本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...如需数据实现本文代码，请到公众号中回复：“基于多列删重”，可免费获取。 得到结果： ?...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题，只要把代码中取两列的代码变成多列即可。...numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv
前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息，从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。..._.*","\\1",bed$V4) #获取转录本号对应的基因名字 symbol=mapping[NM,1] 方法一、使用最原始的gsub函数 #先将bed文件中的内容存放在result1中 result1...参考资料： ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列
导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...从结果知，参数keep=False，是把原数据copy一份，在copy数据框中删除全部重复数据，并返回新数据框，不影响原始数据框name。...四、按照多列去重 对多列去重和一列去重类似，只是原来根据一列是否重复删重。现在要根据指定的列判断是否存在重复（顺序也要一致才算重复）删重。...原始数据中只有第二行和最后一行存在重复，默认保留第一条，故删除最后一条得到新数据框。 想要根据更多列数去重，可以在subset中添加列。...如需处理这种类型的数据去重问题，参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-
显示工作路径 getwd() 向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 表格在R语言中叫数据框 要理解其中的命令、函数的意思!...数据框 1）读取本地数据 A....用以下命令即可获得示例数据框：X<-read.csv('doudou.txt') 图片 2）设置行名和列名 X数据里有doudou.txt 注意这里的变量...）变量的保存与重新加载 这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?...b列 X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）6）直接使用数据框中的变量！！！！！！
数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...data.frame生成指定数据框的列名及列的内容，如代码所示，此时列名不需添加""，df1为变量名，格式为列名=列的向量*matrix矩阵与向量一样只允许同一种数据类型，否则会被转换，可以理解为二维的向量...tsv改变文件名而来的，此时用csv打开会报错，该知识点用于防止部分代码中错误应用csv套用tsv等#文件读写部分(文件位于R_02的Rproject中)#1.读取ex1.txt txt用read.table..."s"，善用Tab可以防止错误rownames(df1)colnames(df1)数据框取子集"$"取子集df1$gene为对数据框df1列名的向量取子集*输入df1$后按tab键可以输出待选的列名mean...c(1,3),1:2] #取出第1、3行的1、2列数据，取多列的时候需要组织成合适的向量df1[,-ncol(df1)] #删去最后一列，"-"意义同向量列名或行名取子集df1[,"gene"] #取出列名为
+函数名称 【R语言有基础包，如base包】 （2）---找R包介绍页面（直接搜） 网页搜：limma package 【一般不需要】 （3）---列出一个包都有哪些函数 ls：列出当前环境的所有变量...、矩阵取子集 [[]]---列表取子集 $ 数据框取列，列表取子集 <- 赋值 = 赋值，连接形式参数与实际参数 == 判断是否相等 !...----文件读取是R语言中的数据框来源 【变量名test--存在R语言内部=read.csv("文件名")】 【表格文件读入到R语言里，就得到了一个数据框，对数据框进行的任何修改都不会同步到表格文件】...一切操作在r语言中进行 （4）R特有的数据保存格式：Rdata Rdata：保存的是变量，不是表格文件 支持多个变量存到同一个Rdata 是R语言特有的数据存储格式，其他软件无法打开 · 相关命令：...如header=F 解决办法：！看函数帮助文档！ read.table(file,header=F---表格中的第一行是否是列名！)
p=30914最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。...)summary(glm.step)vif从模型中变量的VIF值来看，大多数变量之间不存在较强的多重共线性关系。...全子集回归来选出最优的模型全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...logistic）模型分析肺癌数据R语言如何用潜类别混合效应模型（LCMM）分析抑郁症状R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect...R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题基于R语言的lmer混合线性回归模型R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次（分层）贝叶斯模型R语言分层线性模型案例R语言用
p=30914 最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型(GLM)的研究报告，包括一些图形和统计输出。 我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。...) summary(glm.step) vif 从模型中变量的VIF值来看，大多数变量之间不存在较强的多重共线性关系。...全子集回归来选出最优的模型 全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...logistic）模型分析肺癌数据 R语言如何用潜类别混合效应模型（LCMM）分析抑郁症状 R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect...的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题 基于R语言的lmer混合线性回归模型 R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次（分层
p=30914 我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。本文获取了全国的2021年全国的气候数据（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。...step(glm.po2) summary(glm.step) vif 从模型中变量的VIF值来看，大多数变量之间不存在较强的多重共线性关系。...全子集回归来选出最优的模型 全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...effects logistic）模型分析肺癌数据 R语言如何用潜类别混合效应模型（LCMM）分析抑郁症状 R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言建立和可视化混合效应模型...LMM） R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题 基于R语言的lmer混合线性回归模型 R语言用WinBUGS
（x有哪些元素在y不存在）#重点向量筛选(取子集)[]：中括号里面是向量（有4种生成方式）将TRUE对应的值挑选出来，FALSE丢弃。...2.数据框要求每列数据的类型相同3.数据框单独拿出一列是向量，降维，#1.数据框data.frame来源# （1）用代码新建，，变量 数据转换或处理得到，变量...","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] 数据框取子集1$一次只能取1列，2按坐标，名字（一次可以取多列），逻辑df1$gene...有行名是需要用row.names=1归化#列名中有特殊字符如-会被R自动转换，因此需要check.names=F#注意：数据框不允许重复的行名rod = read.csv("rod.csv",row.names...Rdata是R特有的数据储存形式，不是表格文件；保存的是变量。
导语 GUIDE ╲ 通路分析已经成为分析高通量组数据的一种有效的策略，通过结合已有的生物学知识（如KEGG数据库），一些基于通路的方法能够测功能相关基因的协调变化，还可以更多地揭示与疾病相关的潜在生物过程...通常，一个先验定义的通路中只有一个子集的基因参与与表型变异相关的细胞过程，其中子集中的每个基因贡献了一个适度的数量。因此，基因选择是通路分析中的一个重要问题。...(2)利用SuperPCA和AES-PCA方法提取通路中相关基因。 (3)根据所选基因计算主成分(PCs)。这些评估的潜在变量代表了个体受试者的通路活性，然后可以用于执行综合通路分析，如多组学分析。...(6)分析具有复杂实验设计、多协变量、交互效应的研究，如检验男性和女性受试者之间的临床表型通路相关性是否不同。...个主成分(PCs)，测试它们与响应矩阵的关联，并返回每个通路校正p值的数据框。
(列名 =向量(列的内容), 列名 =向量(列的内容))###由已有数据转换或处理得到读取表格文件df2 R语言内置数据属性dim(df1)#维度nrow(...取多列/行修改一个格-取出后赋值df13,3 中不存在的列。...(df1)2 数据框的连接/合集-mergemerge(test1,test2,by="共同列的列名")merge(test1,test3,by.x = "name",by.y...= "NAME")# name为test1需要合并的列的列名矩阵matrix -**二维，只允许一种数据类型新建 子集-[]转置-t()转换为数据框: as.data.frame...()画热图pheatmap::pheatmap()列表list:可装万物新建 子集[[]]、$补充：元素的“名字”-names()难点：数据框按逻辑值取子集删除变量
学习R会慢慢的发现，数据的前期准备通常会花费很多的时间，从最基础的开始学，后面逐渐使用更便利的工具（R包）解决实际的问题。...4.5 缺失值 R中的字符型缺失值与数值型数据使用的缺失值符号是相同的。缺失值以符号NA（Not Available，不可用）表示。...(A,B) 如果两个数据框拥有相同的变量，则可以在行上进行合并，使用rbind()： total <- rbind(dataframeA,dataframeB) 4.10 数据集取子集 4.10.1 选入...（保留）变量 数据框中的元素是通过dataframe[row indices,column indices]这样的记号来访问的，可以通过这种方法轻松的选取变量。...library(sqldf) OK，使用基本的函数解决数据管理就先写这么多，后面再陆续更新一些R包解决较复杂的数据处理管理。
如多尺度卷积神经网络(MS-CNN)和尺度感知的快速卷积神经网络(SA-FastRCNN)分别基于Faster R-CNN和Fast R-CNN框架强调了尺度问题，针对不同尺寸的行人特征设计了不同尺度的子网络...训练时利用训练数据集中行人的标注信息(坐标、宽、高)形成基于目标框式的分割区域，作为行人分割的标注。...而且基于目标检测中的R-CNN缺乏挖掘难负样本的机制，将这样的R-CNN直接用于行人检测时对于被遮挡严重或者尺寸较小的行人检测效果不佳。...▲ 表 1 Caltech数据集中部分子集的划分标准 ▲ 表 2 CityPersons数据集中部分子集的划分标准 本文实验中，采用行人检测和目标检测领域常用的漏检率(Miss rate, MR)...Caltech数据集的检测性能已接近饱和，因此在Reasonable子集上性能的提升非常重要。但在Heavy子集上效果低于Faster R-CNN + ATT，排在第二位。
p=30914原文出处：拓端数据部落公众号我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。本文获取了全国的2021年全国的气候数据。...step(glm.po2)summary(glm.step)vif从模型中变量的VIF值来看，大多数变量之间不存在较强的多重共线性关系。...全子集回归来选出最优的模型全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...----最受欢迎的见解1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现3.matlab中的偏最小二乘回归（PLSR）和主成分回归（PCR）4.R语言泊松Poisson...用线性回归预测股票价格9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI，NRI指标
今天这篇跟大家分享我的R VS Pyhton学习笔记系列5——数据索引与切片。 我之前分享过的所有学习笔记都不是从完全零基础开始的，因为没有包含任何的数据结构与变量类型等知识点。...R语言： 数据框索引： 基于数据框本身提取 subset函数 filter+select函数 Python： 数据框自身的方法 ix方法 loc方法 iloc方法 query方法 -----------...通常情况下这种取值是没有任何意义的，行索引最常用的场景是用于条件索引，来基于分类字段筛选数据子集。...好吧，讲了这么多，终于可以开始总结一下R语言与Python的切片索引规则重要的区别了： R语言中生成数据框使用的圆括号，Python中则根据不同数据类型分别定义（列表用方括号、元组用圆括号、字典和几何用花括号...R语言与Python均可以基于数据框自身进行索引切片，同时又都可以通过外部索引函数进行条件索引。
2.向量是一维的【r语言的一个数据，可以被赋值】=是被装进变量里的东西，是固定的 eg.数字1：5、字符串“a”、“b”、逻辑值“T”“F”“T” 3....一、数据框【将内容作成表格、画图】 来源：1.代码新建、2.读取表格文件、3.现有数据转换或处理、4.R语言内置数据 1.用代码新建一个名为df1的数据框 df1 的目的文件在你开着的R.project的同个文件夹中才能运行代码打开 3.数据框的属性【这个属性是指数据框中黑色加粗的字体，不属于表格内容！只是表格的属性！...取出来的是符合条件的子集】 筛选score > 0的基因 > df1[df1$score > 0,]内容写在逗号前取子集是按行来取子集 取df1数据框中score那一列大于0的df1值如第一行、第二行...8）如何取数据框的最后一列？ 变量[,ncol(变量)]这个函数：与最后一列绑定！！当用于批量处理的时候！
数据和特征决定了机器学习的上限，而模型和算法只是无限逼近这个上限而已。 基于大量数据的简单模型胜于基于少量数据的复杂模型；更多的数据胜于聪明的算法，而好的数据胜于多的数据。...数值特征(定量数据) 主要考虑因素：==大小和分布== 对于目标变量为输入特征的光滑函数的模型，如线性回归、逻辑回归，其输入特征的大小很敏感，因此，使用光滑函数建模时，有必要对输入进行归一化。...对于基于树的模型，如随机森林，梯度提升树等，对输入特征的大小不敏感，输入不需要归一化。...最大最小值缩放 最大绝对值缩放 基于某种范数的归一化 平方根缩放或对数缩放：方差的稳定变换 对有异常点的数据可采用健壮的缩放，如中位数、分位数 缺失值处理。...在决策树中，深度较浅的节点一般对应的特征分类能力更强（可以将更多的样本区分开）。对于基于决策树的算法，如随机森林，重要的特征更有可能出现在深度较浅的节点，而且出现的次数可能越多。
变量名只起提示作用，是赋值对象 ②、由已有的数据转换或处理得到：as.data.frame() ③、读取表格文件： df2 <- read.csv("gene.csv") df2 ④、R语言内置数据：如...iris 2、数据框的属性 #3.数据框属性 # dim(df1) nrow(df1) ncol(df1) # rownames(df1) colnames(df1) 注意：dim()读取行数列数、nrow...()读取行数、ncol()读取列数、rownames()读取行名、colnames()读取列名 3、数据框取子集 ①、$:取数据框中的某一项 #4.数据框取子集 df1$gene mean(df1$...： 5、数据框的修改 数据框的修改和向量类似，先提取出要修改的值，重新赋值后，修改成功了 注意下面这张图片： 提个小问题：你知道这两句代码的区别吗？..."r4") #只修改某一行/列的名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" 6、数据框的连接 我们如何将这两个数据框连接起来呢？
作业讲解 R data 文件：存储有用变量，传递数据 save load # 使用save()函数保存为RData文件 # 创建一些要保存的变量 study1.df 的数据框 | 数据框 一列只能有一种数据 | 列表 没有限制 | 区分矩阵和数据框：根据生成它的函数 或 class() is()族函数 重点：数据框 1.数据框来源 （1）用代码新建 （2）由已有数据转换或处理得到...（3）读取表格文件 （4）R语言内置数据 2.新建和读取数据框 # data.frame 函数 df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4),...# [1] 3 #行名 列名 rownames(df1) ## [1] "1" "2" "3" "4" colnames(df1) ## [1] "gene" "change" "score" 4.数据框取子集...","r2","r3","r4") #只修改某一行/列的名 colnames(df1)[2] 的列名，就是修改列名这个向量的第二个元素 6.两个数据框的连接 merge
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