首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何在mac上将HDF5_DIR设置为hdf5安装目录

在mac上将HDF5_DIR设置为HDF5安装目录,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 首先,确认已经在mac上安装了HDF5库。如果尚未安装,可以通过以下命令使用Homebrew进行安装:
  2. 首先,确认已经在mac上安装了HDF5库。如果尚未安装,可以通过以下命令使用Homebrew进行安装:
  3. 打开终端,进入到你的用户主目录下。可以通过以下命令快速进入:
  4. 打开终端,进入到你的用户主目录下。可以通过以下命令快速进入:
  5. 编辑或创建一个名为.bash_profile的文件,该文件用于设置环境变量。可以使用以下命令进行编辑:
  6. 编辑或创建一个名为.bash_profile的文件,该文件用于设置环境变量。可以使用以下命令进行编辑:
  7. .bash_profile文件中,添加以下内容来设置HDF5_DIR环境变量:
  8. .bash_profile文件中,添加以下内容来设置HDF5_DIR环境变量:
  9. 其中,<version>是你安装的HDF5库的版本号。你可以通过以下命令查看安装的HDF5库的版本号:
  10. 其中,<version>是你安装的HDF5库的版本号。你可以通过以下命令查看安装的HDF5库的版本号:
  11. 保存并关闭.bash_profile文件。在vi编辑器中,可以按下Esc键,然后输入:wq命令保存并退出。
  12. 执行以下命令使环境变量生效:
  13. 执行以下命令使环境变量生效:

现在,你已经成功将HDF5_DIR设置为HDF5安装目录。你可以在你的开发工程中使用该环境变量来指定HDF5库的位置。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

在VMD上可视化hdf5格式的分子轨迹文件

压缩率高,存储下来的文件大小远小于csv等明文数据格式; 支持数据帧读取,有很多高效的数据处理软件vaex专门针对hdf5格式的文件读、写、可视化等进行了优化; 在传统量子化学领域,hdf5格式的文件就得到了大量的使用...在确定需要选择hdf5格式的文件作为分子动力学轨迹的存储格式之后,我们需要考虑下一步如何在已有的可视化软件,VMD中,去展示hdf5格式的轨迹文件。...,Fork的仓库地址:VMD-h5mdplugin,接下来我们看下如何安装与使用该插件。...h5mdplugin.so的文件,然后Makefile会自动将其拷贝到VMD的molfile目录下,如果安装过程中发现拷贝的路径与自己安装VMD的路径不一致,可以手动修改Makefile或者是手动拷贝过去...效果展示 安装完成后,让我们来看看效果: 感兴趣的童鞋可以通过该链接下载文件到本地测试一下,下载解压之后,直接用vmd xxx.h5md即可(这里的h5md格式本质上还是hdf5,只是在名称上稍作调整

66510
  • Amax K40 Linux GPU服务器重装记录

    安装系统遇到的问题 安装系统整个流程是这样的: 下载Ubuntu镜像,从科大的源上下载 制作启动U盘,采用软碟通来制作 插入U盘到机器,进入BIOS设置,选择Legacy模式,并将U盘的启动顺序放在最前面...刚开始我们选择了划分好的某个分区,/dev/sdd1,但是有问题,安装后总有错。后来查看网上的资料,发现都是采用没加下标的盘符,/dev/sdd。...Caffe编译过程中HDF5库路径的问题 在Ubuntu 16.04中,HDF5文件的lib目录不在系统默认的/usr/local/lib或/usr/lib目录下,而是在/usr/lib/x86_64-...同理,其include目录也不在标准目录,而是在/usr/include/hdf5/serial目录,因此也需要将其加入到INCLUDE_DIRS这一行,因此这两行的最终结果如下: 93 # Whatever...设置静态IP 服务器重装后,IP地址改变了,但是我们还是希望大家使用熟悉的IP地址,所以需要设置一个静态IP地址。

    1.8K20

    利用GPU和Caffe训练神经网络

    设置 如果你还没有把Caffe安装在你的系统上,我建议在一个允许GPU处理的EC2实例上工作,例如g2.2xlarge实例。...对于使用Caffe,我也建议你在你的实例上安装IPython Notebook——在这里可以找到教程。 定义模型和元参数 一个模型及其应用的训练至少需要三个配置文件。...数据层(一个用于训练,一个用于测试) 内积层(权值Ⅰ) ReLUs(隐含层) 内积层(权值Ⅱ) 输出层(用于分类的Soft Max) A,Soft Max层给出损失 B,准确性层——允许我们看到网络如何在训练的同时提升...LMDB(闪电内存映射数据库) LevelDB HDF5格式 HDF5可能是最容易使用的,因为你只需要采用HDF5格式把数据集存储到文件中。LMDB和LevelDB是数据库,所以你必须按照他们的协议。...对于一批64个特征矢量,每个长度93的Blob的形状(64,93,1,1)。 在将数据加载到LMDB时,你可以看到个别案例或特征向量存储在Datum的对象上。

    1.2K100

    VMD可视化hdf5格式的分子坐标文件

    这里我们介绍的是通过VMD来可视化hdf5格式的坐标文件——hdf5是量子化学领域非常常用的一个数据格式,对于规模较大的数据集有很好的性能支持。...安装hdf5插件 这里本地使用的是Ubuntu20.04的系统,如果是其他系统,有可能需要针对性的修改下。...接下来我们需要把这些动态链接文件拷贝到vmd的相应目录下,这个跟安装的位置有关系,比如博主的vmd是在local账号下安装的,vmd相关的库文件都在/usr/local/lib/vmd/这个路径下。...,本文通过介绍VMD-h5mdplugin这个插件的安装和使用方法,进一步演示了如何在VMD上直接展示hdf5格式文件的分子构象。...版权声明 本文首发链接:https://www.cnblogs.com/dechinphy/p/vmd-hdf5.html 作者ID:DechinPhy 更多原著文章请参考:https://www.cnblogs.com

    63340

    利用GPU和Caffe训练神经网络

    设置 如果你还没有把Caffe安装在你的系统上,我建议在一个允许GPU处理的EC2实例上工作,例如g2.2xlarge实例。...对于使用Caffe,我也建议你在你的实例上安装IPython Notebook——在这里可以找到教程。 定义模型和元参数 一个模型及其应用的训练至少需要三个配置文件。...数据层(一个用于训练,一个用于测试) 内积层(权值Ⅰ) ReLUs(隐含层) 内积层(权值Ⅱ) 输出层(用于分类的Soft Max) A,Soft Max层给出损失 B,准确性层——允许我们看到网络如何在训练的同时提升...LMDB(闪电内存映射数据库) LevelDB HDF5格式 HDF5可能是最容易使用的,因为你只需要采用HDF5格式把数据集存储到文件中。LMDB和LevelDB是数据库,所以你必须按照他们的协议。...对于一批64个特征矢量,每个长度93的Blob的形状(64,93,1,1)。 在将数据加载到LMDB时,你可以看到个别案例或特征向量存储在Datum的对象上。

    79350

    保存并加载您的Keras深度学习模型

    2017/03更新:添加了首先安装h5py的说明。...每个示例还将演示如何在HDF5格式化的文件中保存和加载你的模型权重。 这些例子将使用同样简单的网络训练,并且这些训练被用于Pima印第安人的糖尿病二分类数据集上。...你可以下载此数据集,并将其放置在你的工作目录中,文件名为“pima - indians - diabetes.csv”。 确认您已安装最新版本的Keras(截至2017年3月v1.2.2)。...注意:您可能需要先安装h5py: sudo pip install h5py 将你的神经网络模型保存到JSON JSON是一种简单的轻量级的数据交换格式。...然后将该模型转换为JSON格式并写入本地目录中的model.json。网络权重写入本地目录中的model.h5。 从保存的文件加载模型和权重数据,并创建一个新的模型。

    2.9K60

    离线编译OpenMolcas+QCMaquis

    应使用高级一些的LaTeX编译器,TeX Live等。...可以使用个人用户安装,也可以用root账户装。本文安装步骤以个人用户例,若读者曾经装过以下将介绍的某些库(且版本符合要求),则可直接跳过相应步骤。...注意若将GCC安装到非默认位置(/opt/gcc-5.4.0),请勿在自己账户的~/.bashrc里导出关于/usr/lib64的库路径,因为显然/usr/lib64里是旧版的库,故意导出旧版库容易造成后续编译问题...安装HDF5库 到 https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ 下载HDF5源码压缩包,例如hdf5-1.12.0.tar.bz2,(发送到...完成后所需库文件都在hdf5-1.12.0文件夹里,而原hdf5文件夹没有用了,可以删除,这也是一开始更改目录名的目的。 2.

    1.5K31

    2023免费mac切换win双系统虚拟机Parallels

    另外在搭载Apple M1 Ultra芯片的Mac Studio上运行时,Parallels Desktop 18也Windows分配了更多RAM和CPU内核,在Mac上将Windows11运行的速度提高了...“在Parallels Desktop 18中,我们做的最重要的一个功能,就是简化了安装新版Windows系统的过程,无论使用者用的是英特尔处理器还是M系列处理器的Mac设备,都可以一键完成Windows11...的安装和配置。”...另外负责磁盘操作的Parallels Tools驱动程序也获得了更新,过去无法在Parallels Desktop 17中运行的游戏(CS:GO)也能在Parallels Desktop 18中成功启动...具体来说,网络调节器让用户能够为虚拟机设置各种网络条件(带宽、丢包、延迟),类似于Windows和Linux虚拟机;在搭载M1芯片的Mac设备上,可以将虚拟机网络与Mac隔离以提高安全性,并将Parallels

    5K10

    Parallels Desktop 18 激活码 - Mac 上优秀的虚拟机软件

    在搭载 Apple M1 Ultra 芯片的 Mac Studio 上, Windows 分配了更多 RAM 和 CPU 内核,在 Mac 上将 Windows 11 的性能提高了 96%。...在 Apple M1 Mac 计算机上将虚拟机网络与 Mac 隔离以提高安全性,并将 Parallels Desktop 用作虚拟化提供程序来启动 Minikube 群集。...如果您需要 Windows,系统将提示您下载并安装 Windows 11,或如果您持有的是基于 Intel 的 Mac,则可使用 Boot Camp 进行安装。...运行 Microsoft Office、Visual Studio、SQL Server、PowerBI、AutoCAD、MetaTrader 等应用程序。...融合模式 在「Coherence™ 模式」下使用应用程序时,您可以隐藏Windows,或者,如果您是初次使用 Mac,则可以将 Windows 设置占据整个屏幕,就像是在使用 Windows PC 一样

    3.4K10

    2024最新 Mac OS版的xshell——Mac OS 终端利器iTerm2入门教程

    Mac OS 终端利器 iTerm2 入门教程 ️ 文章目录 Mac OS 终端利器 iTerm2 入门教程 ️ 摘要 引言 正文 安装与配置 安装iTerm2 初次配置 创建新会话的步骤 高级特性介绍...本文内容涵盖了关键词iTerm2安装教程、Mac OS终端命令、高级终端技巧等。 引言 作为Mac OS用户,在处理日常开发任务时,强大的终端工具是不可或缺的。...初次配置 打开iTerm2,通过Preferences(偏好设置)进行个性化设置。 在Profiles标签下,可以定制各种外观设置字体、颜色主题等。...选择配置文件(可选): iTerm2允许你不同的会话设置不同的配置文件。这些配置文件可以预定义特定的环境变量、执行命令等。...详细代码案例 # 更新Homebrew(假设已经安装) brew update # 安装一些常用工具 brew install wget ️ 操作命令 查看当前路径:pwd 列出目录内容:ls 更改目录

    2.4K10

    从零开始:Postman安装汉化及使用教程

    图片**Windows 版汉化**1、进入Postman安装地址/版本/resources目录(例如:C:/Users/用户名/AppData/Local/Postman/app-8.8.0/resources...app 文件夹放入resources目录(如果已存在就选择替换);图片4、重启 Postman 就可以了。...所以要设置关闭自动更新。打开 Postman,点击界面右上角的齿轮图标,选择“设置”。在弹出的“设置”窗口中,选择“更新”选项卡,禁用自动更新。...输入请求的 URL,选择请求方法( GET、POST、PUT、DELETE 等),并填写请求参数。点击“发送”按钮,即可发送请求并查看响应结果。...知识扩展:了解更多 Postman 相关使用技巧:**如何在 Postman 中配置和使用证书****如何在 Postman 中进行 HTTPS 请求**

    3.3K20

    开源一款云存储图床平台,支持很多云!

    ,加速目录加载速度 对于私有存储桶等支持复制预签名链接进行分享 优化了PicGo的界面,解锁了窗口大小限制,同时美化了部分界面布局 mac平台安装包已签名,从源头解决了PicGo上的安装包已损坏的日经问题...如何在Typora中使用 Windows: 进入Typora设置界面,选择图像,将上传服务设置 PicGo(app),然后在 PicGo路径中填写PicList的安装路径,如下图所示: image...或者,您也可以使用 npm install piclist命令安装PicList-core,然后上传服务设置 PicGo-Core(command line)。...如何在Obsidian中使用 在社区插件中搜索安装 Image auto upload Plugin,然后进入插件设置页面,修改默认上传器 PicGo(app),设置 PicGo server http...构建成功后,会在 dist_electron 目录里出现构建成功的相应安装文件。

    1.8K10
    领券