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Kubernetes上的高性能计算 (HPC)

从 HPC 到 Kubernetes 基于 Kubernetes 的云原生计算已成为新软件项目的实际标准。对于许多用例来说,这很简单,但高性能计算 (HPC) 并不是一个简单的领域。...随着大数据应用程序从低级分布式计算库( MPI)演变为 Spark 和 Ray 等框架,Slurm 和 LSF 等底层平台也受到 Kubernetes 的挑战,Kubernetes 可以适应以提供 HPC...(Spark Operator GitHub) Volcano 虽然前两个项目为分布式系统提供了一个 Pythonic 入口点,但确保作业以有效利用云资源的方式可靠执行非常重要。...ML 团队可能需要根据优先级调度作业等待一组作业全部准备好后再运行这些作业的功能。 这就是 Volcano 项目让您实现的目标,它通过替换默认的 kube-scheduler 来实现此目标。...未决作业存储在集群配置存储 (etcd) ,这可能会根据作业队列的大小造成可用性风险。 Armada 通过使用其自己的控制平面(而不是使用 Kubernetes 控制平面)提供此功能来解决此问题。

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生信自动化流程搭建 06 | 指令

Nextflow自动为conda指令列出的给定包名称设置环境。...仅当使用基于网格的执行程序时才考虑此指令: SGE,LSF,SLURM,PBS / Torque,PBS Pro, Moab和HTCondor执行程序。...待处理的作业被杀死(默认) finish 当出现错误情况时,启动有序的管道关闭,等待任何提交的作业的完成。 ignore 忽略进程执行错误。 retry 重新提交执行以返回错误条件的进程。...Grid Engine执行 uge 该过程是使用Univa Grid Engine作业计划程序执行lsf 该过程是使用Platform LSF作业计划程序执行的 slurm 该过程使用SLURM作业调度程序执行...queue queue目录使可以设置在管道中使用基于网格的执行程序时调度作业的队列。

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    生信自动化流程搭建 07 | 配置文件

    ---- executor 的域 executor配置范围允许您设置可选的执行程序设置,下表列出。 名称 描述 name 使用执行人的名称,local,sge等。...270 sec killBatchSize 确定在单个命令执行可以杀死的作业数(默认值:)100。...10 sec' perJobMemLimit 指定平台LSF 每个作业的内存限制模式。参见LSF。 jobName 确定提交给基础集群执行器的作业的名称,例如。...自动挂载 当trueNextflow自动将主机路径安装在执行的容器时。它要求您在Singularity安装启用了用户绑定控制功能(默认值:)false。 cacheDir 远程奇点图像的存储目录。...可以使用以下设置: 名称 描述 autoMountHostPaths 自动将主机路径安装在作业窗格。仅在使用单节点群集时用于开发目的(默认值:)false。

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    Perl 语言入门学习

    本文旨在为初学者提供一个Perl语言入门学习的概览,包括Perl的基本语法、变量与数据类型、控制结构、函数与模块、以及如何在实践应用Perl。 1....2.2 注释 Perl的注释以#开始,直到行尾。例如: # 这是一个注释 print "这不是注释,将被执行。\n"; 3. 变量与数据类型 Perl是一种动态类型语言,变量的类型在运行时确定。...变量以$(标量变量)、@(数组)、%(哈希表)或&(子程序引用,较少使用)开头。 标量变量:存储单个值,如数字或字符串。...实践应用 Perl在实际应用中非常广泛,特别是在文本处理和网络编程方面。例如,可以使用Perl编写脚本自动处理日志文件、生成报告、执行网络请求等。...系统管理:Perl脚本常用于自动化系统任务,备份、监控等。 7. 结论 Perl以其强大的文本处理能力、灵活的语法和丰富的第三方库,在多个领域展现出了其独特的价值。

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    如何使用Kubernetes Job运行一次性任务

    Job 概念 在 kubernetes ,Deployment、DaemonSet会持续运行任务,这些 pod 的进程在崩溃退出时会重新启动,永远达不到完成态。...在发生节点故障时,该节点上由 Job 管理的 pod 将按照 ReplicaSet 的 pod 的方式, 重新安排到其他节点,以确保任务能够成功完成,所以 Job 通常用于执行一次性任务或批处理作业。...Job 的一些常用使用场景: 批处理作业:Job可以被用来运行需要大量计算资源的作业,例如对大量数据的处理,机器学习模型训练等。...Job 发现 Job 完成以后,Pod 依然存在,完成的 Job 通常不需要留存在系统,在系统中一直保留它们会给 API 服务器带来额外的压力 自动清理已完成 Job (状态为 Complete 或...需要确保 Job Spec 定义的容器可以正常运行,并有足够的资源和权限执行指定的操作。 在设计 Job 时,应考虑 Pod 失败和重试的情况,并设置合适的重试次数和间隔时间。

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    GitHub Actions是什么

    这些工作流程可以自动化各种软件开发活动,构建、测试、部署代码等。GitHub Actions的工作基于“工作流”,一个工作流可以由一个或多个“作业”组成这些作业定义了一系列要执行的“步骤”。...示例以下是一个简单的GitHub Actions工作流示例该示例演示了如何在每次向master分支推送代码时自动运行测试:在这个示例,工作流名为“CI”它会在每次向master分支推送代码时触发。...三、灵活配置和定制自定义触发条件:工作流可以根据不同的触发条件(代码推送、拉取请求、定时任务等)自动执行,满足不同的业务需求。...灵活的任务定义:工作流的每个作业(Job)和步骤(Step)都可以根据需要进行自定义,包括使用的工具、执行的命令等。...四、提高开发效率快速反馈:自动化流程能够迅速提供构建、测试和部署的结果,帮助开发团队快速响应问题并调整开发策略。减少等待时间:工作流可以并行执行多个作业,提高整体执行效率,减少开发过程等待时间。

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    CKAD考试实操指南(四)---优雅设计:掌握Pod设计技巧

    # 此处需要将 替换为第一步获取到的 Pod 名称。:nginx-5c7588df4d-4q8q2。...# --for=condition=complete:这是 wait 命令的一个选项,指定要等待的条件。它要求作业的状态为 "complete",也就是作业的所有任务都已成功完成。...同样的,如果 Job 的成功执行次数小于 1,Kubernetes 就会像这个游戏一样,自动产生新的 Pod 继续执行,直到成功执行了一次,或者执行错误的次数达到了 backoffLimit 指定的次数则自动停止...kubectl delete cj time-limited-job 知识点: startingDeadlineSeconds 参数指定了作业启动的截止时间,即作业的第一个实例开始执行的最大等待时间。...如果作业的启动截止时间已过,但 CronJob 的时间计划仍然满足条件,则 CronJob 会尝试启动下一个作业实例,而不会等待上一个实例的完成。

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    Azure 机器学习 - 使用无代码 AutoML 训练分类模型

    了解如何在 Azure 机器学习工作室中使用 Azure 机器学习自动化 ML,通过无代码 AutoML 来训练分类模型。 此分类模型预测某个金融机构的客户是否会认购定期存款产品。...登录到 Azure 机器学习工作室 选择“创建工作区” 提供以下信息来配置新工作区: 字段 说明 工作区名称 输入用于标识工作区的唯一称。 名称在整个资源组必须唯一。...三、创建自动化机器学习作业 通过 https://ml.azure.com 处的 Azure 机器学习工作室完成以下试验设置和运行步骤,这是一个综合性的 Web 界面,其中包括了为所有技能级别的数据科学实践者执行数据科学方案所需的机器学习工具...五、配置作业 加载并配置数据后,可以设置试验。 此设置包括试验设计任务,选择计算环境大小以及指定要预测的列。 选择“新建”单选按钮。...对于本教程,列表首先显示评分最高的模型(评分根据所选 AUC_weighted 指标给出)。 在等待所有试验模型完成的时候,可以选择已完成模型的“算法名称”,以便浏览其性能详细信息。

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    分布式场景下的定时任务实践

    本次结束执行时间: 每次执行结束时更新,如果需要支持按结束时间间隔则需要 register 将定时任务的信息注册到“定时任务服务”,最重要的是一个表示该方法的唯一标识,可以自定义,也可以来自应用+完整类...提供的能力,spring全家桶各种starter就是基于这个能力实现的。...防坑指南 应用关闭/重启导致锁未释放 Q:任务执行如果有人重发怎么办?任务执行到一半应用关闭,锁也没释放,重启后永远查询不到那个作业的记录。...= false; // 用一个标记让轮询直接跳过简单粗暴 jobExecutor.shutdown();// 不再接收新任务 try { // 等待所有作业执行完...schedule-service短暂抽风 重启、挂掉、网络故障、数据库异常等意外出现时,众多业务系统无法和中心交流,也就无法判断能否执行任务,最好也就不要执行了,耐心等待或者告警。

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    CONQUEST 编译安装指南 Slurm 篇

    我们常见的集群作业管理系统有 PBS、LSF 和 Slurm等。其中,笔者在超算中心、研究所高性能计算集群接触比较多的就是 PBS 作业管理系统。...这样一来,表面上我们仍然可以使用 PBS 中常用的脚本文件和相关命令,而实际上管理和执行任务的作业管理系统则是 Slurm。...Slurm 使用基于 Hilbert 曲线调度或肥胖网络拓扑结构的最适算法,以便优化并行计算机的任务分配。...:查看节点与分区状态 squeue:查看队列状态 srun:执行作业 资源管理系统实体 Slurm 资源管理系统的管理对象包括:节点,分区,作业作业步。...:Job 一次资源分配 位于一个分区作业不能跨分区 排队调度后分配资源运行 通过作业 ID 标识 作业步:Jobstep 通过 srun 进行的任务加载 作业步可只使用作业的部分节点

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    深入了解命令提示符(CMD):Windows的强大命令行工具

    pause:暂停批处理的执行等待用户按下任意键继续。 这些是批处理和脚本中常用的命令,它们允许你组织和控制一系列的命令,实现自动化的操作。...它们使用特定的扩展 .bat 或 .cmd)并包含一系列命令、条件语句和循环等,用于在命令提示符或批处理环境执行一系列操作。...保存文件:将文件保存到指定的位置,并使用适当的文件扩展 .bat 或 .cmd)。 运行批处理文件:双击批处理文件,它将在命令提示符或批处理环境执行其中的命令。...5.2 自动化任务和批处理作业 自动化任务和批处理作业是在计算机系统执行预定义操作的自动化过程。...通过编写脚本或使用自动化工具,可以自动执行这些任务,减少手动干预,提高工作效率。 批处理作业:批处理作业是一系列命令或任务的集合,按照特定的顺序和条件执行

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    filebench - File system and storage benchmark - 模拟生成各种各样的应用的负载 - A Model Based File System Workload

    兼容posix 接口的文件系统我们不仅要测试 posix 接口是否兼容。随机读,随机写,顺序读,顺序写等读写模式下的性能。...我们还要测试在不同工作负载条件下的文件系统的性能的情况;Filebench 是一款文件系统性能的自动化测试工具,它通过快速模拟真实应用服务器的负载来测试文件系统的性能。...它不仅可以仿真文件系统微操作( copyfiles, createfiles, randomread, randomwrite ),而且可以仿真复杂的应用程序( varmail, fileserver...Filebench 比较适合用来测试文件服务器性能,但同时也是一款负载自动生成工具,也可用于文件系统的性能。所以filebench 是非常好用文件系统负载生成工具; ?...注意:一定要安装 filebench 需要在/usr/local/share/filebench 下生成一些文件) 使用: filebench 需要根据 WML 负载模型语言来进行描述负载,然后来进行执行

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    Dinky在Doris实时整库同步和模式演变的探索实践

    在数据开发中提供了用户在生产中常用的一些辅助功能, Flink SQL 自动提示与补全、语法校验、调试查询、血缘分析、Catalog 管理、Jar 任务提交、UDF 动态加载、全局变量、执行环境、语句生成和检查点托管等功能...Doris 在 Dinky 的应用——作业管理 在 Dinky 中支持创建和开发 Doris 类型的作业,可以对 Doris 数据源执行 Doris SQL 语句及查询其元数据信息,也支持如图所示的字段级血缘分析的展现...CDCSOURCE 也会解析成一个 Flink 作业执行,可自动解析配置参数,将指定的一个或多个数据库的数据全量+增量同步到下游任意数据源,也支持分库分表的同步。...四、FlinkCDC 实时模式演变 此外,还有一个用户比较关切的问题,如何在整库同步实现自动模式演变。...DDL 操作并毫秒级执行完成,避免双写和阻塞数据的问题,自动序列化,无需关心 Schema 变动,即无需重启 Flink 作业

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    大数据云原生系列| 微信 Flink on Kubernetes 实战总结

    Pulsar 计算(必要时也会访问其他外部存储,Redis、FeatureKV等),计算结果可以落地到多种存储系统,例如对于报表类业务,计算结果写入 mysql/pg;对于实时样本特征拼接作业,计算结果写入...虽然 Flink on Kubernetes Native 部署可以做到按需自动申请 TM,但是实际上我们的应用场景基本都是单 Job 的流计算,用户事先规划好资源也可接受,而且基于 Flink Operator...,我们可以做批调度,即 Gang Schedule,可以避免资源有限的情况下作业之间互相等待资源 hold 住的情况(例如大作业先提交,部分 TaskManager 长时间处于资源等待状态,小作业后提交...对于历史失败作业,我们在Kubernetes上也部署了一个 Flink History Server,可以灵活地扩缩容,从此再也不用担心半夜作业挂了自动重启无法追溯原因了。 ?...(包括 DDL、DML),然后调用 tableEnvironment.executeSql逐条执行,所以本质上是将库表临时注册到 default catalog

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    StarRocks学习-进阶

    提交的作业将异步执行,用户可通过 SHOW LOAD 命令查看导入结果。 Broker Load适用于源数据在Broker进程可访问的存储系统(HDFS),数据量为几十GB到上百GB。...desired_max_waiting_jobs 等待队列可以容纳的最多导入任务数目,默认值为100。FE处于PENDING状态(即等待执行)的导入任务数目达到该值,则新的导入请求会被拒绝。...此配置仅对异步执行的导入有效,处于等待状态的异步导入任务数达到限额,则后续创建导入的请求会被拒绝。...当数据库中正在运行的导入任务超过最大值时,后续的导入不会被执行。如果是同步作业,则作业会被拒绝;如果是异步作业,则作业会在队列中等待。...这个参数指定了Writer的等待超时时间。默认为600秒。如果在参数指定时间内Writer没有收到任何数据,则Writer会被自动销毁。

    2.7K30

    内存计算网格解释

    有些系统会为你复制并重新启动(Hadoop),当然,也有些系统会要求你通过一些基于UI的拐杖手动执行。...通常情况下,将会有多个作业在网格节点上执行,同时也有可能是多个作业正在执行等待执行。...这项工作在队列等待时长以及何时执行都由冲突SPI来进行控制,这有效地定义了后期负载平衡阶段。 作业窃取算法是负载均衡业务流程的一种开箱即用的实现。...例如,如果从作业中产生新任务,则等待该任务同步完成是错误的,因为作业线程在等待期间将保持占用状态,因此网格的线程可能会被用尽。...因此,在我们的示例,远程作业需要产生另一个任务并等待结果,我们的作业会产生任务执行,然后暂停自己本身。紧接着,每当新任务完成时,我们的工作就会醒来并恢复执行

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    Docker 容器命令:解析容器化应用程序的运行时

    4.1.2 容器运行本质 Docker容器存在的意义就是为了运行容器的应用,对外提供服务,所以启动容器的目的就是启动该运行容器的应用。容器的应用运行完毕后,容器就会自动终止。...镜像是在docker的,应用是在一个镜像的,如何在容器运行一个程序,如果直接使用docker访问是不行的,因为此时的应用只是在某个镜像下启动了,相当于在docker内部,而不是docker本身,此时就需要将镜像的应用程序的启动端口映射给...而 docker pause 命令则会暂停容器中所有进程的执行,但容器的状态仍然是“运行”,容器的其他资源(网络端口、文件系统等)仍然处于占用状态。...例如,以下命令可以创建一个名为 my-container 的容器,并在容器内部运行一个命令 sleep 60,然后使用 docker wait 命令等待该容器的退出: perl复制代码docker run...然后,docker wait 命令等待 my-container 容器的退出,并阻塞当前进程。当容器执行完成并退出时,docker wait 命令返回容器的退出码,并解除进程的阻塞状态。

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    Hadoop面试题总结「建议收藏」

    export原理:根据要操作的表生成一个java类,并读取其元数据信息和分隔符对非结构化数据进行匹配,多个map作业同时执行写入关系型数据库。 ---- 5....规则: 一般要求在Hadoop集群执行MapReduce程序,map执行完100%后,尽量早的看到reduce执行到33%,可以通过命令hadoop job -status job_id或者web页面来查看...Hadoop API 的什么特性可以使 map reducer 任务以不同语言( Perl,ruby,awk 等)实现灵活性? Hadoop序列化机制,支持多语言的交互。 ---- 12....mr跑的慢可能有很多原因,:数据倾斜、map和reduce数设置不合理、reduce等待过久、小文件过多、spill 次数过多、 merge 次数过多等。...,这样在JobTracker关闭后,系统中所有数据目录、 临时目录均会被保留,待 JobTracker 重启之后,JobTracker 自动重新提交这些作业,并只对未运行完成的 task 进行重新调度,

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    【日更计划049】数字IC基础题

    上期答案 [095] perl中有多少种不同类型的变量? 标量(scalars):标量用$定义,标量是perl中最简单的变量。标量可以是数字,也可以是字符串或引用。...Cron Job是操作系统基于时间的作业调度程序。它允许在指定的时间,日期,间隔等自动定期运行作业。...例如:假设用户具有Shell或Perl脚本,该脚本计算UNIX / Linux磁盘的人均磁盘空间使用情况。...在UNIX / Linux为此脚本以指定的频率(或时间)设置Cron Job将确保该脚本在计划的时间(或频率)下自动运行,而用户无需每次都手动运行它。...本期题目 [097] 在UNIX / Linux,“ rsync”命令的用途是什么? [098] C/C++"\0"字符的用途是什么? 欢迎在留言区给出你的答案,正确答案将在下一期公布

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    工程效能CICD之流水线引擎的建设实践

    何在有限的资源下,尽可能提高作业的吞吐能力,同时降低在资源不足情况时造成对核心业务场景的影响。 如果只依靠动态扩容,容易出现资源不足时无法扩容、作业排队等待的情况。...在作业端,作业基于标签属性拆分到不同的作业队列,并引入优先级概念,保证每个队列作业按优先级高低被拉取到,避免在积压时,高优作业排在后面无法被及时处理,阻塞业务研发流程。...所以,在优先级设置上除了基于时间戳的相对公平策略外,引入流水线类型的权重值(发布流水线>自测流水线;人工触发>定时执行),保证核心场景流水线相关作业能够尽早被调度到。...结果查询流程,通过守护线程的方式,取消了原先同步等待的查询限制,这对于需要异步化处理的场景(组件作业逻辑已执行完,仅在等待外部平台接口返回结果)可以提前释放资源,提高资源执行的利用率。...并且,当执行资源故障重启后,结果查询线程会自动恢复待处理异步作业。这部分能力的支持在业务层是透明的,不改变整个交互流程。

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