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我是R的新手，正在尝试将数据帧转换为nifti文件。我有一个有4列的数据框，前3列是维度(体素)，第4列是我想要在nifti文件中写入体素的值。我假设我可以使用fmri包或RNifti中的writeNifti函数，但它们不接受原始数据帧。我不知道如何将数据转换为这些软件包可以接受的可接受格式。 如有任何建议，我们将不胜感激，谢谢！
浏览 22提问于2021-10-13得票数 0
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我正在尝试读取Nifti图像并将头信息写入csv文件。import nibabel as nibhdr = img.headersizeof_hdr : 348
data_type : b'&
浏览 10提问于2020-03-24得票数 0
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您好，我正在尝试在新创建的熊猫数据帧中追加行for i in active_brain_regions: mean = np.mean(expr) dd = pd.DataFrame(dat, columns = ['region', 'mean expr&
浏览 0提问于2020-02-09得票数 0
当我尝试将我的.NII文件加载为4D Niimg类对象时(我已经尝试过nil量和nibabel)，"/Users/audreyphan/Documents/Spring2020/DESPO/res4d/1/res4d_anat.nii“错误: ImageFileError:无法计算出ImageFileError的文件类型
ds_name = '/Users/audreyphan
浏览 1提问于2020-03-03得票数 2
目前，在Python上学习医学成像数据，并考虑是否能够识别NIFti图像的正确方向，以及如何进行转换。我在网上查了一下，找到了一些算法，可以通过一定角度的仿射变换来“旋转”成像数据(主要是JPG格式)，但是没有关于如何在nifti图像上“旋转”并通过nibabel将其保存为新的nifti图像的文档。
浏览 6提问于2021-02-16得票数 1
我正在使用Anaconda 3开发Windows 7 64位，在我的环境Nifti上，我已经安装了Tensorflow 2.1.0、Keras 2.3.1和Python 3.7.7。在Visual代码中，所有这些导入都有问题：from tensorflow.keras.layers我在Visual中的"Python: Select解释器命令“选项中选中了它。我检查了python.
浏览 4提问于2020-06-03得票数 0
代码涉及到NiBabel，一个用于访问的程序/库，它是一种混乱的神经成像文件格式，我无法真正理解以下代码所做的事情：result = os.path.join(folderData, name + '.nii.gz')
nib.save(nib.Nifti1Image(Seg, nib.load(ground_truth_path
浏览 0提问于2019-07-10得票数 1
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我有一个3D阵列。我想改变这张3D图像的一些像素颜色。我想要在给定条件下更改像素颜色，即如果固定3D坐标的掩码像素不等于0，那么我想将3D数组像素更改为红色。最后，我想将其保存为一种漂亮的格式或.nii.gz格式。我以这种方式编写了一些代码，但此代码给出了一个错误
浏览 17提问于2020-08-03得票数 0
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我正在尝试从3d NIFTI图像中提取一个32x32补丁，并将其保存为png。我在R中工作，NIFTI图像包含155片240x240像素。library(oro.nifti)
arr = array(rnorm(240*240*155), dim = c(240,240,155))
png("
浏览 4提问于2020-06-09得票数 1
我在Ubuntu上跑。当调用SimpleITK的Show时，我无法在斐济( ImageJ2)窗口中查看这样的图像。
浏览 1提问于2017-04-04得票数 1
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我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。我尝试使用<code>D1</code>，但它只读取一个文件。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？<code>A2</code>
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
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我有142张Nifti CT的大脑图像，我把它们从Dicom转换过来。每个NIfti文件的尺寸为512×512×40。我的计划是使用3d Conv神经网络进行多类分类。我应该如何在3d CNN中给Nifti图像喂食？
浏览 3提问于2021-12-26得票数 1
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= nib.Nifti1Image(newimg，img.affine)中，第17行文件“d：\卷转换为img.affine”文件"C:\Python39\lib\site-packages\nibabel
浏览 20提问于2022-01-12得票数 1
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我想知道如何用概率值(0-1)替换图像体素(nifti)的强度值，以生成颜色图。我有两个文件，一个是nifti中的原始图像，另一个是CSV中的概率(row= voxels，column =)。
浏览 3提问于2022-01-13得票数 0
我已经创建了一个tflite模型来在iOS应用程序上执行医学图像分割。nii文件将被加载并转换为numpy数组，然后使用tflite模型执行推理。通常，这是使用simpleITK库在python上完成的。如何在Swift中做到这一点？ 我对swift是个新手，对于这个天真的问题我很抱歉。
浏览 26提问于2020-07-19得票数 0
我正在尝试写一个从DICOM图像创建的NIfTI文件。在这个例子中，我使用了来自Kaggle's Data Science Bowl的DICOM映像。您必须接受下载示例文件的条件，但是可以在"stage1“文件夹中找到它：
all_slices_fb99a80cbb2f441bb90135bab5b029fe<- readDICOM("sta
浏览 1提问于2017-01-18得票数 0
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我在蟒蛇上做单体素模拟，以产生附加噪声的模拟信号.然后，我希望将生成的numpy数组转换为nifti文件，其形状如下(100,100)。
我要用以下格式将这个矩阵保存到一个nifti文件中(10，10，1,100)。converted_array = np.array(data, dtype=np.float32)
nifti_file = nib.Nifti1
浏览 5提问于2021-12-17得票数 1
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通过three.js实现了.vtk和.obj文件在web浏览器中的三维曲面可视化。但是现在我想在网络浏览器中进行三维体素可视化，就像nifti文件一样。如有任何建议，敬请见谅。
浏览 3提问于2016-08-04得票数 0
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content/drive/My Drive/labels/labels_slice_{:05d}.png'.format(i), label)我对图像做同样的操作，得到以下.png文件
浏览 4提问于2020-04-18得票数 1
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