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1
回答
Python的GBrowse API
、
、
否则,有没有python模块可以用来创建类似于
基因组
浏览器
的视图?
浏览 6
提问于2011-02-12
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1
回答
如果我有UCSC的坐标,我如何使用Perl脚本从UCSC提取DNA序列?
、
如果我有它们的坐标,我如何使用Perl脚本从
基因组
浏览器
(UCSC)中提取DNA序列?
浏览 3
提问于2010-04-29
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2
回答
使用html按钮更改javascript变量
、
、
、
我正在一个网站上实现IGV
基因组
浏览器
。我想把一个带有染色体位置的表格链接到
基因组
浏览器
,这样当用户点击一个位置时,
基因组
浏览器
就会自动切换到那个位置。到目前为止,我已经在一个单独的javascript文件中获得了
基因组
浏览器
代码,该文件使用了按钮的值。button class='editbtn' value='chr2:200-400' id='ins2'>chr2:200-400&l
浏览 78
提问于2021-11-10
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1
回答
使用交叉遗传算子有哪些优点和缺点?
、
、
、
、
例如,我们遇到了以下问题:使用二进制编码,我们可以用5位来表示个人。经过一种选择方法后,我们得到了遗传算子。
浏览 3
提问于2017-05-19
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1
回答
基因创新在整洁实施中的应用
、
、
在NEAT (通过增强拓扑的神经进化)算法描述中,为每个基因分配一个新息数,例如id,这样
基因组
就可以有意义地交叉:具有相应创新数的基因被对齐,然后进行交叉。这意味着每个
基因组
都有自己的计数器,还是所有
基因组
都有一个独特的计数器?
浏览 0
提问于2018-01-30
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1
回答
遗传算法:仅在一部分基因型中的均匀交叉
、
我需要实现一个“一致交叉”的遗传算子。 if(anyDuplicate(p0_genome,minIndex) || anyDuplicate(p1_genome,minIndex)){ swap(p0_genome,p1_genome,i);
浏览 0
提问于2012-06-02
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1
回答
我应该使用什么权重来开始一个整洁的基于神经网络?
在阅读了几篇关于神经进化的论文后,我意识到在神经网络开始时,关于如何对每个突触进行加权的信息非常少。我知道,在一开始,使用NEAT,所有的输入神经元都连接到输出神经元,然后从那里开始进化。然而,你应该在开始时随机给每个突触加权,还是简单地将每个突触设置为1?
浏览 13
提问于2017-06-29
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1
回答
分割故障(核倾弃)星对齐
、
、
、
我对RNA seq领域真的很陌生,我正试图将我的数据与一个病毒
基因组
与星体进行比对。但是,我经常看到下面的错误。代码:12月24日19:09:40 .启动星运行十二月二十四日19:09:41 .开始映射分段错误(核转储)‘ 谢谢!
浏览 7
提问于2021-12-24
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2
回答
从mysqli向表的每个条目添加一个超链接
、
、
、
我试图在一个用mysqli数据生成的表上添加到每个基因的
基因组
区域的直接链接,但是找不出方法。这个想法是每个基因的名字都有一个超链接到它的区域在一个
基因组
浏览器
上。
浏览 3
提问于2016-12-18
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1
回答
获取GC含量和基因长度列表
我听说我可以从UCSC
基因组
浏览器
上得到这个,但我不知道如何...非常感谢您的帮助!
浏览 1
提问于2014-06-24
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1
回答
在NEAT算法中向结构添加节点/连接
、
一些来源(链接如下)说,突变可以增加一个新节点或减少一个节点,或者增加两个现有节点之间的连接。但是,如果我们这样做,它不会改变整个种群中的基因数量。那么,我们如何才能在两者之间进行交叉呢?这在我的脑海里已经有相当长的一段时间了。谢谢
浏览 5
提问于2019-09-01
得票数 1
1
回答
为特定的数据组织构建堆叠条形图
、
、
、
、
我想构建一个堆叠的条形图,x轴代表
基因组
(或仅仅是有机体)的数量,y轴代表
基因组
的确切数量中出现的基因簇的数量。因为我知道这些基因来自哪些有机体,我希望每个条形图都能显示每个
基因组
在构建这个条形图中的影响。,"E", "D", "N", "*"), genome3_genes = c("*","*", "L", "H", "O", "P,A")
浏览 17
提问于2019-05-20
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1
回答
“语法进化”中的密码子是如何解读的:它们是滑动的窗口,还是用块完成的?
我正在读奥尼尔和瑞恩的报纸,他们说:
浏览 2
提问于2017-06-29
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2
回答
在遗传算法中何时检查染色体的有效性
我正在为Rhino开发一个插件,它生成建筑平面图(基于形状语法)。插件是用C#编写的,使用RhinoCommon API。使用不同的规则,表示为染色体中的基因,我转换一个起始几何学。利用遗传算法,适应度函数确定转换规则的最优序列,以生成与参数标准(面积、视图、最小构造等)相匹配的几何。当我向染色体添加一个基因(表示几何变换操作)时,我可以检查这是否导致无效几何。例如:我的起始形状是一个矩形:一个转换选
浏览 5
提问于2013-02-06
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2
回答
如何筛选
基因组
进行成分研究?
、
我正在研究2600+
基因组
,希望研究不同群体的
基因组
、基因和基因间的特征。如果分类组只有很少的代表,就没有问题。在分类组具有多个
基因组
的情况下,我应该在什么基础上删除相似的
基因组
,以便从每个分类组中只获得几个代表。我是否应该使用lenght或GC%或其他特征来删除
基因组
-例如,如果两个
基因组
的GC%变异小于1%,我将删除它。类似这样的事情。请建议接受的方式,并友好地解释原因以及。tuberculosis alone which have GC% range of 65.48 to 65.
浏览 1
提问于2013-09-27
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1
回答
进化算法的规模?
我有一个关于进化算法“大小”的一般问题。每个EA可以根据它们的个体大小(染色体长度)、它们的种群大小或适应度评估的数量(e.q代数)进行调整。
浏览 3
提问于2015-05-26
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1
回答
在整齐地比较两个
基因组
时,一个人怎么可能有不相交的基因?
、
、
我不能理解为什么会出现不相交的基因,因为我看不到一个
基因组
在其连接基因中的创新数量之间存在差距的方法。据我所知,在一个给定的
基因组
中,一个创新数字是共享的,并且每当一个新基因出现在
基因组
中时,这个数字就会增加。有人能解释一下吗?
浏览 2
提问于2017-09-13
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1
回答
基于DNA坐标的mRNA序列检索
、
、
我有一个
基因组
DNA坐标(hg38)的列表,我想检索相应的mRNA序列200 up以上/下游的这些坐标的位置,和想法? 谢谢。我已经尝试了表格
浏览器
,很容易得到所有的密码子序列的坐标,但我不知道在哪里设置参数200 bp上下流的这些坐标。
浏览 20
提问于2022-11-30
得票数 1
5
回答
php java批处理
、
、
我有3个文件(每个文件大约2 2Gb,包含人类
基因组
序列)。我有java代码来处理这些文件,通过在PHP开发的web界面。处理时间约为24小时,甚至更长。如何从PHP运行Java代码,以便在关闭
浏览器
时处理不会终止。我假设它需要批处理。
浏览 2
提问于2011-05-17
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1
回答
我无法运行我的tophat函数
、
在一个文件夹中,我有我在GTF中的参考
基因组
在这个文件夹中,我有我的领结索引文件。在其他文件夹中,我有我的抄本的两个拆分的fasta文件。我放置了命令tophat,但似乎找不到bowtie索引文件。我用build命令创建了它们,并从.gff中的JGI下载了我的参考
基因组
,后来我将其转换为.gtf。 对我做错了什么有什么建议吗?
浏览 0
提问于2014-12-13
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