首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何使用LOOCV在R中找到比全集分类更好的子集

LOOCV(Leave-One-Out Cross-Validation)是一种交叉验证方法,用于评估机器学习模型的性能并选择最佳的特征子集。在R中,可以使用以下步骤来使用LOOCV找到比全集分类更好的子集:

  1. 导入所需的库和数据集:首先,导入必要的R库,如caretmlbench,并加载适当的数据集。
代码语言:txt
复制
library(caret)
library(mlbench)

data(Sonar)  # 以Sonar数据集为例
  1. 创建特征子集:根据问题的特定要求,选择一组可能的特征子集。可以使用caret库中的createFolds()函数将数据集分成k个折叠(k为特征子集的大小)。
代码语言:txt
复制
feature_set <- c("feature1", "feature2", "feature3")  # 替换为实际的特征名称

folds <- createFolds(1:nrow(Sonar), k = length(feature_set))
  1. 运行LOOCV:使用trainControl()函数设置交叉验证参数,并使用train()函数在每个特征子集上运行LOOCV。
代码语言:txt
复制
ctrl <- trainControl(method = "LOOCV")

results <- lapply(folds, function(fold) {
  train_data <- Sonar[-fold, feature_set]
  train_labels <- Sonar[-fold, "Class"]
  
  test_data <- Sonar[fold, feature_set]
  test_labels <- Sonar[fold, "Class"]
  
  model <- train(train_data, train_labels, method = "classification", trControl = ctrl)
  
  # 在测试集上进行预测
  predictions <- predict(model, test_data)
  
  # 计算预测准确率
  accuracy <- sum(predictions == test_labels) / length(test_labels)
  
  return(accuracy)
})
  1. 选择最佳特征子集:根据LOOCV的结果,选择具有最高准确率的特征子集。
代码语言:txt
复制
best_subset <- feature_set[which.max(results)]

在这个过程中,我们使用了caret库中的函数来实现LOOCV和模型训练。请注意,这只是一个示例,你需要根据你的具体问题和数据集进行适当的调整。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

特征选择常用算法

Selection ) ,是指从全部特征中选取一个特征子集,使构造出来的模型更好。...首先从特征全集中产生出一个特征子集,然后用评价函数对该特征子集进行评价,评价的结果与停止准则进行比较,若评价结果比停止准则好就停止,否则就继续产生下一组特征子集,继续进行特征选择。...(3) 双向搜索( BDS , Bidirectional Search )   算法描述:使用序列前向选择(SFS)从空集开始,同时使用序列后向选择(SBS)从全集开始搜索,当两者搜索到一个相同的特征子集...假设存在特征子集A和特征子集B,分类变量为C,若IG( C|A ) > IG( C|B ) ,则认为选用特征子集A的分类结果比B好,因此倾向于选用特征子集A。   ...(5)分类器错误率 (Classifier error rate ) 使用特定的分类器,用给定的特征子集对样本集进行分类,用分类的精度来衡量特征子集的好坏。

2.6K90

在Python和R中使用交叉验证方法提高模型性能

交叉验证的几种常用方法 验证集方法 留一法交叉验证(LOOCV) k折交叉验证 分层k折交叉验证 对抗验证 时间序列的交叉验证 自定义交叉验证技术 如何测量模型的偏差方差? 为什么模型会失去稳定性?...数据科学竞赛的一种常见做法是迭代各种模型以找到性能更好的模型。为了找到正确的答案,我们使用验证技术。 什么是交叉验证?...例如,在二进制分类问题中,每个类别包含50%的数据,最好安排数据,在每一折中每个类别包含大约一半的实例。 ? 当同时处理偏差和方差时,这通常是更好的方法。...标准偏差值低表明我们的模型在不同的训练数据子集下变化不大。 我们应该集中精力在偏差和方差之间取得平衡。可以通过减小方差并在一定程度上控制偏差来实现。这将获得更好的预测模型。...我们还研究了不同的交叉验证方法,例如验证集方法,LOOCV,k折交叉验证,分层k折等,然后介绍了每种方法在Python中的实现以及在Iris数据集上执行的R实现。

1.6K10
  • 【转载】特征选择常用算法综述

    Selection ) ,是指从全部特征中选取一个特征子集,使构造出来的模型更好。...首先从特征全集中产生出一个特征子集,然后用评价函数对该特征子集进行评价,评价的结果与停止准则进行比较,若评价结果比停止准则好就停止,否则就继续产生下一组特征子集,继续进行特征选择。...(3) 双向搜索( BDS , Bidirectional Search ) 算法描述:使用序列前向选择(SFS)从空集开始,同时使用序列后向选择(SBS)从全集开始搜索,当两者搜索到一个相同的特征子集...B,分类变量为C,若IG( C|A ) > IG( C|B ) ,则认为选用特征子集A的分类结果比B好,因此倾向于选用特征子集A。...(5)分类器错误率 (Classifier error rate ) 使用特定的分类器,用给定的特征子集对样本集进行分类,用分类的精度来衡量特征子集的好坏。

    89521

    FFPred-GAN:“以假乱真“—基于GAN创建合成特征样本改进蛋白质功能预测

    每个网络在完成其任务之前会变得越来越好,直到达到平衡为止,此时生成器无法生成更好的样本,而鉴别器无法检测到更多的合成样本。...最后,FFPred-GAN使用分类器两样本测试(CTST)选择最佳的合成训练蛋白特征样本,用于增强原始训练样本。在下游机器学习分类器训练阶段,预期最佳合成样本可得出更好的分类器,从而提高预测精度。...经过1,000次迭代的进一步训练后,FFPred-GAN提供了更好的LOOCV精度0.737。...FFPred-GAN增强的训练样本比SMOTE增强的训练样本具有更高的预测 准确性 作者还将FFPred-GAN与一种著名的数据增强方法SMOTE进行了比较,.使用SMOTE增强训练样本对SVM分类器进行训练...总的来说,FFPred-GAN增强的训练样本比SMOTE增强的训练样本具有更高的预测准确性,在CAFA 3目标上获得的分数也证实了FFPred-GAN增强训练样本在预测GO词的所有三个域方面具有更高的准确性

    1.2K50

    个性化大脑连接组指纹:它们在认知中的重要性

    使用数据驱动的方法,即没有事先的解剖或临床假设,我们使用深度学习来检测和测试我们的连接体动力学方法是否能够准确地识别一个人的身份,并且比单测量边权值或基于中心的方法具有更高的分类准确性。...更具体地说,与使用简单特征的人员识别模型相比,如WM区域到区域的连通性或区域中心度,使用我们的连接体动态特征的模型的分类性能平均比使用核心性、通信性或首次平均通过时间特征的模型高26%。...与使用区域间特征的模型相比,精确度提高了39%。        在考虑机器学习算法时,DL人识别模型比SV人识别模型平均高出18%。...最后,使用连接体动态特征的DL人识别模型比使用可沟通性特征的模型平均高出33%,比使用平均首个通过时间特征的模型平均高出24%。此外,使用连接体动态特征的DL人识别模型平均准确率为91%。...在随机连接体上重复LOOCV程序,平均绝对误差为22.1分(SD=11.8),平均相关系数为0.14 (R2 =0.02, SD =0.08)。

    69320

    中国台湾大学林轩田机器学习基石课程学习笔记15 -- Validation

    而后者使用的是独立于D的测试集,相当于新的考试题能更好地反映学生的真实水平,所以最小化E_{test}更加理想。 但是,我们拿到的一都是训练集D,测试集是拿不到的。...这是因为随着K的增大,D_{val}增大,但可供模型训练的D_{train}在减小,那得到的g_{m^*}^-不具有很好的泛化能力,即对应的E_{out}会增大,甚至当K增大到一定值时,比E_{in}模型更差...下图是分别使用E_{in}和E_{out}进行训练得到的分类曲线: 很明显可以看出,使用E_{in}发生了过拟合,而E_{loocv}分类效果更好,泛化能力强。...第二个问题是稳定性,例如对于二分类问题,取值只有0和1两种,预测本身存在不稳定的因素,那么对所有的E_{loocv}计算平均值可能会带来很大的数值跳动,稳定性不好。...先从如何选择一个好的模型开始切入,例如使用E_{in}、E_{test}都是不太好的,最终使用E_{val}来进行模型选择。然后详细介绍了Validation的过程。

    94000

    交叉验证的Java weka实现,并保存和重载模型

    1)k-folder cross-validation: k个子集,每个子集均做一次测试集,其余的作为训练集。...交叉验证重复k次,每次选择一个子集作为测试集,并将k次的平均交叉验证识别正确率作为结果。 优点:所有的样本都被作为了训练集和测试集,每个样本都被验证一次。10-folder通常被使用。...一般使用k=10 3)least-one-out cross-validation(loocv) 假设dataset中有n个样本,那LOOCV也就是n-CV,意思是每个样本单独作为一次测试集,...但LOOCV的缺点则是计算成本高,为需要建立的models数量与总样本数量相同,当总样本数量相当多时,LOOCV在实作上便有困难,除非每次训练model的速度很快,或是可以用平行化计算减少计算所需的时间...System.out.println(eval.toMatrixString());// 输出分类的混淆矩阵 Java调用weka实现算法,并保存模型,以及读取。

    95310

    浅谈关于特征选择算法与Relief的实现

    2) 如何做特征选择 特征选择,即是指从全部特征中选取一个特征子集,使得使构造出来的模型效果更好,推广能力更强。...如何做特征选择呢,如果要从全部特征中选择一个最优的子集,使得其在一定的评价标准下,在当前训练和测试数据上表现最好。 从这个层面上理解,特征选择可以看作三个问题: 1.  ...双向搜索( BDS , Bidirectional Search ) 算法描述:使用序列前向选择(SFS)从空集开始,同时使用序列后向选择(SBS)从全集开始搜索,当两者搜索到一个相同的特征子集C时停止搜索...在我们做模式分类算法时,可以根据自己的实际情况,采用关联性度量方法,这样能更好地和我们的分类方法相结合,通常能找到比较好的子集。...分类器错误率(Classifier error rate ) 使用特定的分类器,用给定的特征子集对样本集进行分类,用分类的精度来衡量特征子集的好坏。

    7.6K61

    魔术里的集合、映射和关系(二)——集合怎么用?

    集合的根本定义是某全集到bool集的映射,但发现这个定义竟然使用了概念自身,而有时候要表达的就是全集,或者压根就没考虑全集是什么。...描述法 例如:{x in R| 1 <= x <= 6} 就像给定函数定义域的限制条件那样限制一个集合真实的在全集中的范围,经常用来给函数划定定义域。...注意,以上两种描述写法的条件虽然写的一样,但有着本质的区别,2的描述法是为全集R内判断是否在该集合内给出了bool条件,而3是在2的描述的定义域基础上加上了函数关系构建的值域,哪怕函数很简单,甚至是个自反函数...我们生物里面的“界门纲目科属种”的分类就是典型的树状分类体系;NLP里面的文本分来也是去相对找到一种合理的多级树状体系,哪怕不可能用这个体系解决所有问题,也比没有好,而那些多粒度,多层次的表达交给bool...这比背下来要好得多也是人脑比计算机优势最大的地方,神经网络离我们还差得远。因为每天都会产生新的个体,而属性是可以万能判别,且在一定程度正确的。

    1.3K10

    交叉验证

    概述Holdout 交叉验证K-Fold 交叉验证Leave-P-Out 交叉验证总结 概述 交叉验证是在机器学习建立模型和验证模型参数时常用的办法。...))) #看下训练集和测试集的数据占比 print("训练集的条数(占比): {} (~{}%)".format(len(x_train), TRAIN_SPLIT*100)) print("测试集的条数...data:\n{}\n".format(x_train)) # print("Test data:\n{}".format(x_test)) 完整数据集的条数: 442 训练集的条数(占比): 309...交叉重复验证K次,每个子集都会作为测试集,对模型进行测试。 最终平均K次所得到的结果,最终得出一个单一的模型。 ? 假如我们有100个数据点,并且分成十次交叉验证。...= LeavePOut(p=P_VAL) #分别使用LOOCV和LPOCV来分割数据 split_loocv = loocv.split(data) split_lpocv = lpocv.split

    1.3K20

    《美团机器学习实践》第二章 特征工程

    概念 从数学角度讲,特征工程就是将原始数据空间变换到新的特征空间,或者说是换一种数据的表达方式,在新的特征空间中,模型能够更好地学习数据的规律。...对于分类问题,好的特征应该是在同一个类别中取值比较相似,而在不同类别中取值差异较大。...在穷举搜索的基础上加入了分支限界,若断定某些分支不可能搜索出比当前找到的最优解更优的解,则可以剪掉这些分支。 定向搜索。...与定向搜索类似,唯一的不同是不限制优先队列的长度。 启发式搜索。 序列向前选择。特征子集从空集开始,每次只加入一个特征,这是一种贪心算法。 序列向后选择。特征子集从全集开始,每次删除一个特征。...同时使用序列向前选择和向后选择,当两者搜索到相同的特征子集时停止。 增L去R选择算法。若算法从空集开始,每轮先添加L个特征,再删除R个特征;若算法由全集开始,则每轮先删除R个特征,再添加L个特征。

    67330

    Cerebral Cortex:额顶控制网络的网络间作用可以很好地预测记忆抑制能力

    这项技术可以缩小回归系数β,从而更好地预测未知样本。 对于预测分析,采用留一法(LOOCV)对预测精度进行保守估计。...在分析中使用LOOCV方法评估预测精度。然而,该方法会产生一些偏倚估计。因此,本文运用10折交叉验证(重复10次)来保守验证该估计。(4)外部泛化。...因为使用LOOCV去定义内部验证的模型框架,所以在每一轮交叉验证中获得不同的FC特征。保留在所有轮次中出现的FCs用于进一步分析。...当我们使用数据集1(S1’样本)中静息态数据的另一session来构建功能网络,结果表明在样本1中观测到的预测模型和网络特征同样显著预测个体MS,r=0.54,P在皮下层叶、突显/VAN和DAN形成一个正网络,表明这些网络间更高的连接预测更好的MS能力。

    62000

    股市温度计:个人投资者的“指标可视化”

    在通俗易懂这个方向上,我个人喜欢孟岩的诠释方法,他的“四笔钱”为普适投资开辟了通俗易懂的分类方法,他的“股市温度计”则为普通人指引了择时的简单标准。...我们可以在有知有行 APP 或者网站(youzhiyouxing.cn)中找到如下的“全市场温度”,前日股市大跌只有 1 度,昨日股市大涨到了 2 度。 如何理解1℃、2℃ ?...02\有知有行的”知行温度计“ 有知有行为它的”股市温度计“设置了几个关键尺度,简单的说:‍ 1、样本: 全市场温度计衡量全部上市公司,即样本是全集,而非经过筛选的子集。‍‍‍‍‍‍‍...任意一天的股市点数,基本都可以在 0~100℃ 的坐标轴中找到对应。‍‍‍‍...04‍—”股市温度计“背后的分区 我们常说“波士顿矩阵”比散点图更有意义,因为它增加了比较的基准(没有对比就没有分析)。同理,股市温度计虽好,但指导行为还需要进一步的分类,以及分类后的行动指南。

    20110

    基于 mlr 包的 K 最近邻算法介绍与实践(下)

    这证明了之前的观点,即模型在训练它们的数据上比在未见的数据上表现得更好。 1.1.3 计算混淆矩阵 为了更好地了解哪些实例被正确分类,哪些实例被错误分类,我们可以构造一个混淆矩阵。...1.2.2 如何选择重复次数 一种合理的方法是选择在计算上合理的多次重复,运行该过程几次,然后看看平均性能估计是否有很大差异,如果变化很大,应该增加重复的次数。...如何选择参数 k 来优化 KNN 模型 在 KNN 算法中, k 属于超参数,即可以控制模型预测效果的变量或选项,不能由数据进行估计得到。...mlr 包中的函数实现 KNN 算法外, R 语言中还有 knn 或 kknn 函数也可实现 k 近邻分类和有权重的 k 近邻分类,相关的函数用法读者们可参考 R 中的帮助说明。...当然,你也可以使用最新的mlr3 包进行实践。下期小编将介绍机器学习中基于概率的分类算法: 逻辑回归。

    1.2K41

    Cerebral Cortex:从任务态和静息态脑功能连接预测儿童数学技能

    在这里,我们使用CPM测试在符号和非符号数字比较期间以及在休息期间的功能连通性是否预测儿童在扫描仪之外的数学技能。...更好的数学技能与更好的阅读技能和更高的全面智商相关。更好的阅读技能也与更高的全面智商和在所有三项任务中更少的扫描内运动有关。三项任务的扫描内运动呈正相关。...需要强调的是,由于每个孩子都是在不同的LOOCV轮中被拉出来的参与者,预测每个孩子复合数学技能的确切联系可能是不同的。...这导致了每个模型的一组一致的连接。请注意,这些连接是跨每个LOOCV轮标识的连接的子集,选择这些连接是为了进行说明。...理想情况下是在个体差异出现之前。5 结论我们的研究结果表明,分布在整个大脑中的较弱的功能连接,以及与数学相关的关键大脑区域和与一般领域大脑区域之间较弱的连接,预示着儿童的数学技能更好。

    48720

    解读吴恩达新书的全球第一帖 (中)

    大神对偏差方差的定义为: 偏差是模型在训练集上的误差 方差是模型在开发集和训练集上的误差的差别 咋一看,这是什么定义?所以说我们脑洞不够大,比不了大神。...方法 2 在减小偏差时会增大方差,正则化一般不会单独使用。 方法 3-6 都是直接减小训练误差,因而会同时减少偏差和方差。注意的是方法 6 更好的神经网络架构通常很难找到。...---- 在两种情况下绘制学习曲线会遇到问题。假设全集有 100 个数据,选取 10 个子集,分别包含 10, 20, 30 到 100 个数据点,在每个子集上训练模型,计算训练误差并画图。...很有可能随机选的 10 个数据点并不能反映全集的类别比,比如这10 个数据点都是正类。 对这两个问题,大神也给了解决方案 (都是在取样上做文章)。...方案二:选取子集时,尽量使得其类别比例和全集的类别比例一致。 当数据很多时而且类别比较平衡时,可以忽略上述两个问题。 最后当数据很多时,绘制学习曲线会很耗时,因为会选取不同子集来训练模型。

    39240

    【机器学习】在【R语言】中的应用:结合【PostgreSQL数据库】的【金融行业信用评分模型】构建

    本文将详细介绍如何使用R语言结合PostgreSQL数据库,基于公开数据集构建一个信用评分模型。...1.数据库和数据集的选择 本次分析将使用Kaggle上的德国信用数据集(German Credit Data),并将其存储在PostgreSQL数据库中。...,交替使用每个子集作为验证集,其余子集作为训练集,从而全面评估模型性能。...具体方法: 1.K折交叉验证: 将数据分为K个子集,交替使用每个子集作为验证集。常用的K值包括5和10。...集成学习通过组合多个模型的预测结果,通常能获得比单一模型更好的性能。 具体方法: 1.投票法: 对于分类问题,使用简单多数投票法融合多个模型的预测结果。

    16510

    算法模型自动超参数优化方法!

    : 一个estimator(回归器 or 分类器) 一个参数空间 一个搜索或采样方法来获得候选参数集合 一个交叉验证机制 一个评分函数 Scikit-Learn中的超参数优化方法 在机器学习模型中,比如随机森林中决策树的个数...简单的说,就是考虑了上一次参数的信息,从而更好的调整当前的参数。...贝叶斯调参针对非凸问题依然稳健;网格搜索针对非凸问题易得到局部最优 贝叶斯优化提供了一个优雅的框架来尽可能少的步骤中找到全局最小值。...这意味着在优化过程中,我们使用选定的超参数值训练模型并预测目标特征,然后评估预测误差并将其返回给优化器。优化器将决定要检查哪些值并再次迭代。你将在一个实际例子中学习如何创建一个目标函数。...mutation_rate – 出现属性值随机更改的概率(包括新参数的方法,在初始群体中可能不可用) crossover_rate –用于创造后代的个体所占的百分比 使用这个迭代过程,我们选出最佳配置。

    3.1K20

    《揭秘机器学习中的交叉验证:模型评估的基石》

    精准筛选最优模型 当面对多个模型或同一模型的不同参数组合时,如何选择最优选项?交叉验证提供了客观的评估标准。...在每次迭代中,选取一个子集作为验证集,其余K - 1个子集合并作为训练集;模型在训练集上进行训练,然后在验证集上测试其性能,记录相关指标,如准确率、召回率、均方误差等;重复上述过程,直到每个子集都作为验证集被使用一次...分层交叉验证 分层交叉验证主要应用于分类任务,特别是在类别不平衡的数据集中表现出色。其特点是在划分数据子集时,确保每个子集中各类别的比例与原始数据集的类别分布一致。...例如,在一个正负样本比例为9:1的二分类问题中,普通K折交叉验证可能会出现某个子集中全部或几乎全部是正样本的情况,这会误导模型评估,而分层交叉验证则能有效规避此类问题,保证每个子集中都有合理的类别分布,...具体来说,外层将数据分成多个折,每个折作为验证集,剩余部分作为训练集;而在每个外层折的训练集中,又使用内层交叉验证进行超参数搜索,找到在该训练集上表现最佳的超参数组合,然后用这个超参数配置的模型在外层验证集上进行测试

    14610

    R语言泰坦尼克号随机森林模型案例数据分析|附代码数据

    p=4281 最近我们被客户要求撰写关于随机森林模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。 如果我们对所有这些模型的结果进行平均,我们有时可以从它们的组合中找到比任何单个部分更好的模型。...第一个技巧是使用套袋。Bagging会对您的训练集中的行进行随机抽样。使用样本函数很容易在R中进行模拟。假设我们想在10行的训练集上进行装袋。...随机森林不是查看整个可用变量池,而是仅采用它们的一部分,通常是可用数量的平方根。在我们的例子中,我们有10个变量,因此使用三个变量的子集是合理的。...R的随机森林算法对我们的决策树没有一些限制。我们必须清理数据集中的缺失值。rpart它有一个很大的优点,它可以在遇到一个NA值时使用替代变量。在我们的数据集中,缺少很多年龄值。...此子集是否缺少值。我们现在也想使用method="anova"决策树的版本,因为我们不是要再预测某个类别,而是连续变量。

    76000
    领券