。 实例代码 1、数据准备。导入数据，并随机抽取70%作为训练集，剩下30%作为测试集，并将变量与标签列拆开。...使用包pROC分别绘制训练集和测试集的ROC曲线，并计算出相应的AUC值。...从图上可以直观看出，训练集上，ROC曲线更靠左上角，并且AUC值也更大，因此我们建立的线性分类器在训练集上的表现要优于测试集。 图上还有一条过(0,0)和(1,1)的直线，代表随机判断的情况。...如果ROC曲线在这条线的下方，说明分类器的效果不如随机判断。一般是因为把预测符号弄反了，需要认真检查代码。 ----
二分类变量的最佳截点直接使用pROC包就可以直接得到，前面也介绍过，今天主要说一下生存资料ROC曲线的最佳截点，以及生存资料的ROC曲线如何变得平滑。...平滑曲线 加载R包和数据 多个时间点ROC 画平滑曲线 找最佳截点 平滑曲线 不考虑时间因素的ROC曲线可以使用pROC包中的smooth参数实现平滑版的曲线。...time dependent ROC目前还没发现比较好的方法可以直接实现，只能使用ggplot2曲线救国了。...("AUC at 2 year: ",round(ROC[["AUC"]][2],2)), paste0("AUC at 3 year: ",round(ROC[["AUC"]][3...ROC曲线。
本节目标： （1）总结常用的绘制ROC和PR曲线的R包 （2）生存预测模型的时间依赖性ROC曲线 第一部分：总结常用的绘制ROC曲线的R包： （1）ROCR - 2005 ROCR包已经存在了近14年...，是绘制ROC曲线最常用的工具，这个也是我本人最喜欢用和最常用的R语言包。...例如，要生成precision-recall曲线，您需要输入prec和rec。 下面的代码使用包附带的合成数据集并绘制默认的ROCR ROC曲线。在本文中，我将使用相同的数据集。..., cex.axis=1.2, font=1.2) abline(0,1) （2）pROC 该包的特点是对ROC曲线的可视化较强，同时可以对ROC曲线进行平滑处理。...其相对于ROCR最吸引人的两个特点：（1）计算AUC或ROC曲线的置信区间。（2）可以检验多个ROC曲线之间是否有差异 计算AUC或ROC曲线的置信区间
我之前在《分析与可视化ROC——plotROC、pROC》中介绍了两个包 plotROC 和 pROC，那是一年前的事情了，现在我在处理 ROC 曲线时使用的是什么呢？...pROC 包，它的理论基础来源于下面这篇文章，并且有非常完备的分析方法、可视化方法。...除了 AUC，roc()函数结果还有一个细节： ? 不同的结果存在方向性，我们能修改嘛？...") > auc(rc2) Area under the curve: 0.2686 可以看到 AUC 变成了 1 减去之前的 AUC，这刚好是反向预测的结果。...Area under the curve: 0.7314 比较 ROC pROC 包提供了比较 ROC 的统计检验方法，我们试一试比较 rc 和 rc2，因为它们的 AUC 差异巨大，因此可以提前估计是有显著性差异的
ROC和AUC 对于更关注于正例的情况，ROC（Receiver Operating Characteristic）是很常用的一种图形评价方法。 ROC曲线使用了上面定义的两种比率，灵敏度和误警率。...如果取一组阈值，把对每个阈值计算得到的sensitivity和1-specicity绘制在图中，就得到ROC曲线。ROC曲线表示在尽量少的误判的基础上，尽可能多的判出正例的个体。...因此，引入AUC：ROC曲线下的面积来度量不同分类器的表现。AUC越大，则分类性能越好。...4.ROCR包 图形方法（特别是ROC）是在机器学习/数据挖掘中用来评价模型的重要方法。在R当中，有多个package可用来绘制相应的图形。...使用plot函数可以绘制ROC曲线，colorize=T表示可以按颜色在图形上表示出阈值的分布。
p=10963 在本文中，我描述了如何在CRAN中搜索用于绘制ROC曲线的包，并重点介绍了六个有用的包。...ROC曲线。...在整个文章中，我将使用相同的数据集。...我喜欢AUC在图中绘制曲线下面积的置信区间非常容易。 2014年 该roc.curve()函数 会绘制出干净整齐的ROC曲线 。...2019 ROCit是一个用于绘制ROC曲线和其他二进制分类可视化效果的新程序包 ，并且正在迅速普及。
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