欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法，那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」，小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用...将图例大小设为 5，位置设置为右上角 guides(color = guide_legend(override.aes = list(size = 5))) + theme_bw() + # # 设置图的主题为白色背景...# 设置图的主题样式，包括边框、网格线、背景等 theme(panel.border = element_rect(colour = "black", fill = NA, size = 0.5
如何将下图中的左图（低配版）转化为右图（高配版， x，y 轴分离）。 低配版条形图 首先，构造一个数据集作为样例，读者可以根据自己的数据进行调整即可。假设 y 是分类变量，x 是连续型变量。...高配版条形图 使用 geom_rangeframe()将 x,y 轴分离。...在此之前，创建一个新的数据框，根据你的 x 值，手动划分 x 轴尺度范围。...注意：这里将柱子按照类别进行填充，当然你也可以使用另一个变量进行填充（下面会给例子）。...推文以条形图作为例子进行详细讲解（试图教会你们）。当然这种技巧也可以使用其他图形中。读者如有需求，可以自行探索。
学画图~R语言ggplot2画散点图 2 跟着Nature microbiology学画图~ggplot2散点图添加分组边界 跟着Nature microbiology学画图~ggplot2散点图添加分组边界...学画图~R语言ggplot2画柱形图 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2画柱形图 6 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2画直方图...microbiology学画图~R语言ggtree展示进化树 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggtree展示进化树 10 跟着Nature microbiology学画图~箱线图放到频率分布直方图的右上角...跟着Nature microbiology学画图~箱线图放到频率分布直方图的右上角 11 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2画网络图的一个简单小例子 跟着Nature...microbiology学画图~R语言ggplot2画网络图的一个简单小例子
ggplot2很强大，能够创建各种各样的信息图。可惜，强大也带来了复杂性。不像其他的R包，ggplot2凭借其自身就可以被认为一种综合图形编程语言。...图2，线性拟合结果图 ? 图3，“分组”示例图 ? 了解了ggplot2的基本语法之后，我们首先介绍几何函数及其能够创建的图形类型，然后详细了解函数aes()，以及如何利用它来对数据进行分组。...最后，将研究如何调整ggplot2图形的外观，包括修改坐标轴和图例、改变配色方案以及添加注释。...分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。...在基础图形中可以实现的图形“组合”在ggplot2中自然也不是难事，可以使用函数facet_wrap()和函数facet_grid()创建。
绘图系统 ggplot2初识 更多下期详解 引言 不同类型变量常用的图表 连续数值变量 一个数值变量可以用：柱状图，点图，箱图 两个数值变量可以用：散点图 分类变量 一个分类变量的可视化：频率表，条形图...两个分类变量的可视化：关联表，相对频率表，分段条形图 一个分类变量一个数值变量： 分类箱图、条形图 1 Lattice绘图系统 特点：一次成图；适用于关系变量间的交互：在变量z的不同水平，变量y如何随变量...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数，因此需要将图形存储到对象中，然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法，将第一幅图放置到第二幅图的上面...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离，然后按图层叠加的方式作图，通过+进行叠加。...Facet就是控制分组绘图的方法和排列形式。
ggplot2 初探 在ggplot2中，图是采用串联起来（+）号函数创建的。每个函数修改属于自己的部分。...对于每个声部身高范围上的得分分布，小提琴图展示了更多视觉线索。 接下来我们将使用几何函数创建广泛的图表类型。让我们从分组开始吧——在一个图中展示多个分组观察值。...我们可以使用facet_wrap()函数和facet_grid()函数创建网格图形（在ggplot2中也称为刻面图）。下表给出了相关的语法，var,rowvar,colvar是因子。...将多个ggplot2包的图形放到单个图形中最简单的方式是使用gridExtra包中的grid.arrange()函数。我们需要事先安装这个包。 让我们创建3个ggplot2图并把它放在单个图形中。...multiple pic.png 注意截面图（刻面图）和多重图的区别。 保存图形 可以使用标准方法来保存创建的图形，也可以使用ggsave()函数更方便保存它们。
结果提示虽然吸烟者肺细胞中的突变频率更高，但是当吸烟量累积到一定量时，DNA突变率增加趋于平稳，这使重度吸烟者的突变频率与轻度吸烟者没有显著差异，限制了肺部细胞的突变积累，从而降低肺癌风险。...使用CellTypist（由作者设计的自动化细胞分类工具）分配细胞身份,深入的数据分析揭示了有关免疫系统如何适应在不同器官环境中有效起作用的见解。...Github：https://github.com/requarks/wiki 15、 ggplot2语法的韦恩图绘制R包-ggvenn[10] 韦恩图可以用来展示各个数据集直接的重叠关系，ggvenn...16、UpSetR - 一个产生静态UpSet图的R包 UpSetR产生静态的UpSet图形，这UpSet技术可根据分组和查询的集合交叉点进行可视化，有效的展示相关数据统计信息。...utm_source=wechat_session&utm_medium=social&utm_oi=841811531518836736 [10] ggplot2语法的韦恩图绘制R包-ggvenn:
录制了视频介绍了使用R语言的ggplot2包做常用的数据可视化的10个小例子，以下内容都公布在了B站和自己的公众号。...image.png 3 20分钟掌握如何使用R语言绘制火山图~数据代码公开 时长 20分51秒 https://www.bilibili.com/video/BV185411j7GY...4 R语言ggplot2做柱形图的简单小例子~数据代码公开 时长 15分18秒 https://www.bilibili.com/video/BV1M541147sD ?...image.png 8 R语言ggplot2频率分布直方图的简单小例子 时长 13分 28秒 https://www.bilibili.com/video/BV1Ua411w7uQ ?...image.png 10 ggplot2散点图分组添加拟合曲线~数据代码全公开 时长 14分18秒 https://www.bilibili.com/video/BV1Ci4y137p3 ?
p=24925 Kolmogorov-Smirnov是比较一个频率分布f(x)与理论分布g(x)或者两个观测值分布的检验方法。其原假设H0:两个数据分布一致或者数据符合理论分布。...优点：该检验不依赖于要测试的累积分布函数，相比于卡方拟合检验（卡方检验需要50个以上的样本），不需要大量的样本。...使用ggplot2和基础R绘图的例子 require(ggplot2) # 模拟两个分布 - 您的数据放在这里！...norm(10000, 10, 5) dat <- data.frame # 创建数据的 ECDF cdf1 <- ecdf cdf2 <- ecdf # 找到最小和最大统计数据以在距离最大的点之间画线...ecdf的标准R图 #plot #lines ## 替代，向下到 x 轴 #segments
前面我们在人工智能大模型不会告诉你的热图绘制技巧 演示了如何使用ggplot2热图扩展包（ggalign），可以快速替代之前的 pheatmap： 比如我们可以先去geo数据库里面下载 GSE104171...它使你能够使用熟悉的 ggplot2 语法创建复杂热图。...使用以下自定义布局： align_group()：将布局轴分组到具有组变量的面板中。 align_kmeans()：通过 kmeans 将布局轴分组到面板中。...基本示例 下面，我们将通过一个基本示例，展示如何使用 ggalign 创建带有 dendrogram 的热图。...你可以无缝使用任何 ggplot2 geoms、stats 和 scales 来构建复杂布局，包括垂直或水平排列的多个热图。
ggpubr-一键绘制出版级论文配图 在和学员交流问题的时候，很多刚入门的同学都在咨询， 如何能让自己绘制的图形快速符合论文出版需求，而不是花费时间去设置图层属性？...安装 在R中安装ggpubr可以使用以下命令： install.packages("ggpubr") 主要特点 ggpubr是一个基于ggplot2的扩展，因此它继承了ggplot2的所有功能，并添加了更多的实用功能和自定义选项...ggpubr提供了一系列简单易用的函数，使用户能够快速创建各种常见的统计图形，如线图、散点图、柱状图、箱线图、直方图、小提琴图、QQ图、核密度图、热力图和配对图等。...ggbarplot()：创建柱状图，用于展示不同组别之间的比较。可以设置分组、堆叠和分面。 ggboxplot()：创建箱线图，用于展示不同组别之间的分布差异。支持分组、分面和添加自定义标记。...支持分组、分面和添加自定义标记。 ggqqplot()：创建QQ图，用于检验数据是否符合正态分布。支持添加参考线和自定义颜色。 ggdensity()：创建核密度图，用于展示单一变量的分布情况。
Pandas是Python数据分析处理的核心第三方库，它使用二维数组形式，类似Excel表格，并封装了很多实用的函数方法，让你可以轻松地对数据集进行各种操作。...这里列举下Pandas中常用的函数和方法，方便大家查询使用。...按照指定的行列重塑表格 pivot_table：数据透视表，类似excel中的透视表 cut：将一组数据分割成离散的区间，适合将数值进行分类 qcut：和cut作用一样，不过它是将数值等间距分割 crosstab：创建交叉表...，用于计算两个或多个因子之间的频率 join：通过索引合并两个dataframe stack: 将数据框的列“堆叠”为一个层次化的Series unstack: 将层次化的Series转换回数据框形式...last：获取分组中的第一个和最后一个元素 nunique：计算分组中唯一值的数量 cumsum、cummin、cummax、cumprod：计算分组的累积和、最小值、最大值、累积乘积 数据清洗 dropna
最近有粉丝 提问到如何从表达量差异分析后的某个基因或者蛋白质或者其它元素在两个分组的差异情况的箱线图到其相关的一系列统计指标表，出处是2023年4月的一个文章：《Saliva biopsy: Detecting...因此，选择哪种测试或预测模型，以及如何设定阈值，往往需要根据具体的应用场景和接受的错误类型进行决定。...这个示例使用了pROC包进行ROC分析和绘图，使用ggplot2包进行箱线图的绘制。注意，这只是一个示例，实际的分析可能需要根据你的数据和问题进行调整。...# 安装必要的包 install.packages(c("pROC", "ggplot2")) # 加载必要的包 library(pROC) library(ggplot2) # 假设我们有一个数据框...如果不学统计学，那么你就不可能看懂下面这图，生物信息学领域耳熟能详的生存分析，主成分分析，差异分析你都无法理解。
该过程分为两步： 处理 1 ：图形切割后，切割图形重分组。 处理 2 ：重分组后，非闭合图形，闭合处理。 切割图形重分组算法 检查组内不同经度300度以上的坐标，作为极端值，然后对数据进行平均 。...然后分别对极端值分组标号为一组，将低于300的坐标作为一组。 闭合曲线 分别计算世界点图每个航线的起始点 终点，和航线的曲线数据 ....最后使用ggplot函数进行绘制。...：如何、创建具有精美动画的图 2.R语言生存分析可视化分析 3.Python数据可视化-seaborn Iris鸢尾花数据 4.r语言对布丰投针（蒲丰投针）实验进行模拟和动态 5.R语言生存分析数据分析可视化案例...6.r语言数据可视化分析案例：探索brfss数据数据分析 7.R语言动态可视化：制作历史全球平均温度的累积动态折线图动画gif视频图 8.R语言高维数据的主成分pca、 t-SNE算法降维与可视化分析案例报告
我比较喜欢ggplot2+AI 来做科研绘图， 当然，有高手可以独立使用ggplot2调整全部图表细节，完全不使用AI。...✦ 统计转换（Statistical trassformations, stats）是对数据进行某种汇总，例如将数据分组创建直方图，或将一个二维的关系用线性模型进行解释。...✦ 分面（faceting）如何将数据分解为子集，以及如何对子集作图并展示。 ✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。...ggplot2 Scatterplot 这个教程侧重于8个单元： 展现单个连续变量：散点图，折线图，气泡图 进阶条形图：区域图 展现排序：棒棒糖图 展现连续变量的统计分布：条形图，箱线图，小提琴图，峰峦图...用谷歌搜索来使用ggplot2做可视化（上）：https://mp.weixin.qq.com/s/WN4TSMNjH4b6vZgYVjaRvQ 用谷歌搜索来使用ggplot2做可视化（下）：https
小提琴图是通过使用密度曲线描述一组或多组的数值数据分布。每条曲线的宽度对应于各区域数据点的近似频率。...par(mfrow=c(3, 1)) #一个图版显示3行,1列 vioplot(price ~ cut, data = diamonds, las = 2, col = palette) #根据cut分组展示...=position_dodge(0.8))+ #绘制箱线图 scale_fill_viridis(discrete=TRUE) + #生成一个离散的调色板 theme_ipsum() + #使用...theme( legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用...ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法，这个函数可以用来表示假设的正态分布和置信区间。
为了更深入地了解数据，我们还可以绘制按性别分组的年龄分布图。...# 按性别分组的年龄分布图 ggplot(data, aes(x=age, fill=gender)) + geom_histogram(binwidth=1, position="dodge"...x="Age", y="Count") + theme_minimal() + theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) 按恋爱状态分组的社交活动频率分布图...最后，我们绘制按恋爱状态分组的社交活动频率分布图，以了解不同恋爱状态学生的社交活动频率。...# 按恋爱状态分组的社交活动频率分布图 ggplot(data, aes(x=social_activity, fill=love_status)) + geom_bar(position="dodge
一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 带图例的堆叠柱状图2.4 带图例的分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图...3.3 堆积百分比柱状图3.4 分组柱状图四、讨论一、前言柱状图又称条形图，在统计分析中的使用频率最高，也是众多小白入门R最早绘制的可视化图形。...#353436")) #图例legend("topright",legend = c("Group 1","Group 2"),fill = c("#1b98e0", "#353436"))图片2.4 带图例的分组柱状图...") library("ggplot2") #构建数据框group 分组柱状图将刚刚初阶的分组柱状图设置为水平即可
使用ggplot2进行数据可视化② 添加其他变量的一种方法是aesthetics。 另一种对分类变量特别有用的方法是将绘图分割为多个子图，每个子图显示一个数据子集。...每个图使用不同的可视对象来表示数据。 在ggplot2语法中，我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...例如，条形图使用条形图，折线图使用线条图，箱形图使用箱形图格栅等。 散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述，您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。...请注意，此图包含同一图表中的两个geom！我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。...许多geom，如geom_smooth（），使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms，您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。
From PLoS ONE 5(1): e8694 (2010) ggalluvial是一个基于ggplot2的扩展包，专门用于快速绘制冲击图(alluvial diagram)，有些人也叫它桑基图(...具体参考说明：data设置数据源，axis设置显示的柱，weight为数值，geom_alluvium为冲击图组间面积连接并按生存率比填充分组，geom_stratum()每种有柱状图，geom_text...展示性别与舱位和年龄的关系及存活率比例 我们发现上图居然画的是宽表格模式下的数据，而通常ggplot2处理都是长表格模式，如何转换呢？...to_loades转换为长表格 产生和上图一样的图，只是数据源格式不同。 2. 输入数据格式 定义一种Alluvial宽表格 查看性别与专业间关系，并按录取情况分组 3....长表格数据 主要列说明： x, 主要的分类，即X轴上每个柱 stratum, 主要分类中的分组 alluvium, 连接图的索引 5.
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