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GEE数据集——全球( 30 弧秒)尺度地下水模型GLOBGM v1.0数据集

该数据集利用两个模型层和 MODFLOW 6 框架,利用现有的 30′′ PCR-GLOBWB 数据进行模拟,使研究人员能够探索全球范围的地下水流动态。...在模拟中,我们使用了非结构化网格和 MODFLOW 6 的原型版本,并利用消息传递接口对其进行了并行化处理。...四个地下水模型中的每个模型都被划分为多个不重叠的子模型,这些子模型在 MODFLOW 线性求解器中紧密耦合,每个子模型被唯一分配给一个处理器内核,相关子模型数据在预处理过程中使用数据块并行写入。...鉴于串行模拟需要 4.5 个月的运行时间,我们设定了最多 16 小时模拟运行时间的假设目标。...结果表明,与 5 ′ PCR-GLOBWB 地下水模型相比,将分辨率从 5 ′提高到 30 ′,GLOBGM 在稳态模拟中的效果明显改善。然而,瞬态模拟的结果非常相似,还有很大的改进余地。

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JCCP:亲子神经同步:一种阐明学龄前儿童应激性双向相关的新方法

研究背景:迄今为止有关应激性的研究都主要从个体内差异的角度开展。然而,人际交往中的双向交流过程对其的影响却鲜受重视。亲子互动中的双向同步困难可能是幼儿应激性的一个重要影响因素。...同步编码会持续到互动中断,如实验中亲子二人超过3秒没有进行互动,则表明互动终止。使用相同的方式对挫折期和恢复期的数据进行编码。 在117个有效数据中,有98个是同时具有行为编码和神经同步的数据。...本访谈共计包含12个分数:6个发脾气障碍分数(6种社会环境)和6个急躁情绪障碍分数。...这份简短的问卷包括7个项目:其中6个用于评估应激性的严重程度,另一个用于评估损伤。六个严重程度项目的平均值用于分析,对应到应激性严重程度的三个等级(0-2)中。...发现,轻度挫折和恢复情境都会导致神经同步,在恢复过程中,神经同步性与应激性呈负相关,挫折期后的恢复对应激性高的儿童来说特别困难。

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    重复经颅磁刺激(rTMS)对啮齿动物模型抑郁症状的影响

    相反,它们模拟了MDD的特定特征,使我们能够更好地了解这种疾病。...1.2 用于诱发啮齿动物抑郁样症状的范式由于 MDD 是一种多因素和异质性精神疾病,因此已经设计了许多范式来模拟啮齿动物中 MDD 的特定特征。...1.2.2 孕产妇分离不良的早期生活经历,如童年时期的忽视或虐待,是MDD和焦虑症等精神病理学发展的严重危险因素,这种经历的数量和类型与抑郁症状的严重程度和成年期自杀未遂的次数有关。...1.2.3 慢性约束应激慢性约束应激包括将啮齿动物封闭在透明的小管中,并限制它们每天自由活动 2 至 8 小时,持续数天。...在没有抑郁样表型的幼稚青春期大鼠中,在20Hz刺激6周后,FST中的抗抑郁样作用也被描述,比幼稚成年啮齿动物中使用的刺激方案更强烈。

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    Cell | 都知道 DNA 损伤修复,那细胞是如何应对 RNA 损伤的呢? | 综述

    RSR最初被识别为一种由某些核糖毒素(如毒葛毒素或刺孢霉素)和蛋白质合成抑制剂(如安丝菌素)触发的与翻译耦合的应激反应途径。...值得注意的是,连续的ZAKα介导的p38激活和随后对周期素A/CDK1和CDK4/6的抑制可导致APC/CCdh1的过早再激活,驱动细胞进入G2期退出和随后的有丝分裂旁路。...鉴于UV辐射诱导m6A,烷化剂诱导m7G,这两种修饰似乎在调节受损RNA的隔离中起着普遍作用。 事实上,砷诱导的m7G修饰将RNA靶向到应激颗粒中。 一旦形成,应激颗粒就作为mRNA的分类中心。...理解RNA断裂如何在这种系统中定位以确保忠实修复仍然是一个关键问题。...RNA损伤反应途径(如RSR和ISR)如何在生理和病理情况下诱导RNA损伤后控制细胞命运是一个令人兴奋的未来研究课题。

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    JAMA Psychiatry:遭受创伤的美国黑人女性对威胁的神经反应与种族歧视的关系

    要求被试通过按下按钮快速识别显示的数字数量(3、4、5或6),同时忽略在每个数字刺激前后出现的干扰图像(创伤相关、积极和中性场景)。在一些试次中,数字的数量与实际显示的数字不一致。...使用偏相关探索种族歧视与创伤相关试次中情感Stroop任务表现(错误率和反应时间)之间的关联(一致试次和不一致试次的数量合并)。...在考虑创伤后应激障碍症状或创伤经历后,与创伤相关的干扰试次中,歧视经历和反应时间之间没有明显的相关性。 图2.威胁相关试次中种族歧视体验与情感Stroop表现的关系(创伤后应激障碍症状共变)。...尽管美国黑人和白人PTSD症状的患病率明显不同,但有限的研究调查了压力源反应的差异如何在这些差异中发挥作用。据报道,过度的压力源暴露与关键节点(如vmPFC)内神经对威胁反应的种族差异有关。...6.结论 这项对55名暴露在创伤中的美国黑人女性的横断面研究发现,在对威胁相关刺激的注意方面,那些经历更多种族主义的女性在视觉注意、情绪和恐惧调节网络区域的关键节点内表现出更高的反应,即使考虑到与创伤和创伤后应激障碍症状相关的差异也是如此

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    单细胞测序下的骨髓微环境

    摘 · 要 在本研究中,在体内平衡和应激诱导的造血条件下分别构建了小鼠骨髓血管,血管周围和成骨细胞群的单细胞转录组图谱。...尽管我们对骨髓龛的理解在过去几十年中已经有了很大的发展,但是解决骨髓微环境的分子异质性和功能可塑性的研究任然有限,这主要是由于骨髓中靶标细胞的数量太少及分离技术的局限性。...在本研究中,我们分析了小鼠骨髓龛中的17,374个单细胞,识别出了骨髓微环境中以前未被认识到的异质性,并揭示了微环境是如何在单细胞水平对急性骨髓应激作出反应。...为了追踪应激性造血过程中骨髓龛中基因表达的变化,我们用5-氟尿嘧啶处理了7,752个细胞(图3) ?...将来的研究需要研究骨髓龛异质性对功能异常干细胞的影响,如免疫缺陷,造血系统恶性肿瘤和衰老。

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    NeuroImage:暴力的隐式创伤—异常运动振荡脑活动与创伤后应激症状有关

    在50%的试验中,周边条的方向是相同的,此时受试者用左手按键;不相同时用右手按键。该实验包含了相同数量的用左手和右手按键的中性和威胁实验。...为了创建情绪调节指数,研究人员减去每个受试者在威胁试验中获得的较低α频段(8-10Hz)的α MRAA活性的平均值减去在中性试验中获得的平均值。...在低PTSS受试者中,反应时间与威胁条件下的LRP潜伏期相关,而在高PTSS受试者中,反应时间与中性条件下的LRP潜伏期相关。...4.2 皮层反应激活的时间模式与PTSS 相对于中性条件,在威胁条件期间,LSS潜伏期表明PTSS与响应准备过程之间没有关联。...4.3 皮层反应激活的振荡模式与PTSS 本研究中,研究人员发现情绪调节PTSS中的α波段活动,而观看威胁线索会促进相对于中性刺激的α抑制的减少。

    53200

    文献翻译:Statistical Approaches for Gene Selection, Hub Gene Identification and Module Interaction in...

    通常,微阵列数据用于遗传网络分析中的基因选择和模块检测,其受到其基因维度较多的限制,即基因数量远远大于受试者/样品的数量[6]。...在该研究中,S = 500用于分别在应激和控制条件下获得500个随机GCN。...氧化还原活性也可能与活性氧物种(ROS)有关,这些物质是由于在非生物胁迫(如铝毒性应激)中由于缺水导致的氧化应激而产生的[44]。...可以看出,基因的最大数量与囊泡和膜有关,这与Al胁迫条件下可获得的金属离子的解毒机制一致,特别是在液泡的隔离中[46,47]。...换句话说,从图6中可以更好地看出GCN中统计上强弱连接的基因之间的区别,而不是图5.此外,从提出的DHGA方法获得的两个对比条件(压力与对照)的结果给出了表6.DHGA方法允许将GCN中的水稻187(胁迫

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    双硫死亡 | 发现的细胞 “新” 型死亡方式-MedChemExpress

    SLC7A11----死亡调控途径中的双刃剑SLC 家族成员 SLC7A11 转运蛋白在维持细胞内谷胱甘肽水平和保护细胞免受氧化应激诱导的细胞死亡方面具有重要作用,具有公认的促生存作用[3]。...(图 3a-b), 但二硫应激的还原剂,如二硫苏糖醇 (DTT)、β-巯基乙醇 (2ME) 和 TCEP 可以完全抑制 SLC7A11high 细胞中葡萄糖饥饿诱导的细胞死亡 (图 3d)。...在含糖培养基的 SLC7A11high 细胞中,肌动蛋白丝 (F-肌动蛋白) 主要在细胞皮质和应激纤维中;但葡萄糖饥饿会诱导细胞形态的显著变化:细胞收缩和 F-肌动蛋白收缩。...新的死亡机制的鉴定促进人们对细胞稳态的基本理解,那 “双硫死亡” 最大的意义何在? 双硫死亡,研究的意义何在?...在 SLC7A11 过表达细胞中,GLUT1 抑制剂处理增加 NADP+/NADPH比值 (图 6a,b),并在 UMRC6 细胞中引发强烈的细胞死亡(图 6c)。

    55510

    成年小鼠肾脏snRNA-seq和scRNA-seq之比较

    结论 :在小鼠(C57BL/6)成年肾脏中,snRNA-seq可实现与scRNA-seq相当的基因检测,并且具有明显的优势,包括减少解离偏倚,与冰冻样品相容,消除解离诱导的转录应激反应,并成功地应用于炎症纤维化肾脏...第二,目前用于单细胞解离的酶和机械方法引入了应激诱导的转录伪影。 最后,目前的方法与冷冻材料不兼容,当组织可获得性不可预测或诊断需要时间时,这会使分析变得复杂--例如肾活检。...富核基因包括许多驱动细胞特性的基因,如溶质载体和转录因子,这与大脑最近的一份报告一致。作者还可以在单核测序中优先检测到长的非编码RNA,而不是单细胞(图3D)。...作者可以在小鼠肾小球图谱的所有细胞中检测到丰富的应激反应基因表达,这在snDropSeq生成的数据中是缺失的(图3J)。...作者发现了已知的(Bmp6、Pdgfd和Spp1)和新的(Sema3c、Sema6a、GPC和Slit3)信号关系(图4F)。图4G总结了这些纤维化的肾小管间质串扰通路。 ?

    1.7K30

    Brain Stimulation|压力启动经颅直流电刺激(tDCS)可增强工作记忆中情绪内容的更新

    摘要针对前额叶皮层的经颅直流电刺激(tDCS)已成为精神病学研究的一种有价值的工具。了解情感状态(如刺激时的压力)对前额叶tDCS效果的影响对于推进tDCS干预至关重要。...在这项假对照研究中,我们通过调查应激启动双额tDCS(主动与假对照)对非情绪和情绪工作记忆表现的影响来解决这一差距。这项研究是在146名健康个体中进行的,他们被随机分为四个实验组。...值得注意的是,应激启动对非情绪性工作记忆的表现没有显著影响。这些发现强调了个体先前的情感状态在形成他们对tDCS的反应中的重要性,特别是在情绪工作记忆的背景下。...图2非情感和情感双向任务流程图3电极放置和电场分布模拟结果心理生理学评估:在所有的心理和生理测量中,结果显示任务间存在显著的差异(如图4所示)。...图5非情绪工作记忆任务结果图6情绪工作记忆任务结果对于情绪 n-back 的准确性评级,任务和刺激条件之间存在显著的交互作用。

    7810

    European Heart Journal:边缘和自主神经加工改变支持心碎综合征的脑神经机制

    虽然有强有力的证据表明脑心轴参与了心碎综合征(TTS),但其病理机制仍未得到很好的了解。应激刺激引起的交感神经系统过度刺激被假设为TTS的根本原因,但其在TTS中的影响尚未清楚阐明。...数据是在2013年7月至2014年7月期间获得的,TTS事件和获得MRI扫描之间的中位数时间为378天(四分位数范围:116-564天)。...交感神经关联子网络 在较高的设定阈值下(t=2.25),与心碎综合征相关的交感相关低连接性子网络由分布在6个节点上的5条边组成(P=0.044,FWE-校正,5000个排列)。...杏仁核是控制交感神经系统对压力反应的关键大脑结构之一。因此,杏仁核是调节应激和心血管疾病之间相互作用的主要大脑结构。神经疾病,如癫痫发作、颅内出血和偏头痛,在TTS中的发生率是急性冠脉综合征的两倍。...这项研究中确定的关键节点,如杏仁核、海马和扣带回,都是边缘系统的结构,控制着情绪、动机、学习和记忆。杏仁核和扣带回也参与自主神经系统的中枢控制和心脏功能的调节。

    52020

    Biological Psychiatry:压力诱导网络重构的时空动态反映负性情感

    同样,适应性不良的应激反应,如长时间焦虑、广泛的反刍和消极的应对策略,是精神障碍,特别是情绪和焦虑障碍的常见症状。生理上,适应性不良的应激反应反映在内分泌失调和自主调节。...与抑郁相关的人格特征,如消极情感或特质焦虑,具有共同的基因标签,也会跨阶段影响内分泌应激反应。此外,负性与对压力的负性情绪反应相关,并调节应激生活事件对抑郁的影响。...预处理在MATLAB 2018a和SPMv12中进行。使用DARTEL对fMRI数据进行切片时间校正、重新排列、归一化到蒙特利尔神经学研究所模板,6*6*6mm³半高宽高斯核平滑。...为了模拟跨压力阶段的动态FC变化,我们从预处理任务和21个感兴趣区域(ROI)中提取平均时间序列(未平滑)和侧翼静息状态。...蓝色集群主要反映了跨集团连接(即网络之间的连接,如DMN和SN),显示FC在应激开始时显著下降,然后逐渐恢复。相反,主要反映边连接的黄色星团在应激过程中显示FC增加。

    20010

    nature mental health:童年时期生活逆境对大脑结构和功能连接耦合的影响

    我们首先在我们的全神经影像学队列中模拟了三个时间点(4.5岁,6岁和7.5岁)的SC-FC变化,这是不同和重复样本的混合物(图1)。我们的三个时间点对应于两个标准的儿童阶段——学龄前和儿童中期。...讨论我们的研究模拟了从学龄前到儿童中期SC-FC的变化。因此,我们解决了神经发育文献中的一个关键空白。之前缺乏从学龄前开始的纵向神经成像数据。...我们发现,在4.5岁至6岁的高逆境组中,SC-FC的加速下降表明,这一时期可能是干预的潜在窗口,以减少ELA对后期结果的影响。...大脑皮层厚度在2岁左右达到峰值,暴露于低SES环境中与早期大脑皮层变薄有关。这些发现被认为反映了突触增殖的早期减少和突触修剪窗口的减少。有关产前应激的文献表明,子宫内环境可能影响下游发育的几种机制。...DAN也可能对应激暴露后的恢复过程很重要,这是影响以后生活行为的潜在机制。在解释研究结果时应考虑到一些局限性。

    18610

    癌症起源和治疗中的细胞死亡

    细胞焦亡 细胞焦亡是一种胞内细菌激活的程序化死亡形式,如沙门氏菌。...如果癌细胞暴露于药物足够浓度及足够长的时间,即使没有被彻底杀死,它也将无法复制其DNA并分裂。不幸的是,这些治疗对正常细胞,特别是那些正在迅速增殖的细胞,如骨髓或肠中的祖细胞,具有相同的直接毒性作用。...寻找一种在癌症治疗期间特异性抑制健康组织凋亡的方法将至关重要, 这可以使患者接受更高强度的治疗,从而获得更大的缓解机会。...也许这样的药物能够通过激活两种凋亡途径,与BH3模拟药物协同杀死癌细胞。 非凋亡程序性细胞死亡途径在肿瘤发展和抗癌治疗中的作用 自噬在癌症中的作用仍在争论中。...尽管发现了很多,但仍在继续研究BAX / BAK依赖的细胞死亡机制,以确定它们如何在线粒体外膜上形成孔或通道以及如何通过抗凋亡BCL成员调节其激活的更详细的信息。

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    【flowjo】中性粒细胞流式笔记:你的增殖我的增殖大不一样

    中性粒细胞的增殖特点 早期增殖阶段(骨髓中未成熟细胞) 中性粒细胞的祖细胞,包括粒系祖细胞(GMPs, Granulocyte-Macrophage Progenitors)和髓系前体细胞(如Promyelocytes...这一阶段细胞增殖是为了维持中性粒细胞的数量并补充外周循环中的成熟中性粒细胞。...外周血和组织中(终末分化细胞) 一旦释放到外周血和组织,成熟的中性粒细胞主要功能是执行固有免疫功能(如趋化、吞噬、氧化爆发等)。它们被认为是终末分化细胞,无法再次进入细胞周期。...增殖活性消失:成熟中性粒细胞不再增殖,功能转为免疫防御和应激响应。 因此,研究中性粒细胞的成熟除了从核形态、功能、表面标记物(流式)来评估以外,增殖也是一个重要的角度。...适用细胞 增殖细胞(S 期) 增殖细胞(S 期) 所有分裂细胞 操作和检测 特性 EdU BrdU CFSE 细胞处理 需固定和通透化 需固定和通透化,且需 DNA 解链(如使用 HCl) 活细胞标记

    23210

    ASK1在氧化应激条件下的激活 | MedChemExpress

    其中氧化应激在糖尿病肾病的发病机制中起着至关重要的作用。氧化应激因其可促进糖尿病肾病中的肾小球硬化和肾小管间质纤维化, 常作为糖尿病肾病治疗的研究热点。...GS-444217 对 ASK1 的自磷酸化以及下游底物磷酸化(如 p38 和 JNK )的可逆性抑制作用呈剂量和时间依赖性(如图1 所示)。...GS-444217 浓度为 0.3 μM 时,降低 ASK1 磷酸化,且阻止 MKK3/6,MKK4,p38 和 JNK 磷酸化;浓度为 1 μM 时,完全抑制 ASK1 活性。...口服 GS-444217 可改善双侧缺血/再灌注诱发的肾损伤,损伤后第 1 天血肌酐和血尿素氮,及组织学肾小管坏死评分和凋亡细胞数量得到改善。...从该研究结果中不难看出,ASK1 抑制剂(如 GS-444217)有望成为糖尿病肾病治疗的开发热点。 参考文献 [1]Liles JT, etal.

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    NEJM:创伤后应激障碍

    在PTSD定义变化的更广泛影响变得清晰之前,临床医生应谨慎对待那些在从早期定义到后期定义的转变中不再符合PTSD诊断标准的人,不要轻易地使用这些转变标准从而拒绝使他们获得相应的治疗或保险或残疾福利。...创伤后应激障碍的恐惧习得模型启发了该障碍的一些常见治疗方法,如基于暴露的认知行为疗法,下文将对此进行综述。...具体的认知行为治疗方案大致可分为暴露疗法(如长期暴露)和非暴露疗法(如认知加工)。在暴露疗法中,痛苦和恐惧避免的创伤事件的记忆是在一个安全的环境中进行的。...它对符合创伤后应激障碍诊断标准的患者最有效,在创伤事件发生后1个月或6个月给予同样有效,其结果可维持数年。尽管如此,它在许多事故幸存者身上仍是无效的。...治疗建议可以根据患者和临床资源的偏好进行调整。在现有的选择中,具有最强支持证据的干预措施应优先考虑(如认知行为疗法、舍曲林或文拉法辛),以及针对患者最令人不安的症状的干预措施(如失眠和易怒)。

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    2018 Cell系列相变最强综述,未来已来,你在哪?

    然而,细胞内还有不少缺乏分界膜的细胞器,它们是由蛋白质、核酸及其他分子组成的超分子组装体,如细胞核中的核仁、核斑点 (nuclear speckles),以及细胞质中的应激颗粒stress granules...随着对驱动无膜细胞器形成的分子原理和理化动力的日益了解,可以更清晰阐明它们在各种细胞过程(如应激反应、基因表达调控和信号转导)中的多种功能。...基于数学理论的计算模拟实验表明,与一对一结合模型相比,部分异构交互可以将相界的形成难度降低一个数量级。...确信的是,ALS小鼠模型中敲低Ataxin-2降低了小鼠脊髓中TDP-43聚集物的数量,显著延长了存活率。...如什么介导蛋白质和RNA形成特定相,以及什么阻止了不同的无膜细胞器的聚结? 6. 虽然在体外试管中确定胞体颗粒的内部结构方面取得了一些进展,但缺乏在活细胞中研究该问题的工具。

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    scRNA-seq 鉴定上皮卵巢癌复发的启动子

    转移起始细胞的特征 对转移瘤和复发肿瘤的marker基因进行富集分析发现,未治疗的腹膜转移肿瘤(M1、M2)中的起始细胞主要与免疫反应相关(如CD81、HLA-A、HLA-DRB1、XBP1、CFB、C3...),而复发肿瘤中的起始细胞(R1、R2)主要与细胞周期相关(如MKI67、CKS2、ANLN、CDC20、CDCA8、CENPF)。...细胞的G1/S期或G2/M期在两种复发肿瘤的起始细胞中比较多,并且高表达MKI67,但在腹膜转移瘤中比较少见。...追溯原发性肿瘤中的转移起始细胞 为了追溯原发性肿瘤中转移起始细胞的来源,作者对两种复发肿瘤的起始细胞和四种原发肿瘤的循环细胞进行了差异分析,找到了复发肿瘤起始细胞中45个特异的差异基因,并且功能主要集中在应激反应...另外发现这5个基因都主要具有压力应激的功能,然后去每个原发肿瘤中寻找具有该功能的top100差异基因,发现CYR61是其marker基因。 接下来网络图显示了化疗耐药基因与CYR61的联系。

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