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Blender + Python:用少量有效数据绘制势能面示意图的方法

这种图正规绘制需要大量的单点计算，并用软件描面画成。但是实际上，我无法计算出如此多的单点来绘制一张图，毕竟在一般的计算有机工作中，单是定位过渡态就够普通鼠标侠喝一壶了，更别说选CV扫描并绘图了。...因此只能利用现用的计算数据合理规划着绘制，也就是说我只能依据目前算出的几个结构的数据，或者IRC上的点进行绘制。 经朋友启发，组织了一个简易的流程，来画这种简易的示意图。...（当然，我们可以使用调整，直接捏出想要的形状，但是我们目的不是在Blender中捏出，只是利用其捏出基本形貌，后利用坐标在常用的科研作图软件中插值制作出符合审美的示意图，所以我建议使用刷选并只改变Z值，...='3d') #plt.axis('off') #ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride = 1, cstride = 1, cmap = plt.get_cmap('gnuplot...)那里会展示最初捏出的草图形貌，不过在Blender里就能看到它就不需要matplotlib渲染了 代码默认生成200x200的图，使用Rbf来拟合曲面。

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    关于Python可视化Dash工具

    1、scatter：散点图 在散点图中，每行data_frame由2D空间中的符号标记表示； 2、scatter_3d：三维散点图 在3D散点图中，每行data_frame由3D空间中的符号标记表示；..._3d：三维线图 在三维线图中，每行数据框都表示为三维空间中多段线标记的顶点 9、line_polar：极坐标线条图 在极线图中，每行data_frame表示为极坐标中折线标记的顶点...； 10、line_ternary：三元线条图 在三元线图中，每行data_frame表示为三元坐标中折线标记的顶点； 11、line_mapbox：地图线条图 在Mapbox线图中，每一行...y(或者x，如果orientation是'h'时)； 21、pie：饼图 在饼图中，数据帧的每一行表示为饼图的扇区。...dash_html_components和HTML属性有几点重要的不同： 1. 在HTML中，style属性是以分号分隔的字符串。在Dash中，你可以使用一个字典。

    3.2K10

    用Matplotlib创建Synthwave

    但是每天都在处理数据，既不是动画师，图形设计师也不是艺术家。 然后想：“确实创建了视觉效果，在Matplotlib中可视化了数据。...每行唯一要更改的值是Numpy linspace函数中的最终x值。使用for循环，范围是从x = -500到x = 500，步长为50。 现在，没有地平线，没有地平线就不可能有无尽的合波之路。...如果绘制所有十条运动线，请牢记此逻辑，可以可视化时间（x轴）到线的y位置（y轴）： 通过使用指数函数，将运动线和透视线混合在一起。...对于辉光，再放置一些半径稍大且alpha值较低的圆圈。在使用简单的黑色线条图后添加线条。 将迈阿密太阳和霓虹灯网格放在一起，得到： 目的地 无尽的霓虹紫色路需要目的。一个遥远但并非太遥远的目的地。...Matplotlib中的 gnuplot颜色图参考 还自由地减少了霓虹灯网格的线宽，认为现在看起来好多了。

    1.4K30

    博客园排名预测

    echo 这种命令在 gnuplot 脚本中是不存在的，于是这里绕了一个大圈——在脚本执行完成后，通过分拆 fit.log 中的拟合日志提取函数的各个参数 (a/b/c/f/g/m/n)，再构建函数计算预测值...，最后写入数据文件——哪位高手如果知道如何在 gnuplot 脚本中直接输出信息的话，不吝赐教哈，就可以把这个大弯路省掉了。...当脚本运行完毕后，more.txt 中的数据自动合入 score.txt，同时产生三个包含历史预测值的 predicate_xxx.data 文件。...在命令行中使用gnuplot快速查看数据 [4]. Gnuplot重定向fit输出 [5]. gnuplot常用技巧 [6]....在gnuplot中，绘制一些分段函数 [7]. gnuplot使用手册 [8]. shell脚本，awk实现跳过文件里面的空行。 [9]. AWK 打印匹配内容之后的指定行 [10].

    1.1K40

    GNUplot 5.4全平台安装包官方下载入口（含SSH远程绘图配置说明）

    ​一、软件简介GNUplot 是开源跨平台命令行绘图工具 ，支持 2D/3D 数据可视化、函数绘图、动态图表生成等功能，广泛应用于科研论文、工程数据分析等领域。.../configure && make && sudo make install四、基础功能验证测试1：绘制正弦函数gnuplot> set terminal pngcairo # 设置输出格式 gnuplot...> set output "sin.png" # 指定输出文件 gnuplot> plot sin(x) with lines # 生成正弦曲线测试2：数据文件可视化创建 data.dat 文件：# X...Y 1 22 53 84 6执行命令：gnuplot> plot 'data.dat' using 1:2 with points五、高级配置技巧1....set terminal svg enhanced background rgb "white" set output "chart.svg" replot七、延伸学习官方手册 提示：本文使用 GNUplot

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    「首席架构师精选」精选绘图软件

    绘图和绘图程序与图形用户界面，旨在产生公开准备的2D和3D绘图。此外，它还可以用作绘图模块。 图是一种表示数据集的图形技术，通常表示两个或多个变量之间的关系。...绘图可以用手工绘制，也可以用机械或电子绘图仪绘制。 精选绘图软件 ? ? ?...智能文本数据导入使用“导入文本表”菜单项打开保存在文本文件中的数据。自动识别列分隔符和十进制分隔符。...它包括用于创建脚本的实时编辑器，这些脚本将代码、输出和格式化的文本组合到一个可执行的记事本中。...此外，它还可以用作Python中的绘图模块。Veusz是多平台的，运行在Windows、Linux/Unix和macOS上。

    1.8K40

    4000字，25张精美交互图表，开启Plotly Express之旅

    最主要的是 Plotly 可以与 Pandas 数据类型 DataFrame 完美的结合，对于数据分析、可视化来说实在是太便捷了，而且是完全免费的，非常值得尝试 下面我们使用 Ployly 的几个内置数据集来进行相关图表绘制的演示...包括字段：纬度、经度、汽车小时数、高峰小时 carshare = px.data.carshare() carshare Output 内置调色板 Plotly 还拥有众多色彩高级的调色板，使得我们在绘制图表的时候不再为颜色搭配而烦恼...x="gdpPercap", y="lifeExp") Output 还可以通过参数 color 来区分不同的数据类别 px.scatter(gap2007, x="gdpPercap", y="...来指定当鼠标悬浮的时候，展示的信息 还可以根据数据集中不同的数据类型进行图表的拆分 px.scatter(gap2007, x="gdpPercap", y="lifeExp", color="continent...day", facet_col="time") Output 三维散点图 px.scatter_3d(election, x="Joly", y="Coderre", z="Bergeron", color

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    用 Python 画如此漂亮的专业插图 ？简直 So easy！

    如图所示（题目描述中的图在最后）：（以下图片均引用自 Thumbnail gallery ） 像这种普通的函数图象： plt.fill(x, y1, 'b', x, y2, 'r', alpha=0.3...显出你那高贵冷艳的X格，最重要的是只需一行代码就能搞定。从此再也不用忍受 Matlab以及GNUPlot 中那蛋疼的配色了。 想画 3D 数据？..., Y, Z, zdir='z', offset=-100, cmap=cm.coolwarm) cset = ax.contourf(X, Y, Z, zdir='x', offset=-40, cmap...下载安装后直接使用即可，它几乎预装了所有要用到的科学计算及可视化的库。 有盆友在评论里说希望能有完整的教程，确实就这个答案来说，离实际使用还有很大的距离，网上相关的中文资料也不多。...（没加误差棒）： 当我们用这一思想来思考该如何绘制插图时，就很容易实现自己的小想法，仿造甚至创造出理想的插图。

    94210

    如何在科研论文中画出漂亮的插图？

    如图所示（题目描述中的图在最后）： （以下图片均引用自 Thumbnail gallery ） 像这种普通的函数图象： ?...从此以后再也不用忍受 Matlab以及GNUPlot 中那蛋疼的配色了。 想画 3D 数据？没有问题 (不过用 mayavi 可能更方便一些)： ?...ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=8, cstride=8, alpha=0.3) cset = ax.contourf(X, Y, Z, zdir='z', offset...(X, Y, Z, zdir='y', offset=40, cmap=cm.coolwarm) 四行代码你就能拥有（后三行是画坐标平面上的等高线，严格的额说还是一行）。...下载安装后直接使用即可，它几乎预装了所有要用到的科学计算及可视化的库。 有盆友在评论里说希望能有完整的教程，确实就这个答案来说，离实际使用还有很大的距离，网上相关的中文资料也不多。

    1.2K21

    如何在科研论文中画出漂亮的插图？

    如图所示（题目描述中的图在最后）： （以下图片均引用自 Thumbnail gallery ） 像这种普通的函数图象： ?...从此以后再也不用忍受 Matlab以及GNUPlot 中那蛋疼的配色了。 想画 3D 数据？没有问题 (不过用 mayavi 可能更方便一些)： ?...ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=8, cstride=8, alpha=0.3) cset = ax.contourf(X, Y, Z, zdir='z', offset...(X, Y, Z, zdir='y', offset=40, cmap=cm.coolwarm) 四行代码你就能拥有（后三行是画坐标平面上的等高线，严格的额说还是一行）。...下载安装后直接使用即可，它几乎预装了所有要用到的科学计算及可视化的库。 有盆友在评论里说希望能有完整的教程，确实就这个答案来说，离实际使用还有很大的距离，网上相关的中文资料也不多。

    1.2K21

    OpenGL 3D 模型加载和渲染

    在使用 OpenGL 绘制时，我们最多绘制的是一些简单的图形，比如三角形、圆形、立方体等，因为这些图形的顶点数量不多，还是可以手动的写出那些顶点的，可要是绘制一些复杂图形该怎么办呢？...Obj 模型文件 obj 模型文件是众多 3D 模型文件中的一种，它的格式比较简单，本质上就是文本文件，只是格式固定了格式。...，加载过程中可以忽略 “v” 开头的行用于存放顶点坐标，后面三个数表示一个顶点的 x , y , z 坐标 如： 1v -0.052045 11.934561 -0.071060 "vt" 开头的行表示存放顶点纹理坐标...，后面三个数分别表示一个顶点的法向量在 x 轴，y 轴，z 轴上的分量。...每组数据中包含 3 个数值，用 / 分隔，依次表示顶点坐标数据索引、顶点纹理坐标数据索引、顶点法向量数据索引，注意这里都是指索引，而不是指具体数据，索引指向的是具体哪一行对应的坐标 如： 1f 1/10

    3.2K21

    SSD(Single Shot MultiBox Detector):绘制训练过程loss，accuracy曲线

    分析日志生成数据 caffe在tools/extra中自带日志分析工具， 在$ssd_root/tools/extra下执行（log文件名根据你的实际情况而定） ....修改gnuplot设置 在$ssd_root/tools/extra下执行 cp plot_log.gnuplot.example plot_log.gnuplot 绘制train loss单曲线 复制...plot_log.gnuplot.example的一个副本plot_log.gnuplot，在plot_log.gnuplot上修改，主要修改的是44行 下图是用rabbitvcs显示了修改前后的差异...y轴名称 set xlabel "Training iterations" set ylabel "Training loss" # 曲线绘制 title表示曲线名 # using 1:3 表示使用log-data.train...y轴名称 set xlabel "Training iterations" set ylabel "Training loss" # 曲线绘制 title表示曲线名 # using 1:3 表示使用log-data.train

    2.1K80

    查看博客园积分与排名趋势图的工具

    打开博客园积分与排名显示 这个就不消多说了，在博客园后台，选项->控件显示设置中，将积分与排名勾选并保存。 刷新页面后，可以在侧边栏看到自己博客的积分与排名: 2....使用 curl 在本地获取当天信息 为了获取当天的积分与排名，需要使用 curl 下载页面。...输出比较多，只看我们关心的部分 可以看到积分是在名为 liScore 的 html 元素中，排名是在 liRank，没有找到解析 html 的趁手命令，直接使用 grep + sed 搞起 curl...使用 gnuplot 绘制趋势图 有数据以后，就该通过图表呈现了，这个任务是通过 gnuplot 工具完成的。...参考 [1].WP 获取博客园积分，并以图表形式呈现变化趋势 [2].Ubuntu环境下使用gnuplot由数据表绘制曲线图 [3].利用 gnuplot 绘制时间序列图 [4].谈谈gnuplot（三十四

    79330

    一篇文章学会Matplotlib

    列表x和y分别包含水平和垂直坐标数据，并使用plt.plot()函数连接它们以绘制线条。添加标题、坐标轴标签和刻度标签可以提高图表可阅读性。...列表x和y包含水平和垂直坐标数据，而colors列表则定义了用于每个数据点的颜色。使用plt.scatter()函数确定样式参数（如点的大小和形状），以及通过alpha参数调整点的透明度。...plt.pie()函数用于绘制它，参数中包含数据列表’数据’和自动标签生成器’labels’。...Z = np.sin(np.sqrt(X**2 + Y**2)) # 根据X和Y数组生成Z数组 # 在3D坐标系中绘制3D曲面 ax.plot_surface(X, Y, Z, cmap=plt.cm.Blues...# 在第一个子图中绘制sin函数 ax1.plot(x, y1, 'r-', linewidth=2) #调用plot()函数，在第一个子图中绘制sin函数，使用以红色为基调的单匹配线条。

    10710

    基于Matlab的三维人脸识别系统开发

    然而在3D图像中，不存在像素信息，而是仅每个点的位置（x，y，z）可用。 最近开始研究FRGC2.0 3D人脸数据集，最初无法找到足够的资源来处理3D图像。...您可以使用每个范围像素的3D坐标，也可以丢弃X和Y图像，并仅关注Z值。请注意，图像的“纵横比”不必为1。...Despiking，填充孔和去噪 Despiking：3D面部噪声很大并且包含尖峰，因此需要应用平滑技术。在研究中，将2D加权中值滤波技术的概念扩展到3D人脸图像。...所研究的技术使用网格中值滤波的加权中值实现来执行3D数据集的过滤。 孔填充：去除尖钉会导致孔的形成，因此必须填充这些孔。为此使用了3D插值。在所有插值技术中，使用' 立方'。...如果要运行ICP算法，建议使用GPU。 完整的代码可以在GitHub存储库中找到。可以下载并使用它来预处理自己的3D面部数据集。

    1.8K30

    一键让「手绘图」变动画！AnT模型技术公开，手绘图变动画准确率提升10% | ICCV 2021

    与基于像素的视频跟踪方法需要大量注意力计算不同，AnT在线条图像中的线条封闭段上进行操作，并使用基于Transformer的架构来学习线条之间的空间和视觉关系。...由于缺少公开可用的数据集，论文中使用了两个自用数据： 1、合成数据集（Synthetic Dataset）：为了训练AmT的分段对应标签，研究人员使用免费的3D模型在Cinema4D数据集中生成一个合成数据集...使用TurboSquid的11个3D角色模型，以1500x1500像素的分辨率为每个角色生成1000帧，总共生成11000帧。...2、真实数据集（Real Dataset）：由于动画师不局限于3D程序的限制，所以手绘动画比3D动画更具多样性和表现力，并且手绘动画包含更广泛的动画样式和角色设计。...但对于视觉对应模型来说，它们并不能从3D程序的合成数据中训练。 为了解决这个问题，研究人员从17个不同的真实动画作品中收集了一个高分辨率手绘动画数据集，总共3578帧。

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