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专注于Agilent microRNA 芯片数据的处理R包-AgiMicroRna

AgiMicroRna主要目的是产生处理后的数据,并使用limma软件包进行分析。...目标文件中的其他列是可选的。它们可能包括其他说明实验条件的解释变量的信息,如年龄、性别和考虑到实验设计的阻塞变量(配对、阻塞设计等)。 这些变量应该包含在目标文件中,以便最终在limma模型中使用。...: 使用preprocessCore的rma.background.correct函数对信号进行背景校正; 使用limma函数normalizeBetweenArrays用分位数(quantile)方法对信号进行...,因此,我们需要先创建ddaux对象,然后在ddauxmeanS中存储想使用的矩阵。...在获得全基因信号后,无论是提取AFE产生的TGS,还是使用RMA算法,我们都可以使用AFE算法附加的FLAGS对signals 进行过滤。

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    干货 | 携程百亿级缓存系统探索之路——本地缓存结构选型与内存压缩

    从实验结果可以看出,若我们可以直接使用基础类型来代替包装类存储时,可以大幅减少内存占存。此结论对其他如HashMap等数据结构也同样有效。...在应用请求处理过程中,会使用房型ID以及日期从该缓存中获取房型某一天的价格数据。 下面将以单房型下存储的日期信息为例,逐步展示数据压缩优化的全部过程。...1)使用字典编码对每日重复的价格信息进行编码 首先,将所有该房型上出现的价格提取并存储到一个价格数组上,在数据字典里则存储实际价格数据在价格字典的索引。...2)使用差值编码处理日期 因为在绝大部分情况下,数据字典中的日期均为连续的,且从业务场景上来说最大的日期也不会过大,因此我们采用差值编码处理日期,将数据字典中的日期替换为与服务器启动日期之间相差天数的偏移量...4)使用RLE编码处理末尾 在很多房型下的到天价格数据,在距离现在最远的日期带的价格通常都是重复的,因此,我们可以使用RLE的方式对末尾重复的数据进行截尾,来进一步压缩数据位图大小。

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    Power Pivot中忽略维度筛选函数

    函数不单独使用,必须和其他函数配合 D. 作用 忽略指定过滤器后进行计算。 E. 案例 如果要忽略全部筛选条件,则第一参数使用表名来进行。...中初步认识自定义函数 Power Query引用中的each,_,(a)=>的使用 如何理解Power Query中的“#”转义字符?...分列数据的方法比较 如何在Power Query中提取数据?——文本篇 如何在Power Query中提取数据?——数值篇 如何在Power Query中提取数据?...——时间篇(2) 从如何在Power Query中提取数据——记录片 如何在Power Query中提取数据——列表篇(1) 如何在Power Query中提取数据——列表篇(2) 如何在Power Query...中提取数据——列表篇(3) 如何在Power Query中提取数据——列表篇(4) 如何在Power Query中获取数据——表格篇(1) 如何在Power Query中获取数据——表格篇(2) 如何在

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    CV语义分割实践指南!

    在赛题数据中像素属于2类(无建筑物和有建筑物),因此标签为有建筑物的像素。赛题原始图片为jpg格式,标签为RLE编码的字符串。...RLE是一种简单的非破坏性资料压缩法,经常用在在语义分割比赛中对标签进行编码。 RLE与图片之间的转换代码详见本文第二节Baseline代码解析。...,并划分验证集以监督模型精度; 步骤3:使用更加强大模型结构(如Unet和PSPNet)或尺寸更大的输入完成训练; 步骤4:训练多个模型完成模型集成操作; Baseline代码分析 Ⅰ.将图片编码为rle...其中,我将opencv的读取图片换成了PIL读取,因为路径中包含中文 augments['mask'][None]中的[None],将(256,256)的mask形状转为(1,256,256),起到升维作用...最后放入数据加载器中。

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    .NET下正则表达式应用的四个示例

    您可以使用 IsValidEmail,在应用程序将地址存储在数据库中或显示在 ASP.NET 页中之前,筛选出包含无效字符的电子邮件地址。 ...return Regex.Replace(strIn, @"[^/w/.@-]", "");  }  3.更改日期格式  以下代码示例使用 Regex.Replace 方法来用 dd-mm-yy 的日期形式代替...//d{2,4})//b",  " }  Regex 替换模式  本示例说明如何在 Regex.Replace 的替换模式中使用命名的反向引用。其中,替换表达式 ${day} 插入由 (?...) ...有几种静态函数使您可以在使用正则表达式操作时无需创建显式正则表达式对象,而 Regex.Replace 函数正是其中之一。...如果您不想保留编译的正则表达式,这将给您带来方便  4.提取 URL 信息  以下代码示例使用 Match.Result 来从 URL 提取协议和端口号。

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    程序员需要了解的硬核知识之压缩算法

    可用于对数据的准确性要求严格的场合,如可执行文件和普通文件的压缩、磁盘的压缩,也可用于多媒体数据的压缩。该方法的压缩比较小。如差分编码、RLE、Huffman编码、LZW编码、算术编码。...因为图像文件的本质也是字节数据的集合体,所以可以用 RLE 算法进行压缩 RLE 算法的缺点 RLE 的压缩机制比较简单,所以 RLE 算法的程序也比较容易编写,所以使用 RLE 的这种方式更能让你体会到压缩思想...38328字节 40% EXE文件 24576字节 15198字节 62% 通过上表可以看出,使用 RLE 对文本文件进行压缩后的数据不但没有减小反而增大了!...比如说ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ,26个英文字母所占空间应该是 26 个字节,我们用 RLE 压缩算法压缩后的结果为 A1B1C1D1E1F1G1H1I1J1K1L1M1N1O1P1Q1R1S1T1U1V1W1X1Y1Z1...这显然不是我们想要的结果,所以这种情况下就不能再使用 RLE 进行压缩。 哈夫曼算法和莫尔斯编码 下面我们来介绍另外一种压缩算法,即哈夫曼算法。

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    美团外卖搜索基于Elasticsearch的优化实践

    Geo Polygon[2] 的方式进行检索,而是通过上游一组 R-tree 服务判定可配送的商家列表来进行外卖搜索。...RoaringBitmap有不同的实现方式,下面以 Lucene 实现(RoaringDocIdSet)进行详细讲解: 如原理图中所示,RoaringBitmap 中存在两种不同的 Container:...在数组完全连续场景下中,对 32768 个 id (short) 进行存储,数组存储需要 64 kB,Bitmap 存储需要使用 4 kB,而 RLE 编码后直接存储仅需要 4 byte。...当然 RLE 并不适用所有情况,在目标序列完全不连续的场景下,如 [1, 3, 5, 7, ... , M],RLE 编码存储需要使用 2 * M byte的空间,比数组直接存储的空间效率差一倍。...4.4 功能集成 至此,核心的倒排索引问题已经解决,后续主要为工程问题:如何在 Elasticsearch 系统中集成基于 RLE 的倒排格式。

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    基于游程法的二值图像Blob 分析算法

    算法描述 2.1 游程及 Blob 目标对象数据结构定义 不失一般性,设分割得到的二值图像中,背景像素灰度为0,目标像素灰度为 1。一行中灰度值连续为 1 的像素构成一个游程数据单元。...定义如下的游程数据结构对之进行描述: struct RLE { short r,s,e; RLE * pn; BLOB **ppB} 其中: r 代表游程所在行号,s 为游程像素在该行的起始位置,e 为其在该行的终止位置...因每个游程数据单元必属于且仅属于某个唯一的 Blob 对象,将同属一个目标对象的所有游程数据单元组织成一个线性链表, 每个游程数据单元即为链表中的一个节点,用指针 pn 来指向链表中的下一游程节点。...可见,一个 BLOB 对象实际上描述了一个 RLE 链表, 通过它可访问同属该目标的所有 RLE 对象。算法结束后, 将动态生成一个 BLOB 链表,它描述了一幅图像中的全部目标对象。...如涉及版权,请联系删除!

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    JPEG 编码过程:为 GPU 处理开路

    从RGB颜色模式向YUV模式转换采用以下公式: Y = 0.299R' + 0.587G' + 0.114B' U = -0.147R' - 0.289G' + 0.436B' V = 0.615R'...如采用全黑色进行补齐将产生振铃效应,在边缘较为锐利的文字型图像中较为容易发现。通常采用重复边缘上的数据来进行填充。 其次是图像在进行DCT变换时高频分量的丢失或者精度损失也造成振铃效应。...量化 数据量化是针对DCT变换后得到的系数矩阵进行精度处理,使用DCT系数矩阵中的每一项分别于对应的量化矩阵位置处的值相除所得到的新矩阵为量化后的结果。...针对AC系数序列进行RLE游程编码。是因为经过zigzag扫描后产生许多连续的0,RLE编码能够大幅减少0数据的空间占位。...再使用标准的huffman表对DC和AC编码后的数据进行huffman编码得到二进制序列。而使用huffman表编码时,针对DC直流分量和AC交流分量分别采用不同的huffman表。

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    在微信小程序上做一个「博客园年度总结」:使用redis存储数据

    前面写过一篇博客:解决前端获取接口数据太慢的一种思路 当时是由于博客园接口获取数据比较慢,所以从博客园拿到数据后,先把数据存到一个文件中,再从文件中读取数据,这样就不必每次都请求接口了 本次用redis...redis 关于如何在python中使用redis,可以参考这篇博客,写的比较清楚,传送门: https://zhuanlan.zhihu.com/p/374381314 (1)定义操作redis的基本方法...if j in month_blog_date: # 如果一个日期在bug列表中,说明这个日期有值,取bug字典中该日期的值赋给...需要转为字符串 这里使用json.dumps()进行转换,同时指定ensure_ascii为False,以避免中文乱码 执行这个方法后,redis中会存储blogs_data键,效果如下, (3)调用...所以需要判断这个情况,当key失效后,重新向redis写入数据 class GetBlogs(Resource): """接口:获取个人随笔列表""" """使用redis数据"""

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    练习题︱图像分割与识别——UNet网络练习案例(两则)

    1.1 训练集的构造 因为使用的是比赛数据,赛方已经很好地帮我们做好了前期数据整理的工作,所以目前来说可能很方便的制作训练集、测试集然后跑模型。这里下载得到的数据为提供图像中单个物体的掩膜。...从掩膜列表可以到,比赛中是把每个细胞的掩膜都分开来了。...那么掩膜的提交需要编码压缩: Run-Length Encoding(RLE)行程长度的原理是将一扫描行中的颜色值相同的相邻像素用一个计数值和那些像素的颜色值来代替。...对于拥有大面积,相同颜色区域的图像,用RLE压缩方法非常有效。由RLE原理派生出许多具体行程压缩方法。...mask二值化 mask, class_ids = mask.astype(np.bool), np.ones([mask.shape[-1]], dtype=np.int32) # 提取每个掩膜的坐标

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    在Python中遇到字符串和数字要分开提取怎么办?这篇文章看完必会!

    从字符串中提取数字 嘿,朋友们!你有没有遇到过这样的情况:手里拿着一堆文本数据,却苦于找不到其中的数字信息?别担心,今天咱们就来聊聊如何在Python中轻松提取字符串里的数字。...我们的目标是提取出这些数字字符组成的序列。 查找数字序列: 然后,代码使用re.findall()函数和正则表达式r’\d+'来查找字符串text中所有与正则表达式匹配的数字序列。...转换数字类型: 接下来,代码使用列表解析来遍历numbers列表(包含数字字符串的列表),并将每个元素(数字字符串)转换为整数类型。转换后的整数被收集到一个新的列表numbers_int中。...filter和str.isdigit(仅提取单个数字) 如果只需要提取单个数字字符,可以使用filter函数。...例如,用户可能输入“我想要预订一个价值150美元的房间,入住日期是2023年10月1日”。通过提取这些数字,应用程序可以解析用户意图,并相应地执行操作,如计算费用、检查可用性、生成预订确认等。

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    你所能用到的无损压缩编码(一)

    既然是介绍无损压缩编码,那么就从最简单的RLE开始,RLE 全称Run-Length Encoding,一个接受的比较光的是行程编码,首先,让我们看一下RLE在Wiki中的定义: Run-length...定义中也说了RLE对重复数据比较集中出现的数据压缩效果比较好,也就是行程长的数据,所以RLE主要应用于二值图像之中,如果相同数据连续出现的比较少,那么RLE压缩的效果将会很不理想,大部分情况下会越压缩越大...但是,反过来,如果数据是0101010101,那么使用RLE压缩后的结果就是1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1,本来只需要10个空间存储的数据,现在压缩之后变成了需要...,先给大家展示下我的函数: 1 //RLE压缩算法函数 2 //输入:原始数据,原始信息长度,压缩数据 3 //输出:压缩率 4 double RLE(int input[],long inputLenth...主要用于二值图像,所以在我们的函数中使用二值图像来测试我们的压缩算法和解压缩算法,测试图像如下: ?

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