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scRNA分析|自定义你的箱线图-统计检验，添加p值，分组比较p值

在前面scRNA分析|使用AddModuleScore 和 AUcell进行基因集打分，可视化中，基因集评分使用小提琴图或者箱线图进行展示，那如何进行统计检验以及添加P值呢？...本文主要解决以下几个问题 （1）指定统计检验方式（2）指定比较组并添加P值（3）任意比较（4）分组比较 （5）使用星号代替P值 等 一 载入R包 数据 使用本文开始的基因集评分的结果 和 ggpubr...right") p2 + stat_compare_means(aes(group = group)) 三 可视化调整 除上述之外还有一些常见的小调整，比如去掉p值前面的统计方法， 将P值改为星号，...= paste0("p =", ..p.format..)) ) 2，将p值改为星号 p1+stat_compare_means(comparisons = my_comparisons,...#label.y = 0.7 # p值展示在什么地方 ) + labs(x="", y="AUCell_score") + #更改坐标轴 theme_classic

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    一行代码添加P值的可视化技巧分享~~

    在一些常见的统计图表中经常需要在一些图表中添加P值，那么今天小编给大家汇总一下关于统计图表中P值的添加方法。...P值是一个服从正态分布的随机变量，在实际使用中因样本等各种因素存在不确定性.在许多研究领域，0.05的P值通常被认为是可接受错误的边界水平。...(内容来源于网络，本来小编想自己写来着，可是，小编机会忘完啦，详细的内容，小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文的重点介绍，如何在我们的可视化图表中添加P值，使其更好的表现图表含义是在绘制图表是需要考虑的...直接上干货~~ R-ggpubr 添加P值 在使用ggpubr包进行P值添加之前，我们需导入R-rstatix包进行必要的统计操作(T检验等)，这里我们直接通过例子进行解释说明。...设置P值的具体添加位置。

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    大数据在P2P借贷上的四大要素

    现在P2P借贷领域的许多人，包括我自己，都喜欢使用借贷平台提供的大数据来分析趋势和帮助自己更好地了解借款人，以及分析他们的行为，从而来控制我们在 P2P借贷市场上的风险。...如果你愿意自学一些信贷和金融技术来帮助你在P2P借贷领域做出更好的投资决策，你就会知道事实并非如此，而且可谓是大错特错 大数据并不能解决所有问题，你需要了解在关于大数据在P2P借贷上的四大要素。...那些我们从历史记录得到的重要信息，如支付历史、FICO信用得分和贷款清单上的不良信用者，都只是向我们展示了我们 的借款人的过去行为。他们是否有按时还贷的历史记录？...所有这些都是从Lend Academy 上的Lending Club月度交易量分析中得出的。这意味着所有贷款中，有2/3的贷款期限都不超过1年。...当我们在进行 数据分析时，如果能够记得所有这些因素：大数据只是对过去的记录而不具备预测性，而我们的贷款池小且新，大数据将相互依存的变量孤立开来，相互关系不意味 着因果关系，我们就会在P2P借贷领域领先于其他投资者一步

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    统计绘图 | 一行代码添加P值的可视化技巧分享

    在一些常见的统计图表中经常需要在一些图表中添加P值，那么今天小编给大家汇总一下关于统计图表中P值的添加方法。...P值是一个服从正态分布的随机变量，在实际使用中因样本等各种因素存在不确定性.在许多研究领域，0.05的P值通常被认为是可接受错误的边界水平。...(内容来源于网络，本来小编想自己写来着，可是，小编机会忘完啦，详细的内容，小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文的重点介绍，如何在我们的可视化图表中添加P值，使其更好的表现图表含义是在绘制图表是需要考虑的...直接上干货~~ R-ggpubr 添加P值 在使用ggpubr包进行P值添加之前，我们需导入R-rstatix包进行必要的统计操作(T检验等)，这里我们直接通过例子进行解释说明。...设置P值的具体添加位置。

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    统计绘图 | 一行代码添加P值的可视化技巧分享

    在一些常见的统计图表中经常需要在一些图表中添加P值，那么今天小编给大家汇总一下关于统计图表中P值的添加方法。...P值是一个服从正态分布的随机变量，在实际使用中因样本等各种因素存在不确定性.在许多研究领域，0.05的P值通常被认为是可接受错误的边界水平。...，详细的内容，小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文的重点介绍，如何在我们的可视化图表中添加P值，使其更好的表现图表含义是在绘制图表是需要考虑的。...直接上干货~~ R-ggpubr 添加P值 在使用ggpubr包进行P值添加之前，我们需导入R-rstatix包进行必要的统计操作(T检验等)，这里我们直接通过例子进行解释说明。...添加P值并修改P值样式。

    1.6K10

    在Hexo博客上添加可爱的Live 2D模型

    在查找资料的偶然间，我发现一个博客上有非常可爱的Live 2D模型，当时我就被打动了，马上开启审查元素，试图找出这个Live 2D模型的信息，可是找了半天没找到。...最后通过截图->谷歌图片的方式，终于一层一层的找到了相关资料，我正好有一个Hexo博客，所以今天就来在博客上添加一波Live 2D模型！...首先，安装npm包： npm install --save hexo-helper-live2d 然后在hexo的配置文件_config.yml中添加如下配置，详细配置可以参考文档： live2d:...live2d-widget-model-tsumiki live2d-widget-model-unitychan live2d-widget-model-wanko live2d-widget-model-z16 下载完之后，在Hexo...根目录中新建文件夹live2d_models，然后在node_modules文件夹中找到刚刚下载的live2d模型，将其复制到live2d_models中，然后编辑配置文件中的model.use项，将其修改为

    1.6K40

    Excel小技巧：在Excel中添加复选标记的15种方法（上）

    在本文中，介绍在Excel工作簿中添加复选标记的15种方法。 方法1：插入复选标记 可以使用功能区“插入”选项卡中的“符号”命令，如下图1所示。...图1 在图2所示的“符号”对话框中，选择“Wingdings”字体，滚动到底部，可以看到复选标记字符。...图3 方法2：添加复选标记的项目符号 在工作表中插入一个文本框，单击鼠标右键，在快捷菜单中选择“项目符号——选中标记项目符号”，如下图4所示。...方法4：使用CHAR函数创建复选标记 在单元格中，输入公式： =CHAR(252) 并将该单元格的字体设置为Wingdings。...图5 方法8：使用自动更正功能插入复选框 单击Excel左上角“文件——选项”命令，在“Excel选项”对话框左侧选择“校对”选项卡，单击对话框右侧的“自动更正选项”按钮，在“替换”框中输入一个单词，本例中为

    3.5K30

    Python在Finance上的应用5 ：自动获取是S&P 500的成分股

    我可以给你一个清单，但实际上获得股票清单可能只是你可能遇到的众多挑战之一。 在我们的案例中，我们需要一个标普500公司的Python列表。...在我们的例子中，我们将从维基百科获取列表http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_S%26P_500_companies. 维基百科中的代号/符号被组织在table。...BeautifulSoup所做的工作基本上可理解为将源代码转换为BeautifulSoup对象，我们可以将其视为典型的Python Object。 有时会出现维基百科试图拒绝Python的访问。...目前，在我写这篇文章的时候，代码工作时没有改变头文件。...（这就是为什么要写[1：]），说的是股票行情是“表格数据”（td），通过抓住它的.text，将此代码添加到列表 tickers。

    2.3K10

    合并列，在【转换】和【添加列】菜单中的功能竟有本质上的差别！

    有很多功能，同时在【转换】和【添加】两个菜单中都存在，而且，通常来说，它们得到的结果列是一样的，只是在【转换】菜单中的功能会将原有列直接“转换”为新的列，原有列消失；而在【添加】菜单中的功能，则是在保留原有列的基础上...，“添加”一个新的列。...但是，最近竟然发现，“合并列”的功能，虽然在大多数情况下，两种操作得到的结果一致，但是他们却是有本质差别的，而且一旦存在空值（null）的情况，得到的结果将有很大差别。...比如下面这份数据： 将“产品1~产品4”合并到一起，通过添加列的方式实现： 结果如下，其中的空值直接被忽略掉了： 而通过转换合并列的方式： 结果如下，空的内容并没有被忽略，所以中间看到很多个连续分号的存在...显然，我们只要将其所使用的函数改一下就OK了，比如转换操作生成的步骤公式修改如下： 同样的，如果希望添加列里，内容合并时保留null值，则可以进行如下修改： 这个例子，再次说明，绝大多数的时候，我们只需要对操作生成的步骤公式进行简单的调整

    2.6K30

    R语言ggplot2画热图的时候在色块上添加文本

    今天的推文没有详细介绍代码，代码的介绍会以视频形式放到B站，欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfa.1 head(dfa.1) 读取添加文本的数据 dfb...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记...今天推文的示例数据和代码可以在后台留言20211007获取

    1.9K10

    答读者问~ggplot2画图添加拟合方程的R2并且在右上角添加星号表示显著性；只有分位数和中位数数据画箱线图

    我记得之前分享过一篇文章 ggplot2绘图添加文本注释上下标问题，ggplot2画图如果添加文本注释可以用annotate()这个函数。...简单的小例子 library(extrafont) fonts() ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(aes(shape=D),size=10)...image.png 如果要添加上标，annotate()函数label参数的写法 ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(aes(shape=D),size...image.png 添加拟合方程的R2的写法 ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(size=5)+ annotate("text",x=3,y...image.png 公众号一位读者留言问 自己的数据是经过计算的的只有分位数和中位数的数据，应该如何画箱线图？我自己能想到的一个办法是利用annotate()函数画线段，将其组合成为一个箱子。

    1.3K20

    原 在PostgreSQL中秒级完成大表添加带有not null属性并带有default值的实验

    近期同事在讨论如何在PostgreSQL中一张大表，添加一个带有not null属性的，且具有缺省值的字段，并且要求在秒级完成。...因为此，有了以下的实验记录： 首先我们是在PostgreSQL 10下做的实验： postgres=# select version();...，如何快速添加这么一个字段： 首先，在这里我们涉及三张系统表，pg_class（表属性）、pg_attribute（列属性）、pg_attrdef（缺省值信息），接下来依次看一下三张表的信息： #pg_class...# update pg_class set relnatts=relnatts+1 where relname='add_c_d_in_ms'; UPDATE 1 Time: 43.979 ms #添加缺省值...postgres=# alter table add_c_d_in_ms add a10 text; ALTER TABLE #如果添加not null属性的字段，则会检测其他字段属性，将会报错 postgres

    8.2K130

    Python在Finance上的应用6 ：获取是S&P 500的成分股股票数据

    在之前的Python教程中，我们介绍了如何获取感兴趣的公司名单（在我们的案例中是S&P 500指数），现在我们将收集所有这些公司的股票数据。...在这里，我将展示一个可以处理是否重新加载S&P500列表的方法的快速示例。如果我们提出要求，该计划将重新抽取S&P500指数，否则将只使用我们的pickle。现在我们要准备抓取数据。...你应该已经知道如何做到这一点，因为在第一个教程中做到了！...因为我们每天都在拉数据，所以你希望能重新拉动至少最新的数据。也就是说，如果是这样的话，你最好用一个数据库代替一个公司的表，然后从雅虎数据库中提取最新的值。不过，我们现在要把事情简单化！...如果雅虎扼杀了你，你可能需要import time 并添加一个time.sleep（0.5）。在写这篇文章的时候，雅虎并没有完全扼杀我，而且能够毫无问题地完成整个过程。

    2K30

    安利一款在 Windows10 上兼顾颜值与功能的 RSS 阅读应用

    在 Windows10 的菜单栏中，有许多图标包括应用商品，照片，邮件等，当然你移除了肯定是没有的 我又换回去 Windows10了，今天来安利一款在 Windows10 上兼顾颜值与功能的 RSS...阅读应用：Newsflow，这是一个 UWP 应用 什么是 UWP 应用 在 Windows 10 中，微软首次引入了 UWP（通用 Windows 平台）的概念，让开发者只需一次编写，就能让程序在电脑和手机等多种设备上运行...RSS 应用中的订阅列表，或者备份在 Newsflow 中的相关设置 使用这款应用，你可以 接收最新文章的通知 与你的朋友分享文章 通过关键词浏览一组文章 固定到动态磁贴 查看文章图片 添加文章到收藏夹...添加文章到稍后阅读 分类并管理你的订阅源 在应用内观看YouTube或HTML页面视频 播放GIF动图 搜索特定新闻 更舒服的方式管理已读和未读的文章 许多更酷的事情 怎么下载 Newsflow 你可以在...原创文章采用CC BY-NC-SA 4.0协议进行许可，转载请注明：转载自：安利一款在 Windows10 上兼顾颜值与功能的 RSS 阅读应用

    1.3K20

    Python在生物信息学中的应用：在字典中将键映射到多个值上

    我们想要一个能将键（key）映射到多个值的字典（即所谓的一键多值字典[multidict]）。 解决方案 字典是一种关联容器，每个键都映射到一个单独的值上。...如果想让键映射到多个值，需要将这多个值保存到另一个容器（列表、集合、字典等）中。...defaultdict 的一个特征是它会自动初始化每个 key 刚开始对应的值，只需要关注添加元素即可。...如果你并不需要这样的特性，你可以在一个普通的字典上使用 setdefault() 方法来代替。...因为每次调用都得创建一个新的初始值的实例（例子程序中的空列表 [] ）。 讨论 一般来说，构建一个多值映射字典是很容易的。但是如果试着自己对第一个值做初始化操作，就会变得很杂乱。

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    首个在ImageNet上精度超过80%的二值神经网络BNext问世，-1与+1的五年辛路历程

    目前，制约 BNN 应用的瓶颈主要有两方面：首先，无法有效缩小和传统 32-bit 深度学习模型的精度差距；第二则是缺乏在不同硬件上的高性能算法实现。...机器学习论文上的加速比通常无法体现在你正在使用的 GPU 或 CPU 上。...在优化技巧方面，BNext 作者充分考虑了现代高精度模型优化中数据增强可能带来的增益，并提供了首个针对现有流行数据增强策略在二值模型优化中可能带来影响的分析结果，实验结果表明，现有数据增强方法并不完全适用于二值模型优化...在同全精度模型如 RegNetY-4G (80.0%)等的对比中，BNext-L 在展现相匹配的视觉表征学习能力同时，仅仅使用了有限的参数空间与计算复杂度，这为在边缘端部署基于二值模型特征提取器的下游视觉任务模型提供了丰富想象空间...BNext 作者在论文中提到的，他们和合作者们正积极在 GPU 硬件上实现并验证这个高精度 BNN 架构的运行效率，未来计划扩展到其他更广泛的硬件平台上。

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