前面我们学习了ggplot2中组合图形的绘制，在科研论文中，组合图形每张子图通常需要加上ABCD等标签，如下图所示。 ? 这种ABCD标签既可以在PS或者AI中添加，也可以在R中直接添加。...今天我们来学习组合图形中怎么添加ABCD标签。 组合图形的标签添加可以使用ggpubr包的ggarrange()函数或annotate_figure()函数。 1....对象列表 plotlist # 要显示的绘图列表 ncol、nrow # 图形组合的列数和行数 labels # 要添加到图形中的标签列表，可以设置lable="AUTO"或"auto"自动生成大写标签或小写标签...label.x、label.y # 相对于子图，图标签x、y位置的值或向量，x默认为0，y默认为1，也就是左上角； hjust、vjust # 调整每个标签的水平或垂直位置，单个值应用于所有标签，值向量应用于每个标签...widths # 相对列宽度的数值向量；如widths = c(2, 1)表示第1列宽度是第2列宽度的两倍 heights # 同上 legend # 指定图例位置的字符；允许值为"top", "bottom
scales: 这个参数通常由 ggplot2 内部处理，在这里并没有具体使用。 r: 圆的半径，默认为 3。这是文本标签围绕的圆的大小。 x0: 圆心的 x 坐标，默认为 0。...y0: 圆心的 y 坐标，默认为 0。 start: 起始角度，默认为 45 度。表示第一个文本标签的起始位置。 end: 结束角度，默认为 -45 度。表示最后一个文本标签的位置。...这个对象继承自 ggplot2 的 Stat 类，并定义了一些自定义的行为和属性，用于在 ggplot2 中实现圆形文本布局。...这个参数描述了数据中的变量如何映射到视觉属性。 3.data：要显示的数据。 4.position：指定图层中几何对象的位置调整方式。默认值为 "identity"，即不进行位置调整。...默认值为 FALSE。 6.hjust：文本水平对齐方式，默认值为 1。 7.show.legend：逻辑值，是否在图例中显示这个图层，默认值为 NA。
三、ggplot2中的数据变换 一、基本绘图 ggplot2绘图是逐步叠加式的，由+号进行连接，每个函数控制着自己的部分。...，接下来将逐步对其进行微调 (1) 添加标题、横纵轴标签 ggplot(data=singer, aes(x=voice.part,y=height,fill=voice.part,color=...II.坐标轴标签样式调整 #axis.text.x对x轴标签调整 #axis.text.y对y轴标签调整 #axis.text 统一对坐标轴标签调整 #angle旋转的角度 windowsFonts(myFont...multiplot(p1,p2,p3,p4,cols=2) 这种方式虽然快捷，但它是默认按列进行排列的，无法指定各个图片放置的位置，当然也无法指定某个图片占一排的情况。...图片p3占画布第二行的第二个位置 通过编写自定义函数，可以实现对图片指定位置摆放 三、ggplot2中的数据变换 通过上述的介绍，我们可以知道，其实ggplot中图例的出现是由于aes
也正因其代表不同的图层，因此也可以利用新的图层对旧的图层进行叠加（或覆盖）。 先后顺序 但也正和图层的叠加一样，R中ggplot 的叠加也有先后顺序，后来的图层会覆盖在原来的图层上。...因此某种程度来说，统计变换对应的函数和几何对象对应的函数差别不大。 geom_bar 相当于默认的帮助我们以cut 列作为统计对象，对diamonds 表格进行频数计算。...theme 中的参数，如通过rel函数将字体大小提升到1.5倍： ggplot(new_metadata) + geom_point(aes(x = age_in_days, y= samplemeans...绘图中的标签进行修改。...") # 图例标签修改 p + labs(x = "New x label") # x轴标签 p + labs(title = "New plot title", subtitle = "A subtitle
其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观，逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数（图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色）。...；第二种是应用一个坐标变换。...通过坐标变换，数据则不会被修剪。从本质上讲，只是将数据放大或缩小到指定的范围。...标度范围是0～1（其中0对应黑色，1对应白色），灰度调色板的默认范围是0.2～0.8，但这个可以更改。
在ggplot2中，图层可以包括几何对象（如点、线、面等），统计变换，数据映射等。 比例（scales）： 定义了图形的比例尺，例如x轴和y轴的取值范围和断点。...标签（labels）： 可能包含图形的标签信息，例如轴标题、图例标题等。...默认情况下，包括所有群组。 sort：根据被绘制属性的平均表达量对身份类别（x轴上）进行排序。你也可以传递'increasing'或'decreasing'来改变排序方向。...group.by：根据对象元数据中的不同方式对细胞进行分组（例如，orig.ident）。 split.by：对象元数据中的一个因子，用于分割图表。传递'ident'可以按细胞身份分割。...默认是选择data数据进行可视化的，当需要选择counts矩阵进行可视化时，可以使用slot参数进行指定 #默认data数据可视化结果 VlnPlot(pbmc, features = c("NKG7"
2 坐标轴标尺修改（x , y） 本部分主要是对坐标轴做如下改变， 更改坐标轴名称 更改x轴上标数的位置和内容 显示对一个轴做统计变换 只展示一个区域内的点 更改刻度标签的位置 实现上面的这些可以使用scale_x...注：除使用scale参数进行设置外，后面会介绍使用更简单易用的函数。 五 统计变换（Statistics） ggplot2提供了多种统计变换方式，此处介绍两种较常用的。...2 stat_smooth 对原始数据进行某种统计变换计算，然后在图上表示出来，例如对散点图上加一条回归线。...#添加默认曲线 #method 表示指定平滑曲线的统计函数，如lm线性回归, glm广义线性回归, loess多项式回归, gam广义相加模型(mgcv包), rlm稳健回归(MASS包) ggplot...注：以下为ggplot2提供的其他统计变换方式，也可以自己写函数基于原始数据进行计算。
3-改变图例标题和子标签 改变图例标题的方法有很多，关于子标签，可以使用scale_xx_discrete 定义 labels ： ggplot(chic, aes(x = date, y = temp...，可以指定图例背景为透明，好看一些： 4.3-调整图例方向 默认下，图例显示是竖直的（自上而下），我们可以将其改变为水平horizontal ： ggplot(chic, aes(x = date,...其实不只是图例，aes 中设定的属性都可以进行排序。...规则是现将排序的列转为因子类型，并对levels 属性进行调整： chic$season <- factor(chic$season, levels = c("Winter", "...默认下，如果是多个图都指定了某个分组： 图例标记也会非常智能的显示的。
ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机，但是往往在我们用ggplot2画图时候，需要根据需求更改坐标，图例等，最常见的就是更改x，y坐标系的名称。...在ggplot2中，坐标系与比例尺和参考线是自动生成的，并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板，今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺，调整中断和标签，修改轴和图例等。...强大的 Scale包，可以实现在ggplot基础上，对图形进行微调及更改。...1.基础底图 Scale包为ggplot底图提供了四种样式的比例尺： demo_continuous() and demo_log10() for numerical axes demo_discrete
() #使用geom_text绘制标签散点图 使用geom_label绘制标签散点图 p+geom_label() 绘制点，并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移 p+geom_point(...color='dodgerblue')+geom_text(nudge_x = 0.15,nudge_y = -1) #所有标签整体向右平移0.15，向下平移1 使用angle参数对标签角度进行设置 p...(dat,aes(x,y,color=p,size=q,shape=r))+geom_point() #画出散点图，在不对图例进行任何调整的情况下，图形有测也会出现三个图例，分别是color,size,...在theme函数中，与图例有关的主要参数有： 参数 用法 功能 legend.background 接受函数element_rect() 定义图例背景 legend.margin 接受数值 定义图例的边缘范围.../width 接受unit() 定义图例中每一个小图标的背景大小 legend.text 接受函数element_text() 定义图例中每一个图标的标签 legend.text.align 取值0-1
然后通过 covid中的country与africa中的country进行数据关联。 cd=left_join(africa,COVID)，将covid数据关联到africa sf数据库中。...默认的颜色好像有点丑，而且与WHO的图不一样，Cumulative_cases是连续性变量，需要对Cumulative_cases进行变量转换。...这里提一下，在ArcGis中，可以选择几何分段，jenks分段，等间距分段对连续性数值进行转换。得到分类的图例数据。...R里面也有对应的函数cartography::getBreaks()可以实现对应的功能。 首先我们对Cumulative_cases进行分类，按照WHO的分类条件，分成5类。...默认给定的。
4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包，它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射，例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后，通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数，在图中绘制图形元素其他类型的图形，如直方图...(4)统计变换 统计变换函数以“stat”开头，它们可以对原始数据进行某种函数变换，是非常重要的功能。...()+stat_smooth() 第二图层添加散点;第三图层对Y轴作log10变换;第四图层添加平滑的统计变换 (5)分面 当我们想要观察某一分类变量对数据的影响情况时，仅通过shape, color区分是不够的...”) 生成文件后，默认在后台扫一开，所以查看图形文件前需要用dev.off()关闭文件 此外，程序包ggplot2中的函数ggsave()也用于保存图形，并且可以指定为不同的文件类型。
几何对象（geometric）:几何对象（geom）代表你在图中实际看到的元素，如点、线、多边形等。 统计变换（statistics）:统计变换（stat）是对数据进行的某种汇总。...例如将数据分组计数以创建直方图，或将一个二维的关系用线性模型进行解释。统计变换是可选的，但通常非常有用。...我们通常使用的是笛卡尔坐标系，但也可以将其变换为其它类型，如极坐标和地图投影。 图层（Layer）:图层的作用是生成在图像上可以被人感知的图形。...图5添加图层中的shape的映射关系 p6 <- p + geom_point(aes(y = carb)) + labs(title="图6") #图6修改默认的y的映射关系, 注意图中y轴名称仍然以默认的...对比图10和图11，aes中color参数属性可以发现，如color对应变量为factor因子时，图10中图例分组显示不同颜色；但如factor对应的变量为数值，ggplot将其识别为连续变量，数值大小决定颜色深度
今天复现文章中的Fig.1A，即饼图绘制。...接下来再对这张图进行修饰即可，观察Fig.1A，知道应该做如隐藏x，y轴、移除多余的图形元素、将value值标注在对应的色块中并且居中排列、将图例放在图的下方按照两列排列并隐藏图例名称、图例外有黑边包边...（或饼图）的堆叠位置中的显示方式。...在饼图中，position_stack(vjust = 0.5)用于将标签（如百分比）放置在每个饼图扇形区域的中间位置，从而使得标签更清晰地显示在每个部分的中心。.../results/Figure 1A.pdf') 其中如何在饼图外加分组名称暂未研究明白。
图层（Layer）：图层是ggplot2中最基本的组成单元。每个图层都由数据、图形属性和统计变换组成。通过将多个图层叠加在一起，可以创建复杂的图形。...几何对象（Geom）：几何对象是图层中的图形元素，用于表示数据的形状、大小、颜色等属性。ggplot2提供了多种几何对象，如点、线、条形、面积等。...统计变换（Stat）：统计变换是对数据进行汇总、转换或计算的过程。例如，计算数据的均值、中位数、频率等。ggplot2提供了多种统计变换函数，如summarize、count、bin等。...ggplot2提供了多种坐标系，如笛卡尔坐标系、极坐标系等。 主题（Theme）：主题用于设置图形的整体样式，包括背景色、字体、标签等。...它提供了许多用于绘制统计图表的高级函数，如散点图、直方图、小提琴图和回归图等。 美观的默认样式：Seaborn具有吸引人的默认绘图样式和颜色主题，使图表在外观上更具吸引力。
ggplot2的语法讲解 ---- 如果读者对R语言比较熟悉，一定听过或使用过ggplot2的绘图体系了。...，有两点需要说明，一方面，在ggplot2绘图过程中均采用图层思想，将多个图形进行叠加和设置；另一方面，图层思想是通过代码中的加号（+）表现出来的。...ggplot函数所指定的数据框； stat：借助于该参数控制绘图数据的统计变换，默认为'count'，表示计数（前提是绘图数据为明细数据）；如果指定为'identity'，表示直接使用原始数据绘制y轴（...函数中； na.rm：bool类型的参数，在剔除绘图数据中的缺失值时，是否不返回警告信息，默认为FALSE； show.legend：bool类型的参数，是否显示条形图的图例信息，默认为NA，即表示显示图例...；如果设置为FALSE，则不显示任何图例；如果设置为TRUE，则显示图例； inherit.aes：bool类型的参数，绘图时是否延用ggplot函数中的数据和轴属性，默认为TRUE；根据作者的经验，如果
简介 我们知道在大语言模型中, 不管模型的能力有多强大，他的输入和输出基本上都是文本格式的，文本格式的输入输出虽然对人来说非常的友好，但是如果我们想要进行一些结构化处理的话还是会有一点点的不方便。...这个基础类提供了对LLM大模型输出的格式化方法，是一个优秀的工具类。...就是把LLM的输出用逗号进行分割。...然后在parse方法中对这个LLM的输出进行格式化，最后返回datetime。...，然后让LLM给我一个学生的信息，并用json的格式进行返回。
简介我们知道在大语言模型中, 不管模型的能力有多强大，他的输入和输出基本上都是文本格式的，文本格式的输入输出虽然对人来说非常的友好，但是如果我们想要进行一些结构化处理的话还是会有一点点的不方便。...这个基础类提供了对LLM大模型输出的格式化方法，是一个优秀的工具类。...就是把LLM的输出用逗号进行分割。...然后在parse方法中对这个LLM的输出进行格式化，最后返回datetime。...，然后让LLM给我一个学生的信息，并用json的格式进行返回。
看到打开了一个窗口，上部为图形预览窗口，下部有6个选项卡，分别对应各类主题细节的调整，下面我们进行详细解释。 设置Settings ?...Vjust：Y轴刻度值垂直位置调整，默认0.5为相对刻度线居中对齐，0为相对刻度线下对齐；1为相对刻度线上对齐 Angle：坐标轴角度，如标签过长，可调为30度或45度旋转，避免文字重叠的同时还可以节约空间...Legend Text 同上 图例背景属性 Legend Background 括填充色Fill，外边框类型Type、线宽Size和颜色Colour 图例核心属性 Legend Keys 即图例中颜色图状的属性...可以修改子标题(Subtitle)和图注(Caption)中的内容。...同时还可以修改文字的属性，如字体家族、样式、大小、颜色和水平位置 编辑结果导出绘图代码 以上面板中可修改上百个参数，并提供几百个属性值的选择。这些要是靠自己记住，那可真是太难了。
最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签（还有图例）。 接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...在上述例子中，geom_point()函数在图形中画点，创建了一个散点图。labs()函数是可选的，可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数，并且大多数包含可选的参数。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量，几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前，有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...选项 详述 color 对点、线和填充区域的边界进行着色 fill 对填充区域着色，如条形和密度区域 alpha 颜色的透明度，从0（完全透明）到1（不透明） linetype 图案的线条（1=实线，...指定刻度标记、labels=指定刻度标记标签、limits=控制要展示的值的范围 scale_x_discrete()和scale_y_discrete() breaks=对因子的水平进行放置和排序，labels
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