如何在python中使用h4toh5将hdf4转换为hdf5？
在Python中使用h4toh5将HDF4转换为HDF5，可以通过以下步骤实现：
- 安装h4toh5库：h4toh5是一个Python库，用于将HDF4文件转换为HDF5格式。可以使用pip命令安装h4toh5库：
pip install h4toh5 - 导入h4toh5库：在Python脚本中，使用
import h4toh5语句导入h4toh5库。 - 转换HDF4文件为HDF5格式：使用h4toh5库中的
convert函数来执行HDF4到HDF5的转换。该函数接受两个参数，第一个参数是HDF4文件的路径，第二个参数是转换后的HDF5文件的路径。例如：import h4toh5 h4toh5.convert('input.hdf', 'output.h5') - 完成转换：执行上述代码后，h4toh5库将读取HDF4文件并将其转换为HDF5格式，并保存为指定的输出文件。
HDF4和HDF5是两种不同的数据格式，HDF5相对于HDF4具有更多的优势，如更高的性能、更大的数据容量支持、更好的数据压缩和更灵活的数据组织方式。因此，将HDF4转换为HDF5可以提升数据处理和存储的效率。
应用场景：HDF4和HDF5格式广泛应用于科学数据、气象数据、地理信息系统等领域。通过将HDF4转换为HDF5，可以更好地利用HDF5提供的丰富功能和性能优势。
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请注意，以上链接仅为示例，具体产品和服务选择应根据实际需求进行评估和选择。
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1回答
OSError:无法打开文件(找不到文件签名)
我觉得问题是.hdf文件，因为我没有.h5或.hdf5文件。那么如何在python中打开.hdf呢？
浏览 9提问于2022-06-01得票数 -1
我想在python中将hdf4文件转换为hdf5，我认为这个工具h4toh5可以解决这个问题，但我不知道如何在python中使用它，有人知道吗？
上提供的工具
浏览 13提问于2016-08-18得票数 0
我有一些带有3D数组的HDF4文件，我想将这些文件转储到ascii，其中的浮点值反映了源文件的全部精度。我使用了HDP：HDP dumpsds，但它只打印了6位的精度和舍入。我倾向于使用开源实用程序来读取HDF4；python还是java？谢谢。(我使用了标签HDF5，没有HDF4。我意识到这些格式并不兼容，但是开发社区经常并行工作)。
浏览 2提问于2013-12-10得票数 0
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我有一个应用程序，需要存储数据到hdf文件。
可以将数据集存储在hdf中吗?hdf实际上是一个C++对象。例如，我想将下面对象a中包含的数据存储到一个hdf文件(hdf4或hdf5)中。我能这么做吗？如果是，如果有人能做到这一点，我将不胜感激。谢谢。
class A(){
public:
A(int i, double j):i(i), j(j){};
~A();
int i;
double j;
int* ai;
vector<int> b;
setValues(int i, double j){};
}
void main(){
浏览 4提问于2011-11-25得票数 4
第一。我检查了导出功能，NetCDF文件到硬盘文件，但读取Hdf4和目前是不可用的。 如何在GeoServer中读取HDF4或HDF5文件？是否有用于读取HDF文件的插件或库？ 请推荐任何插件或解决方案。谢谢。
浏览 41提问于2020-01-03得票数 0
5回答
我正在编写一个简单的原型代码来演示& profile I/O方案(HDF4、HDF5、HDF5使用并行IO、NetCDF等)。一个物理密码。由于关注的焦点是IO，所以程序的其余部分非常简单：
class Grid
{
public:
floatArray x,y,z;
};
class MyModel
{
public:
MyModel(const int &nip1, const int &njp1, const int &nkp1, const int &numProcs);
Grid grid;
map<string, f
浏览 5提问于2010-06-09得票数 0
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1回答
我一直在努力让python设置来做一些图像处理，所以我真的需要在 6.5上安装CentOS GDAL库。我希望在没有根访问的情况下将包安装在本地文件夹(可能是/workspace/GDAL)中。当我尝试从源代码构建时，CentOS似乎缺少了一堆库。
拜托，网络巫师和系统管理员，你能给我指明正确的方向吗？
谢谢。
更新
我将使用它打开HDF4，HDF4-EOS文件，并在本地安装HDF5 4/HDF5 5库(例如/workspace/HDF)。如果我可以在没有根的情况下安装二进制文件，那么有什么方法可以将GDAL指向这些库呢？
浏览 1提问于2014-08-15得票数 0
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我在上一篇文章中看到过使用gdalUtils在stackoverflow中打开.hdf文件，使用Modis数据打开栅格。我都试过了，但我的文件打不开。请帮助或建议在R中打开任何东西。顺便说一下，我的文件是hdf4格式的。在尝试已经给出的代码时，我得到了中给出的以下错误和警告
浏览 38提问于2018-09-06得票数 0
1回答
有人能建议在macos上安装带有hdf4支持的gdal的简单方法吗？
我尝试了许多方法，但我仍然无法阅读hdf4。
我通过自制的指令安装了gdal。显然，gdal不支持hdf4。
我尝试过按照以前的使用sudo port install gdal +hdf4 +hdf5 +netcdf的建议通过Macport安装gdal，但是安装失败了，出现了以下错误：
错误:无法构建gdal:命令执行失败错误:有关详细信息，请参阅/opt/local/var/macports/logs/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_macpor
浏览 0提问于2020-06-18得票数 0
我正在寻找一个Windows程序，可以打开和显示一个LMDB文件(闪电存储器-映射数据库)。理想情况下，免费提供，也可以编辑文件，并支持大文件，如HDFView的HDF4和HDF5文件。
📷
浏览 0提问于2015-07-11得票数 3
我有大量的并行netCDF生成的数据，有足够的条目，只能以CDF-5格式生成输出。我在python中有一个分析例程，我想传递这些数据。但是，虽然ncmpidump -h提供了正确的头文件信息，但我仍然无法打开任何python包(或者访问或读取带有ncdump的头文件)。有人知道吗？
1)可以读取can 5格式数据的python包。
2)一个实用程序，它可以将并行的netCDF CDF-5数据转换为更广泛支持的东西，比如HDF5，然后我可以将这些数据读入到python中？
备选案文1当然更可取。
谢谢
浏览 1提问于2016-01-07得票数 4
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我正在尝试读取一个HDF4文件()。
import os
import numpy as np
from pyhdf.SD import SD, SDC
# Open file.
FILE_NAME = 'MOD13A2.A2016001.h23v05.006.2016029070140.hdf'
hdf = SD(FILE_NAME, SDC.READ)
# List available SDS datasets.
print (hdf.datasets())
# Read dataset.
DATAFIELD_NAME="1_km_16_days_NDVI&#
浏览 1提问于2018-04-05得票数 1
4回答
我有一个hdf5格式的文件。我知道它应该是一个矩阵，但是我想在R中读取这个矩阵，这样我就可以研究它。我看到有一个h5r包应该对此有所帮助，但我没有看到任何简单易读/理解的教程。网上有这样的教程吗？具体地说，如何使用此包读取hdf5对象，以及如何实际提取矩阵？
更新
我发现了一个包rhdf5，它不是CRAN的一部分，而是BioConductoR的一部分。界面相对容易理解，文档和示例代码相当清晰。我可以毫不费力地使用它。我的问题似乎是输入文件。我想要读取的矩阵实际上是作为python pickle存储在hdf5文件中的。因此，每次我尝试打开它并通过R访问它时，我都会得到一个segmentation
浏览 1提问于2013-04-12得票数 59
3回答
我有一大堆代码通过h5py与hdf文件交互。这段代码已经运行多年了。最近，随着python环境的变化，我收到了这个新的错误消息。
IOError: Unable to open file (unable to lock file, errno = 11, error message = 'Resource temporarily unavailable')
有趣的是，错误在一些地方间歇性地发生，而在另一些地方持续出现。在经常发生这种情况的地方，我查看了我的代码，确认没有其他h5py实例连接到该文件，并且最后一个连接已正确刷新和关闭。同样，在环境改变之前，这一切都工作得很好。
下
浏览 1提问于2018-06-22得票数 3
1回答
一段时间以来，我一直在为正确安装GDAL而斗争，就在我认为一切都正常工作的时候，我发现了另一个路障。
我使用描述的解决方案安装了GDAL，这是一种支持HDF4文件格式的表单。例如，在bash中使用gdalinfo --formats返回支持的文件格式列表，其中包括HDF4。此外，gdalinfo XYZ.hdf返回对我输入的任何hdf文件的完整描述。
但是，当试图通过Python处理HDF4文件时，我会发现一个错误，即HDF4不是受支持的文件格式。使用
import osgeo.gdal as gdal
gdal.GetDriverByName('HDF4')
没有任何回报
浏览 1提问于2017-08-01得票数 0
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1回答
在python2.7中，我可以使用关键字分析hdf5文件
$ python
>>> import h5py
>>> f = h5py.File('example.h5', 'r')
>>> f.keys()
[u'some_key']
然而，在python3.4中，我得到了一些不同的东西：
$ python3 -q
>>> import h5py
>>> f = h5py.File('example.h5', 'r')
>
浏览 1提问于2015-06-25得票数 21
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我在网站()上有一个称为“百万首歌数据集”的数据集的子集，我想在该数据集上对SAS Enterprise Miner (13.2)执行数据挖掘操作。
我下载的子集包含10,000个文件，它们都是HDF5格式的。如何将hdf5文件转换为(Sas7bdat)可读的格式
浏览 2提问于2015-03-19得票数 0
1回答
我正在尝试安装fortran的netcdf模块。下面是链接http://albeniz.eng.uci.edu/software/WRFCMAQ/NetCDF_安装_为_C_和_福特兰_libraries-HPC.pdf中的步骤
我正在犯错误：
configure: netCDF 4.4.1.1
checking build system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking target system type... x86_64-unkn
浏览 0提问于2023-02-13得票数 0
1回答
我想知道hdf5是否适合实时数据记录？
更准确地说:我在做一个项目，在这个项目中，我们希望连续(采样率从30到400 of )混合不同性质(遥测、信号、视频)的相当数量的数据(几个小时)。
数据必须实时写入(或稍有延迟)，以防止我们在潜在崩溃时丢失它们。
我们的第一个原型是基于sqlite3的，但是我们觉得从长期使用中可能会出现一些限制:速度，一个数据库==一个文件，以及从多个线程访问数据库的困难(同时读取和写入时锁定异常)。
因此，我正在考虑使用hdf5作为后端在磁盘上存储数据的可能性(以及使用numpy/pytable作为内部表示)。你认为有可能从这样的python绑定中定期更新hdf5文
浏览 2提问于2012-07-13得票数 9
一个Pandas DataFrame可以像这样转换成一个hdf5文件；
df.to_hdf('test_store.hdf','test',mode='w')
我有一个sqlite db文件，它必须转换为hdf5文件，然后我将使用pd.read_hdf通过pandas读取hdf5文件。
但首先，我如何将python sqlite db转换为hdf5文件？
编辑：
我知道在pandas中使用.read_sql方法。但是我想先把db转换成hdf5。
浏览 3提问于2014-04-08得票数 5
1回答
我有一堆hdf5文件，我想把其中的一些数据转换成拼花文件。不过，我很难把它们读成熊猫/皮亚罗。我认为这与最初创建文件的方式有关。
如果我使用h5py打开文件，数据看起来与我所期望的完全一样。
import h5py
file_path = "/data/some_file.hdf5"
hdf = h5py.File(file_path, "r")
print(list(hdf.keys()))
给我
>>> ['foo', 'bar', 'baz']
在这种情况下，我感兴趣的组“酒吧”，其中有3
浏览 75提问于2022-03-07得票数 1
1回答
我使用熊猫内置的HDF5方法存储数据。
不知怎么的，这些HDF5文件被转换成“只读”文件，当我以写模式打开这些文件时，我收到了大量的Opening xxx in read-only mode消息，而不能将它们写成，这是我真正需要做的事情。
到目前为止，我真正不明白的是，这些文件是如何变成只读的，因为我不知道我编写的一段代码可能会导致这种行为。(我试图检查存储在HDF5中的数据是否损坏，但我能够读取和操作它，因此它似乎工作得很好)
我有两个问题：
如何将数据附加到那些“只读模式”HDF5文件中？(我可以将它们转换回写模式或任何其他聪明的解决方案吗？)
在默认情况下，是否有任何熊猫方法可以
浏览 0提问于2018-01-25得票数 2
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我正在构建一个使用NetCDF C++库构建的应用程序，而NetCDF正在使用HDF-4libary。然而，它引入了错误的HDF-4库。
下面是我的应用程序的链接方式：
/apps1/intel/bin/icpc -gxx-name=/apps1/gcc-4.5.0/bin/g++ -shared -o lib/libMyCustom.so
-Llib -L/apps1/boost-1.48.0/lib -Wl,-rpath=/apps1/boost-1.48.0/lib
-L/apps1/gdal-1.8.0-jasper/lib -Wl,-rpath=/apps1/gdal-1.
浏览 1提问于2012-03-02得票数 5
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我正在尝试用Python从hdf5文件中读取数据。我可以使用h5py读取hdf5文件，但是我不知道如何访问文件中的数据。
我的代码
import h5py
import numpy as np
f1 = h5py.File(file_name,'r+')
这将起作用，文件将被读取。但是如何访问文件对象f1中的数据呢？
浏览 576提问于2015-01-27得票数 101
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我有一个非常大的数据集，我通过如下所示的方式以块的形式写入hdf5：
with pd.HDFStore(self.train_store_path) as train_store:
for filepath in tqdm(filepaths):
with open(filepath, 'rb') as file:
frame = pickle.load(file)
if frame.empty:
os.remove(filepath)
continue
浏览 5提问于2019-12-10得票数 4
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3回答
我一直在探索HDF5及其python (h5py)，所以我尝试将一个HDF5文件(一亿个整数的一维数组)读入:一个普通列表，另一次读入一个numpy数组。与我试图将数据集转换为普通python列表时相比，将数据集转换为numpy的速度非常快(实际上，处理一个列表需要很长时间才能完成它)。
有谁能帮助我理解内部发生的事情，这使得将HDF5数据集转换为一个numpy数组比使用普通列表的速度要快得多呢？这与h5py与numpy的兼容性有关吗？
import numpy as np
import hdf5
def readtolist(dataset):
return "normal
浏览 0提问于2018-04-18得票数 1
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有没有一种快速简单的方法从bash命令行将HDF5文件转换为netcdf(4)？或者，在R、NCL或python中自动处理这种转换的简单脚本？
浏览 4提问于2018-02-19得票数 2
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我正在构建一个hdf5文件，其中包含不同的测量数据集。对于实验和每次测量，我都有一些我想加入的元数据。 我的元数据包含有关我的样本、设置、测试过程等的信息，因此我希望将其组织为嵌套字典。由于HDF5文件格式不能将字典存储在属性中(而且我发现将元数据放入数据集中的替代方法是不干净的)，所以我决定使用pyTables而不是h5py，因为它有自己的语法来将字典作为字符串存储在hdf5属性中/从hdf5属性中解析出来。 我构建了一个具有以下结构的文件 'G1'
'M1'
'M2' 我能够存储每个度量的元数据，执行以下操作： store
浏览 38提问于2021-10-16得票数 0
我正在从一个DataFrame文件中读取hdf5：
import pandas as pd
store = pd.HDFStore('some_file.h5')
df= store['df']
store.close()
使用info显示：
In [11]: df.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
Int64Index: 21423657 entries, 0 to 21423656
Data columns (total 5 columns):
date datet
浏览 2提问于2015-09-17得票数 1
回答已采纳
2回答
我有一个关于如何最好地使用python / h5py写入hdf5文件的问题。
我有如下数据：
-----------------------------------------
| timepoint | voltage1 | voltage2 | ...
-----------------------------------------
| 178 | 10 | 12 | ...
-----------------------------------------
| 179 | 12 | 11 | ...
-------
浏览 1提问于2014-09-04得票数 31
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5回答
我有一个字典，其中键是datetime对象，值是整数的元组：
>>> d.items()[0]
(datetime.datetime(2012, 4, 5, 23, 30), (14, 1014, 6, 3, 0))
我想将它存储在HDF5数据集中，但是如果我试图转储字典，h5py引发的错误：
TypeError:对象dtype dtype(' Object ')没有本机HDF5等效
什么是“最好”的方式来转换这个字典，以便我可以将它存储在HDF5数据集中？
具体来说，我不想仅仅将字典转储到numpy数组中，因为这会使基于日期时间查询的数据检索复杂化。
浏览 5提问于2013-05-11得票数 33
我正在尝试安装工具，并需要安装hdf5。我试过了
$ pip安装hdf5
并获取
无法找到满足hdf5需求的版本(来自版本：)没有为hdf5找到匹配的发行版
我的回声$PATH是：
/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/opt/X11/bin:/usr/local/munki:/opt/salt/bin:/usr/local/sbin
$which python吸引了我：
/usr/local/bin/python
我怀疑PATH存在一些问题，因为这个mac最初安装了anaconda和python 3.x，我
浏览 3提问于2017-04-06得票数 2
1回答
这是我的代码：
import os
import pandas as pd
def load_hdf(filename):
"""
Load the first key of an HDF file
"""
hdf = pd.HDFStore(filename,mode = 'r')
keys = hdf.keys()
if not keys:
hdf.close()
return pd.DataFrame()
data_df = hdf.
浏览 2提问于2018-12-28得票数 1
1回答
因此，我试图访问HDF5文件中子目录中的条目。下面是我的代码
data = h5py.File(filename, 'r')
seqTags = []
for entry in data['somesebdir']:
seqTags.append(str(entry).replace("b'", "")[:-1])
seq_list_file.append(str(entry).replace("b'", "")[:-1])
如您所见
浏览 1提问于2021-05-30得票数 0
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我在用Python语言读取hdf5 Matlab7.3文件时遇到了问题。我使用的是h5py 2.0.1。
我可以读取文件中存储的所有矩阵，但不能读取字符串列表。h5py将字符串显示为形状为(1,894)、类型为|04的数据集。此数据集包含对象引用，我尝试使用h5file[obj_ref]语法取消对它们的引用。
这会产生类似于dataset "FFb": shape (4, 1) type "<u2"的东西。我将其解释为长度为4的字符数组。它似乎是字符串的ASCII表示。
有没有一种简单的方法可以把字符串弄出来？
有没有提供matlab to python
浏览 1提问于2012-08-20得票数 8
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我正在尝试将数据从.mat文件加载到python中，这样我就可以将其保存在HDF5文件中。
问题是scipy.io.loadmat返回一个包含计数数组的字典(‘dtype=’，‘|o4’)
每当我尝试创建一个返回其中一个数组的数据集时，我都会得到以下错误：
>> mat = scipy.io.loadmat('state-10.mat')
>> h = h5py.File('test.hdf5','w')
>> h.create_dataset('set', data=mat['Prot
浏览 1提问于2013-04-18得票数 2
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1回答
HDF5 C代码生成
、、、
我想知道是否有一个工具可以从C数据结构中产生C HDF5读写代码。
我希望这个工具能够解析一个C头文件，并生成相应的C HDF5读/写代码。
可以区分静态分配和动态分配的情况。第一次，我只对静态分配感兴趣。
例如，我想从结构sensor_t的定义中生成以下代码，该结构包含一个整型和两个双精度型。所显示的代码是从类型定义C结构到C HDF5结构的直接转换。
typedef struct {
int serial_no;
double temperature;
double pressure;
} sensor_t;
#include "hdf5.h&
浏览 0提问于2012-06-25得票数 6
1回答
h5py内存文件与多处理错误
、、、、
这是给你的HDF5和多处理大师..。首先，我知道python和多处理模块并不一定彼此喜欢，但是我得到了一个我无法理解的错误。我正在处理的脚本创建了一个临时内存中的hdf5文件，将来自(泡菜)输入文件的数据存储在内存文件中，然后多处理池对来自临时HDF5文件的数据执行(只读)操作。
我已经能够隔离导致错误的代码，下面是一个简化的代码片段。当我在生成器函数中创建内存中的hdf5文件，然后使用该生成器为多处理池生成参数时，我会得到一系列HDF5错误。下面是一些尽可能简单的代码，以便重新创建错误：
import h5py
from multiprocessing import Pool
from it
浏览 3提问于2013-02-27得票数 1
1回答
在图像分类和回归任务上，我很难与HDF5合作，由于某种原因，HDF5的培训在一开始就会失败，测试和训练损失很快就会降到接近于零。在尝试了所有的技巧后，比如降低学习率，添加RELU，辍学，什么都没有起作用，所以我开始怀疑我提供给caffe的HDF5数据是错误的。
所以目前我正在开发通用数据集(和它也有 )，首先我尝试了ImageData和LMDB层进行分类，它们都工作得很好。最后，我使用HDF5数据层进行细化，除非在数据层上使用HDF5，否则training_prototxt不会改变。同样，在学习开始时，迭代60时损失从5降到0.14，迭代100时损失从0.00146降到0.14，这似乎证明了H
浏览 2提问于2015-10-19得票数 0
我想把HDF5文件读入Python，然后做一些编码工作。要在python环境中访问HDF5文件中的数据，需要使用HDF5文件的数据集名称。但是，我不知道如何找到数据集的名称，我想寻求帮助。
def select_HDF_file(self):
filename2 = QFileDialog.getOpenFileName(self.dlg, "Select output
file","",'*.hdf')
dataset_name = '**************'
file = h5py
浏览 30提问于2017-07-24得票数 3
回答已采纳
1回答
我无法在mac el capitan版本10.11.6上使用bash编译支持hdf4的gdal。我从上描述的构建gdal的自制方法开始。不幸的是，gdal默认不支持hdf4。包含了对hdf4数据结构的很好的描述，但却无法帮助获得对gdal的支持。我已经安装了讨论的szip、zlib和jpeg库，并回顾了/u/dschneiderch 所描述的困难。github线程将我引向最终的，这是我当前帖子的基础。
使用homebrew，我已经安装了hdf4 (brew install homebrew/versions/hdf4返回versions已弃用的警告，homebrew将使用science )。我
浏览 0提问于2017-06-04得票数 1
1回答
用hdf5数据集绘制地图
、、、、
在将hdf5文件从hdf4中切换后，我正在尝试绘制它们。我在计算文件中的经度和纬度变量时遇到了一些困难，它们都有一个形状(4224，3)，我猜它们对应于1:值的数目，2:卫星的起始/中间/结束颗粒点。
我的问题是我的数据'extinction_coefficient_532‘有一个形状(4224,399)，它不匹配我的lon/lat变量。如果我错了，纠正我，但我需要有一个数据文件的形状(值，隆，拉特)，以绘制它在地图上的卡拉托比。
是否有一种方法来调整数据的形状以匹配lon/lat变量？
f['Longitude'].shape
Out[296]: (4224, 3)
浏览 2提问于2022-02-09得票数 0
1回答
正如hdf5文档所述，HDF5使用NumPy存储数据
它建立在HDF5库、Python语言和NumPy包的基础上。它具有一个面向对象的接口，它结合了对代码性能至关重要的部分的C扩展，使它成为一个快速但非常容易使用的工具，用于交互存储和检索大量数据。
..。
"PyTables使用这些NumPy容器作为内存缓冲区，将I/O带宽推向平台限制。“
那么机制是什么？PyTables是如何使用NumPy的?最后，它们生成了可从其他语言访问的普通hdf5 .
浏览 3提问于2010-11-09得票数 0
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我已经通过发行版安装了python。它适用于大多数正常的事物。我需要能够打开一个MODIS HDF4-EOS文件，但是。我试过了
conda install -c https://conda.binstar.org/mutirri hdf4
conda install gdal
python -c "from osgeo import gdal; ds=gdal.Open("MOD021KM.A2014005.0910.006.2014005194151.hdf"); print type(ds)"
但我得到
错误4：`MOD021KM.A2014005.09
浏览 10提问于2014-08-15得票数 3
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我尝试使用Tensorflow在python中构建一个机器学习模型。问题是训练数据不适合存储在内存中。它们将另存为大型HDF5文件。输入是存储一堆图像的4D数组(每个图像具有10个以上的通道，例如红外通道)。我设法使用这篇文章中的代码读取了数据：Tensorflow-IO Dataset input pipeline with very large HDF5 files import tensorflow_io as tfio
BATCH_SIZE = 256
EPOCHS = 50
# Create an IODataset from a hdf5 file's dataset
浏览 13提问于2020-09-06得票数 0
1回答
我已经通过pandas和pandas.HDFStore()将大约800 GB的巨大数据帧存储到HDF5中。
import pandas as pd
store = pd.HDFStore('store.h5')
df = pd.Dataframe() # imagine the data being munged into a dataframe
store['df'] = df
我想用Impala来询问这个问题。有没有一种简单的方法可以将这些数据解析到Parquet中？或者Impala允许您直接使用HDF5？对于HDF5上的数据，还有其他选择吗？
浏览 15提问于2017-01-06得票数 0
我有一个M1 MacBook。我使用pyenv安装了Python3.9.1，并使用pip3版本21.0.1。我已经通过brew install hdf5安装了自制软件和hdf5 1.12.0_1。 当我输入的时候 pip3 install h5py 我得到了错误： Requirement already satisfied: numpy>=1.19.3 in /Users/.../.pyenv/versions/3.9.1/lib/python3.9/site-packages (from h5py) (1.20.0)
Building wheels for collected pac
浏览 104提问于2021-03-22得票数 2
1回答
我最近开始为一台由蔡司的ZEN控制的显微镜编写宏程序。Zeiss宏环境使用IronPython 2.7.2.1。我需要编写一个hdf5文件，但不幸的是，hdf5对IronPython的支持非常糟糕。
我想要传输的数据是ArrayByte类型的，它似乎以某种方式连接到.NET的CLR：
print "length: %i type: %s" %(len(data), type(data))
给予：
length: 4915200 type: <type 'Array[Byte]'>
我可以成功地通过套接字连接(建议的)，使用泡菜将包含ints和Stri
浏览 9提问于2015-11-18得票数 0
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我想知道我是否造成了问题，因为我在Python2.7中不正确地分配和转换数据类型到numpy-数组。
我正在做的是将hdf5 64位整数值从numpy.float64类型读取到numpy.zeros()数组！然后将这些值写入另一个hdf5，分配64位无符号整数！
一些原始值的两个示例，它们实际上是ID号(因此它们不因数据类型转换而改变是至关重要的)：
12028545243
12004994169
问题1:第二个hdf5 5文件中的无符号整数与原始文件中的整数相同吗？
我用一个小的子样本检查了这一点，但是我无法控制是否对所有的人都是这样(有数百万)！
问题2:如果我使用数据type=float
浏览 1提问于2017-03-07得票数 0
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cmake/thirdparty/SetupGeosxThirdParty.cmake:131出现CMake错误(消息)：GEOSX需要hdf5，请将HDF5_DIR设置为hdf5安装目录。
浏览 116提问于2021-07-22得票数 0
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