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关于r包安装到哪里了以及如何看自己的r包数量

但是绝大部分小伙伴都是在中国大陆地区,因为有个别r包依赖于几十个其它包,比如这个大名鼎鼎的clusterProfiler,如果你网络不好,很有可能它本来是可以自动安装各种依赖的因为网络问题终止。...这个时候你需要单独的安装它缺失的依赖包即可,比如如果你的报错告诉你你缺 GO.db,它是一个R包,你只需要装它,仿写你运行的脚本里面BiocManager开头的代码,把引号里面的词换成GO.db就行。...r的包的安装路径都是在C盘,其实是可以调整为D盘或者其它,当然了,如果是mac电脑就万事大吉了。...在不同的会话中使用不同的包安装路径: 在Linux运行环境里面使用 R 中,每次启动都是一个新的会话。可以通过在启动脚本或命令行中设置 .libPaths() 来在不同的会话中使用不同的包安装路径。...这些技巧可以帮助你更灵活地管理和配置 R 包的安装路径,特别是在需要在多个项目或环境中使用不同的包集时。

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AI 技术讲座精选:如何创建 R 包并将其发布在 CRAN GitHub 上?

它受欢迎的主要原因就是数据科学社区 R 语言使用者的不断贡献和支持。他们贡献的包形成了 R 编程语言的基础。 虽然大家在社区内共享了许多关于如何使用 R 解决问题的教程,但是却较少关注开源的发展。...通过这张介绍 R 中最常使用的程序包库的信息图,你可以明白 R 包的重要性: ? 2. 我开始创建 R 包的原因是? 之前在一个 Analytics Vidhya 竞赛中,我试图集成多个模型。...因此,我创建了一个名为 ensembleR 的包,你可以在 CRAN 上找到它。这个包使人们能够在 R 中创建多个模型的集成。...你可在此找到关于如何使用此包的更多信息:https://cran.r-project.org/web/packages/ensembleR/vignettes/Introduction_to_ensembleR.html...创建 R 包的过程既有趣又富有挑战性,尤其是在首次创建时。我开始学的是创建包的基本结构和流程。 当我编码完包后,我就学会了如何将它发布在 CRAN 上共享给其他社区成员。

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    在Python里面如何达到R的gplots包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果

    在 R 编程语言中,使用 table() 函数可以创建列联表(contingency table),也称为频数表或交叉表。列联表用于显示两个或多个分类变量之间的关系,它显示了每个组合的计数(频数)。...我们做单细胞转录组数据分析的时候尤其是喜欢使用这个函数,比如我们的多个样品整合后细分到亚群,然后在R的gplots包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果如下所示: R的gplots...包的balloonplot函数对table后的列联表的可视化效果 从上面的列联表可以看到06的这个样品其实是有点惨淡,它整体就细胞数量偏少。...当然了,上面的是绝对数量的展现,也可以展现细胞比例,那个是后话。...目前学员们感兴趣的如何在Python编程语言里面实现这个过程,首先是需要把R里面的数据导出来: load('phe.Rdata') colnames(phe) write.csv(phe[,c(1,16

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    SAS or R:谁更适合你?(四)

    引用最广泛的TIOBE世界编程语言排行榜的三月榜单中,R排名第16,并且保持上升的趋势,而SAS排名为第21。 图:R在编程语言中的排名 ? ? 哪 里可以找到支持?...当你不知道要选哪个包时候,果断选vignette最多的以及托管在github上的 ” 其实,大猫写这段的目的不是比较两种语言的support孰优孰劣,而是告诉大家在选择语言的时候,一定要选择well supported...遇到问题,我们又可以去哪里找帮助呢? 1) 官方文档 常常见到很多初学者在论坛里求教:xx问题怎么办?在线等!这时老鸟一般都拽拽地给出一个关键词,然后说“自己去manual”里找。...说其负责任,因为的确所有问题都可以从manual里找到答案,而且manual里面讲的是最清楚的。说其不负责任,因为对于菜鸟而言,基本操作都还不会,怎么看得懂如此深奥晦涩的manual呢?...会暂告一段落,大猫会继续向小伙伴们介绍data.table的使用技巧,不出意外的话应该是讲如何在data.table中进行分组回归,这是一个非常常用并且小伙伴们在公众号后台中多次提到的需求,敬请期待哦。

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    Apache配置压缩优化时报错——undefined symbol: inflateEnd

    3、接着我在google下面找到了以前也遇到过相似问题的人,他们是在apr的主配置文件apr-1-config(老版本可能是apr-conf)里面将LDFLAGS="" 修改为 LDFLAGS="-lz...每安装一个包都几乎一定的会在安装目录里建立一个lib目录。如果明明安装了某个包,而安装另一个包时,它愣是说找不到,可以抒那个包的lib路径加入的LDFALGS中试一下。...LIBS:告诉链接器要链接哪些库文件,如LIBS = -lpthread -liconv 简单地说,LDFLAGS是告诉链接器从哪里寻找库文件,而LIBS是告诉链接器要链接哪些库文件。...有时候LDFLAGS指定-L虽然能让链接器找到库进行链接,但是运行时链接器却找不到这个库,如果要让软件运行时库文件的路径也得到扩展,那么我们需要增加这两个库给"-Wl,R": LDFLAGS = -L/...var/xxx/lib -L/opt/mysql/lib -Wl,R/var/xxx/lib -Wl,R/opt/mysql/lib 如果在执行.

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    详解Python虚拟环境的原理及使用

    在没有管理员权限的主机上安装软件包。 只需要一个项目,无需在系统范围内安装软件包,就能保持全局site-packages /目录整洁。 听起来很方便,不是吗?...在虚拟环境中,我们无法访问系统范围的站点包,并且无法在虚拟环境之外访问安装包。...虚拟环境如何做到这一点? 想了解更多有关虚拟环境的信息吗?比如,活动环境如何使用正确的Python解释程序并如何找到合适的第三方库?...echo $ PATH 这一切都归结为PATH的价值,它告诉shell使用什么Python实例以及在哪里寻找网站包。在基础shell中,PATH看起来或多或少是这样表现的。...Python实例: (venv) % which python3 ~/test-project/venv/bin/python3 在哪里可以找到项目的本地站点包?

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    2012年08月16日 Go生态洞察:优雅的代码组织之道

    那么,如何做到这一点呢?让我们一探究竟。 正文 选择好的名称 在Go中,一个好的名称起着至关重要的作用。不仅影响你对代码的思考,还关系到如何与其他开发者沟通。...让我们来看看如何选择好的包名和导出标识符,以及这对于编写可维护代码的重要性。 命名的艺术 选择一个好的包名是一门艺术。例如,标准库中的bytes包导出了Buffer类型。...gofmt命令的-r标志提供了语法感知搜索和替换,使得大规模重构更为简单。 选择一个好的导入路径 导入路径对于Go包的用户来说就像是地址。它告诉用户从哪里可以找到包的源代码。...main包通常比其他包要大,因为它包含了很多只有在可执行文件上下文中才有用的代码。 文档你的代码 好的文档是代码可用性和可维护性的关键。阅读关于如何编写好的文档注释的指南,并将其应用于你的代码中。...总结 在本文中,我们探讨了Go语言的代码组织技巧,从命名到打包,再到最小化接口和编写文档。通过深入这些实践,我们可以写出更清晰、更可维护、更高效的Go代码。

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    数据科学家:站在大数据金字塔尖的人

    1、Airbnb 在Airbnb,工程师要解决这样一个问题:如何让用户了解一个自己从来没去过的地方?如何知道哪个地方最适合自己的旅行?...,Airbnb的「location relevance model」会通过Airbnb社区告诉未来的客人哪里是更好的住宿地。...下一步,这张图甚至可以预测,这样车主会知道提前去哪里等待可以载到更多的乘客。 数据科学家的由来和定义 虽然数据科学三十年前就诞生了,但是数据科学家却是几年前刚出现的一个新词。...该角色的工作是变化多样的:在任意给定的一天,团队的一个成员可以用Python实现一个多阶段的处理管道流、设计假设检验、用工具R在数据样本上执行回归测试、在Hadoop上为数据密集型产品或服务设计和实现算法...此外,它还具备称为CRAN(The Comprehensive R Archive Network)的包扩展机制,通过导入扩展包就可以使用标准状态下所不支持的函数和数据集。

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    谁站在大数据金字塔的塔尖?

    1、Airbnb 在Airbnb,工程师要解决这样一个问题:如何让用户了解一个自己从来没去过的地方?如何知道哪个地方最适合自己的旅行?...的「location relevance model」会通过Airbnb社区告诉未来的客人哪里是更好的住宿地。...下一步,这张图甚至可以预测,这样车主会知道提前去哪里等待可以载到更多的乘客。 数据科学家的由来和定义 虽然数据科学三十年前就诞生了,但是数据科学家却是几年前刚出现的一个新词。...该角色的工作是变化多样的:在任意给定的一天,团队的一个成员可以用Python实现一个多阶段的处理管道流、设计假设检验、用工具R在数据样本上执行回归测试、在Hadoop上为数据密集型产品或服务设计和实现算法...此外,它还具备称为CRAN(The Comprehensive R Archive Network)的包扩展机制,通过导入扩展包就可以使用标准状态下所不支持的函数和数据集。

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    Python编程遇问题,文科生怎么办?

    例如说,你打算用决策树做分类,于是找到了我这篇《贷还是不贷:如何用Python和机器学习帮你决策?》,开始实践,重现结果。 前面还好,一直很顺利。你的信心在逐渐积累。...方法其实并不难,只需要加上必要的路径,让电脑知道dot这个命令在哪里,就可以了。...这个时候似乎手头没有葫芦可以照着画,你得自己找葫芦。 例如读完了我那篇《如何用Python做词云?》后,有读者在微信公众号后台留言,询问我如何在绘制词云的时候,把词云变成需要的形状。 ?...我也曾经把思维导图秒变成幻灯的代码发布在github上面。右上方几个统计数字很重要,尤其是Star,说明了该项目受欢迎程度。wordcloud软件包的受欢迎数字超过3000,可以说是非常棒的。...对于“找葫芦画瓢”类场景,方法如下: 依照类似的功能,按图索骥找到提供相应功能的软件包。 阅读其官方说明文档,最好能找到特定功能的样例代码。

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    Joe主题使用海报插件

    接着,在指定的PHP文件中添加一个挂载点,以便插件知道在哪里生成海报。完成这些步骤后,就可以在Joe主题中使用ArticlePoster插件生成文章海报了。...ArticlePoster是一款非常实用的文章海报插件,它可以帮助你轻松地生成具有吸引力的文章海报。这篇文章将会详细地指导你如何在Joe主题中使用这款插件。...一、下载、安装并启用插件 首先,你需要访问ArticlePoster,下载Joe专版插件的安装包。下载完成后,将插件上传到你的服务器的/usr/themes目录,并解压。...二、在指定位置添加挂载点 接下来,你需要在/usr/themes/Joe/public/handle.php文件的指定位置添加一个挂载点。挂载点的作用是让文章海报插件知道在哪里生成海报。...$this->cid是当前文章的ID,用于告诉插件生成哪篇文章的海报。 完成以上步骤后,你就可以在Joe主题中使用ArticlePoster插件生成文章海报了。

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    怕死秃头工作站???

    故事背景 一个同学,告诉我,我之前写的程序,运行不出来了…… ? 我一头雾水,什么情况,我写的有bug?...链接:如何在RStudio进行python编程 是我去年介绍Rstudio运行Python的文章,我赶快运行一遍。...于是,我将我之前写的示例代码,在Rstudio中运行了一遍,同样报错!python中我明明安装了numpy和matplotlib啊,什么情况??? 兵来将挡,水来土掩!...「香在哪里???」 1,Rstudio支持终端界面,不用另外打开终端Terminal ? 2,补全功能强大,不只是包,好友包的函数,对象的方法,应有尽有 ? ? ?...3,帮助文档,直接显示,风格和R一样 ? 4,图片展示,直接在Rstudio中 ? 所以,Rstudio改名的话…… ❝前面加个P,变为PRstudio,中文名可以音译为:“怕死秃头工作站”❞

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    【Linux】动静态库

    静态库打包 只有一个.o的压缩包 tar - c :创建一个新的归档文件即压缩包 tar- r : 若.c文件修改了,则对一个或者多个.o文件做替换 ---- 当前目录下包含 mylib otherperson...目录中存在.h文件 与main.c 以及 .o目标文件的压缩包 报错1 输入 gcc - o myetst main.c 指令 会报错 有库后,将库引入项目,必须让编译器找到头文件和库文件 因为引入的库...报错2 头文件找不到 因为头文件在inlcude 里,不在当前路径下 ---- 在include的路径下,寻找头文件 依旧报错了,但是头文件找到了 ---- 告诉编译器库在lib中 还是会报错...2.如果没有默认安装到系统的gcc/g++默认的搜索路径下,用户必须指明对应的选项,告知编辑器, 头文件在哪里,库文件在哪里,库文件具体是谁 将头文件和库拷贝对应的系统路径 在otherperson目录下...只是告诉了编译器,并不是操作系统 运行时,你的.so并没有在系统默认的路径下,所以操作系统依旧找不到 找到动态库的方法 方法1 ——环境变量(临时方案) LD_LIBRARY_PATH LD代表链接 LIBRARY

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    Linux基本工具——yum

    **那么软件包是在哪里的呢?**是在别人的电脑上(远端服务器/云服务器)。 那么如何才能知道我们需要的软件包再哪一台服务器上呢? 电脑:去官网搜索,然后找到软件包在哪里。...Linux的软件包 我们都知道linux是开源的操作系统,那么在上面的软件包是谁提供的?又放在了哪里? 提供软件的几乎都是开源软件,放在了租用的服务器中。...yum的三板斧 在linux下,想去安装软件需要sudo提权或者是直接用root去安装才可以。 并且下载的时候是软件包,安装时是拷贝软件包的文件。...yum list 这条指令发会将现在所有的yum源对应的远端服务器中的软件名都给你展示出来(上面还有一堆): 那么这么多是不方便看的,这里如何才能找到自己想要的呢?...yum list | grep sl 这条指令的意思就是在远端服务器中找带有sl名字的软件: 这里还有另一种搜索方式,但是不常用: yum search sl 这条指令还会告诉你这些软件是干嘛用的

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    命令行创建Android虚拟机?

    还记得一开始就要下载的支持包 emulator 吗? 如果你需要启动 Android虚拟机 的话就需要使用它了。 不知道如何使用?OK,没问题。...然后剪切一下,在 SDK 文件夹下找到 tools 文件夹,进入右键粘贴。 然后你会发现这里也有一个 emulator.exe !!!这是什么情况?真假孙悟空?! 不要慌!!!..." 然后 google/bing/百度 一下你自己主板的虚拟化支持的选项在哪里就OK。...开启完成后,在你的SDK文件夹下找到 extras\intel\Hardware_Accelerated_Execution_Manager 这是刚刚下载的 HAXM 管理包,双击安装。...adb devices flutter devices 都可以识别出来是 Android 虚拟机了! 好了,现在你可以连接虚拟机进行 调试 和 开发 了!

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    数据科学家:共享经济的幕后功臣

    1、Airbnb 在Airbnb,工程师要解决这样一个问题:如何让用户了解一个自己从来没去过的地方?如何知道哪个地方最适合自己的旅行?...的「location relevance model」会通过Airbnb社区告诉未来的客人哪里是更好的住宿地。...下一步,这张图甚至可以预测,这样车主会知道提前去哪里等待可以载到更多的乘客。 数据科学家的由来和定义 虽然数据科学三十年前就诞生了,但是数据科学家却是几年前刚出现的一个新词。...该角色的工作是变化多样的:在任意给定的一天,团队的一个成员可以用Python实现一个多阶段的处理管道流、设计假设检验、用工具R在数据样本上执行回归测试、在Hadoop上为数据密集型产品或服务设计和实现算法...此外,它还具备称为CRAN(The Comprehensive R Archive Network)的包扩展机制,通过导入扩展包就可以使用标准状态下所不支持的函数和数据集。

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    win10 uwp MetroLog 入门

    在实际的项目,需要做很多记录,记录日志可以作为调试。在 UWP 如果自己写日志,放在文件,那么需要很多重复代码。 在 UWP 写文件是很慢,而且需要异步,所以很多小伙伴不喜欢写日志。...在以前可以使用 log4net ,一个很好用的日志。在 UWP 没有支持,但是有另一个日志,也是很多大神在使用的 MetroLog 。...安装 可以通过 Nuget 的方式安装 右击解决方法,选择 Nuget 搜索 MetroLog 安装第一个 最近有大神和我说 Log4Net 支持 UWP ,现在我先告诉大家如何用 MetroLog...因为一个软件有很多模块,如我有一个是网络通信,那么如果写的和计算模块相同日志,那么就很难知道哪里是计算模块写的。 因为只是告诉大家如何使用,就不分模块,使用 逗比 日志。...然后从资源管理器打开 %appdata% 打开里面 的 Local\Packages 找到应用的包系列名。

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    Android的引用jar包

    , 然后点击add jars 8.找到对应jar包,依次确定即可。...User Liberary加到Eclipse中,只是eclipse中生效,就是只有Eclipse知道那些引用的类放在哪里,但是如果你要web工程启动正常,是要告诉Tomcat等容器,你的jar包是在哪里...Java虚拟机是根据Java ClassLoader(类加载器)决定如何,到那里去加载Class : 我们之所以把jar包放在classPath下,是因为存在ClassPath ClassLoader...如jrd目录下jre\lib\*.jar 我们之所以把Jar包放入webroot下的lib文件夹,并且可以在我们的程序中使用,那是容器实现了自己的ClassLoader。...所以说能不能加载Jar,加载哪里的Jar,是根据ClassLoader决定的。 在android中有些公共资源可以共用,封装成jar包。

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    点击此文,无需转发,即可下载上千个免费R包

    当然了,R包本来就是免费的,你只是不会下载而已,所以重新发下这篇优秀的文章,教大家如何解决R包安装问题。如果你使用了别人的R包,一定要在写文章的时候引用,尊重别人的劳动。...---- 文章目录如下: 查看已经安装了和可以安装哪些R包 如何安装旧版本的包 如何切换镜像以及为什么要切换 4种常见的R包安装方式 说明: 该文首发于我的个人博客以及生信技能树论坛,请点击文末的阅读原文前往查看详细资料...---- R包安在哪里,可以安装哪些R包 首先在R里面输入 .libPaths()即可查看当前的R把包安装到了机器的哪个地方,这样可以直接进入目录去查看有哪些包,每个包都会有一个文件夹。...然后去包的官网上面找到它的旧版本的下载链接: 我这里拿ggplot2举例: http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ #packageurl...或者用 choose.files()来手动选择把下载的源码 BiocInstaller_1.20.1.tar.gz放到哪里。但这种形式大部分安装都无法成功,因为R包之间的依赖性很强!

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    【Linux】yum、vim

    目录 Linux 软件包管理器 yum 什么是软件包 查看软件包 如何安装软件 如何卸载软件 软件源​编辑 关于 rzsz Linux编辑器-vim使用 vim的基本概念 vim的基本操作 vim...更多有趣好玩的指令,可以自行搜索。 如何卸载软件 卸载就是remove。...在卸载或者安装的时候, 都会提示是否确认安装/删除,如果不想被询问,可以在install/remove后面加上-y 软件源 epel是拓展软件源,可以告诉系统要在哪里下载。...替换 「r」:替换光标所在处的字符。 「R」:替换光标所到之处的字符,直到按下「ESC」键为止。 撤销上一次操作 「u」:如果您误执行一个命令,可以马上按下「u」,回到上一个操作。...键,再输入您想寻找的字符,如果第一次找的关键字不是您想要的,可以一直 按「n」会往前寻找到您要的关键字为止。 /是往下查找,?

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