我正在用ggplot2绘制多个饼图，并成功地将标签绘制在正确的位置，如下所示：
df <- data.frame(annotation=rep(c("promoter", "intergenic", "intragene", "5prime", "3prime"), 3), value=c(69.5, 16, 10.7, 2.5, 1.3, 57.2, 18.8, 20.2, 2.1, 1.7, 50.2, 32.2, 15.3, 1.2, 1.1), treatment=rep(c("treated
浏览 5提问于2017-09-18得票数 7
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4.843975286 4.657188246我想按列对其进行聚类，以找出相似的启动子(列表示启动子，行表示基因)。我总共有20列和22810个基因。
浏览 2提问于2012-11-01得票数 0
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4.843975286 4.657188246在上述矩阵中，第一列是基因列表( 22810)，对应的列对应于不同的启动子(共4种不同类型)。在这种情况下，如何才能找到差异表达的基因呢？
我想用t检验来识别DEG的，我知道在两种情况下(如控制和治疗)，DEG使用的是R中最多的包。但不知道如何进行四种不同类型的促进者和确定副秘书长的。
浏览 3提问于2012-10-16得票数 1
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4.843975286 4.657188246其中不同的列对应于四种不同类型的启动子，并且四种启动子中的每一种都具有生物复制，所以总共有8列。我尝试使用Limma软件包来寻找几个启动子(带有重复)的差异表达基因，但我总是得到一个错误，因为我对r来说是新的，无法完全理解它。
浏览 3提问于2012-10-17得票数 0
夜莺( nightwatch bot.js -c config_chrome.json )
启动子进程，用于:test/extra/断言/customAssertion启动子进程，用于:test/extra启动子进程，用于:test/extra/tests/customCommandConstructor启动子进程，用于:test/External/commands/other/otherCommand启动
浏览 4提问于2016-07-18得票数 1
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在NEAT (通过增强拓扑的神经进化)算法描述中，为每个基因分配一个新息数，例如id，这样基因组就可以有意义地交叉:具有相应创新数的基因被对齐，然后进行交叉。这个创新数字是全球范围内唯一不同的基因吗？这意味着每个基因组都有自己的计数器，还是所有基因组都有一个独特的计数器？
浏览 0提问于2018-01-30得票数 1
如果以静态方式启动子规范： {ok, {{RestartStrategy, MaxR, MaxT},start_child(SupRef, ChildSpec) -> startchild_ret()
如何确定MaxR和MaxT的重新启动策略？
浏览 0提问于2013-04-03得票数 2
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在jenetics库中，Mutator类的alter() methid中给出了以下代码：有人能解释一下计算这个新的突变概率的目的吗？它有什么好处？我们如何使用这个类来实现一个位置或点突变？
浏览 6提问于2015-04-14得票数 0
在第109页(pdf中的12)中，它指出：“匹配的基因是随机遗传的，而不相交的基因(中间不匹配的基因)和多余的基因(最终不匹配的基因)是从更合适的父母那里遗传的。”
浏览 0提问于2018-12-22得票数 0
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嗨，我正试图用PyGAD来解决一个Tsp问题，我做了一个结果，但是结果是重复的。[[ 1 12 26 19 22 20 6 15 17 23 21 7 28 5 13 14 16 2 24 4 3 10 9 8 18 25 27 11] [ 3 23 12 7 2 11 15 13 19 26 21 14 9 5 24 20 25 1 8 16
浏览 11提问于2022-06-16得票数 1
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我有一个基因列表文件。像这样的事情 SSA1 EFB1 MDM10chrI 134183 135665 YAL010C - MDM10
我想从第二个文件中提取出那些在第一个文件中有基因名称的行
浏览 0提问于2014-03-24得票数 7
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这是合理的，因为你不希望相同的基因以不同的创新数字结束。如果他们这样做了，当他们用相同的基因和不同的创新数杂交两个基因组时会出现问题，因为你最终会得到一个后代，每个基因的拷贝来自每一个父母，产生两次相同的联系。但是，对我来说没有意义的是，如果在两个基因之间发生突变，然后在下一代发生相同的突变会发生什么呢？你是否有一份基因对的全球列表和相应的创新编号来防止这个问题？为什么这篇论文只说明在同一代发生相同突变而不考虑跨代突变的情况下会发生什么呢？
浏览 2提问于2017-05-20得票数 1
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到目前为止，我一直在尝试这样做：如果我在自己的dev帐户下运行服务(让我们称其为开发人员)，并试图在特权较低的帐户(我们称之为immediately.If )下<e
浏览 3提问于2012-05-29得票数 5
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我在研究遗传算法。我有一个疑问如下:假设我有两个大小不同的染色体，如下: 1234567 ABCDEFGHIJ123|4567=>ABC4567
浏览 1提问于2018-05-27得票数 0
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为特定的数据组织构建堆叠条形图
、、、、
我想构建一个堆叠的条形图，x轴代表基因组(或仅仅是有机体)的数量，y轴代表基因组的确切数量中出现的基因簇的数量。因为我知道这些基因来自哪些有机体，我希望每个条形图都能显示每个基因组在构建这个条形图中的影响。； 1)第一列显示了每个基因簇所涉及的基因组数量； 2)第二列表示聚类中的基因数量； 3)列3-5代表来自不同基因组的基因的具体名称； "*“表示该基因组的簇中没有基因
浏览 17提问于2019-05-20得票数 0
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在我运行这个基因并得到每个基因的结果之后，我对这些基因做一些加权乘法(这样排名越好的基因就能得到最多的倍数)。问题是，我不知道怎样才能使人口再次减少到X。在交叉基因时，什么是常见的做法？编辑：
对健身功能中的100个基因进行运行
浏览 0提问于2014-06-22得票数 0
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我正在研究2600+基因组，希望研究不同群体的基因组、基因和基因间的特征。如果分类组只有很少的代表，就没有问题。在分类组具有多个基因组的情况下，我应该在什么基础上删除相似的基因组，以便从每个分类组中只获得几个代表。我是否应该使用lenght或GC%或其他特征来删除基因组-例如，如果两个基因组的GC%变异小于1%，我将删除它。类似这样的事情。请建议接受的方式，并友好地解释原因以及。tuberculosis alone which have
GC% ran
浏览 1提问于2013-09-27得票数 0
如果我们有教师作为基因，并且有三个教师{harry,sam,bran}，那么我们使用2位二进制值，并将值分配给教师，如下所示：如果我们可以做到这一点，那么如何处理未使用的二进制值
浏览 2提问于2018-05-08得票数 1
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