这是一个对我有特殊意义的教程,大约在一年半以前,我和朋友开始研究如何将多个数据集合并为一个数据集来分析,但是当时试了很多方法,效果不理想,再加上很多前辈告诉我很多人不认同这样合并多个数据集(因为会导致很多误差...然后最近因为疫情我又重新开始研究这段,终于给摸索出来一个还可以的教程并结合自己的数据集做了实例验证,效果挺满意的,所以想把这段教程写下来并总结以待后用。
这是一个对我有特殊意义的教程,大约在一年半以前,我和朋友开始研究如何将多个数据集合并为一个数据集来分析,但是当时试了很多方法,效果不理想,再加上很多前辈告诉我很多人不认同这样合并多个数据集(因为会导致很多误差...然后最近因为疫情我又重新开始研究这段,终于给摸索出来一个还可以的教程并结合自己的数据集做了实例验证,效果挺满意的,所以想把这段教程写下来并总结以待后用。 移除批次效应前 ? ? ?...因为目前合并多个测序、芯片数据集这一块并没有完全统一的标准,方法大概有五六种。公说公有理婆说婆有理,对于我这样的新手来说,最简单的是跟随顶级文章的文章思路或者分析流程和步骤。
MapReduce将负责的运行于大规模集群上的并行计算过程高度地抽象为两个函数(Map和Reduce),利用一个输入集合来产生一个输出地对集合。...二 Map/Reduce过程 MongoDB中的Map/Reduce对于批量处理数据进行聚合操作是非常有用的。在思想上它跟Hadoop一样,从一个单一集合中输入数据,然后将结果输出到一个集合中。...c.如果一个键有多个值的话,进行reduce的操作,在进行reduce 操作的时候将所有的值进行累加 如果一个健只有一个值的话就直接输出到结果集合 d.Reduce完后将结果输出到预先定义好的结果集合中...,这部分返回的就是结果中的value值; **out:** , // 输出到某一个集合中,注意本属性来还支持如果输出的集合如果已经存在了,那是替换,合并还是继续reduce?...// 使用传字符串的方法 单次传入: var map = function() { emit(this.state, this.loc); }; 多次传入 function() {
基于聚合的创建集合听起来就像是$out,它是聚合框架中的一个执行阶段,从很早的MongoDB 2.6就有了。$out阶段可以获取聚合结果,将其放到新的集合中,并用新的结果完全替换掉集合中原来的内容。...我们可以使用$merge将结果写入另一个集合,就如同添加{ $merge: { into: "bedcount" } }作为管道的最后一个执行阶段一样简单,如下所示: 这样,开发人员可以引用该集合作为他们的结果...使用on属性,可以使用任意具有唯一值的字段。 如果匹配上_id,在默认的情况下,$merge执行阶段将提取新的结果文档以及集合中的结果文档,合并这两个文档,生成一个包含它们所有字段的复合文档。...例如,它可以读取或写入分片集合的数据($out只能读取分片集合的数据),这就允许你的物化视图能够跨越多个分片,从而水平扩展集合。...它还可以将结果写入不同的数据库,允许你不仅能运行一个可更新的聚合,还能将结果迁移到不同节点上的不同数据库中。
都会重新计算, 转换算子与行动算子的区别于联系 转换算子是spark中的一种操作,用于从一个RDD转换成另一个RDD,它可以被用来创建新的RDD,也可以被用来转换已有的RDD。...行动算子是spark中的另一种操作,它们用于从一个RDD中收集数据,或者从一个RDD中计算结果,如collect、reduce、count等。...它与map算子的区别在于,map算子只是将一行数据拆分成一个元素,并将其放在新的集合中, 而flatMap算子可以将一行数据拆分成多个元素,并将所有元素放在一个新的集合中。...subtract 可以从一个RDD中减去另一个RDD中的元素,以得到一个新的RDD。...key进行聚合操作,将每个key对应的value进行聚合, 将聚合后的结果与zeroValue进行combine操作,返回一个新的RDD, 新的RDD中的每个元素是一个key-value对,其中key是原
每个函数接口都带有 @FunctionalInterface 注释,有且仅有一个未实现的方法,表示接收 Lambda 表达式,它们存在的意义在于将代码块作为数据打包起来。...如果该注释添加给一个枚举类型、 类或另一个注释, 或者接口包含不止一个抽象方法, javac 就会报错。...java8 之前我们迭代集合,都只能依赖外部迭代器 Iterator 对集合进行串行化处理。而 Stream 支持对集合顺序和并行聚合操作,将更多的控制权交给集合类,是一种内部迭代方式。...接下来让我们瞧瞧 Stream 如何结合 Lambda 表达式优雅的处理集合... foreach - 迭代集合 list.forEach(e -> System.out.println(e)); map.forEach...四、其他 使用 Lambda 表达式,就是将复杂性抽象到类库的过程。 面向对象编程是对数据进行抽象, 而函数式编程是对行为进行抽象。
foreach (var item in q) { Console.WriteLine(item); } } 四、联接操作符 联接是指将一个数据源对象与另一个数据源对象进行关联或者联合的操作...Except 返回差集,差集是指位于一个集合但不位于另一个集合的元素。 Intersect 返回交集,交集是指同时出现在两个集合中的元素。...ToLookup ToLookup操作符将创建一个 Lookup对象,这是一个one-to-many集合,一个Key可以对应多个Value。...Single Single方法的无参形式将从一个序列中返回单个元素,如果该序列包含多个元素,或者没有元素数为0,则会引发异常。...Single方法的有参形式将从一个序列中返回符合指定条件的唯一元素,如果有多个元素,或者没有元素符合这一条件,则会引发异常。
Stream(流)是一个来自数据源的元素队列并支持聚合操作 元素是特定类型的对象,形成一个队列。Java中的Stream并不会存储元素,而是按需计算。 数据源 流的来源。...当终端操作返回一个特定类型的结果时,中间操作返回流本身,所以你可以链接多个方法调用。流在源上创建,例如一个 java.util.Collection 像列表或集合(不支持映射)。...bbb2, ddd1 Map 中间操作映射通过给定函数将每个元素转换为另一个对象。...以下示例将每个字符串转换为大写字母字符串。但是您也可以使用 map 将每个对象转换为另一种类型。结果流的泛型类型取决于您传递给 map 的函数的泛型类型。...顺序流上的操作在单个线程上执行,而并行流上的操作在多个线程上同时执行。 以下示例演示了通过使用并行流提高性能是多么容易。
map(Function):将流中的每个元素映射为另一个元素。sorted():对流进行排序。distinct():去除流中重复的元素。limit(long):限制流中元素的数量。...如何使用Java 8的Stream API来操作集合:public static void main(String[] args) { List strings = Arrays.asList...("Average of doubles: " + average); }三、收集器 Collectors收集器(Collectors)用于将流的元素累积到集合中,或者进行聚合操作。...在使用流进行数据处理时,收集器是非常有用的工具,它们能够简化代码并提高效率。常用的收集器及其用法:1.toList()将流中的元素收集到一个列表中。...IntSummaryStatistics stats = stream.collect(Collectors.summarizingInt(String::length)); 如何将一个字符串流收集成一个列表
【原文地址】https://docs.mongodb.com/manual/ 聚合 聚合操作处理数据记录并返回计算后的结果。聚合操作将多个文档分组,并能对已分组的数据执行一系列操作而返回单一结果。...所有这些操作从一个集合中聚合文档。虽然这些操作提供了简单的实现聚合操作的方式,但是它们缺乏灵活性和同聚合管道与 map-reduce相似的性能。 ?...为查看优化程序如何改进一个特定的聚合管道,在db.collection.aggregate()方法中使用explain 选项。...1.4.1 投影器优化 聚合管道能够判定是否使用集合中字段的一个子集来获得结果。如果使用子集,那么聚合管道将只会使用那些需要的字段以减少管道中传输的数据量。...对于要运行在多个分片上的聚合操作,如果操作不需要运行在数据库的主分片上,这些操作将会路由结果到任意分片来合并结果以避免数据库主分片过载。 $out阶段和$lookup阶段需要运行在数据库主分片上。
Java NIO的主要构成核心就是Buffer、Channel和Selector这三个 对于Channel我想要提醒的是,Channel中的数据总是要先读到一个Buffer,或者总是要从一个Buffer...对每一个新进来的连接都会创建一个SocketChannel Scatter/Gather 分散(scatter)从Channel中读取是指在读操作时将读取的数据写入多个buffer中。...因此,Channel将从Channel中读取的数据“分散(scatter)”到多个Buffer中 聚集(gather)写入Channel是指在写操作时将多个buffer的数据写入同一个Channel,因此...byte、char等的个数相等 Buffer中所有剩余的byte、char等都相同 只比较的是剩余的数据 compareTo():满足下列条件,则认为一个Buffer“小于”另一个Buffer 第一个不相等的元素小于另一个...Buffer中对应的元素 所有元素都相等,但第一个Buffer比另一个先耗尽(第一个Buffer的元素个数比另一个少) Selector Selector允许单线程处理多个 Channel。
transformation的结果是从一个RDD转换到另一个RDD,而action则是从一个RDD转换到一个非RDD,因此从执行结果是否仍然是RDD也可推断出该操作是transformation抑或action...从本地或HDFS文件中创建RDD对象,适用于大数据集,也是生产部署中较为常用的方式 从一个已有RDD中生成另一个RDD,所有transformation类算子其实都是执行这一过程 from pyspark....map(lambda x:(x, 1)) # 从一个RDD转换为另一个RDD 需要指出的是,RDD作为分布式的数据集合,其本身是不可变对象(immutable),所以所有的transformation...至于说转换过程中仍然可以使用相同的变量名,这是由Python的特性所决定的,类似于字符串是不可变数据类型,但也可以由一个字符串生成另一个同名字符串一样。...前面提到,Spark在执行过程中,依据从一个RDD是生成另一个RDD还是其他数据类型,可将操作分为两类:transformation和action。
方法 解释 int binarySearch(List list, Object key) 二分查找返回索引,前提是用sort排好序了 void copy(List dest, List src) 将所有元素从一个...list复制到另一个list void fill(List list, T obj) 填充 int frequency(Collection c, Object o) 指定元素出现的次数 int indexOfSubList...mutex),用了装饰者模式,现在不推荐使用了,下面列举一个例子 static class SynchronizedCollection implements Collection, Serializable...volatile保证可见性,然后对比当前值与内存是否相等,相等才修改,多个线程对同一变量修改时,只有一个能成功 ? ...数组转集合 返回值 方法名 解释 List Arrays.asList(T... a) 返回数组的List集合 若传参是普通类型的数组,List会把整个数组放到第一个元素里 返回指定数组的固定大小的List
在传统的拷贝操作中,当数据从一个位置(例如磁盘、网络等)传输到另一个位置(例如应用程序的内存),通常需要将数据从源位置复制到中间缓冲区,然后再从中间缓冲区复制到目标位置。...而零拷贝技术通过避免这些不必要的数据复制,从而提高数据传输和处理的效率。具体而言,它允许数据在不进行额外复制的情况下直接从源位置传输到目标位置。...(fury.deserialize(bytes, buffers)); } } 这段代码的主要目的是将一个包含不同类型对象的列表进行序列化和反序列化操作,其中序列化操作通过 Fury 库实现零拷贝...bufferObjects.add(e)); 使用 Java 8 的流操作将 bufferObjects 集合转换为 MemoryBuffer 类型集合 buffers: List<MemoryBuffer...(bytes, buffers)); 这段代码主要演示了如何使用 Fury 库进行零拷贝的序列化和反序列化操作,其中非基本类型对象被存储在 BufferObject 类中,以实现更高效的数据传输和处理
Lambda表达式还增强了集合库。 Java SE 8添加了2个对集合数据进行批量操作的包: java.util.function 包以及java.util.stream 包。...对stream的操作也不会影响到创建它的数组和集合,对于stream的聚合、消费或收集操作只能进行一次,再次操作会报错。...set(0,0))是可以修改原来集合的元素,如果集合里存的是引用类型也可以重新set或者直接改变对象里的字段。 由于stream的延迟执行特性,在聚合操作执行前修改数据源是允许的。并且会影响到流里。...在本节中,我们将看到lambda表达式如何影响我们编码的方式。...结合 map 方法,我们可以使用 collect 方法来将我们的结果集放到一个字符串,一个 Set 或一个TreeSet中: System.out.println("将 javaprogrammers
操作符(Operators) 操作符是定义在聚合管道阶段中的指令,它们告诉MongoDB如何处理数据。...$unwind: 用于将数组类型的字段拆分成多条记录。 $limit: 用于限制输出结果的数量。 $lookup: 用于进行表连接操作,可以在一个集合中根据外键查询另一个集合的数据。 4....通常,聚合管道的输出结果是一个包含处理后的文档的游标(Cursor),可以通过遍历游标来获取结果。此外,还可以使用聚合管道的输出阶段(如$out)将结果直接写入另一个集合中。...为了实现这些需求,我们使用多个聚合阶段,包括group、 sort、limit和 lookup。...第三个和第四个sort及 limit阶段将结果按平均订单金额降序排序,并限制输出为前5名客户。 第五个$lookup阶段将客户ID与客户集合中的详细信息关联起来。
什么是 reduce Java8 中有两大最为重要的改变,其一是 Lambda 表达式,另一个就是 Stream API 了。...Stream 是 Java8 中处理集合的关键抽象概念,它将数据源流化后,可以执行非常复杂的查找、过滤和映射数据、排序、切片、聚合统计等操作。操作之后会产生一个新的流,而数据源则不会发生改变。...在使用 Stream 操作的过程中,往往有三个步骤, 1. 创建 Stream 从一个数据源(集合,数组)中,新建一个 Stream 流。 2....使用 reduce 查询整数集合的最小值 // 创建一个整数集合 List numbers = Arrays.asList(1, 2, 3, 4, 5, 6); // 找出集合中的最小值...使用并行流的好处能够充分利用多核 CPU 的优势,使用多线程加快对集合数据的处理速度。 不过并行流也不是任何时候都可以使用的,并行流执行过程中实际按照多线程执行,多线程编程有的问题,并行流都有。
TreeSet 将元素存储在红-黑树数据结构中,而 HashSet 使用散列函数。 LinkedHashSet也使用了散列,使用了链表来维护元素的插入顺序。...因此,能够很容易地将集合组合起来以快速生成强大的数据结构。...队列Queu 先进先出集合。 即从集合的一端放入事物,再从另一端去获取它们,事物放入集合的顺序和被取出的顺序是相同的。 队列通常被当做一种可靠的将对象从程序的某个区域传输到另一个区域的途径。...队列在并发编程中尤为重要,因为它们可以安全地将对象从一个任务传输到另一个任务。...如果执行的操作会修改这个 List ,并且不希望修改原始数组,那么就应该在另一个集合中创建一个副本。 小结 Java 提供了许多保存对象的方法: 数组将数字索引与对象相关联。
1)业务逻辑 我们从业务逻辑的层面上来优化数据倾斜,比如上面的两个城市做推广活动导致那两个城市数据量激增的例子,我们可以单独对这两个城市来做count,单独做时可用两次MR,第一次打散计算,第二次再最终聚合计算...set mapred.reduce.tasks=3; // 启动两个job,一个负责子查询(可以有多个reduce),另一个负责count(1): select count(1) from (select...由于其本质,它通常被称为棋盘距离,因为国际象棋的国王从一个方格到另一个方格的最小步数等于切比雪夫距离。 用例 如前所述,切比雪夫距离可用于提取从一个正方形移动到另一个正方形所需的最小移动次数。...例如,如果我们从一个地方到另一个地方旅行,那么该距离始终为正。 但是,如果我们从一个地方到自己的地方旅行,则该距离为零。标量因数—当向量与正数相乘时,其长度会更改,同时保持其方向。...; client 开始往A上传第一个 block(先从磁盘读取数据放到一个本地内存缓存),以 packet 为单位(默认64K),A收到一个 packet 就会传给B,B传给C;A每传一个 packet
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